Mitwoch U Sex reversal in the horse: 2 sides of a common coin. Equine Veterinary Journal 29: Nei M dan Kumar S

Transkripsi

1 DAFTAR PUSTAKA Anderson et al Sequence and the organization mitochondrial genom. Nature 290: Arikunto Manajemen Penelitian. Bandung : Penerbit Rhenika Citra. Aripin AY Analisa homologi gen penyandi kode genetik sifat-sifat produksi pada ternak sapi, domba dan kambing [tesis]. Bogor : Sekolah Pascasarjana, Institut Pertanian Bogor. Arnason T, Van Vleck LD Genetic improvement of the horse. Di dalam: Bowling AT, Ruvinsky A. editor. The Genetic of Horse. New York: Cabi publishing. hlm Bowling AT Validation of microsatellite markers for routine horse parantege testing. Animal Genetics 29: Bowling AT Historical development and application of moleculer genetic test for horse identification and parantage control. Livestock Production Science 31: Bowling AT, Ruvinsky A Genetic aspect of domestication breed and the origins. Di dalam: Bowling AT, Ruvinsky A. editor. The Genetic of Horse. New York: Cabi publishing. hlm Chowdary BP, Raudsepp T Cytogenetic and physical gene maps. Di dalam: Bowling AT, Ruvinsky A. editor. The Genetic of Horse. New York: Cabi publishing. hlm [DSN] Dewan Standarisasi Nasional Standar Nasional Indonesia Nomor 01/4226/1996 tentang Kuda Pacu Indonesia. Jakarta: DSN. Edward EH Ensyclopedy of Horse. New York: McGraw Hill. Goodenough U Genetika. Ed ke-3. Jakarta: Erlangga. Groves CP, Ryder OA Systematics and phylogeny of the horse. Di dalam: Bowling AT, Ruvinsky A. editor. The Genetic of Horse. New York: Cabi publishing. hlm Ishida N, Hasegawe T, Oyunsuren T, Mukoyama H PCR-RFLP analysis of the cytochrome b gene in horse mitochondrial DNA. Animal genetic 76: Kirby LT DNA Fingerprinting. Japan : Stocton Press. Kocher et al Dynamic of mitchondrial DNA evolution in animal: amplification and sequensing with conserved primer. Natural Academy Science 86: Mendez JA, Pereira AB, Avellanet R, Dzama K, Jordana J Mitchondrial DNA variation and genetic relationships in Spanish Donkey (Equus asinus). Journal of Animal Breeding and Genetics 121:

2 Mitwoch U Sex reversal in the horse: 2 sides of a common coin. Equine Veterinary Journal 29: Nei M dan Kumar S Molecular Evolution and Phylogenetics. Oxford University Press. Nilson MA, Gullberg A, Spotorno AE, Arnason U, Janke A Radiation of extant marsupials after The K/T boundary evidence from complete mitochondrial genomes. Journal Molecular Evolution 57: Rashidi HH, Bucher LK Bioinformatics Basic Application I Biological Science and Medicine. CRC Press. Saastamomen MT, Barrey Genetics of Conformation, locomotion and Physiological. Di dalam: Bowling AT, Ruvinsky A. editor. The Genetic of Horse. New York: Cabi publishing. hlm Soeharjono O Kuda. Jakarta: Yayasan Pamulang Equstrian Centre. Yang et al Phylogenetic relationships of Cheju Horse to other horse breeds as determined by mtdna D-loop sequence polymorphism. Animal Genetic 129:

3 Cooper A, Chauvire CM, Chamber GK, Haeseler AV, Wilson AC, and Paabo S Indefendent Origin of New Zealand Moas and Kiwis. Proc. Natl. Acad.Sci. Vol 89, pp USA. Gasfersz V Metode Perancangan Percobaan. Penerbit Armico, Bandung Geor R RaciHarerra M, Rodero E, Gutierrez MJ, Pena F and Rodero JM Application of multifactorial diskriminant analysis in the morphostructural differentiation of Andalusian caprine breed. Small ruminant research Elsevier Scienceng Toward Injury. Lindgren G, Sandberg K, Persson H, Marklund S, Breen M, Sandgren B, Caristen J, and Ellegren E A Primary male autosomal linkage map of the horse genome. www. Genome. Org. Wah. Reuters. www. Kompas.com Stell RGD dan Torrie RA Prinsip dan Prosedur Statiska. Terjemahan Bambang Sumantri. Gramedia Pustaka Utama, Jakarta.

4 TB (x1) PB (x2) LD (x3) PBH (x4) TPG (x5) time Jarak Kecepatan Time in S 154, ,2 0, , , ,5 1, , , , , , , , , , , , , , , , ,5 1, , ,5 1, , , , ,1 1, , ,5 137, ,1 1, , , , , ,5 1, , , , , ,8 147, ,5 1, , , , , , , , , ,3 148, ,2 1, , , , , , , , , ,5 1, , ,5 148, ,5 1, , , , , , , , , , , ,07 73

5 DNA mitokondria hean mempunyai ukuran 80 kb samapi600 kb. lebih rendah dibandingkan mitokondria pada tanaman. eva 2005 Mitokondria adalah rangkaian organela yang unik karena memiliki DNA tersendiri yang disebut DNA mitokondria dengan sifat-sifat yang spesifik MITOKONDRIA DNA mitokondria manusia merupakan DNA sirkuler tertutup yang berada pada matriks mitokondria yang mengandung 37 gen, dan berukuran pasang basa. Dua puluh empat gen (24) diperlukan untuk translasi mtdna [2 RNA ribosom (rrnas) dan 22 RNA transfer (trna)] dan 13 mengkode subunit rantai respirasi, dengan perincian sebagai berikut: 7 subunit untuk kompleks I [ND1, ND2, ND3, ND4, ND4L, ND5 DAN ND6 (ND singkatan dari NADH dehydrogenase)], 1 subunit untuk kompleks III (sitokrom b), 3 subunit untuk sitokrom oksidasi (COX1,II,III) serta 2 subunit untuk ATP sintetase. Sebagian rantai respirasi dikode oleh DNA nukleus. Genetika mitokondria berbeda dengan hukum Mendel dalam 3 aspek utama: diturunkan dari ibu, heteroplasmi dan segregasi mitotik. 1. Diturunkan dari ibu Secara hukum umum, semua DNA mitokondria dalam zigot berasal dari ovum. Sehingga seorang ibu membawa mutasi mtdna pada semua anak-anaknya, tetapi hanya anak perempuannya yang akan memindahkan mutasi tersebut pada keturunannya. Bukti baru transmisi paternal mtdna pada otot rangka (tetapi tidak pada jaringan lain) pada pasien dengan miopati mitokondria memberikan peringatan penting bahwa sifat mtdna yang diturunkan dari ibu bukan merupakan hukum yang mutlak, tetapi tidak disangkal bahwa penyakitpenyakit yang berhubungan dengan mtdna terutama diturunkan dari pihak ibu Santosa, et al 2005 Mutations in the mitochondrial DNA are one of the most important causes of sensorineural hearing loss, especially in the 12S ribosomal RNA (rrna) gene Balana Et al 2006

6 DNA mitokondria, sesuai dengan namanya, merupakan rantai DNA yang terletak di bagian sel yang bernama mitokondria. DNA mitokondria memiliki ciri-ciri yang berbeda dari DNA nukleus ditinjau dari ukuran, jumlah gen, dan bentuk. Besar genom pada DNA mitokondria relatif kecil apabila dibandingkan dengan genom DNA pada nukleus. Ukuran genom DNA mitokondria pada tiap tiap organisme sangatlah bervariasi. Pada manusia ukuran DNA mitokondria adalah 16,6 kb, sedangkan pada Drosophila melanogaster kurang lebih 18,4 kb. Pada khamir, ukuran genom relatif lebih besar yaitu 84 kb. Tidak seperti DNA nukleus yang berbentuk linear, mtdna berbentuk lingkaran. Sebagian besar mtdna membawa gene yang berfungsi dalam proses respirasi sel. Eksperimen yang dilakukan dengan menghilangkan mtdna pada S. cerevisceae menunjukan penurunan tingkat pertumbuhan yang signifikan yang ditandai dengan mengecilnya ukuran sel. gen sitokrom b berevolusi relatif lambat karena semua jenis suku Varanidae walaupun berada pada anak marga yang berbeda tetapi perbedaan sekuens sitokrom b relatif kecil. Irvan 2003 Sedangkan DNA yang berada pada mitokondria hanya diturunkan dari ibu kepada anak-anaknya. Keunikan pola pewarisan DNA mitokondria menyebabkan DNA mitokondria dapat digunakan sebagai marka untuk mengidentifikasi hubungan kekerabatan secara maternal.eijkmen Institute 2006 DNA mitokondria, yakni sitokrom b dapt dijadikan marka untuk mengetahui variasi DNA dalam sebuah populasi (wardhana dan Muharsini Pewarisan sepihak (ayah tidak ikut campur) ini membuat rekombinasi tidak dijumpai pada mtdna. Demikian juga, dalam penelusuran gen yang membawa berbagai penyakit yang diturunkan, mtdna telah terbukti terlibat dalam sejumlah pewarisan penyakit tersebut. Kendati begitu, pewarisan sifat genetik tidak selamanya berakibat suatu penyakit. Sejumlah mutasi dan variasi lain di dalam gen ternyata juga dapat terjadi secara alamiah dan tidak membawa akibat buruk kepada si pemilik, kecuali menyebarkan variasi individu yang khas. Sifat ini dikenal sebagai polimorfisme genetik. Dalam penelusuran asal-usul manusia dan pencarian hubungan kekerabatan antarberbagai ras dan suku, sifat polimorfisme inilah yang dipakai untuk menentukan atau membedakan ras yang satu dengan yang lain. Lantaran mtdna dapat berubah oleh adanya proses mutasi sehingga menghasilkan suatu variasi, dan karena variasi tersebut diwariskan, jauh-dekatnya kekerabatan kelompok etnik dapat dilihat dari persamaan variasi yang dimiliki suatu populasi. Variasi mtdna di dalam populasi

7 dapat berupa penggantian (substitusi), penyisipan (insersi), atau penghapusan (delesi) basa pada satu atau beberapa nukleotida tanpa menyebabkan suatu kelainan atau penyakit. DNA mitokondria tersusun atas unit pasangan basa (nukleotida) dalam setiap lingkarannya. Setiap unit merupakan kombinasi dari basa-basa adenin (A), guanin (G), sitosin (C), dan timin (T). Dengan kecepatan mutasi 5-10 kali lebih cepat daripada DNA inti, molekul mtdna sangat polimorfik alias beragam. Beatricia Iswari/G. Sujayanto, 2003

8 Lampiran 6. Kecepatan = 22,1-0,0453 PB (x2) Penduga Coef SE Coef T P Konstanta 22,147 3,172 6,98 0,000 PB (x2) -0, , ,07 0,026 S = 0, R-Sq = 27.4% R-Sq(adj) = 16,2% Analysis of Variance Source DF SS MS F P Regression 1 2,3801 2,3801 4,30 0,026 Residual Error 16 8,8660 0,5541 Total 17 11,2461