Gambar 1. Skema penggolongan HIV-1 [Sumber: Korber dkk. 2001: ]
|
|
- Adi Hermanto
- 6 tahun lalu
- Tontonan:
Transkripsi
1
2 75 Gambar 1. Skema penggolongan HIV-1 [Sumber: Korber dkk. 2001: ] Gambar 2. Struktur virus HIV-1 [Sumber: Henriksen 2003: 12.]
3 76 Keterangan: 5 LTR : daerah 5 Long Terminal Region gag : gen gag HIV-1 pol : gen pol HIV-1 vif : gen vif HIV-1 vpr : gen vpr HIV-1 vpu : gen vpu HIV-1 tat 1 : gen tat ekson 1 tat 2 : gen tat ekson 2 rev 1 : gen rev ekson 1 rev 2 : gen rev ekson 2 nef : gen nef RRE : Rev Responsive Element 3 LTR : daerah 3 Long Terminal Region Gambar 3. Struktur genom HIV-1[Sumber: Bohne dkk. 2005: 826.] Gambar 4. Siklus hidup HIV-1 [Sumber: Henriksen 2003: 14.]
4 77 Gambar 5. Pola pemotongan mrna primer dan regulasi ekspresi gen HIV-1 [Sumber: Bohne dkk. 2005: 826.] Gambar 6. Skema overlapping extension PCR [Sumber: Roche 2002: 4.]
5 78 Gambar 7. Skema plasmid pqe-80l [Sumber: QIAGEN 2003: 33.]
6 79 XmaI Ex1-TatpNL4 tccccccgggg 5821 gagcaagaaa a tggagccagt agatcctaga ctagagccct ggaagcatcc aggaagtcag 5881 cctaaaactg cttgtaccaa ttgctattgt aaaaagtgtt gctttcattg ccaagtttgt 5941 ttcatgacaa aagccttagg catctcctat ggcaggaaga agcggagaca gcgacgaaga 6001 gctcatcaga acagtcagac tcatcaagct tctctatcaa agcagtaagt agtacatgta ttcgaagagatagtt tc gtc Ex1-TatpNL4C atcaa agcag gggtggaggg Ex2-TatpNL gcagggatat tcaccattat cgtttcaga c ccacctcccaatcccga atcccga ggg gacccgacag 8401 gcccgaagga atagaagaag aaggtggaga gagagacaga gacagatcca ttcgattagt Ex2-TatpNL4C tgtct c tg tc taggtaagctaatccagctgccct SalI Keterangan: cccggg : situs restriksi XmaI gtcgac : situs restriksi SalI atcaaagcag : overlap region primer Ex2-TatpNL4 gggtggaggg :overlap region primer Ex1-TatpNL4C Gambar 8. Sekuen fragmen ekson 1 dan 2 gen tat HIV-1, posisi primer Ex1-TatpNL4, Ex1-TatpNL4C, Ex2-TatpNL4 & Ex2-TatpNL4C, dan posisi situs restriksi XmaI dan SalI pada peta plasmid pnl43 [Accession number M ] 79
7 80 pnl Sintesis fragmen gen tat HIV-1 Isolasi vektor pqe-80l pqe- PCR overlapping untuk mendapatkan fragmen gen tat HIV-1 Isolasi alkali lisis Purifikasi produk PCR Visualisasi pada gel agarosa Elektroforesis gel agarosa 0,8%, 100V, Digesti DNA vektor dan sisipan SalI XmaI SalI Spektrofotometri DNA sisipan XmaI Ligasi dengan T4 DNA ligase Transformasi heat shock Verifikasi plasmid rekombinan Isolasi koloni transforman Gambar 9. Skema cara kerja
8 81 PCR pertama Ex1-TatpNL4 Ex2-TatpNL Ex1-TatpNL4C Ex2-TatpNL4C PCR kedua Ex1-TatpNL4 Arah ekstensi primer Arah ekstensi primer Ex2-TatpNL4C Gambar 10. Skema PCR overlapping fragmen gen tat HIV-1. 81
9 82 M 1 2 K pb 800 pb 350 pb 200 pb 100 pb 236 pb 110 pb Gel agarosa 1,5%; 100 V; EtBr 0,5 μg/ml Keterangan: M : Marka 50 pb 1 : Produk PCR ekson 1 tat HIV-1 2 : Produk PCR ekson 2 tat HIV-1 K- : Kontrol negatif PCR Gambar 11. Hasil elektroforesis produk PCR standar fragmen gen tat HIV-1 ekson 1 dan 2.
10 83 M M pb 600 pb 326 pb 326 pb 300 pb (a) (a) Agarosa 1,5%; 100 V; EtBr 0,5 μg/ml Keterangan: (a) : Hasil optimasi suhu annealing M : Marka 100 pb 1 : Suhu annealing 64 C; 30 detik 2 : Suhu annealing 66 C; 30 detik 3 : Suhu annealing 68 C; 30 detik Gambar 12. Hasil elektroforesis optimasi kondisi annealing PCR overlapping fragmen ekson 1 dan 2 gen tat HIV-1 (b) (b) : Hasil optimasi kondisi annealing 4 : Annealing 64 C; 15 detik 5 : Annealing 64 C; 30 detik 6 : Annealing 64 C; 45 detik 7 : Annealing 64 C; 1 menit
11 84 M 1 K- M pb 1500 pb 2072 pb 1500 pb 600 pb 326 pb 300 pb 600 pb 326 pb 300 pb 100 pb 100 pb (a) (b) Agarosa 1,5%; 100 V; EtBr 0,5 μg/ml Keterangan: (a) : Hasil PCR overlapping fragmen gen tat HIV-1 (b) : Hasil purifikasi produk PCR overlapping M : Marka 100 pb 1 : produk PCR overlapping K : kontrol negatif PCR Gambar 13. Hasil elektroforesis PCR fragmen gen tat HIV-1
12 85 1 M 1 2 b 4700 pb 3000 pb a 1000 pb 316 pb 250 pb Gel agarosa 0,8%; 100 V; EtBr 0,5 μg/ml Keterangan: 1 : plasmid pqe-80l a : bentuk closed circular b : bentuk nicked circle Gambar 14. Pola migrasi vektor pqe-80l Hasil isolasi Gel agarosa 1,2%; 100 V; EtBr 0,5 μg/ml Keterangan: M : Marka 1 kb 1 : pqe-80l hasil digesti 2 : fragmen gen tat HIV-1 hasil digesti Gambar 15. Purifikasi hasil digesti DNA vektor dan sisipan
13 86 Keterangan: = E.coli TOP 10 pembawa plasmid rekombinan Gambar 16. Koloni Escherichia coli TOP10 setelah ditransformasi dengan vektor pembawa fragmen tat HIV-1
14 87 WT c b WT c b a Pola migrasi plasmid lebih tinggi Gel agarosa 0,8%; 100 V; EtBr 0,5 μg/ml Keterangan: a : bentuk closed circular atau supercoiled b : bentuk linear c : bentuk nicked circle WT : plasmid pqe-80l tanpa DNA sisipan Lajur : plasmid rekombinan no Gambar 17. Analisis perbandingan pola migrasi plasmid rekombinan dengan pqe-80l (wild type)
15 pb Fragmen gen tat HIV-1 BamHI XmaI SalI HindIII pqe80-l rekombinan Keterangan: Menunjukkan pita fragmen gen tat HIV-1 berukuran 316 pb pada hasil elektroforesis analisis digesti dan orientasi plasmid rekombinan Gambar 18. Skema pqe-80l rekombinan yang tepat [Sumber: QIAGEN 2003: 33.]
16 89 M WT M pb 3000 pb 316 pb 300 pb 1000 pb 250 pb Gel agarosa 1,5%; 100 V; EtBr 0,5 μg/ml M2 WT M pb 1000 pb 250 pb 316 pb 300 pb 100 pb Keterangan: M1 : Marka DNA 100 pb M2 : Marka DNA 1 kb WT : pqe-80l tanpa DNA sisipan 10 : plasmid rekombinan no : plasmid rekombinan no. 11 Gel poliakrilamid 8%; 100 V; EtBr 0,5 μg/ml 12 : plasmid rekombinan no : plasmid rekombinan no : plasmid rekombinan no. 15 Gambar 19. Visualisasi hasil analisis plasmid rekombinan melalui digesti SalI dan XmaI
17 90 M K1 K pb 1500 pb 600 pb 581 pb 300 pb 100 pb Gel agarosa 1,5%; 100 V; EtBr 0,5 μg/ml Keterangan: M : Marka DNA 100 pb 10 : plasmid rekombinan no. 10 K1 : Kontrol negatif PCR 12 : plasmid rekombinan no. 12 K2 : Kontrol negatif verifikasi 14 : plasmid rekombinan no : plasmid rekombinan no. 15 Gambar 20. Hasil verifikasi PCR terhadap plasmid rekombinan
18 91 Start codon pqe-80l 1 atg aga gga tcg cat cac cat cac cat cac gga tcc gca tgc gag 45 1 M R G S H H H H H H G S A C E 15 6x Histidin tag 46 ctc ggt acc ccg gga tgg agc cag tag atc cta gac tag agc cct L G T P G W S Q * I L D * S P 30 tat HIV-1 ccc ggg atg gag cca gta gat cct aga cta gag ccc P G M E P V D P R L E P 91 gga agc atc cag gaa gtc agc cta aaa ctg ctt gta cca att gct G S I Q E V S L K L L V P I A 45 tgg aag cat cca gga agt cag cct aaa act gct tgt acc aat tgc tat tgt aaa W K H P G S Q P K T A C T N C Y C K 136 att gta aaa agt gtt gct ttc att gcc aag ttt gtt tca tga caa I V K S V A F I A K F V S * Q 60 aag tgt tgc ttt cat tgc caa gtt tgt ttc atg aca aaa gcc tta K C C F H C Q V C F M T K A L 181 aag cct tag gca tct cct atg gca gga aga agc gga gac agc gac K P * A S P M A G R S G D S D 75 ggc atc tcc tat ggc agg aag aag cgg aga cag cga cga aga gct G I S Y G R K K R R Q R R R A 226 gaa gag ctc atc aga aca gtc aga ctc atc aag ctt ctc tat caa E E L I R T V R L I K L L Y Q 90 cat cag aac agt cag act cat caa gct tct cta tca aag cag ccc H Q N S Q T H Q A S L S K Q P 271 agc agc cca cct ccc aat ccc gag ggg acc cga cag gcc cga agg S S P P P N P E G T R Q A R R 105 acc tcc caa tcc cga ggg gac ccg aca ggc ccg aag gaa tag aag T S Q S R G D P T G P K E * K 316 aat aga aga aga agg tgg aga gag aga cag aga cag atc cat tcg N R R R R W R E R Q R Q I H S 120 aag aag gtg gag aga gag aca gag aca gat cca ttc gat tag gtc gac K K V E R E T E T D P F D * V D 361 att agg tcg acc tgc agc caa gct taa tta gct gag I R S T C S Q A * L A E Keterangan: A: Alanin F : Fenilalanin L : Leusin Q : Glutamin W : Triptofan C: Sistein G : Glisin M : Metionin R : Arginin Y : Tirosin D: As. aspartat H : Histidin N : ASparagin S : Serin * : Stop E: As. glutamat I : Isoleusin P : Prolin T : Treonin Gambar 21. Prediksi translasi asam amino fragmen gen tat HIV-1 yang diklona ke dalam plasmid pqe-80l.
19 TABEL
20 93 Tabel 1 Pasangan primer untuk sintesis fragmen gen tat HIV-1 full length dari cetakan pnl43 Ekson Forward (5 3 ) Reverse (5 3 ) Ekson 1 Ex1Tat-pNL4 TCCCCCCGGGATGGAGCCA GTAGATCCTAGA TAGAGAAGCTT Ekson 2 Ex2Tat-pNL4 ATCAAAGCAGCCCACCTCC CAATCCCGA Ex1Tat-pNL4C GGGAGGTGGGCTGCTTTGA Ex2Tat-pNL4C TCCCGTCGACCTAATCGAAT GGATCTGTCTCTGT Keterangan: : situs restriksi XmaI; : situs restriksi SalI : sekuen nukleotida yang overlap Tabel 2 Pengukuran konsentrasi DNA plasmid pqe-80l dan fragmen gen tat HIV-1 Sampel DNA Λ260 Λ280 PQE-80L hasil isolasi Fragmen gen tat HIV-1 hasil PCR Konsentrasi (ng/µl) 0,014 0, ,016 0, Tabel 3 Pengukuran konsentrasi DNA plasmid pqe-80l dan fragmen gen tat HIV-1 yang telah didigesti Sampel DNA Konsentrasi Λ260 Λ280 (ng/µl) pqe-80l 0,036 0, Fragmen gen tat HIV-1 0,030 0,
21 LAMPIRAN
22 95 Lampiran 1 Komposisi bahan kimia dan pembuatan larutan, buffer, dan medium yang digunakan dalam penelitian Larutan, buffer, dan medium Medium Luria Bertani (LB) padat 250 ml Medium Luria Bertani (LB) 100 ml Medium Super Optimal Catabolite (SOC) Komposisi bahan kimia dan pembuatan Sebanyak 2,5 g tripton, 1,25 g yeast extract, 1,25 g NaCl, dan 3,75 g agar dilarutkan dengan akuades hingga mencapai volume 250 ml. Medium kemudian disterilisasi dan ditambahkan ampisilin sebanyak 125 µl. Sebanyak 1 g tripton, 0,5 g yeast extract, dan 0,5 g NaCl dicampur dan dilarutkan dengan akuades hingga mencapai volume 250 ml, kemudian disterilisasi dan disimpan di dalam lemari pendingin. Sebanyak 10 g bakto tripton, 5 g yeast extract, 0,5 g NaCl, dan 10 ml KCl 250 mm ditambahkan akuades hingga mencapai volume 1000 ml. ph larutan diukur (ph 7). Medium kemudian disterilisasi, MgCl 2 dan 20 ml glukosa ditambahkan sesaat sebelum digunakan. Buffer TAE 50X Sebanyak 48,4 g Tris base, 7,4 g EDTA dan 11,42 ml asam asetat glasial ditambahkan akuades hingga mencapai volume 200 ml. Buffer TAE 1X Sebanyak 4 ml buffer TAE 50X ditambah dengan 196 ml akuades. Buffer P1 Sebanyak 800 µl Tris-Cl 10 mm (ph 8,0), 80 µl EDTA 1 mm (ph 8,0) dan 400 µl RNaseA 10 mg/ml ditambahkan akuades hingga mencapai volume 40 ml. Buffer P2 Sebanyak 0,32 g NaOH padat dan 4 ml Sodium Dodecyl Suphate (SDS) 1% dilarutkan dengan akuades hingga mencapai volume 40 ml.
23 96 Lampiran 1 (lanjutan) Buffer P3 Larutan fenol: kloroform: isoamilalkohol Larutan agarosa 0,8% (b/v) 100 ml Larutan agarosa 1,5% (b/v) 100 ml Larutan MgCl 2 0,1M Larutan CaCl 2 0,1M Marka 100 pb Marka 1 kb Loading buffer 6X Buffer TE 10X dan 1X Sebanyak 11,7 g KCl dan 4,6 ml asam asetat glasial dilarutkan dengan akuades hingga mencapai volume 40 ml. Sebanyak 25 ml fenol dicampur dengan 24 ml kloroform dan 1 ml isoamilalkohol Sebanyak 0,8 g agarosa dilarutkan dengan 100 ml buffer TAE 1x Sebanyak 1,5 g agarosa dilarutkan dengan 100 ml TAE 1x Sebanyak 2,033 g MgCl2 ditambah dengan akuades hingga mencapai volume 100 ml. Larutan kemudian disterilisasi dan disimpan di dalam ruang pendingin. Sebanyak 1,665 g CaCl2 ditambah dengan akuades hingga mencapai volume 150 ml. Larutan kemudian disterilisasi dan disimpan di dalam ruang pendingin. Sebanyak 10 µl stok marka 100 pb, 17 µl loading buffer 6X dan 73 µl buffer TE 1X dicampur dan dihomogenasi, kemudian disentrifus beberapa detik. Sebanyak 10 µl stok marka 1 kb, 17 µl loading buffer 6X dan 73 µl buffer TE 1X dicampur dan dihomogenasi, kemudian disentrifus beberapa detik. Sebanyak 1,5 g bromfenol biru dan 3 ml gliserol ditambah akuades hingga mencapai volume 10 ml. Sebanyak 10 µl stok marka 1 kb, 17 µl loading buffer 6X dan 73 µl buffer TE 1X dicampur dan dihomogenasi, kemudian disentrifus beberapa detik.
24 97 Lampiran 1 (lanjutan) Larutan Sodium Dodecyl Suphate (SDS) 10% (b/v) Larutam SDS 1% (b/v) EDTA 0,5 M Sebanyak 100 g SDS dilarutkan dengan 1000 ml akuades. Sebanyak 100 ml larutan SDS 10% dicampurkan dengan 1000 ml akuades. Sebanyak 22,334 g bubuk EDTA dilarutkan dengan akuades hingga mencapai volume 60 ml. Larutan TBE 10X Sebanyak 108 g Tris base, 55 g boric acid, dan 40 ml EDTA 0,5 M dilarutkan dengan akuades hingga mencapai volume 1000 ml. Larutan akrilamid Sebanyak 29 g akrilamid dan 1 g bisakrilamid ditambahkan dengan akuades hingga volume 80 ml. Larutan didiamkan pada suhu 37 C selama 10 menit, kemudian ditambahkan akuades hingga mencapai volume 100 ml. Gel poliakrilamid 8% Sebanyak 500 µl TBE 10X dicampur dengan 1350 µl larutan akrilamid, 3150 µl akuades, 60 µl amonium persulfat 10% (b/v) dan 10 µl TEMED. [Sumber: Sambrook & Russell 2001: A1.1--A2.12.]
25 98 Lampiran 2 Perhitungan konsentrasi DNA sisipan untuk reaksi ligasi ng sisipan = ng vektor x ukuran sisipan x 3 ukuran vektor x 1 ng sisipan = 180 x 322 x x1 = 36,77 ng/µl Konsentrasi DNA sisipan = 150 ng/ µl Volume DNA sisipan untuk reaksi ligasi = 0,245 ~ 0,25 µl Volume DNA vektor = 1 µl [Sumber: Promega 1999: 6.]
26 99 Lampiran 3 Perhitungan efisiensi transformasi sel Escherichia coli TOP10 kompeten Transforman cfu = Jumlah koloni transforman x faktor pengenceran x volume kultur total/volume kultur ditransformasi = 642 x 1 x (200/50) = 2,568 x 10 3 Efisiensi transformasi = transforman cfu/konsentrasi plasmid = 2,568 x 10 3 /0,01 = 2,568 x 10 5 cfu/µg [Sumber: Zhiming Tu dkk. 2005: 118.]
BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN. A. SINTESIS DAN AMPLIFIKASI FRAGMEN GEN tat HIV-1 MELALUI
BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN A. SINTESIS DAN AMPLIFIKASI FRAGMEN GEN tat HIV-1 MELALUI TEKNIK PCR OVERLAPPING 1. Sintesis dan amplifikasi fragmen ekson 1 dan 2 gen tat HIV-1 Visualisasi gel elektroforesis
Lebih terperinciSINTESIS DAN PENGKLONAAN FRAGMEN GEN tat (TRANSAKTIVATOR) HIV-1 KE DALAM VEKTOR EKSPRESI PROKARIOT pqe-80l EKAWATI BETTY PRATIWI
SINTESIS DAN PENGKLONAAN FRAGMEN GEN tat (TRANSAKTIVATOR) HIV-1 KE DALAM VEKTOR EKSPRESI PROKARIOT pqe-80l EKAWATI BETTY PRATIWI 0304040257 UNIVERSITAS INDONESIA FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN
Lebih terperinciGambar 1. Struktur organisasi promoter pada organisme prokariot [Sumber: University of Miami 2008: 1.]
Gambar 1. Struktur organisasi promoter pada organisme prokariot [Sumber: University of Miami 2008: 1.] Gambar 2. Struktur organisasi promoter pada organisme eukariot [Sumber: Gilbert 1997: 1.] Gambar 3.
Lebih terperinciBAB 3 METODOLOGI PENELITIAN
BAB 3 METODOLOGI PENELITIAN 3.1 Desain Penelitian Bentuk desain penelitian yang akan digunakan adalah bentuk deskriptif molekuler potong lintang untuk mengetahui dan membandingkan kekerapan mikrodelesi
Lebih terperinciBAHAN DAN METODE. Produksi Protein Rekombinan Hormon Pertumbuhan (rgh)
11 BAHAN DAN METODE Penelitian ini terdiri atas 2 tahapan utama, yaitu produksi protein rekombinan hormon pertumbuhan (rgh) dari ikan kerapu kertang, ikan gurame, dan ikan mas, dan uji bioaktivitas protein
Lebih terperinciBAHAN DAN METODE. Waktu dan Tempat
BAHAN DAN METODE Waktu dan Tempat Penelitian dilakukan terhadap sampel yang dikoleksi selama tujuh bulan mulai September 2009 hingga Maret 2010 di Kabupaten Indramayu. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium
Lebih terperincibio.unsoed.ac.id METODE PENELITIAN A. Materi, Lokasi, dan Waktu Penelitian 1. Materi Penelitian
III. METODE PENELITIAN A. Materi, Lokasi, dan Waktu Penelitian 1. Materi Penelitian 1.1. Peralatan Penelitian Alat yang digunakan dalam penelitian ini adalah botol sampel, beaker glass, cool box, labu
Lebih terperinciBAB V HASIL DAN PEMBAHASAN
21 BAB V HASIL DAN PEMBAHASAN Pada penelitian sebelumnya diperoleh kerangka baca terbuka gen IFNα2b yang mengandung tiga mutasi dengan lokasi mutasi yang letaknya berjauhan, sehingga mutagenesis terarah
Lebih terperinciBAB IV Hasil dan Pembahasan
BAB IV Hasil dan Pembahasan Bab ini akan membahas hasil PCR, hasil penentuan urutan nukleotida, analisa in silico dan posisi residu yang mengalami mutasi dengan menggunakan program Pymol. IV.1 PCR Multiplek
Lebih terperinciBAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN
BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN 4.1. Isolasi RNA Total RNA total sengon diisolasi dengan reagen Trizol dari jaringan xylem batang sengon yang tua (berumur 5-10 tahun) dan bibit sengon yang berumur 3-4 bulan.
Lebih terperinciIsolasi dan Karakterisasi Gen Penyandi Protein Permukaan VP28 White Spot Syndrome Virus (WSSV) pada Udang Windu (Penaeus monodon Fabricius, 1798)
Isolasi dan Karakterisasi Gen Penyandi Protein Permukaan VP28 White Spot Syndrome Virus (WSSV) pada Udang Windu (Penaeus monodon Fabricius, 1798) Asmi Citra Malina 1, Andi Aliah Hidayani 1 dan Andi Parenrengi
Lebih terperinciMETODE Waktu dan Tempat Materi Sampel DNA Primer
METODE Waktu dan Tempat Penelitian ini dilaksanakan mulai bulan September 2010 sampai dengan bulan Pebruari 2011. Penelitian dilakukan di Laboratorium Genetika Molekuler Ternak Bagian Pemuliaan dan Genetika
Lebih terperinciBAB 3 PERCOBAAN. Alat elektroforesis agarosa (Biorad), autoklaf, cawan Petri, GeneAid High Speed Plasmid
BAB 3 PERCOBAAN 3.1 Alat Alat elektroforesis agarosa (Biorad), autoklaf, cawan Petri, GeneAid High Speed Plasmid Mini kit, inkubator goyang (GSL), jarum Ose bundar, kit GFX (GE Healthcare), kompor listrik
Lebih terperinciANALISIS GEN PENYANDI HEMAGLUTININ VIRUS HIGHLY PATHOGENIC AVIAN INFLUENZA SUBTIPE H5N1 ISOLAT UNGGAS AIR
ANALISIS GEN PENYANDI HEMAGLUTININ VIRUS HIGHLY PATHOGENIC AVIAN INFLUENZA SUBTIPE H5N ISOLAT UNGGAS AIR ABSTRACT Avian influenza viruses (AIV) subtype H5N isolated from waterfowls in West Java pose the
Lebih terperinciPembuatan Media Kultur Bakteri Pemanenan sel bakteri. Isolasi DNA kromosom bakteri. Kloning DNA
LAMPIRAN 15 15 Lampiran 1 Tahapan penelitian Pembuatan Media Kultur Bakteri Pemanenan sel bakteri Isolasi DNA kromosom bakteri Pemotongan DNA dengan enzim restriksi Kloning DNA Isolasi DNA plasmid hasil
Lebih terperinciBAB III METODE PENELITIAN
BAB III METODE PENELITIAN A. Jenis Penelitian deskriptif. Jenis penelitian yang digunakan adalah penelitian dasar dengan metode B. Objek Penelitian Objek penelitian ini adalah sampel DNA koleksi hasil
Lebih terperinciPENENTUAN POHON FILOGENETIK BAKTERI XILANOLITIK SISTEM ABDOMINAL RAYAP TANAH BERDASARKAN 16S rrna
PENENTUAN POHON FILOGENETIK BAKTERI XILANOLITIK SISTEM ABDOMINAL RAYAP TANAH BERDASARKAN 16S rrna SKRIPSI SEPTHIA DWI SUKARTININGRUM DEPARTEMEN KIMIA FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI UNIVERSITAS AIRLANGGA
Lebih terperinciBAB 4. METODE PENELITIAN
BAB 4. METODE PENELITIAN Penelitian penanda genetik spesifik dilakukan terhadap jenis-jenis ikan endemik sungai paparan banjir Riau yaitu dari Genus Kryptopterus dan Ompok. Penelitian ini bertujuan untuk
Lebih terperinciBAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN. A. ISOLASI DNA GENOM PADI (Oryza sativa L.) KULTIVAR ROJOLELE,
BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN A. ISOLASI DNA GENOM PADI (Oryza sativa L.) KULTIVAR ROJOLELE, NIPPONBARE, DAN BATUTEGI Isolasi DNA genom padi dari organ daun padi (Oryza sativa L.) kultivar Rojolele, Nipponbare,
Lebih terperinciBAB 3 PERCOBAAN Mikroba C. violaceum, Bacillus cereus dan E. coli JM 109
9 BAB 3 PERCOBAAN 3.1 Alat, Bahan dan Miroba 3.1.1 Alat Bunsen, inkubator 37 o C, sentrifuga (Mikro 200R Hettich), Eppendorf 100 ul, 500 ul, 1,5 ml, tabung mikrosentrifuga (Eppendorf), neraca timbang (Mettler
Lebih terperinciBAB III METODE PENELITIAN
BAB III METODE PENELITIAN 3.1 Waktu dan Tempat Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Januari 2012 sampai bulan Juli 2012, yang bertempat di Laboratorium Genetika dan Biologi Molekuler Jurusan Biologi
Lebih terperinciV. GENETIKA MIKROORGANISME
V. GENETIKA MIKROORGANISME Genetika merupakan suatu cabang ilmu yang membahas tentang sifat-sifat yang diturunkan oleh suatu organisme. Penelaahan genetika secara serius pertama kali dilakukan oleh Gregor
Lebih terperinciBAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN A. AMPLIFIKASI DAN PURIFIKASI GEN NS1 VIRUS DENGUE. Proses amplifikasi gen NS1 virus dengue merupakan tahap awal
38 BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN A. AMPLIFIKASI DAN PURIFIKASI GEN NS1 VIRUS DENGUE Proses amplifikasi gen NS1 virus dengue merupakan tahap awal dalam penelitian. Fragmen gen NS1 virus dengue diamplifikasi
Lebih terperinciHASIL DAN PEMBAHASAN
HASIL DAN PEMBAHASAN Isolasi RNA total RNA total dari ujung akar G. max kultivar Slamet telah berhasil diisolasi. Kuantifikasi RNA total dengan spektrofotometer menunjukkan bahwa rendemen isolasi RNA total
Lebih terperinciBAB III METODE PENELITIAN
BAB III METODE PENELITIAN A. Jenis Penelitian Metode penelitian yang digunakan pada penelitian ini adalah deskriptif. Penelitian deskriptif bertujuan untuk membuat deskripsi, gambaran, atau lukisan secara
Lebih terperinciSaya telah melihat cara membuat strand dna ini di internet dan akhirnya,,,, inilah hasilnya
Untuk menghasilkan bahan 3D saya ini, bahan yang telah saya gunakan adalah kertas berwarna, dawai, double tape, gabus dan pelekat. Bahan-bahan ini merupakan bahan yang mudah untuk dicari dan semestinya
Lebih terperinciBAB 3 PERCOBAAN 3.1 Bahan 3.2 Alat
BAB 3 PERCOBAAN 3.1 Bahan Bahan yang digunakan memiliki kualitas pro analisis atau pro biologi molekular, yaitu : primer M. tuberculosis forward: 5 GGATCCGATGAGCAAGCTGATCGAA3 (Proligo) dan primer M. tuberculosis
Lebih terperinciGambar Penerapan metode..., Anglia Puspaningrum, FMIPA UI, 2008
Gambar 52 Gambar 1. Hasil elektroforesis Escherichia coli ATCC 25922 yang diisolasi menggunakan CTAB dan diamplifikasi dengan PCR [lajur 1 dan lajur 2]. 650 pb 500 pb Gambar 2. Hasil elektroforesis sampel
Lebih terperinciBAB 4 HASIL PERCOBAAN DAN PEMBAHASAN
BAB 4 HASIL PERCOBAAN DAN PEMBAHASAN Sebelum melakukan PCR, terlebih dahulu dilakukan perancangan primer menggunakan program DNA Star. Pemilihan primer dilakukan dengan mempertimbangkan parameter spesifisitas,
Lebih terperinciMETODE PENELITIAN. Survei dan Pendataan
METODE PENELITIAN Tempat dan Waktu Penelitian Kegiatan identifikasi penyebab penyakit umbi bercabang pada wortel dilakukan di Laboratorium Nematologi dan Laboratorium Virologi Departemen Proteksi Tanaman
Lebih terperinciHASIL DAN PEMBAHASAN 28S 18S
4 (http://www.tools.neb.com/nebcutter2/htm). Analisis kesamaan, filogenetik, dan profil berdasarkan urutan nukleotida dan deduksi asam amino dengan Mt2 dari spesies lain menggunakan program MAFFT ver.6.0.
Lebih terperinciBAB 4 HASIL PERCOBAAN DAN BAHASAN. Oligonukleotida sintetis daerah pengkode IFNα2b sintetis dirancang menggunakan
BAB 4 HASIL PERCOBAAN DAN BAHASAN Oligonukleotida sintetis daerah pengkode IFNα2b sintetis dirancang menggunakan program komputer berdasarkan metode sintesis dua arah TBIO, dimana proses sintesis daerah
Lebih terperinciBAB V KESIMPULAN DAN SARAN. Berdasarkan hasil penelitian yang telah dilakukan dari empat primer yang
BAB V KESIMPULAN DAN SARAN A. KESIMPULAN Berdasarkan hasil penelitian yang telah dilakukan dari empat primer yang digunakan hanya primer GE 1.10 dengan suhu annealing sebesar 49,5 o C yang dapat dianalisis
Lebih terperinciBAB III METODE PENELITIAN
BAB III METODE PENELITIAN 3.1 Rancangan Penelitian Penelitian tentang Pengaruh Suhu Annealing pada Program PCR terhadap Keberhasilan Amplifikasi DNA Udang Jari (Metapenaeus elegans) Laguna Segara Anakan
Lebih terperinciBAB III METODE PENELITIAN. Jenis penelitian yang dilakukan termasuk dalam penelitian dasar yang. dilakukan dengan metode deskriptif (Nazir, 1998).
BAB III METODE PENELITIAN A. Jenis Penelitian Jenis penelitian yang dilakukan termasuk dalam penelitian dasar yang dilakukan dengan metode deskriptif (Nazir, 1998). B. Populasi dan Sampel 1. Populasi yang
Lebih terperinciIII. BAHAN DAN METODE
11 III. BAHAN DAN METODE 3.1 Ikan Uji Larva ikan gurame diperoleh dari pembenihan di Desa Ciherang Kec. Darmaga, Kab. Bogor. Larva dipelihara dalam akuarium berukuran 1,0x0,5x0,5 m 3 dengan kepadatan sekitar
Lebih terperinciBAB II TINJAUAN PUSTAKA. di sebagian besar negara-negara di dunia biasanya disebabkan karena
BAB II TINJAUAN PUSTAKA A. HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS Virus Human Immunodeficiency Virus (HIV) merupakan virus penyebab penyakit Acquired Immunodeficiency Syndrome (AIDS). Virus tersebut dibagi ke dalam
Lebih terperinciBAHAN DAN METODE. Tempat dan Waktu Penelitian. Metode Penelitian
BAHAN DAN METODE Tempat dan Waktu Penelitian Pengambilan sampel dilakukan pada 3 lokasi yang berbeda, yaitu: Dusun Sidomukti, Desa Kopeng, Kecamatan Getasan, Kabupaten Semarang pada ketinggian 1200-1400
Lebih terperinciMetodologi Penelitian. Metode, bahan dan alat yang digunakan dalam penelitian ini akan dipaparkan pada bab ini.
Bab III Metodologi Penelitian Metode, bahan dan alat yang digunakan dalam penelitian ini akan dipaparkan pada bab ini. III.1 Rancangan Penelitian Secara garis besar tahapan penelitian dijelaskan pada diagram
Lebih terperincio C 1 menit, penempelan 50 o C 1 menit, polimerisasi 72 o C 1 menit (tiga tahap ini
13 BAB IV PERCOBAAN IV.1 Bahan Air miliq, deoksinukleotida trifosfat (dntp), MgCl 2, (Promega), enzim Pfu DNA polymerase, dapar Pfu (Stratagene), oligonukleotida SR1, SR2, SR3, SR4, SR5, AR6, AR7, AR8,
Lebih terperinciAsam Asetat Glacial = 5,7 ml EDTA 0,5 M ph 8.0 = 10 ml Aquades ditambahkan hingga volume larutan 100 ml
36 Lampiran 1. Pembuatan Larutan Stok dan Buffer A. Pembuatan Larutan Stok Tris HCL 1 M ph 8.0 (100 ml) : Timbang Tris sebanyak 12,114 g. Masukkan Tris ke dalam Erlenmeyer dan ditambahkan 80 ml aquades.
Lebih terperinciMATERI DAN METODE. Materi
MATERI DAN METODE Lokasi dan Waktu Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Genetika Molekuler Ternak, Departemen Ilmu Produksi dan Teknologi Peternakan, Fakultas Peternakan IPB dan Laboratorium Terpadu,
Lebih terperinciBAHAN DAN METODE. Tempat dan Waktu Penelitian
BAHAN DAN METODE Tempat dan Waktu Penelitian Penelitian dilakukan di Laboratorium Kerjasama Bioteknologi Indonesia- Belanda (BIORIN) dan Laboratorium Biologi Molekuler dan Seluler Tanaman (BMST), Pusat
Lebih terperinci3 BAHAN DAN METODE. Waktu dan Tempat
13 3 BAHAN DAN METODE Waktu dan Tempat Penelitian ini dilakukan pada bulan April 2012 hingga Januari 2013, bertempat di Laboratorium Kultur Jaringan serta Laboratorium BIORIN (Biotechnology Research Indonesia-the
Lebih terperinciBABm METODE PENELITIAN
BABm METODE PENELITIAN 3.1 Jenis Penelitian Penelitian ini merupakan penelitian analitik dengan desain cross-sectioned, yaitu untuk mengetahui apakah terdapat perbedaan distnbusi genotipe dan subtipe VHB
Lebih terperinciVISUALISASI HASIL PCR DENGAN METODE PCR LANGSUNG DAN TIDAK LANGSUNG PADA SAMPEL BAKTERI Pseudomonas fluorescens dan Ralstonia solanacearum
VISUALISASI HASIL PCR DENGAN METODE PCR LANGSUNG DAN TIDAK LANGSUNG PADA SAMPEL BAKTERI Pseudomonas fluorescens dan Ralstonia solanacearum Pendahuluan Polymerase Chain Reaction (PCR) adalah suatu teknik
Lebih terperinciPERAN ISOFORM TAp73 DAN STATUS GEN p53 TERHADAP AKTIFITAS htert PADA KARSINOMA SEL SKUAMOSA RISBIN IPTEKDOK 2007
PERAN ISOFORM TAp73 DAN STATUS GEN p53 TERHADAP AKTIFITAS htert PADA KARSINOMA SEL SKUAMOSA RISBIN IPTEKDOK 2007 LATAR BELAKANG p53 wt
Lebih terperinciHASIL DAN PEMBAHASAN Isolasi DNA Genomik Sengon
HASIL DAN PEMBAHASAN Isolasi DNA Genomik Sengon DNA genomik sengon diisolasi dari daun muda pohon sengon. Hasil uji integritas DNA metode 1, metode 2 dan metode 3 pada gel agarose dapat dilihat pada Gambar
Lebih terperinciMATERI DAN METODE. Materi. Tabel 1. Sampel Darah Sapi Perah dan Sapi Pedaging yang Digunakan No. Bangsa Sapi Jenis Kelamin
MATERI DAN METODE Lokasi dan Waktu Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Genetika Molekuler Ternak, Bagian Pemuliaan dan Genetika, Fakultas Peternakan, Institut Pertanian Bogor. Penelitian ini berlangsung
Lebih terperinciMATERI DAN METODE. Materi
MATERI DAN METODE Lokasi dan Waktu Penelitian ini dilakukan di Laboratorium Genetika Molekuler Ternak, Bagian Pemuliaan dan Genetik Ternak, Departemen Ilmu Produksi dan Teknologi Peternakan, Fakultas Peternakan,
Lebih terperinciMATERI DAN METODE. Kota Padang Sumatera Barat pada bulan Oktober Amplifikasi gen Growth
III. MATERI DAN METODE 3.1 Waktu dan Tempat Pengambilan sampel darah domba dilakukan di Kecamatan Koto Tengah Kota Padang Sumatera Barat pada bulan Oktober 2012. Amplifikasi gen Growth Hormone menggunakan
Lebih terperinciHASIL DAN PEMBAHASAN
HASIL DAN PEMBAHASAN Isolasi RNA Total RNA total M. malabathricum telah berhasil diisolasi melalui modifikasi metode Chang et al. (1993). Modifikasi dilakukan pada larutan penyangga dengan peningkatan
Lebih terperinciBAB III METODE PENELITIAN. bertujuan untuk menidentifikasi gen angiotensin converting enzyme (ACE)
BAB III METODE PENELITIAN 3.1 Rancangan Penelitian Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah deskriptif yang bertujuan untuk menidentifikasi gen angiotensin converting enzyme (ACE) insersi/ delesi
Lebih terperinciBAHAN DAN METODE. 1. Waktu dan Tempat penelitian
BAHAN DAN METODE 1. Waktu dan Tempat penelitian Penelitian dilakukan di Laboratorium Biologi Molekuler dan Rumah Kaca Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian
Lebih terperinciMETODE PENELITIAN. Tempat dan Waktu. Bakteri Uji. Bahan dan Media
39 METODE PENELITIAN Tempat dan Waktu Penelitian dilakukan di Laboratorium Patogen dan Bioteknologi Pangan (Southeast Asian Food and Agricultural Science and Technology) SEAFAST Center, Institut Pertanian
Lebih terperinciBAB III METODE PENELITIAN Bagan Alir Penelitian ini secara umum dapat digambarkan pada skema berikut:
BAB III METODE PENELITIAN Tahapan-tahapan yang dilakukan dalam penelitian ini adalah: pengumpulan sampel, lisis terhadap sampel mtdna yang telah diperoleh, amplifikasi daerah HVI mtdna sampel dengan menggunakan
Lebih terperinciBAB in. METODE PENELITIAN
BAB in. METODE PENELITIAN Waktu Dan Tempat Penelitian Penelitian ini telah dilakukan dari April sampai November 2009 di laboratorium Biologi Molekular dan Rekayasa Genetika, Balai Penelitian Bioteknologi
Lebih terperinciBAB III METODE PENELITIAN
25 BAB III METODE PENELITIAN 3.1 Waktu dan Tempat Penelitian telah berlangsung sejak bulan Januari 2012 - Juli 2012 di Laboratorium Mikrobiologi, Lab. Optik, Lab. Genetika dan Lab. Biologi Molekuler Jurusan
Lebih terperinciBAB III METODE PENELITIAN. amplifikasi daerah HVI mtdna sampel dengan menggunakan teknik PCR;
BAB III METODE PENELITIAN Secara garis besar, langkah-langkah yang dilakukan dalam penelitian ini adalah: pengumpulan sampel; lisis terhadap sampel mtdna yang telah diperoleh; amplifikasi daerah HVI mtdna
Lebih terperinciMETODE. Materi. Tabel 1. Jumlah Sampel DNA yang Digunakan dan Asal Pengambilan Sampel Darah.
METODE Lokasi dan Waktu Penelitian ini dilaksanakan di Laboratorium Pemuliaan dan Genetika Molekuler, Bagian Pemuliaan dan Genetik Ternak, Departemen Ilmu Produksi dan Teknologi Peternakan, Fakultas Peternakan,
Lebih terperinciBAHAN DAN METODE Waktu dan Tempat Penelitian Rancangan Percobaan
13 BAHAN DAN METODE Waktu dan Tempat Penelitian Penelitian telah dilakukan mulai bulan Juni 2008 sampai Januari 2009. Pengambilan sampel DOC dilakukan di gudang keberangkatan domestik dan kedatangan international
Lebih terperinciBAB III BAHAN DAN CARA KERJA. Penelitian dilakukan di Laboratorium Biologi Molekuler, Pusat
BAB III BAHAN DAN CARA KERJA A. LOKASI DAN WAKTU PENELITIAN Penelitian dilakukan di Laboratorium Biologi Molekuler, Pusat Penelitian Bioteknologi, LIPI, Cibinong selama 9 bulan (Maret 2008-- November 2008).
Lebih terperinciBAB III. METODOLOGI PENELITIAN. Pengambilan sampel. Penyiapan templat mtdna dengan metode lisis sel
16 BAB III. METODOLOGI PENELITIAN Bab ini menggambarkan tahapan penelitian yang terdiri dari pengambilan sampel, penyiapan templat mtdna dengan metode lisis sel, amplifikasi D-loop mtdna dengan teknik
Lebih terperinciMATERI DAN METODE Lokasi dan Waktu Materi Sampel Pengambilan Sampel Ekstraksi DNA Primer
MATERI DAN METODE Lokasi dan Waktu Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Juni hingga Nopember 2010. Penelitian dilakukan di Laboratorium Pemuliaan dan Genetik Molekuler, Bagian Pemuliaan dan Genetik Ternak,
Lebih terperinciBAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN. Penelitian tentang identifikasi gen angiotensin converting enzyme (ACE)
BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN Penelitian tentang identifikasi gen angiotensin converting enzyme (ACE) insersi/ delesi (I/D) dilakukan pada 100 pasien hipertensi yang berobat di poli jantung rumah sakit dr.
Lebih terperinciII. BAHAN GENETIK DAN EKSPRESI GEN
A. Latar Belakang A.1. Bahan Genetik II. BAHAN GENETIK DAN EKSPRESI GEN DNA: Deoxyribo Nucleic Acid, merupakan bahan dasar genetik yang terbentuk dari tiga komponen yaitu: 1. Basa, yang merupakan bahan
Lebih terperinciBAB 4 HASIL PERCOBAAN DAN BAHASAN
14 BAB 4 HASIL PERCOBAAN DAN BAHASAN Konfirmasi bakteri C. violaceum dan B. cereus dilakukan dengan pewarnaan Gram, identifikasi morfologi sel bakteri, sekuensing PCR 16s rdna dan uji kualitatif aktivitas
Lebih terperinciBAB III BAHAN DAN CARA KERJA. Penelitian dilakukan di Laboratorium Institute of Human Virology and
23 BAB III BAHAN DAN CARA KERJA A. LOKASI DAN WAKTU PENELITIAN Penelitian dilakukan di Laboratorium Institute of Human Virology and Cancer Biology of the University of Indonesia (IHVCB-UI), Jl. Salemba
Lebih terperinciBAB III METODE PENELITIAN
18 BAB III METODE PENELITIAN A. Jenis Penelitian Jenis penelitian ini merupakan jenis penelitian deskriptif. Penelitian deskriptif merupakan penelitian yang bertujuan untuk membuat deskripsi, gambaran
Lebih terperinci3. METODE PENELITIAN
29 3. METODE PENELITIAN 3.1. Lokasi dan Waktu Penelitian Lokasi penelitian meliputi Laut Sulawesi, Selat Makassar, Teluk Bone, Laut Flores, Laut Banda, Teluk Tolo, Laut Maluku dan Teluk Tomini (Gambar
Lebih terperinciPETUNJUK PRAKTIKUM BIOLOGI SEL DAN MOLEKULER Oleh: Ixora Sartika M ISOLASI DNA PLASMID
PETUNJUK PRAKTIKUM BIOLOGI SEL DAN MOLEKULER Oleh: Ixora Sartika M ixomerc@uny.ac.id ISOLASI DNA PLASMID Plasmid adalah DNA ekstrakromosom yang berbentuk sirkuler dan berukuran kecil (1 200 kb). Sebagian
Lebih terperinciBAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN. Sintesis fragmen gen HA Avian Influenza Virus (AIV) galur
20 BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN A. KONDISI OPTIMAL REAKSI AMPLIFIKASI Sintesis fragmen 688--1119 gen HA Avian Influenza Virus (AIV) galur A/Indonesia/5/2005 dilakukan dengan teknik overlapping extension
Lebih terperinciFAKULTAS BIOLOGI LABORATORIUM GENETIKA & PEMULIAAN INSTRUKSI KERJA UJI
ISOLASI TOTAL DNA TUMBUHAN DENGAN KIT EKSTRAKSI DNA PHYTOPURE Halaman : 1 dari 5 1. RUANG LINGKUP Metode ini digunakan untuk mengisolasi DNA dari sampel jaringan tumbuhan, dapat dari daun, akar, batang,
Lebih terperinciHASIL DAN PEMBAHASAN bp bp bp
HASIL DAN PEBAHASAN Purifikasi dan Pengujian Produk PCR (Stilbena Sintase) Purifikasi ini menggunakan high pure plasmid isolation kit dari Invitrogen. Percobaan dilakukan sesuai dengan prosedur yang terdapat
Lebih terperinciLAMPIRAN. Lampiran 1. Deskripsi Pembuatan Larutan Stok dan Buffer
LAMPIRAN Lampiran 1. Deskripsi Pembuatan Larutan Stok dan Buffer 1. Pembuatan Larutan Stok a. CTAB 5 % Larutan dibuat dengan melarutkan : - NaCl : 2.0 gr - CTAB : 5.0 gr - Aquades : 100 ml b. Tris HCl
Lebih terperinciFAKULTAS BIOLOGI LABORATORIUM GENETIKA & PEMULIAAN INSTRUKSI KERJA UJI
Halaman : 1 dari 5 ISOLASI TOTAL DNA HEWAN DENGAN KIT EKSTRAKSI DNA 1. RUANG LINGKUP Metode ini digunakan untuk mengisolasi DNA dari sampel jaringan hewan, dapat dari insang, otot, darah atau jaringan
Lebih terperinciKloning Domain KS dan Domain A ke dalam Sel E. coli DH5α. Analisis Bioinformatika. HASIL Penapisan Bakteri Penghasil Senyawa Antibakteri
3 selama 1 menit, dan elongasi pada suhu 72 0 C selama 1 menit. Tahap terakhir dilakukan pada suhu 72 0 C selama 10 menit. Produk PCR dielektroforesis pada gel agarosa 1 % (b/v) menggunakan tegangan 70
Lebih terperinciLAMPIRAN. Lampiran 1. Pembuatan Larutan Stok dan Buffer
LAMPIRAN Lampiran 1. Pembuatan Larutan Stok dan Buffer A. LARUTAN STOK CTAB 5 % (100 ml) - Ditimbang NaCl sebanyak 2.0 gram - Ditimbang CTAB sebanyak 5.0 gram. - Dimasukkan bahan kimia ke dalam erlenmeyer
Lebih terperinciIdentifikasi Type Human Papillomavirus (HPV) pada Penderita Kanker Serviks
Jurnal Sains Farmasi & Klinis, 3(1), 54-63 Jurnal Sains Farmasi & Klinis (p- ISSN: 2407-7062 e-issn: 2442-5435) diterbitkan oleh Ikatan Apoteker Indonesia - Sumatera Barat homepage: http://jsfkonline.org
Lebih terperinciBAB III METODE PENELITIAN. Dalam penelitian ini dilakukan lima tahap utama yang meliputi tahap
BAB III METODE PENELITIAN Dalam penelitian ini dilakukan lima tahap utama yang meliputi tahap penyiapan templat mtdna, amplifikasi fragmen mtdna pada daerah D-loop mtdna manusia dengan teknik PCR, deteksi
Lebih terperinciIsolasi DNA Total Dan Optimasi Suhu Annealing Untuk Primer COX2 Pada Ikan Ompok eugeneiatus (Vaillant 1893) Asal Sungai Indragiri Hulu Riau
Isolasi DNA Total Dan Optimasi Suhu Annealing Untuk Primer COX2 Pada Ikan Ompok eugeneiatus (Vaillant 1893) Asal Sungai Indragiri Hulu Riau JESSICA RODEARNI SARAGIH 1 *, ROZA ELVYRA 1, DEWI INDRIYANI ROSLIM
Lebih terperinci3 Metodologi Penelitian
3 Metodologi Penelitian 3.1 Alat Penelitian ini dilakukan di Laboratorium Penelitian Biokimia, Program Studi Kimia, Institut Teknologi Bandung. Peralatan yang digunakan pada penelitian ini diantaranya
Lebih terperinciBAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN. Isolasi DNA genom tanaman padi T0 telah dilakukan pada 118
45 BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN A. HASIL Isolasi DNA genom tanaman padi T0 telah dilakukan pada 118 sampel. Berdasarkan hasil digesti DNA dengan enzim EcoRI, diperoleh sebanyak 74 sampel tanaman dari 118
Lebih terperinciBAB III METODE PENELITIAN. Secara garis besar langkah-langkah yang dilakukan dalam penelitian ini
BAB III METODE PENELITIAN Secara garis besar langkah-langkah yang dilakukan dalam penelitian ini adalah: pengumpulan sampel; lisis terhadap sampel mtdna yang telah diperoleh; amplifikasi daerah D-loop
Lebih terperinciKAJIAN MOLEKULER LUMBA-LUMBA HIDUNG BOTOL (Tursiops sp.) ASAL LAUT JAWA BERDASAR URUTAN GEN CYTOCHROME C OXIDASE SUB-UNIT II (COX II)
Jurnal Kedokteran Hewan P-ISSN : 1978-225X; E-ISSN : 2502-5600 Rini Widayanti dan Yuda Heru Fibrianto KAJIAN MOLEKULER LUMBA-LUMBA HIDUNG BOTOL (Tursiops sp.) ASAL LAUT JAWA BERDASAR URUTAN GEN CYTOCHROME
Lebih terperinciIII. Bahan dan Metode
III. Bahan dan Metode A. Waktu dan Tempat Penelitian Penelitian ini dilaksanakan selama 3 bulan dari bulan Mei-Juli 2011 yang dilakukan di LPPT UGM Yogyakarta. B. Bahan Penelitian Sampel yang digunakan
Lebih terperinciAnalisis kadar protein
LAMPIRAN Lampiran 1 Bagan alir penelitian Biawak air bagian duodenum, jejenum, ileum, kolon Cuci dengan akuades dan kerok lapisan atasnya (mukosa Ekstraksi enzim protease Analisis kadar protein Pencirian
Lebih terperinciIV. HASIL DAN PEMBAHASAN
IV. HASIL DAN PEMBAHASAN 4.1 Isolasi Fragmen DNA Penyandi CcGH Mature Plasmid pgem-t Easy yang mengandung cdna GH ikan mas telah berhasil diisolasi. Hal ini ditunjukkan dengan adanya pita DNA pada ukuran
Lebih terperinciPengklonaan Gen Nonstruktural 3 Virus Dengue Serotipe 2 (ns3 denv-2) Strain Indonesia ke dalam Plasmid umvc4a
Majalah Kedokteran UKI 2014 Vol XXX No.1 Januari - Maret Artikel Asli Pengklonaan Gen Nonstruktural 3 Virus Dengue Serotipe 2 (ns3 denv-2) Strain Indonesia ke dalam Plasmid umvc4a Mardhatillah Sariyanti,
Lebih terperinciLampiran 1 Pembuatan Medium Kultur DMEM Lampiran 2 Pembuatan Larutan PBS Lampiran 3 Prosedur Pewarnaan HE
LAMPIRAN Lampiran 1 Pembuatan Medium Kultur DMEM Medium kultur DMEM merupakan medium Dulbecco s Modified Eagle s Medium (DMEM; Sigma) yang telah dimodifikasi dengan penambahan asam amino non-esensial (AANE;
Lebih terperinciBAB I PENDAHULUAN. Saat ini, seiring dengan perkembangan ilmu pengetahuan dan teknologi, yang
BAB I PENDAHULUAN A. Latar Belakang Penelitian Saat ini, seiring dengan perkembangan ilmu pengetahuan dan teknologi, yang berpengaruh langsung pada diversifikasi produk pangan menyebabkan beranekaragamnya
Lebih terperinciBAHAN DAN METODE. Tempat dan Waktu
17 BAHAN DAN METODE Tempat dan Waktu Pengambilan contoh tanaman dilakukan di Pulau Derawan Kab. Berau Kalimantan Timur dan sebagai pembanding digunakan contoh tanaman kelapa dari perkebunan kelapa di daerah
Lebih terperinciBAHAN DAN METODE Waktu dan Tempat Penelitian Bahan Penelitian
BAHAN DAN METODE Waktu dan Tempat Penelitian Penelitian dilakukan pada bulan Juli 2010 sampai Juli 2011 di Laboratorium Bakteriologi Tumbuhan, Departemen Proteksi Tanaman, Fakultas Pertanian dan Laboratorium
Lebih terperinciHASIL DAN PEMBAHASAN
19 HASIL DAN PEMBAHASAN Vektor Kloning Protein rgh Isolasi Plasmid cdna GH. Plasmid pgem-t Easy yang mengandung cdna; El-mGH, Og-mGH dan Cc-mGH berhasil diisolasi dari bakteri konstruksi E. coli DH5α dengan
Lebih terperinciBAB III METODE PENELITIAN. Jenis penelitian yang digunakan dalam penelitian ini adalah deskriptif.
BAB III METODE PENELITIAN A. Jenis Penelitian Jenis penelitian yang digunakan dalam penelitian ini adalah deskriptif. Penelitian deskriptif adalah metode penelitian yang bertujuan untuk membuat gambaran
Lebih terperinciGambar 2 Vektor pengklonan pgem T Easy
BAHAN DAN METODE Waktu dan Tempat Penelitian ini dilaksanakan dari bulan September 2007 sampai dengan bulan April 2008. Penelitian dilakukan di Laboratorium Biologi Molekuler Seluler Tanaman, dan Laboratorium
Lebih terperinciMETODE PENELITIAN Waktu dan Tempat Penelitian Bahan Metode penelitian Isolasi RNA total
METODE PENELITIAN Waktu dan Tempat Penelitian Penelitian ini dilakukan mulai bulan Februari 2005 hingga bulan Maret 2008 di Laboratorium Biologi Molekuler dan Seluler Tanaman dan Laboratorium BIORIN (Biotechnology
Lebih terperinciIndikator 30. Urutan yang sesuai dengan sintesis protein adalah
Indikator 30 1. Fase-fase sintesis protein: 1) RNAd meninggalkan inti menuju ribosom 2) RNAt mengikat asam amino yang sesuai 3) RNAd dibentuk di dalam inti oleh DNA 4) Asam amino berderet sesuai dengan
Lebih terperinciIV. HASIL DAN PEMBAHASAN
24 IV. HASIL DAN PEMBAHASAN 4.1 Hasil 4.1.1 Perhitungan Kepadatan Artemia dan Kutu Air serta Jumlah Koloni Bakteri Sebanyak 1,2 x 10 8 sel bakteri hasil kultur yang membawa konstruksi gen keratin-gfp ditambahkan
Lebih terperinciVARIASI GEN CYT B MITOKONDRIA PADA IKAN BELIDA EVI ALFIAH TAUKHID G
VARIASI GEN CYT B MITOKONDRIA PADA IKAN BELIDA EVI ALFIAH TAUKHID G34062381 DEPARTEMEN BIOLOGI FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM INSTITUT PERTANIAN BOGOR BOGOR 2011 ii VARIASI GEN CYT B MITOKONDRIA
Lebih terperinci