SKRIPSI. ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum)

Transkripsi

1 SKRIPSI ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum) Oleh : INDAH DEWI M.J H PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SEBELAS MARET SURAKARTA 2016 i

2 ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum) SKRIPSI untuk memenuhi sebagian persyaratan guna memperoleh (derajat) Sarjana Pertanian di Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret Surakarta Oleh : Indah Dewi M.J H PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SEBELAS MARET SURAKARTA 2016 ii

3 SKRIPSI ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum) Indah Dewi M.J H Pembimbing Utama Pembimbing Pendamping Dr. Ir. Sri Hartati, M.P Dra. Linayanti Darsana, M.Si NIP NIP Surakarta, 2016 Universitas Sebelas Maret Surakarta Fakultas Pertanian Dekan Prof. Dr. Ir. Bambang Pudjiasmanto, M.S NIP iii

4 SKRIPSI ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum) yang dipersiapkan dan disusun oleh Indah Dewi M.J H telah dipertahankan di depan Tim Penguji pada tanggal: 2016 dan dinyatakan telah memenuhi syarat untuk memperoleh gelar (derajat) Sarjana Pertanian Program Studi Agroteknologi Susunan Tim Penguji : Ketua Anggota I Anggota II Dr. Ir. Sri Hartati, M.P Dra. Linayanti Darsana, M.Si Dr. Ir. Parjanto M.P NIP NIP NIP iv

5 PERNYATAAN Dengan ini saya Nama: Indah Dewi M.J, NIM: H , Program Studi Agroteknologi, menyatakan bahwa dalam skripsi saya yang berjudul ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum) ini tidak terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar akademik dan sepanjang pengetahuan penulis juga tidak ada unsur plagiarisme, fabrikasi karya, data atau pendapat yang pernah ditulis dan dipublikasikan oleh penulis lain kecuali yang secara tertulis diacu dalam naskah ini dan disebutkan dalam daftar pustaka. Surakarta, 2016 Yang menyatakan Indah Dewi M.J H v

6 KATA PENGANTAR Segala Puji bagi Allah SWT atas segala limpahan rahmat-nya kepada penulis sehingga penyusunan skripsi ini dapat terselasaikan dengan baik tanpa halangan yang berarti. Penulis sadari bahwa dalam penyusunan skripsi ini tidak terlepas dari bantuan berbagai pihak. Oleh karena itu penulis sampaikan terimakasih kepada: 1. Prof. Dr. Ir. Bambang Pudjiasmanto, MS selaku Dekan Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret Surakarta 2. Prof. Dr. Ir. Hadiwiyono, M.Si selaku Ketua Program Studi Agroteknologi Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret Surakarta. 3. Dr. Ir. Sri Hartati, MP selaku Pembimbing Utama yang dengan sabar memberikan saran, pengarahan, bimbingan dan bantuan biaya penelitian kepada penulis sehingga skripsi ini dapat diselesaikan. 4. Dra. Linayanti Darsana, M.Si selaku Pembimbing Pendamping yang telah memberikan pengarahan, bimbingan dan motivasi sehingga skripsi ini dapat diselesaikan 5. Dr. Ir. Parjanto MP selaku Dosen Pembahas yang telah memberikan masukan dan saran pada skripsi ini. 6. Prof. Dr. Ir Sulandjari, MS selaku Pembimbing Akademik yang telah memberikan bimbingan dan pengarahan akademik. 7. Keluarga tercinta, Bapak Subiyanto S.Pd, Ibu Nurul Hidayah, Kakak Novi Farida Nurjannah S.Pd M.Pd, Adik Rizky Setyo Nurahmadi atas doa dan dukungannya baik yang bersifat moril maupun materil. 8. Teman-teman Agroteknologi 2009 yang telah membantu dan mendukung penulis selama penelitian dan penyusunan skripsi. 9. Semua pihak yang telah membantu dan mendukung penulis selama penelitian dan penyusunan skripsi Penulis menyadari bahwa dalam penulisan skripsi ini masih jauh dari sempurna, oleh karena itu kritik dan saran yang bersifat membangun sangat diharapkan vi

7 Akhir kata, semoga skripsi ini dapat bermanfaat bagi yang berkepentingan dan pembaca pada umumnya. Surakarta, 2016 Penulis vii

8 DAFTAR ISI Halaman KATA PENGANTAR... vi DAFTAR ISI... viii DAFTAR TABEL... x DAFTAR GAMBAR... xi DAFTAR LAMPIRAN... xii RINGKASAN... xiii SUMMARY... xiv I. PENDAHULUAN... 1 A. Latar Belakang... 1 B. Rumusan Penelitian... 2 C. Tujuan Penelitian... 3 D. Hipotesis Penelitian... 3 II. TINJAUAN PUSTAKA... 4 A. Klasifikasi Anggrek... 4 B. Kromosom... 7 C. Kariotipe III. METODE PENELITIAN A. Waktu dan Tempat Penelitian B. Bahan dan Alat C. Cara Kerja Penelitian D. Variable pengamatan E. Analisis Data IV. HASIL DAN PEMBAHASAN A. Jumlah Kromosom B. Ukuran Kromosom C. Bentuk Kromosom D. Kariotipe Kromosom viii

9 DAFTAR ISI (Lanjutan) V. KESIMPULAN DAN SARAN A. Kesimpulan B. Saran DAFTAR PUSTAKA LAMPIRAN ix

10 DAFTAR TABEL Nomor Dalam Teks Halaman 1 Bentuk Kromosom Berdasarkan Rasio Lengan Kromosom Jumlah Kromosom Anggrek Alam Jawa Timur Ringkasan Kisaran Panjang Total Kromosom Anggrek Alam Jawa Timur (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum) Bentuk Kromosom dan Pola kariotipe Anggrek Alam Jawa Timur (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum) Nilai Indeks Asimetri Intrakromosomal (A1) dan Indeks Asimetri Interkromosomal (A2) Anggrek Alam Jawa Timur (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum). 26 Dalam Lampiran 1 Ukuran dan Bentuk Kromosom Anggrek Paphiopedilum glaucophyllum Ukuran dan Bentuk Kromosom Anggrek Coelogyne speciosa Ukuran dan Bentuk Anggrek Dendrobium crumenatum x

11 DAFTAR GAMBAR Nomor Dalam Teks Halaman 1 Anggrek Paphiodilum glaucophyllum Anggrek Coelogyne speciosa Anggrek Dendrobium crumenatum Kromosom Anggrek Paphiodilum glaucophyllum Kromosom Anggrek Coelogyne speciosa Kromosom Anggrek Dendrobium crumenatum Kariogram Paphiodilum glaucophyllum Kariogram Coelogyne speciosa Kariogram Dendrobium crumenatum Idiogram Paphiodilum glaucophyllum Idiogram Coelogyne speciosa Idiogram Dendrobium crumenatum Dalam Lampiran 1 Pemotongan akar Ujung Akar Paphiopedilum glaucophyllum Ujung Akar Coelogyne speciosa Ujung Akar Dendrobium crumenatum xi

12 DAFTAR LAMPIRAN Nomor Judul Halaman 1 Tabel1. Ukuran dan Bentuk Kromosom Anggrek Paphiopedilum glaucophyllum Tabel 2. Ukuran dan Bentuk Kromosom Anggrek Coelogyne speciosa Tabel 3. Ukuran dan Bentuk Anggrek Dendrobium crumenatum Gambar 1. Pemotongan akar Gambar 2. Ujung Akar Paphiopedilum glaucophyllum Gambar 3. Ujung Akar Coelogyne speciosa Gambar 4. Ujung Akar Dendrobium crumenatum xii

13 RINGKASAN ANALISIS KROMOSOM PADA ANGGREK ALAM JAWA TIMUR (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum).skripsi : Indah Dewi M.J (H ). Pembimbing Sri Hartati, Linayanti Darsana, Parjanto. Program Studi: Agroteknologi, Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret (UNS) Surakarta. Anggrek Alam yang ada di Jawa Timur populasinya sangat beragam, namun jumlahnya di habitat asli sangat terbatas. Pemuliaan tanaman dapat digunakan untuk melestarikan dan membudidayakan tanaman anggrek. Salah satu faktor yang mendukung keberhasilan pemuliaan tanaman dengan mengetahui informasi genetik. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui informasi genetik berupa jumlah, bentuk, ukuran, dan kariotipe kromosom. Diharapkan dengan adanya informasi genetik tersebut dapat digunakan sebagai dasar dalam pemuliaan tanaman untuk mendapatkan varietas unggul dan perbaikan sifat tanaman. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Oktober Februari 2016 di Laboratorium Fisiologi dan Bioteknologi Fakultas Pertanian Universitas Sebelas Maret Surakarta. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah metode squash (pencet) pada ujung akar tanaman anggrek. Metode squash dilakukan dengan beberapa tahap meliputi: Pra-perlakuan selama 24 jam dengan 8-Hydroxyquinoline 0,002 M pada suhu 6ºC, Fiksasi dengan asam acetat glacial 45% selama 2 jam, hidrolisis dengan larutan HCL 1N di dalam oven suhu 65ºC selama 3 menit, Pewarnaan larutan aceto orcein 2% selama 24 jam, dilanjutkan squashing dan penyegelan. Pengamatan dilakukan dengan mikroskop cahaya. Variabel yang diamati adalah jumlah kromosom, ukuran kromosom, bentuk kromosom dan kariotipe kromosom. Data hasil pengamatan dianalisis secara deskriptif berdasarkan pengamatan dari gambar kromosom hasil pemotretan dan data pengamatan ukuran dan bentuk kromosom. Hasil penelitian menunjukkan Anggrek Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa dan Dendrobium crumenatum memiliki kesamaan jumlah kromosom yaitu n = 19 dengan 2n=38. Anggrek P. glaucophyllum memiliki ukuran kromosom 4.26 ± 014 sampai 9.73 ± 019 µm. Anggrek C. speciosa memiliki ukuran kromosom 0.35 ± 0.03 sampai 6.30 ± 0.84 µm. Anggrek D. crumenatum 2.46 ± 0.20 sampai 5.33 ± 0.02 µm. Bentuk kromosom Anggrek P.glaucophyllum, C.speciosa dan D.crumenatum dominan metasentrik. Susunan pola kariotipe Anggrek P.glaucophyllum adalah 2n = 38 m, C.speciosa adalah 2n = 36 m + 2 ak dan D. crumenatum adalah 2n = 38 m. xiii

14 SUMMARY ANALYSIS CHROMOSOMES ON EAST JAVA-NATURAL ORCHIDS (Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa and Dendrobium crumenatum). Thesis: Indah Dewi M.J (H ). Consultant: Sri Hartati, Linayanti Darsana, Parjanto. Agrotechnology Study Program, Agricultural Faculty of Surakarta SebelasMaret University (UNS). Natural Orchid existing in East Java has very diverse population, but its number in original habitat is very limited. Plant breeding can be used to conserve and to breed orchid plant. One factor supporting a successful plant breeding by find out genetic information. This research aimed to find out genetic information constituting number, form, size, and chromosome karyotype. The presence of genetic information is expected to be used as the foundation in plant breeding in order to get superior variety and to improve the properties of plant. This research was conducted on October 2015 to February 2016 in Physiological and Biotechnological Laboratories of Agricultural Faculty of Surakarta Sebelas Maret University. The method employed in this research was squash method in the root tip of orchid plant. Squash method was conducted in some stages included: Pre-treated for 24 hours with 8-Hydroxiquinoline 0,002 M at temperature of 6 C, fixed with glacial acetic acid of 45% for 2 hours, hydrolysis with HCL 1 N in oven at 65 o C for 3 minutes, coloring with acetoorcein solution 2% for 24 hours, followed with squashing and sealing. Observation was conducted using light microscope. The variables observed included: chromosome number, chromosome size, chromosome size, and chromosome karyotype. The data obtained from the result of observation was analyzed descriptively based on observation on chromosome picture resulting from portraying, and chromosome size and form. The result of research showed that Paphiopedilum glaucophyllum, Coelogyne speciosa and Dendrobium crumenatum orchids had chromosome number similarity, n = 19, with 2n = 38. P. glaucophyllum orchid had chromosome size ranging between 4.26 ± 014 and 9.73 ± 019 µm. C. speciosa orchid had chromosome size ranging between 0.35 ± 0.03 and 6.30 ± 0.84 µm. D. crumenatum orchid had chromosome size ranging between 2.46 ± 0.20 and 5.33 ± 0.02 µm. The chromosome form of P. glaucophyllum, C. speciosa and D.crumenatum orchid was dominantly metacentric. Karyotype pattern structure of P. glaucophylum orchid was 2n = 38 m, C. speciosa was 2n = 36 m + 2 ak and D. crumenatum was 2n = 38 m. xiv