EKSPLORASI BAKTERI DAN CENDAWAN RIZOSFER YANG BERASOSIASI DENGAN PENYAKIT BUSUK BASAH PADA BATANG PEPAYA (Carica papaya L.) DI PASIR KUDA, DESA CIOMAS, BOGOR ANGGIE FERFINIA DEPARTEMEN PROTEKSI TANAMAN FAKULTAS PERTANIAN INSTITUT PERTANIAN BOGOR 2010
EKSPLORASI BAKTERI DAN CENDAWAN RIZOSFER YANG BERASOSIASI DENGAN PENYAKIT BUSUK BASAH PADA BATANG PEPAYA (Carica papaya L.) DI PASIR KUDA, DESA CIOMAS, BOGOR ANGGIE FERFINIA A34052316 Skripsi sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Sarjana Pertanian pada Departemen Proteksi Tanaman, Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor DEPARTEMEN PROTEKSI TANAMAN FAKULTAS PERTANIAN INSTITUT PERTANIAN BOGOR 2010
Judul Skripsi Nama Mahasiswa : Anggie Ferfinia NRP : A34052316 : Eksplorasi Bakteri dan Cendawan Rizosfer yang Berasosiasi dengan Penyakit Busuk Basah pada Batang Pepaya (Carica papaya L.) di Pasir Kuda, Desa Ciomas, Bogor Menyetujui Dosen Pembimbing Ir. Ivonne Oley Sumarauw, M.Si NIP. 1949 02 08 1976 032 002 Mengetahui Ketua Departemen Proteksi Tanaman Dr. Ir. Dadang, M.Sc NIP. 1964 02 04 1990 021 002 Tanggal lulus:
RIWAYAT HIDUP Penulis dilahirkan di Bogor, 17 Juli 1987, dari pasangan Zainal Arifien dan Ferry Firdaus. Penulis merupakan anak ketiga dari tiga bersaudara. Penulis telah menyelesaikan pendidikan formal dari SMAN 7 Bogor pada tahun 2005. Pada tahun yang sama penulis diterima di IPB melalui jalur SPMB dan tercatat sebagai mahasiswa Departemen Proteksi Tanaman, Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor pada tahun 2006.
PRAKATA Puji syukur penulis panjatkan kepada Allah SWT untuk setiap petunjuk dan kemudahan yang senantiasa diberikan kepada penulis sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Sarjana Pertanian pada Departemen Proteksi Tanaman, Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor. Penulis menyampaikan terima kasih yang sebesar-besarnya kepada Ir. Ivonne Oley Sumarauw, M.Si sebagai pembimbing tugas akhir. Ucapan terima kasih juga diucapkan kepada Dr. Ir. I Wayan Winasa, M.Si selaku dosen penguji tamu yang telah memberikan saran dan masukan kepada penulis dalam penyusunan skripsi ini, serta Dr. Ir. Kikin Hamzah Mutaqin, M.Si sebagai pembimbing akademik selama masa perkuliahan. Penulis mengucapkan terima kasih kepada semua teman di Laboratorium Bakteriologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman, serta keluarga besar HPT angkatan 42 atas doa, dukungan, dan bantuannya. Terima kasih yang sebesar-besarnya kepada orang tua penulis, Ayah dan Ibu tercinta, Firza, Zarmy, Rafi serta seluruh keluarga atas semangat, kasih sayang dan dorongan yang telah diberikan. Penulis menyadari bahwa tulisan ini masih memiliki kekurangan, tetapi penulis berharap semoga tulisan ini dapat bermanfaat. Bogor, Januari 2010 Penulis
DAFTAR ISI Halaman DAFTAR TABEL... viii DAFTAR GAMBAR...ix DAFTAR LAMPIRAN...xi PENDAHULUAN...1 Latar Belakang...1 Tujuan...2 TINJAUAN PUSTAKA...3 Arti Penting Tanaman Pepaya...3 Agroekologi...4 Penyakit Tanaman Pepaya...4 Penyakit Busuk Basah pada Batang Pepaya...4 Rizosfer...5 BAHAN DAN METODE...7 Tempat dan Waktu...7 Bahan dan Alat...7 Metode Penelitian...7 Pra-Pengamatan atau Survei...7 Penentuan Tanaman Contoh dan Pengambilan Tanah...8 Isolasi Mikroorganisme Rizosfer...8 Identifikasi...8 Bakteri...8 Cendawan...12 HASIL DAN PEMBAHASAN...13 Penentuan Tanaman Contoh dan Pengambilan Tanah...13 Isolasi Mikroorganisme Rizosfer...13 Identifikasi...14 Bakteri...14 Hasil Uji Gram (KOH 3%)...14 Hasil Uji Oksidatif/fermentatif...14
Hasil Uji Pembentukan Endospora...15 Hasil Uji Fluoresensi...15 Hasil Uji Levan...16 Hasil Uji Oksidase...17 Hasil Uji Pembusukkan pada Kentang...17 Hasil Uji Arginine dihydrolase...18 Hasil Reaksi hipersensitif...19 Hasil Uji Pertumbuhan pada media YDC...20 Hasil Uji Pertumbuhan pada media TZC...20 Hasil Uji Pertumbuhan pada media D1M Agar...21 Cendawan...21 Keanekaragaman Mikroorganisme Rizosfer...23 KESIMPULAN DAN SARAN...29 Kesimpulan...29 Saran...29 DAFTAR PUSTAKA...30 LAMPIRAN...32 Komposisi Bahan untuk Isolasi dan Identifikasi Bakteri dan Cendawan...32 Kunci Identifikasi Bakteri (Schaad et al. 2001)...36 Kunci Identifikasi Cendawan (Watanabe 1993)...37
DAFTAR TABEL Halaman 1. Hasil identifikasi cendawan pada tanah tanaman terinfeksi dan tidak terinfeksi penyakit busuk basah pada batang...22 2. Keanekaragamanan mikroorganisme rizosfer pada tanah tanaman pepaya terinfeksi dan tidak terinfeksi penyakit busuk basah pada batang...24
DAFTAR GAMBAR Halaman 1. Contoh tanah di sekitar perakaran yang diambil (a) dan gejala busuk basah pada batang pepaya (b)..... 13 2. Reaksi bakteri Gram-negatif (a) dan bakteri Gram-positif (b) dalam uji Gram...14 3. Hasil uji oksidatif/fermentatif. Bakteri bersifat oksidatif (a), bakteri bersifat fermentatif (b)....15 4. Hasil uji Fluoresensi pada media King s B. Reaksi positif (kiri) dan reaksi negatif (kanan)....16 5. Hasil uji Levan yang menunjukkan reaksi positif 17 6. Reaksi positif bakteri uji pada Uji Oksidase (diberi tanda panah) dibandingkan dengan kontrol negatif....17 7. Reaksi positif pembusukkan kentang (a) dan reaksi negatif (b)......18 8. Reaksi negatif bakteri pada uji arginine dihydrolase (a) dan reaksi positif bakteri uji dibandingkan dengan kontrol (b)...19 9. Reaksi negatif (a) dan reaksi positif (b) dari uji hipersensitif pada daun tembakau.... 20 10. Reaksi positif pada media YDC...20 11. Isolat bakteri pada media TZC yang bersifat avirulen.. 21 12. Bakteri uji yang mampu tumbuh pada media D1M Agar.....21 13. Makroskopis (a) Aspergillus sp., (b) Rhizopus sp., (c) Trichoderma sp., (d) Pestalotia sp... 22
14. Mikroskopis Aspergillus sp. (a), Rhizopus sp. (b), Trichoderma sp. (c), Pestalotia sp. (d)...23