PENGARUH ph AIR TERHADAP TINGKAT PATOGENITAS VIRAL NERVOUS NECROSIS PADA BENIH IKAN KERAPU MACAN (Epinephelus fuscoguttatus) SKRIPSI

Transkripsi

1 PENGARUH ph AIR TERHADAP TINGKAT PATOGENITAS VIRAL NERVOUS NECROSIS PADA BENIH IKAN KERAPU MACAN (Epinephelus fuscoguttatus) SKRIPSI HELMI KRISTINA SIMAMORA DEPARTEMEN BIOLOGI FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM UNIVERSITAS SUMATERA UTARA MEDAN 2011

2 PENGARUH ph AIR TERHADAP TINGKAT PATOGENITAS VIRAL NERVOUS NECROSIS PADA BENIH IKAN KERAPU MACAN (Epinephelus fuscoguttatus) SKRIPSI Diajukan untuk melengkapi tugas dan memenuhi syarat mencapai gelar Sarjana Sains OLEH HELMI KRISTINA SIMAMORA DEPARTEMEN BIOLOGI FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM UNIVERSITAS SUMATERA UTARA MEDAN 2011

3 PERSETUJUAN Judul : PENGARUH ph AIR TERHADAP TINGKAT PATOGENITAS VIRAL NERVOUS NECROSIS PADA BENIH IKAN KERAPU MACAN (Epinephelus fuscoguttatus) Kategori : SKRIPSI Nama : HELMI KRISTINA SIMAMORA Nomor Induk Mahasiswa : Program Studi : SARJANA(S1) BIOLOGI Departemen : BIOLOGI Fakultas : MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM (FMIPA) UNIVERSITAS SUMATERA UTARA Diluluskan di Medan, September 2011 Komisi Pembimbing : Pembimbing 2 Pembimbing 1 Dedy Arief Hendriyanto, S. St.Pi, M.Si. Prof. Dr. Dwi Suryanto, M.Sc. NIP NIP Diketahui/Disetujui oleh Departemen Biologi FMIPA USU Ketua, Dr. Nursahara Pasaribu, M. Sc. NIP

4 PERNYATAAN PENGARUH ph AIR TERHADAP TINGKAT PATOGENITAS VIRAL NERVOUS NECROSIS PADA BENIH IKAN KERAPU MACAN (Epinephelus fuscoguttatus) SKRIPSI Saya mengakui bahwa skripsi ini adalah hasil kerja saya sendiri, kecuali beberapa kutipan dan ringkasan yang masing-masing disebutkan sumbernya. Medan, Helmi Kristina Simamora

5 PENGHARGAAN Puji dan syukur penulis panjatkan kepada Tuhan Yesus Kristus atas cinta kasih dan berkat penyertaan-nya sehingga penulis dapat menyelesaikan Skripsi yang berjudul Pengaruh ph Air Terhadap Tingkat Patogenitas Viral Nervous Necrosis Pada Benih Ikan Kerapu Macan (Epinephelus fuscoguttatus) dibuat sebagai salah satu syarat untuk meraih gelar sarjana di FMIPA USU Medan. Ucapan terima kasih penulis ucapkan kepada Bapak dan Ibu dosen terkasih: Prof. Dr. Dwi Suryanto, M.Sc selaku Dosen Pembimbing I dan Dedy Arief Hendriyanto, S.St.Pi, M.Si selaku Dosen Pembimbing II, Prof. Dr. Syafruddin Ilyas, M.Biomed dan Dra. Nunuk Priyani, M.Sc selaku Dosen Penguji serta kepada Dosen Penasehat Akademik, Drs. Arlen H.J., M.Si yang selama ini telah memberikan arahan, bimbingan dan masukkan demi kesempurnaan skripsi ini. Ucapan terima kasih juga penulis sampaikan kepada Ibu Dr. Nursahara Pasaribu, M.Sc, selaku Ketua Departemen Biologi FMIPA USU dan Bapak Kiki Nurtjahja, M.Sc, selaku Sekretaris Departemen Biologi FMIPA USU, Ibu Roslina Ginting, Ibu Nurhasni Muluk dan Bang Ewin selaku Staf Pengawai Administrasi dan seluruh Dosen Pengajar di Departemen Biologi FMIPA USU. Ucapan terima kasih yang sebesar-besarnya penulis sampaikan kepada Bapak Ir. Viktor Immanuel selaku Kepala Balai Karantina Ikan Kelas I Polonia, Medan, Bapak Ramon Nasution, Ibu Ir. Barita Sriwanty Aritonang, Bapak Sahala Sianturi, S.Si, Ibu Marlina Dolok Saribu, S.Si, Bapak Drh. Sangkot SN dan Staf Pengawai BKI Polonia Medan atas kepercayaan dan kerjasama yang terbina selama ini. Ucapan terima kasih yang tak ternilai penulis ucapkan kepada kedua orang tua, Ayah tercinta A. Simamora dan Ibunda tercinta J. Sihite atas doa, dukungan dan setiap tetesan keringat yang tercurah untuk anak-anaknya. Serta kepada Abang saya Jack Jones Simamora, Kakak terkasih Romauli Simamora dan Adik tersayang David Simamora atas dorongan semangat yang diberikan kepada penulis. Ucapan terima kasih juga penulis ucapkan kepada sahabat seperjuangan: Resti Fawzia dan Laura Aprilini. Semoga setiap pengalaman yang kita hadapi bersama menjadi kenangan terindah yang tidak akan terlupakan. Rasa terima kasih penulis juga ucapkan buat adik-adik dari SMKN 1 Kisaran dan SMKN 1 Tanjung Balai atas bantuan yang luar biasa: Nico, Dedy, Sinta, Fitri, Eva, Kessy, dan Dera. Serta buat Like D Ants : Natalia, Ibeth, Eva, Else, Hotda, Siti, Anggun, Katrina, Dina, Putri, Yanti, Misfalla, Asril, Nila, Alex, Mirza, Ria, Affan, dan teman stambuk 2007 lainnya, abang dan kakak asuh stambuk 2005, 2006 dan adik asuh 2009: Astrid dan Bertua. Terima kasih penulis ucapkan kepada adik-adik sekolah minggu, seluruh anggota R/N HKBP Parsaoran dan teman-teman dari Ikatan Muda-Mudi Cinta Damai atas doa dan dukungannya selama ini.

6 Penulis menyadari bahwa dalam pembuatan skripsi ini masih banyak kekurangan. Oleh karena itu, penulis mengharapkan saran dan kritik yang bersifat membangun demi kesempurnaan skripsi ini. Semoga skripsi ini bermanfaat. Tuhan memberkati kita semua. Medan, September 2011 Penulis

7 PENGARUH ph AIR TERHADAP TINGKAT PATOGENITAS VIRAL NERVOUS NECROSIS PADA BENIH IKAN KERAPU MACAN (Epinephelus fuscoguttatus) ABSTRAK Penelitian tentang pengaruh ph air terhadap tingkat patogenitas viral nervous necrosis pada benih ikan kerapu macan (Epinephelus fuscoguttatus) telah dilakukan pada bulan Januari sampai April Tujuan dari penelitian ini untuk mengetahui pengaruh ph air terhadap tingkat patogenitas VNN pada benih kerapu macan. Adapun ikan yang digunakan yaitu benih kerapu macan ukuran ± 10 cm. Penelitian ini diawali dengan uji FID 50 yaitu untuk mendapatkan konsentrasi virus VNN yang akan diinjeksikan pada Uji Utama. Selanjutnya dilakukan uji konfirmatif yang meliputi Uji Hematologi, Uji Histopatologi dan Uji RT-PCR. Hasil penelitian yang dilakukan memperoleh nilai FID 50 sebesar 10-4 /0,1 ml yang diinjeksikan pada benih ikan. Pada Uji Utama diperoleh persentase kematian ikan tertinggi pada perlakuan ph 6,0 sebesar 96,67% dan terendah pada perlakuan ph 8,5 sebesar 63,33%. Dari hasil yang didapat, perlakuan ph 8,5 berbeda nyata terhadap perlakuan lainnya (p<0,05). Pada Uji Hematologi diperoleh bahwa jumlah leukosit pada masing-masing perlakuan mengalami penurunan dari jumlah leukosit normal sebesar sel/mm 3. Jumlah eritrosit pada setiap perlakuan relatif normal dari jumlah eritrosit normal sebesar 1,3 juta -3 juta sel/mm 3. Nilai hematokrit pada masing-masing perlakuan menurun dari nilai hematokrit normal sebesar 12-14% dan jumlah Hemaglobin diperoleh juga mengalami penurunan dari jumlah hemoglobin normal sebesar 30,8-45,5 g/dl. Pada uji histopatologi dampak infeksi VNN ditandai dengan adanya penggumpalan atau akumulasi sel-sel radang dan sel-sel glia yang berkelompok secara umum dan terjadinya vaskulitis. Hasil diagnosis PCR diperoleh bahwa terdapat perbedaan tingkat patogenitas yang berbeda pada masing-masing perlakuan. Kata kunci: VNN, FID 50, Uji Hematologi, Uji Histopatologi, dan Uji RT-PCR.

8 Effect of ph Water Levels on the Pathogenicity of Viral Nervous Necrosis in Seed Tiger Grouper (Epinephelus fuscoguttatus) ABSTRACT A study on effect of ph on pathogenicity of viral nervous necrosis in seed tiger grouper (Epinephelus fuscoguttatus) has been carried out from January to April The purpose of this study was to investigate the effect of ph on the pathogenicity level of VNN in tiger grouper seed. The fish used was tiger grouper seeds of ± 10 cm. Study was initiated with FID 50 test to get the concentration of virus VNN to be injected in Main Test. Confirmative test included Hematology Test, Histopatology Test and RT-PCR. The result showed that FID 50 value was 10-4 /0,1 ml to be injected to the fish. The highest percentage of morbidity of fish was at ph 6.0 (96.67%) and the lowest occured at ph 8.5 (63.33%). ph 8.5 showed significantly different to the other treatments (p<0.05). The number of leukocytes in each treatment decreased from the normal ( cells/mm 3 ). The number of erythrocytes of all treatments was normal (1.3-3 million cells/mm 3 ). The hematocrite decreased to 12-14%. The hemoglobin decreased to g/dl. The impact of VNN infection characterized by the accumulation of clotting or imflammatory cells, more glial cells revealed and the occurence of vasculitis. PCR results confirmed the different of pathogenicity of each treatment. Keywords: VNN, FID 50, Test Hematology, Histopathology Test, and RT-PCR Test.

9 DAFTAR ISI Halaman PERSETUJUAN PERNYATAAN PENGHARGAAN ABSTRAK ABSTRACT DAFTAR ISI DAFTAR TABEL DAFTAR GAMBAR DAFTAR LAMPIRAN ii iii iv vi vii viii x xi xii BAB 1 PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang Permasalahan Penelitian Tujuan Penelitian Hipotesis Penelitian Manfaat Penelitian 3 BAB 2 TINJAUAN PUSTAKA 2.1 Ikan Kerapu Macan (Epinephelus fuscoguttatus) Viral Nervous Necrosis (VNN) Kualitas air 7 BAB 3 BAHAN DAN METODE 3.1 Waktu dan Tempat Alat dan Bahan Prosedur Penelitian Isolat Virus Uji FID Pengaruh ph Terhadap Patogenitas VNN Pengamatan Gejala Klinis Uji Hematologi Pemeriksaan Histopatologi Uji Biologi Molekuler (RT-PCR) Analisis Data 17 BAB 4 HASIL DAN PEMBAHASAN 4.1 Uji FID Pengaruh ph air Terhadap Tingkat Patogenitas VNN Gejala Klinis Akibat Infeksi VNN Uji Hematologi Pemeriksaan Histopatologi Diagnosis Reverse Transcriptase-PCR 26

10 BAB 5 KESIMPULAN DAN SARAN 5.1 Kesimpulan Saran 28 DAFTAR PUSTAKA 29

11 DAFTAR TABEL Halaman Tabel 4.1 Nilai FID Tabel 4.2 Pengaruh ph air terhadap tingkat patogenitas VNN 19 Tabel 4.4 Uji hematologi 22

12 DAFTAR GAMBAR Halaman Gambar 4.3 Gejala klinis infeksi VNN 21 Gambar 4.5 Pemeriksaan histopatologi 25 Gambar 4.6 Diagnosis Reverse Transcriptase-PCR 26

13 DAFTAR LAMPIRAN Halaman Lampiran A. Pengamatan Harian Pada Masing-masing Perlakuan 32 Lampiran B. Uji Normalitas, Non Parametrik Mann-Whitney 33 Lampiran C. Amplikasi Reverse Transcriptase Polimerase Chain Reaction 45 Lampiran D. Pembuatan Isolat Virus 46 Lampiran F. Alur kerja Uji FID Lampiran G. Pemeriksaan Hematologi 48 Lampiran H. Pemeriksaan Histopatologi 51 Lampiran I. Uji Reverse Trancriptase Polimerase Chain Reaction (RT-PCR) 53 Lampiran J. Dokumentasi penelitian 56