ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PROBIOTIK DARI ORGAN PENCERNAAN IKAN PATIN (Pangasius hypophthalmus)

Transkripsi

1 ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PROBIOTIK DARI ORGAN PENCERNAAN IKAN PATIN (Pangasius hypophthalmus) SKRIPSI Diajukan untuk Memenuhi Sebagian Syarat Mencapai Derajat Sarjana (S-1) Oleh : PUTRI UTAMI PROGRAM STUDI PENDIDIKAN BIOLOGI FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO 2017

2 ii ii

3 iii iii

4 iv iv

5 v MOTTO Artinya : Orang yang menuntut ilmu bearti menuntut rahmat ; orang yang menuntut ilmu bearti menjalankan rukun Islam dan Pahala yang diberikan kepada sama dengan para Nabi. ( HR. Dailani dari Anas r.a ) Artinya: Kesabaran itu dapat menolong sagala pekerjaan v

6 vi HALAMAN PERSEMBAHAN Karya kecil ini, penulis persembahkan untuk : 1. Bapak Prio Utomo, S.Pd.SD dan Ibu Santi Aprina tercinta terimakasih atas segala kasih sayang, doa, dan pengorbanan yang tiada henti. 2. Keluarga besarku yang selalu memberikan dukungan dan doa yang tak putus pula. vi

7 vii UCAPAN TERIMAKASIH Assalamu alaikum wr. wb. Puji syukur kehadirat Allah SWT yang telah memberikan rahmat dan karunia-nya kepada penulis sehingga dapat menyelesaikan skripsi yang berjudul Isolasi dan Identifikasi Bakteri Probiotik Dari Organ Pencernaan Ikan Patin (Pangasius hypophthalmus). Penulis menyusun skripsi ini sebagai salah satu persyaratan untuk memperoleh gelar kesarjanaan pada Program Studi Pendidikan Biologi di Universitas Muhammadiyah Purwokerto. Pada kesempatan ini, penulis mengucapkan terimakasih setulus tulusnya kepada Drs. Heri Maryanto, M.Si. selaku pembimbing I dan drh. Cahyono Purbomartono, M.Sc. selaku pembimbing II yang telah berkenan membimbing dan mengarahkan penulis dalam penyelesaiian skripsi ini. Ucapan terimakasih dan penghargaan juga penulis sampaikan keada : 1. Drs. Pudiyono, M. Hum. Selaku Dekan Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan Universitas Muhammadiyah Purwokerto. 2. Drs. Arief Husin, M.Si. selaku Ketua Program Studi Pendidikan Biologi. 3. Seluruh Dosen Program Studi Pendidikan Biologi Universitas Muhammadiyah Purwokerto yang telah membimbing dan memberikan ilmunya kepada penulis selama perkuliahan. 4. Kedua orang tua tercinta Ibu Santi Aprina dan Bapak Prio Utomo, S.Pd.SD. yang telah memberikan dukungan moril maupun materil kepada penulis dalam penyusunan skripsi ini. 5. Laboran Laboratorium Mikrobiologi dan Pangan Selvi Yenitasari, S.Pd. yang telah melayani dengan sepenuh hati. 6. Teman teman (Mufliah, Epriliana Dewi, Anna Miftakhul Jannah, Vika Anggelika, Di ayatul Choeriyah) yang selalu menyemangati, menemani, menuntun serta menghibur dalam suka dan duka. vii

8 viii 7. Teman teman penelitian (Inditia Rara P., Darmuti, Novi Widayanti, Lina Nur Afifah, Vika Lawnia, Berlian Bunya Rista, Akbar Arifurrohman, Yunita, dan Suci Dwi R) yang telah membantu penulis selama penelitian. 8. Teman teman Program Studi Pendidikan Biologi Universitas Muhammadiyah Purwokerto terimakasih atas bantuan, semangat, dan dukungannya selama ini. 9. Bapak dan Ibu pemilik Kost Begonia dan teman teman Kost Begonia yang senantiasa memberikan kasih sayang, pengertian, dan perhatiannya selama ini. 10. Semua pihak yang membantu terselesaikannya penulisan skripsi. Penulis menyadari bahwa dalam penyusunan skripsi ini masih terdapat banyak kekurangan bahkan jauh dari sempurna. Oleh karena itu, penulis mengharapkan adanya kritik dan saran yang bersifat membangun demi kesempurnaan skripsi ini. Demikian, semoga dengan terselesaikannya skripsini berguna bagi para pembaca pada umumnya dan khususnya bagi penulis serta Program Studi Pendidikan Biologi. Wassalamu alaikum wr. wb. Purwokerto, 21 Januari 2017 Penulis, viii

9 ix ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI BERPOTENSI PROBIOTIK DARI ORGAN PENCERNAAN IKAN PATIN (Pangasius hypophthalmus) ABSTRAK Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan mengidentifikasi bakteri probiotik pada organ pencernaan (lambung dan unsus) ikan Patin (Pangasius hypophthalmus). Penelitian telah dilaksanakan pada bulan Agustus November Isolasi dilakukan dengan mengambil bagian organ lambung dan usus ikan Patin. Seleksi bakteri probiotik dilakukan dengan memasukkan organ lambung dan usus ikan Patin kedalam larutan NaCl 0,9% ph 2 kemudian diencerkan pada pengenceran 10-1 dilanjutkan menanam secara pour plate pada medium Tryptone Soya Agar. Isolat murni yang diperoleh sebanyak 7 isolat, kemudian diidentifikasi berdasarkan pengamatan makroskopis sel, mikroskopis sel, dan uji biokimia aktivitas sel bakteri.isolat bakteri diidenfikasi menggunakan buku Bergey s Manual Determinative of Bacteriologgy (Holt et al., 1994). Hasil identifikasi terdapat 5 genus bakteri diantaranya Enterobacter, Bacillus, Pseudomonas, Neisseria, dan Azomonas. Kelima genus tersebut ketika di uji antagonistik terhadap bakteri patogen (Aeromonas hydrophylla) genus Azomonas tidak dapat menghambat bakteri A. hydrophylla. Berdasarkan hasil penelitian, 7 isolat bakteri memiliki potensi sebagai bakteri probiotik. Kata Kunci : Bakteri Probiotik, Identifikasi, Ikan Patin, Isolasi. ix

10 x ISOLATION AND IDENTIFICATION OF PROBIOTIC BACTERIA FROM CATFISH DIGESTIVE ORGAN (Pangasius hypophthalmus) ABSTRACT The research aims to isolate and identify probiotic bacteria in digestive organ (stomach and intestine) of cathfish (Pangasius hypophthalmus). This research was conducted from July to November The isolation was done by taking the parts of stomach and catfish intestine. Probiotic bacteria selection was done by entering the stomach and intestine of catfish into liquid of NaCl 0,9% ph 2 then it was diluted 10-1 dilution, after that planted using pour plate in Tryptone Soya Agar medium. In order to obtain 7 isolats, it was identified based on the observation of cell macroscopic, cell microscopic, and biochemical test on bacteria cell activity. Bacterium isolat was identified using Bergey s Manual Determinative of Bacteriology book (Holt et al., 1994). The result showed that there were 5 genus of bacterianamely Enterobacter, Bacillus, Pseudomonas, Neiseria, and Azomonas. When those five genus were tested antagonistic to patogen bacterium (Aeromonas hydrophylla), Azomonas genus could not impede A. hydrophylla bacterium. Based on the research, seven isolate bacteria had the potential as the probiotic bacterium. Keyword: Probiotic Bacterium, Catfish, Isolation, Identification. x

11 xi DAFTAR ISI Halaman UCAPAN TERIMAKASIH... vii DAFTAR ISI... xi DAFTAR TABEL... xiv DAFTAR GAMBAR... xv DAFTAR LAMPIRAN... xvii BAB I PENDAHULUAN 1.1 Latarbelakang Permasalah Perumusan Masalah Tujuan Penelitian Manfaat Penelitian... 4 BAB II TINJAUAN PUSTAKA 2.1 Isolasi Bakteri Identifikasi Bakteri Ukuran Bakteri Bentuk Bakteri Pewarnaan Bakteri Probiotik Karakteristik Probiotik Mekanisme Kerja Bakteri Probiotik Ikan Patin (Pangasius hypophthalmus) Klasifikasi Ikan Patin Morfologi Ikan Patin xi

12 xii Sifat Biologis Ikan Patin Bakteri Aeromonas hydrophylla Klasifikasi Bakteri Aeromonas hydrophylla Morfologi Bakteri Aeromonas hydrophylla Habitat Bakteri Aeromonas hydrophylla Patogenitas Bakteri Aeromonas hydrophylla BAB III METODE PENELITIAN 3.1 Tempat dan Waktu Alat dan Bahan Alat Bahan Metode Penelitian Cara Kerja Sterilisasi Alat dan Bahan Pengambilan Sampel Pembuatan Medium Isolasi Bakteri Probiotik Tahap Pemurnian Kultur Bakteri Pemeliharaan Pengamatan Karakteristik Bakteri Uji Biokimia Terhadap Isolat Seleksi Bakteri Probiotik Identifikasi Bakteri xii

13 xiii Analisis Data BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN 4.1 Hasil Isolasi dan Identifikasi Bakteri Hasil pengamatan Karakteristik Makroskopis Koloni Bakteri Hasil pengamatan Karakteristik Mikroskopis Sel Bakteri Hasil Uji Biokimia Pembahasan Uji Biokimia Positif Karakteristik Bakteri Probiotik Uji Sensitifitas Bakteri Probiotik dengan Bakteri Patogen BAB V KESIMPULAN DAN SARAN 5.1 Kesimpulan Saran DAFTAR PUSTAKA LAMPIRAN LAMPIRAN xiii

14 xiv DAFTAR TABEL Halaman Tabel 4.1. Kode Isolat Tabel 4.2. Morfologi koloni bakteri probiotik pada cawan petri Tabel 4.3. Pengamatan mikroskopis bentuk sel bakteri Tabel 4.4. Karakteristik isolat LUP Tabel 4.5. Karakteristik isolat LUP-02 dan LUP Tabel 4.6. Karakteristik isolat LUP-03 dan LUP Tabel 4.7. Karakteristik isolat LUP Tabel 4.8. Karakteristik isolat LUP Tabel 4.9. Isolat bakteri hasil identifikasi Tabel 4.10 Diameter zona hambat bakteri probiotik Terhadap bakteri Aeromonas hydrophylla xiv

15 xv DAFTAR GAMBAR Halaman Gambar 4.1. Hasil pengamatan motilitas bakteri probiotik menujukkan semua bakteri motil. (Bakteri A = LUP-01; B = LUP-02; C = LUP-03; D = LUP-04; E = LUP-05; F = LUP-06; G = LUP- 07) Gambar 4.2. Hasil uji fermentasi karbohidrat dilakukan pada 7 isolat calon bakteri probiotik menunjukkan bahwa bakteri A,B,C,D,F,G, dapat memfermentasi laktosa dan sukrosa, tidakmenghasilkan gas, sedangkan bakteri E tidak dapat memfermentasikan karbohidrat dan tidak menghasilkan gas.(bakteri A = LUP- 01; B = LUP-02; C = LUP-03; D = LUP-04; E = LUP-05; F = LUP-06; G = LUP-07) Gambar 4.3. Hasil uji MR dilakukan pada 7 isolat probiotik adalah (MR +) dengan warna merah pada permukaan medium. (Bakteri A = LUP-01; B = LUP-02; C = LUP-03; D = LUP-04; E = LUP- 05; F = LUP-06; G = LUP-07) Gambar 4.4. Hasil uji VP dilakukan pada 7 isolat bakteri calon probiotik adalah (VP +) dengan warna merah pada medium sedangkan (VP -) dengan warna kuning pada medium. (Bakteri A = LUP-01; B = LUP-02; C = LUP-03; D = LUP-04; E = LUP- 05; F = LUP-06; G = LUP-07) Gambar 4.5. Hasil uji indol dilakukan pada 8 isolat bakteri calon probiotik adalah (indol +) dengan warna merah pada permukaan medium. (Bakteri A = LUP-01; B = LUP-02; C = LUP-03; D = LUP-04; E = LUP-05; F = LUP-06; G = LUP-07) Gambar 4.6. Zona hambat isolate bakteri calon probiotik (isolate A, B, C, D, E, F, G,) terhadap bakteri A. hidrophylla. (Bakteri A = LUP-01;B = LUP-02; C = LUP-03; D = LUP-04; E = LUP- 05; F = LUP-06; G = LUP-07) Gambar 4.7.Persamaan reaksi penguraian H2O2 oleh enzim Katalase (Cappucino & Sherman, 1987) Gambar 4.8. Persamaan reaksi perubahan warna pada medium uji VP (Capucino & Sherman, 1987) xv

16 xvi Gambar 4.9. Persamaan reaksi fermentasi karbohidrat (Cappuccino & Sherman, 1987) Gambar Persamaan reaksi perubahan warna pada medium VP (Cappuccino & Sherman, 1987) Gambar Reaksi penguraian Tryptophan oleh enzim Tryptophanase (Cappuccino & Sherman, 1987) xvi

17 xvii DAFTAR LAMPIRAN Halaman Lampiran Lampiran Lampiran Lampiran Lampiran xviii