BIOLOGI TUMBUHAN. Ketua Program Studi/Koordinator Mayor: Dr.Ir. Miftahudin, MSi. Prof. Dr. Ir. Alex Hartana, MSc Prof. Dr. Mien Ahmad Rifa i *

Transkripsi

1 Meraih masa depan berkualitas bersama Sekolah Pascasarjana IPB BIOLOGI TUMBUHAN Ketua Program Studi/Koordinator Mayor: Dr.Ir. Miftahudin, MSi Staf Pengajar: Prof. Dr. Ir. Alex Hartana, MSc Prof. Dr. Mien Ahmad Rifa i * Dr. Ari Prihardianto * Dr. Ir. Miftahudin, MSi Dr. Ir. Aris Tjahjoleksono Dr. Nunik Sri Aryanti, MSi Prof. Dr. Ir. Dede Setiadi, MS Dr. Rita Megia Dr. Dedy Darnaedi* Dr. Rugayah* Dr. Ir. Diah Ratnadewi Dr. Sri Sudarmiyati, MSc Dr. Ir. Dodi Supriadi, MSc. * Dr. Ir. Suharsono, DEA Dr. Ir. Dorly, MSi. Dr. Ir. Sulistijorini, MSi Dr. Eko Baroto Waluyo * Dr. Sumaryono* Dr. Ir. Ence Darmo Jaya Supena, MSi Dr. Ir. Tatik Chikmawati, MSi Dr. Ir. Hamim, MSi Dr. Teguh Triono * Dr. Harry Wiriadinata * Dr. Triadiati, MSi Dr. Ir. Ibnul Qayim Dr. Ir. Utut Widyastuti, MSi Dr. Ir. Ignatius Muhadiono Dr. Yohannes Purwanto * Ket: * Dosen Luar Biasa Tujuan Pendidikan: 1. Menghasilkan lulusan Magister dan Doktor yang profesional dan berakhlak tinggi, 2. Mengembangkan penelitian dan inovasi ilmu pengetahuan dan teknologi dalam bidang Biologi Tumbuhan guna memanfaatkan sumber daya alam secara berkelanjutan bagi kesejahteraan manusia, 3. Membina kehidupan akademik yang berkualitas tinggi. Kompetensi Lulusan S2: Mampu memahami prinsip dasar ekologi atau taksonomi tumbuhan atau biologi selular dan molekular tumbuhan, dan mengaplikasikannya dalam bidang biodiversitas, sistematika dan atau bioteknologi tumbuhan. Kompetensi Lulusan S3: Menguasai prinsip dasar dan mampu menemukan inovasi dalam bidang ekologi atau taksonomi tumbuhan atau biologi selular dan molekular tumbuhan, dan mengembangkannya dalam penelitian dasar dan terapan untuk mendukung pengelolaan biodiversitas tumbuhan dan ekosistemnya, pengembangan sistematika tumbuhan dan pengembangan bioteknologi tumbuhan. Katalog

2 Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor KURIKULUM Program Magister Sains Kode Mata Kuliah SKS Semester Mata Kuliah Wajib SPs 6 SKS (14.6%) PPS 500 Bahasa Inggris 3 Ganjil/Genap STK / SPS Morfometrika / Analisis Statistik 3 Genap Mata Kuliah Wajib Mayor 22 SKS (56.1%) BIO 541 Genetika 3(3-0) Ganjil BIO 533 Sumberdaya Tumbuhan 3(2-3) Ganjil BIO 543 Metabolisme Tumbuhan 3(2-3) Ganjil BIO 531 Ekologi Tumbuhan 3(2-3) Ganjil BIO 590 Metode Ilmiah 2(2-0) Genap PPS 601 Kolokium 1 Genap PPS 690 Seminar 1 Ganjil/Genap PPS 699 Penelitian dan Tesis 6 Ganjil/Genap Mata Kuliah Pilihan Mayor minimal 12 SKS (29.3%) Mata Kuliah Kode BIO 5xx / 6xx dari mayor Biologi Tumbuhan Kelompok I : Minat Biologi Sel dan Fisiologi Tumbuhan BIO 546 Ekofisiologi Tumbuhan 3(2-3) Genap BIO 545 Biologi Kultur In Vitro Tumbuhan 3(2-3) Ganjil BIO 641 BIO 635/6 xx Pertumbuhan dan Perkembangan Tumbuhan Lanjut 3(2-3) Ganjil Mikroteknik Lanjut atau Pilihan BIO 6XX 3(2-3) Genap Kelompok II : Minat Genetika dan/atau Biologi Molekular Tumbuhan BIO 544 Genetika Molekular* 3(2-3) Genap BIO 643 Analisis Genetika* 3(2-3) Ganjil BIO 642 Rekayasa Genetika Tumbuhan 3(2-3) Genap BIO 613 Fisiologi Molekular* atau Plihan BIO 6xx 3(2-3) Ganjil Kelompok III : Minat Ekologi dan Sumberdaya Hayati Tropika BIO 534 Ekologi Sumberdaya Tropis 3(2-3) Genap BIO 532 Metodologi Ekologi Tumbuhan 3(2-3) Genap BIO 636 Fitoindikator atau Plihan BIO 6xx 3(2-3) Ganjil BIO 631 Biologi Konservasi Tumbuhan 3(2-3) Ganjil Katalog 2012

3 Meraih masa depan berkualitas bersama Sekolah Pascasarjana IPB Kode Mata Kuliah SKS Semester Kelompok IV : Minat Sistematika Tumbuhan BIO 535 Azas-azas Taksonomi Tumbuhan 3(2-3) Ganjil BIO 536 Tata Nama Biologi 3(2-3) Genap BIO 632 BIO 633 Teknik Penelitian Taksonomi dan Pengelolaan Herbarium Taksonomi Numerika dan Pemrosesan Data Taksonomi 3(2-3) Genap 3(2-3) Ganjil BIO 630 Tinjauan Tumbuhan Rendah** 2(2-0) Ganjil Total SKS * Menjadi Mata Kuliah Mayor di Program Studi Bioteknologi (BTK) ** Wajib diambil untuk mahasiswa yang mengambil topik penelitian tumbuhan rendah Catatan: Mata kuliah Pilihan Mayor diambil pada semester semester 2 sebanyak 6 SKS dan semester 3 sebanyak 6-8 SKS. Program Doktor Kode Mata Kuliah SKS Semester Mata Kuliah Wajib SPS 2 SKS (5%) PPS 702 Falsafah Sains 2 (2-0) Ganjil Mata Kuliah Wajib Mayor 24 SKS (60%) BIO 731 Keragaman, Evolusi dan Ekologi Tumbuhan 3(2-3) Ganjil BIO 742 Analisis dan Presentasi Data Biologi 3(2-3) Genap BIO 744 Biologi Molekular Tumbuhan 3(2-3) Genap PPS 701 Kolokium 1 Ganjil/Genap BIO 790 Seminar Biologi Tumbuhan 1(0-2) Ganjil/Genap PPS 790 Seminar 1 Ganjil/Genap PPS 799 Penelitian dan Disertasi 12 Ganjil/Genap Mata Kuliah Pilihan Mayor 15 SKS (35%) Mata Kuliah BIO 6xx / 7xx dari mayor Biologi Tumbuhan atau mata kuliah kode 6xx / 7xx dari mayor lain Kelompok I : Minat Biologi Sel dan Fisiologi Tumbuhan BIO 741 Interaksi Tumbuhan-Mikroba 3(2-3) Ganjil BIO 743 Transport dan Metabolisme Unsur Hara Tumbuhan 3(2-3) Ganjil BIO 746 Fisiologi Tumbuhan Lanjut 3 (3-0) Genap Mata Kuliah Penunjang 3 Ganjil Katalog

4 Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor Kode Mata Kuliah SKS Semester Mata Kuliah Penunjang 3 Genap Kelompok II : Minat Rekayasa Produk Alami Tumbuhan BIO 642 Rekayasa Genetika Tumbuhan 3(2-3) Genap BIO 748 BIO 733 Produk Alami Tumbuhan dan Rekayasa Metabolik Struktur Organ Sekretori dan Histokimia atau Mata Kuliah Penunjang 3(2-3) Genap 3(2-3) Ganjil Mata Kuliah Penunjang 3 Ganjil Mata Kuliah Penunjang 3 Ganjil Kelompok III : Minat Biologi Molekular Tumbuhan dan Bioteknologi BIO 642 Rekayasa Genetika Tumbuhan 3(2-3) Genap BIO 745 Reproduksi Tumbuhan 3(2-3) Ganjil BIO 747 Genetika Fisiologi Tumbuhan 3(3-0) Ganjil Mata Kuliah Penunjang 3 Ganjil Mata Kuliah Penunjang 3 Genap Kelompok IV : Minat Ekologi dan Sumberdaya Hayati Tropika BIO 735 Populasi, Komunitas dan Sistem Ekologi 3(2-3) Genap BIO 737 Strategi Konservasi Biodiversitas 3(2-3) Ganjil BIO 732 Fitososiologi dan Fitogeografi 3(2-3) Genap BIO 637 Keragaman Tumbuhan Simbion 3(2-3) Ganjil BIO 631 Biologi Konservasi Tumbuhan 3(2-3) Ganjil Kelompok V ; Sistematika Tumbuhan BIO 736 Seluk Beluk Konsep Jenis 2(2-0) Genap BIO 739 Falsafah Taksonomi 2(2-0) Ganjil BIO 738 Taksonomi dan Filogeni Tumbuhan 3(2-3) Genap BIO 639 Sitotaksonomi dan Sistematika Molekuler 3(2-3) Ganjil BIO 638 Klasifikasi Tradisional dan Sistematika Masa Depan 3(2-3) Ganjil BIO 634 Etnobotani dan Etnoekologi*** 2(2-0) Ganjil/Genap BIO 732 Fitososiologi dan Fitogeografi*** 3(2-3) Genap Total SKS *) Mahasiswa yang belum mendapatkan mata kuliah Analisis Statistika/ Morfometrika, dan atau Metodologi Penelitian/Metode Ilmiah atau yang setara pada jenjang S2 harus mengambil mata kuliah-mata kuliah tersebut. **) Pilihan mata kuliah harus disesuaikan dengan minat, topik penelitian dan seizin komisi pembimbing Katalog 2012

5 ***) Pilih salah satu dari mata kuliah tersebut Meraih masa depan berkualitas bersama Sekolah Pascasarjana IPB Catatan: Mata kuliah Pilihan Mayor/Penunjang diambil pada semester 1 sebanyak 6 SKS, semester 2 sebanyak 6 SKS dan semester 3 sebanyak 3-4 SKS. Program Doktor Jalur Riset Program Studi Biologi Tumbuhan membuka Program Doktor Jalur Riset dengan persyaratan dan ketentuan sesuai persyaratan dan ketentuan yang berlaku pada penerimaan Program Doktor Jalur Riset Sekolah Pascasarjana IPB. Bagi calon mahasiswa yang akan mengambil jalur ini harus sudah memiliki calon pembimbing utama di PS Biologi Tumbuhan. SILABUS MATA KULIAH BIO 531 Ekologi Tumbuhan 3(2-3) 1 Batasan sejarah dan perkembangan ekologi tumbuhan; perubahan energi dan produktifitas primer; pembentukan dan perkembangan habitat, sifat fisik dan kimia tanah serta lingkungannya. Hubungan stres air dan aspek fisiologisnya; habitat tergenang dan hubungannya dengan perkembangan tumbuhan; hara mineral dan siklus biogeokimia serta ekologi hara mineral bagi kehidupan; kompetisi, struktur tumbuhan dan faktor penyebabnya; suksesi, komposisi komunitas dan perubahan kecenderungan keragaman serta dominasi jenis; interaksi, variasi genetik dan ekologi dalam awal suksesinya. Dede Setiadi Muhadiono Ibnul Qayim BIO 532 Metodologi Ekologi Tumbuhan 3(2-3) 2 Pengumpulan data ekologi, pengambilan contoh di lapang; pendugaan kepadatan populasi tumbuhan; teknik penangkapan, penandaan dan penangkapan ulang; metode kuadrat dan garis transek; metode titik perempat; pendugaan parameter komunitas, kesamaan komunitas; analisis gugus dan pengukuran keanekaragaman spesies. Dede Setiadi Muhadiono BIO 533 Sumberdaya Tumbuhan 3(2-3) 1 Mata kuliah ini membahas arti dan makna sumberdaya tumbuhan, teknik dan strategi prospeksi, evaluasi, konservasi, dengan penekanan pada kegunaan plasmanutfah dan pemakaian bioteknologi dalam semua tahapan tersebut di atas, serta peran database dan bioinformatika dalam pemanfaatan dan pengelolaan sumberdaya tumbuhan juga dibahas arti dan makna biodiversitas tumbuhan, penggunaan karakter fitografi untuk mengetahui keragaman dan kekerabatan Katalog

6 Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor tumbuhan,peran domestikasi dan fitogeografi dalam persebaran jenis, tipe habitat dan penentu pusat keragaman tanaman. Rita Megia Tatik Chikmawati Harry Wiriadinata BIO 534 Ekologi Sumberdaya Tropis 3(2-3) 2 Sifat dan ciri utama ekosistem tropis, silvigenesis dan derajat sklerofili, pembandingan di dalam dan antar-daerah tropis, faktor dan sifat tanah hutan tropis, serta ciri-ciri biologis. Studi kasus dan perkembangan daerah tropis. Muhadiono BIO 535 Azas-azas Taksonomi Tumbuhan 3(2-3) 1 Teori, hukum, praktek dan seluk beluk penamaan, pencirian dan penggolongan. Bermacam kunci determinasi dan hakikat nama daerah dan nama ilmiah. Bukti-bukti taksonomi beserta perincian ciri dan sifat. Sejarah perkembangan pendekatan klasifikasi dan sistem klasifikasi. Takson, peringkat klasifikasi dan kategorisasi. Pendekatan penelitian flora, revisi dan monografi. Mien Ahmad Rifa i BIO 536 Tata Nama Biologi 3(2-3) 2 Tata nama botani dan zoologi dalam teori dan praktek. Sejarah, pertumbuhan dan perkembangan mutakhir sistem tata nama. Pendalaman asas dan pasal demi pasal kode tata nama botani internasional. Latihan kasus tata nama bermasalah. Mien Ahmad Rifa i dantim BIO 541 Genetika 3(3-0) 1 Genetika dan Organisme: gen sebagai penentu spesies, keragaman genetik, metodologi yang digunakan dalam genetika, organisme Sebagai model, gen, lingkungan, dan organisme. Pola Pewarisan: Pewarisan autosomal, kromosom sex dan pewarisan terpaut seks, Pewarisan sitoplasma. Kromosom sebagai dasar Pewarisan: Perkembangan sejarah teori kromosom, kodrat kromosom, Mitosis dan Meiosis, tingkah laku kromosom dan pola pewarisan pada eukaryot, kromosom orgarnel. Pemetaan Kromosom berdasarkan Rekombinasi: Penenemuan pola pewarisan gen-gen terpaut, rekombinasi, peta keterpautan, uji khi-kuadrat dalam analisis keterpautan, menghitung pindahsilang ganda yang tak tampak, peta keterpautan berdasarkan data F 2, keterpautan dalam silsilah manusia menggunakan logaritme. Genetika bakteri dan virusnya: Bagaimana bekerja dengan mikroorganisme, konjugasi bakteri, transformasi bakteri, genetika bakteriofage, transduksi, peta fisik vs.peta keterpautan. Hubungan Gen ke fenotipe: gen dan produk gen, interaksi alel dalam satu gen, interaksi gen dan Katalog 2012

7 Meraih masa depan berkualitas bersama Sekolah Pascasarjana IPB protein, penggunaan uji khi-kuadrat dalam rasio interaksi gen. Mutasi Kromosom: Perubahan pada struktur kromosom, perubahan dalam banyaknya kromosom. Struktur dan replikasi DNA: DNA sebagai bahan genetik, struktur DNA, replikasi semikonservatif, sekilas replikasi DNA, Replisom. Transkripsi dan prosesing RNA: RNA, Transkripsi, Transkripsi dalam eukaryot. Protein dan sintesis protein: Struktur protein, kolinearitas gen dan protein, Kode genetic, trna, ribosom, kejadian pascatranslasi. Mutasi, Pemulihan, dan Rekombinasi. Alex Hartana Aris Tri Wahyudi BIO 543 Metabolisme Tumbuhan 3(2-3) 1 Metabolisme tumbuhan membahas tentang pengetahuan terbaru mengenai aspek-aspek metabolisme di dalam tumbuhan mulai dari energi dan enzim, sel, fotosintesis, respirasi metabolisme karbohidrat, metabolisme lemak, metabolisme nitrogen, metabolisme sekunder dan pemanfaatan pengetahuan metabolisme untuk meningkatkan manfaat tumbuhan melalui rekayasa genetika, metabolik dan bioteknologi. Juga dilengkapi dengan pembahasan tentang teknologi omic, seperti metabolomic. Kuliah ini dilengkapi dengan kegiatan praktikum di laboratorium. Miftahudin Hamim Diah Ratnadewi Triadiati BIO 544 Genetika Molekular 3(2-3) 2 Mata kuliah ini memberikan pengertian tentang: peranan gen dalam kehidupan, sejarah penemuan bahan genetik, bahan genetik yang terdapat di inti sel dan bahan genetik di organel mitokondria dan kloroplast, struktur genom, proses replikasi DNA dan perangkat yang terlibat, proses ekspresi gen yang meliputi proses transkripsi dan translasi dan perangkat yang terlibat di dalam proses tersebut, faktor-faktor yang dapat menimbulkan keragaman genetik yaitu mutasi dan rekombinasi secara molekuler, dan regulasi sintesis protein pada organisme prokaryot, virus, dan organisme eukaryot. Suharsono Utut Widyastuti BIO 545 Biologi Kultur In Vitro Tumbuhan 3(2-3) 1 Mata kuliah ini membahas teknik kultur sel dan jaringan tanaman, konsep pertumbuhan dan diferensiasi sel/protoplas, de-diferensiasi dan re-diferensiasi, embriogenesis somatik, organogenesis, kejadian variasi somaklonal dan variasi yang diinduksi, metabolisme sekunder, serta berbagai fenomena yang terjadi dalam kultur in vitro. Diah Ratnadewi Ence Darmo Jaya Supena Sumaryono Katalog

8 Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor BIO 546 Ekofisiologi Tumbuhan 3(2-3) 2 Mata kuliah ini mempelajari aspek-aspek fisiologi tumbuhan berkaitan dengan dinamika yang terjadi pada lingkungan pada tingkat iklim mikro tumbuhan hingga iklim global. Dalam mata kuliah ini juga dibahas respon fisiologis dari tumbuhan dalam menghadapi perubahan lingkungan tersebut yang pada jangka pendek melahirkan adaptasi dan pada jangka panjang menjadi mata rantai evolusi. Triadiati, Sulistijorini BIO 590 Metode Ilmiah 3(2-3) 2 Mempelajari bagaimana pengetahuan baru diciptakan. Sains faktual vs sains ideal. Hal: sifat dan hukum. Kognisi dan pengetahuan. Persepsi dan pengamatan. Pengujian dan bukti. Tata cara penulisan karya ilmiah. Metode penelitian. Pembuatan proposal penelitian. Bambang Suryobroto Alex Hartana BIO 613 Fisiologi Molekular 3(2-3) 1 Struktur sel prokariot dan eukariot; struktur dan fungsi intraselular, spora; struktur, biogenesis dan peranan membran; asam amino dan protein; enzim; fotosintesis; koordinasi metabolisme energi aerob; metabolisme energi anaerob yang meliputi transport elektron anaerob, fermentasi; siklus sel dan kanker; modifikasi pasca traskripsi dan sortasi protein; signal sel; pergerakan sel. Kuliah dilengkapi praktikum. Anja Meryandini Nisa Rahmania Miftahudin BIO 630 Tinjauan Tumbuhan Rendah 3(2-3) 1 Mengantarkan konsep terbaru penataan dunia tumbuhan rendah: ganggang dan lumut. Mengupas evolusi, spesiasi, keanekaragaman morfologi dan reproduksi serta aspek-aspek pemanfaatannya. Sri Sudarmiyati Nunik Sri Aryanti BIO 631 Biologi Konservasi Tumbuhan 3(2-3) 1 Konsep konservasi biologi, tingkat kepentingan populasi, tingkat kepentingan sistem, sasaran konservasi keanekaragaman hayati, kepunahan dan biografi pulau, fragmentasi habitat, polusi dan degradasi habitat; konservasi pada tingkat spesies, populasi, komunitas, dan ekosistem; peranan kelembagaan dalam konservasi. Dede Setiadi Katalog 2012

9 BIO 632 Meraih masa depan berkualitas bersama Sekolah Pascasarjana IPB Teknik Penelitian Taksonomi dan Pengelolaan Herbarium 3(2-3) 2 Pengadaan spesimen herbarium melalui eksplorasi dan tukar-menukar koleksi. Pembuatan, pengelolaan, pendokumentasian, pengawetan dan pemanfaatan spesimen. Pengelolaan umum herbarium sebagai spesimen acuan dan bahan penelitian. Teknik pemeriksaan contoh tumbuhan hidup dan spesimen herbarium untuk penelitian. Langkah-langkah dan administrasi penelitian berdasarkan bahan herbarium. Seluk beluk penyusunan kunci determinasi. Penyitiran sinonim, spesimen serta pemahaman singkatan dan akronim. Macammacam pertelaan dan diagnosis. Penyiapan naskah untuk penerbitan. Teguh Triono, Nunik Sri Ariyanti BIO 633 Taksonomi Numerika dan Pemrosesan Data Taksonomi 3(2-3) 1 Pengelolaan data taksonomi dengan komputer. Pengelolaan spesimen dalam data base, pembuatan label spesimen, membuat deskripsi dan kunci determinasi serta peta persebaran. Program yang tersedia a. l. DELTA, IBIS, KORT MAPPING SYSTEM. Aliran klasik, fenetik, filogenetik dan kladistika. Pendekatan holistik, korelasi dan diskriminasi ciri serta penafsiran kekerabatan dengan memanfaatkan semua data dan informasi yang terkumpul dengan bantuan komputer. Teori dan praktek taksonomi numeris berdasarkan program yang tersedia (NT-Sys, HENNIG 86, PAUP dll.). Penyusunan dan penafsiran dendrogram dan kladogram sebagai alat bantu penelitian biosistematika. Rugayah BIO 634 Etnobotani dan Etnoekologi 2(2-0) 1/2 Sejarah pertumbuhan, ruang lingkup, konsep dasar dan pemanfaatan etnobotani dan botani ekonomi. Pendekatan botani, ekologi, ekonomi dan antropologi dalam penelitian sumber daya nabati suatu lingkungan budaya. Etnobotani dan botani ekonomi sebagai pembantu dan kepanjangan tangan taksonomi. Pengetahuan tradisional tentang adaptasi dan interaksi antar organisme dan pengaruh pengelolaan tradisional lingkungan alam terhadap kualitas lingkungan. Pengelolaan keanekaragaman hayati dengan melakukan identifikasi praktis dan kemungkinan pengembangannya untuk dapat menunjang pemanfaatan keanekaragaman hayati tersebut secara lestari dan menguntungkan. Praktik konservasi untuk promosi konservasi biologi dan keanekaragaman genetik. Etnoekologi mempelajari pula pengaruh aktivitas manusia terhadap lingkungan pada masa lalu dan masa sekarang. Eko Baroto Waluyo B.Yohannes Purwanto BIO 635 Mikroteknik Lanjut 3(2-3) 2 Pengetahuan tentang cara pembuatan sediaan mikroskopis tumbuhan dengan berbagai metode dan pembuatan foto sediaan mikroskopis menggunakan fotomikroskop, mikroskop fluoresens, fase kontras dan elektron Miftahudin Dorly Katalog

10 Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor BIO 636 Fitoindikator 3(2-3) 1 Pengertian adaptasi organisme terhadap faktor-faktor lingkungan; peran tumbuhan, hewan dan makro detritus dalam mengindikasikan kondisi lingkungan; jenis organisme yang berfungsi sebagai indikator keadaan habitat; algae dan tanaman tinggi sebagai indikator lingkungan, kehidupan ikan sebagai indikator kualitas perairan; pengukuran parameter ekologi di masa depan dalam memantau kualitas air. Ibnul Qayim BIO 637 Keragaman Tumbuhan Simbion 3(2-3) 1 Ragam simbiosis dalam ekosistem alamiah dan kegiatan pertanian. Trofobiosis, pola interaksi cahaya dan produktivitas tanaman. Lingkungan tumbuh optimum untuk produktivitas, sustainabilitas, stabilitas dan ekuitabilitas dalam sistem ekologi tropis. Analisis gradasi lahan, imobilisasi hara dan mimik multistrata komunitas tumbuhan menuju produktivitas optimum. Muhadiono BIO 638 Klasifikasi Tradisional dan Sistematika Masa Depan 3(2-3) 1 Persepsi tradisional terhadap sumberdaya alam tumbuhan melalui analisis simbolik dalam ritual dan mitos serta konsekuensi ekologinya, sistem pengetahuan tradisional tentang klasifikasi dan organisasi lingkungan melalui studi etnotaksonomi dan kapita selekta pembahasan perkembangan penelitian taksonomi mutakhir. Pemantauan kemajuan penyelesaian project flora Malesiana. Pemutakhiran dan pengupasan keberlakuan tata nama tetumbuhan sekitar sesuai simpulan versi dan penelaahan terakhir. Mien Ahmad Rifa i BIO 639 Sitotaksonomi dan Sistematika Molekular 3(2-3) 1 Kuliah ini membahas tentang pendekatan sitologi dan molekular dalam perkembangan mutahir dari taksonomi. Data Kromosom, isozim dan DNA dipakai untuk mengetahui variasi genetika pada tingkat populasi maupun jenis serta makna evolusinya dalam pemahaman kekerabatan antar takson. Tatik Chikmawati Dedi Darnaedi BIO 641 Pertumbuhan dan Perkembangan Tumbuhan Lanjut 3(2-3) 2 Kuliah Pertumbuhan dan Perkembangan Tumbuhan Lanjutan adalah mata kuliah yang mengajarkan tentang aspek-aspek penting dari pertumbuhan dan perkembangan tumbuhan yang meliputi pengenalan pertumbuhan dan diferensaisi Katalog 2012

11 Meraih masa depan berkualitas bersama Sekolah Pascasarjana IPB sel, pendalaman materi tentang fisiologi dan metabolisme hormon tumbuhan termasuk hubungannya dengan toleransi dan interaksi tumbuhan dengan mikroba, perkembangan dan pematangan buah dan biji, pembentukan cadangan makanan pada organ vegetatif, senesensi dan absisi. Pada bagian akhir mata kuliah ini dibahas aspek-aspek molekular dari kerja hormon, transduksi sinyal dan sistem penangkapan sinyal pada tumbuhan serta responnya terhadap perubahan lingkungan. Diah Ratnadewi Hamim BIO 642 Rekayasa Genetika Tumbuhan 3(2-3) 2 Rekayasa dan teknik-teknik dalam konstruksi mutan secara in vitro dan in vivo, pemetaan fisik dan genetik pada plasmid dan genom total,pengklonan molekular dan strateginya, analisis komplementasi dan hibridisasi Southern, transkripsi/translasi in vitro, pulse field gel electrophoresis (PFGE), PCR, DNA sequencing, analisis DNA dan protein dengan komputer, analisis transkripsi, mutagenesis terarah dan rekayasa protein, produksi protein di sel eukariot, rekayasa genetika pada tanaman. Analisis sifat quantitatif secara molekular. Gene slencing. Biosafety, paten dan bioetika. Utut Widyastuti Suharsono Miftahudin BIO 643 Analisis Genetik 3(2-3) 1 Mata kuliah ini membahas struktur dan ekspresi genom, teknik manipulasi DNA, isolasi DNA dan RNA, teknik pengklonan gen, pustaka genom, analisis genetik dan fisik genom virus dan bakteri, pemetaan genom eukariot, analisis rekombinasi dan analisis molekular, analisis genetik populasi, struktur, kesetimbangan dan keragaman populasi, analisis jarak dan kemiripan antar populasi, analisis genetik kuantitatif dan populasi, sifat monogen dan poligen, keragaman genetik dan lingkungan, heterosis dan kemajuan seleksi Suharsono Alex Hartana BIO 731 Keragaman, Evolusi dan Ekologi Tumbuhan 3(2-3) 1 Membahas tentang keragaman tumbuhan dari berbagai sudut pandang, seperti keragaman morfologi, anatomi, fisiologi, dan genetika yang dikaitkan dengan perjalanan evolusi dan ekologi dari tumbuhan tersebut. Disamping itu juga dibahas tentang mekanisme adaptasi dari berbagai ragam tumbuhan terhadap ekologi tertentu. Topik-topik terbaru dari aspek-aspek tersebut di atas akan menjadi bahan diskusi mahasiswa. Ibnul Qayim Tatik Chikmawati BIO 732 Fitososiologi dan Fitogeografi 3(2-3) 2 Sejarah fitososiologi, kelompok masyarakat tumbuhan sebagai satuan Katalog

12 Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor vegetasi, dinamika kelompok tumbuhan, simorfologi, metode pengambilan contoh vegetasi, pengolahan tabel dan data fitososiologi, ordinasi, pemetaan vegetasi, sintaksonomi dan sikronologi serta terapan fitososiologi. Asas-asas pemencaran dan persebaran tetumbuhan. Persebaran membujur dan melintang bumi serta meninggi. Peta bumi tumbuhan, pola vegetasi Malesia dan pemetaan. Plastisitas, fenotipe dan ekotipe dan pendekatan morfogeografi. Ibnul Qayim Ari Prihardianto BIO 733 Struktur Organ Sekretori dan Histokimia 3(2-3) 1 Pengetahuan tentang berbagai struktur organ sekretori yang merupakan tempat diakumulasinya berbagai senyawa metabolit sekunder dan pembahasan tentang beberapa teknik histokimia dan teknik isolasi senyawa kimia tersebut. Juliarni BIO 735 Populasi, Komunitas dan Sistem Ekologi 3(2-3) 2 Evaluasi berdasarkan prinsip-prinsip ekologi terhadap manajemen lingkungan, faktor abiotik dan biotik yang mempengaruhi distribusi jenis, strategi sejarah kehidupan, kompetisi antarspesies dan persamaan Lotka-Voltera; pendugaan kepadatan populasi pada organisme yang kontinyu, diskret doubling time, interaksi antar individu dalam populasi dan komunitas. Dede Setiadi BIO 736 Seluk Beluk Konsep Jenis 2(2-0) 2 Perkembangan konsep jenis dan Linneaus sampai kini, berawal dari konsep jenis morfologi, biologi, internodon dan komposit. Penerapan konsep tersebut dalam penyelesaian permasalahan taksonomi. Mien Ahmad Rifa i BIO 737 Strategi Konservasi Biodiversitas 3(2-3) 1 Nilai dari keanekaragaman hayati alami; kehilangan keanekaragaman hayati; strategi untuk konservasi keanekaragaman hayati; kebijakan nasional dalam konservasi keanekaragaman hayati; dorongan kebijakan lingkungan internasional dalam konservasi keanekaragaman hayati; insentif terhadap konservasi keragaman hayati lokal; pengelolaan keragaman hayati dalam lingkungan manusia; konservasi spesies, populasi, dan keragaman genetik; pengelolaan sumberdaya manusia untuk melindungi keanekaragaman hayati. Dede Setiadi Dodi Supriadi Katalog 2012

13 Meraih masa depan berkualitas bersama Sekolah Pascasarjana IPB BIO 738 Taksonomi dan Filogeni Tumbuhan 3(2-3) 2 Sejarah perkembangan konsep analogi dan homologi, paralelisme dan konvergensi, filogenetik dan filetik, monofiletik dan para filetik. Pengembangan dendogram menjadi pohon filogeni, fenogram, kladogram dan makna pengertian klasifikasinya. Mien Ahmad Rifa i BIO 739 Falsafah Taksonomi 2(2-0) 1 Perkembangan pemikiran klasifikasi dari Theophrathes sampai sekarang. Intuisi, diktum, teori Hennig. Intervensi teori evolusi dan kladistika dalam pola pikir penyusunan Klasifikasi. Mien Ahmad Rifa i BIO 741 Interaksi Tumbuhan-Mikroba 3(2-3) 1 Mata kuliah ini menjelaskan tentang interaksi antara tumbuhan dan mikroba dengan penekanan pada pengetahuan tentang interaksi yang bersifat simbiotik terutama simbiosis fiksasi nitrogen dan simbiosis mikoriza. Materi yang diberikan meliputi jenis-jenis interaksi yang dapat terjadi antara tumbuhan dengan mikoriza dan manfaatnya dalam kehidupan terutama di bidang pertanian, biodiversitas dan ekologi bakteri pemfiksasi nitrogen, metabolisme nitrogen di dalam rhizobia, metabolisme karbon dan fosfat, mekanisme molekular dan gen-gen yang terlibat di dalam proses simbiosis fiksasi nitrogen, beberapa metode pendekatan yang dapat digunakan dalam mempelajari interaksi antara tumbuhan dengan mikroba. Disampaikan pula secara terbatas tentang aspek molekular dari interaksi yang bersifat patogenik terutama interaksi cendawan patogen dengan tumbuhan dan mikoriza. Aris Tjahjoleksono Utut Widyastuti BIO 742 Analisis dan Presentasi Data Biologi 3(2-3) 2 Membahas teknik analisis dan presentasi data biologi dalam forum ilmiah secara benar dan baku, yang meliputi teknik analisis data, penulisan dan koreksi suatu makalah, penyajian hasil penelitian dalam bentuk poster, seminar dan publikasi ilmiah pada jurnal ilmiah nasional dan internasional. Mahasiswa akan mendapat kesempatan latihan membuat poster, makalah seminar, bahan presentasi seminar dan mempresentasikan makalah seminar, serta membuat publikasi ilmiah. Ence Darmo Jaya Supena BIO 743 Transport dan Metabolisme Unsur Hara Tumbuhan 3(2-3) 1 Mata kuliah ini membahas tentang prinsip unsur hara tumbuhan dari pengetahuan klasik sampai terkini, transport dan metabolismenya di dalam Katalog

14 Sekolah Pascasarjana Institut Pertanian Bogor tumbuhan. Topik yang dipelajari meliputi definisi dan klasifikasi unsur hara tumbuhan, fisiologi hara, ketersediaan hara, pergerakan hara dari tanah sampai tumbuhan; absorpsi dan tranport yang meliputi ion uptake, transpor jangka pendek dan panjang di dalam tumbuhan, mobilitas hara dalam floem, tinjauan fisiologi dan molekular tranport melalui ion channel, transporter dan bagian lain dari membran; asimilasi dan fungsi unsur hara di dalam tumbuhan yang meliputi unsur hara makro, fiksasi N biologis, hara mikro; aspek-aspek ekologi, genetik dan molekular dari unsur hara yang meliputi resistensi terhadap penyakit, variasi genetik dalam pengambilan unsur hara, kompetisi unsur hara, adaptasi tumbuhan terhadap defisiensi dan keracunan unsur hara. Kuliah akan dilengkapi dengan seminar dan diskusi. Triadiati BIO 744 Biologi Molekular Tumbuhan 3(2-3) 2 Mata kuliah ini akan membahas pendekatan molekular yang digunakan dalam mempelajari memecahkan masalah-masalah biologi tumbuhan dari mulai proses-proses perkembangan tumbuhan sampai respon fisiologi. Dalam kuliah ini akan dipelajari dan didiskusikan topik-topik antara lain, overview pendekatan dasar molekular dalam biologi tumbuhan; model/sistem ekspresi gen, analisis genetik, pendekatan molekular dalam mempelajari pembelahan sel, perkembangan tumbuhan (embriogenesis, meristem, akar, pembungaan); pensinyalan hormon, interaksi tumbuhan-patogen; respons tumbuhan terhadap cekaman biotik dan abiotik; fotomorfogenesis; rekayasa genetik pada tumbuhan, projek genom Arabidopsis dan Padi. Miftahudin Utut Widyastuti BIO 745 Reproduksi Tumbuhan 3(2-3) 1 Reproduksi merupakan tahapan menentukan bagi organisme untuk kelangsungan hidupnya dan merupakan kajian yang sangat menarik dalam penelitian dasar biologi tumbuhan maupun pengembangan dan aplikasinya dalam agrobisnis. Mata kuliah reproduksi tumbuhan membahas mulai dari siklus hidup dan dasar selular reproduksi seksual dan aseksual; organ dan mekanisme pembungaan; gametogenesis dan fertilisasi; sampai embriogenesis dan perkembangan biji. Embriogenesis nonzigotik yaitu embryogenesis somatik, androgenesis, ginogenesis dan apomiksis; serta perbanyakan vegetatif secara alami dan induksi in vivo maupun in vitro juga merupakan materi yang dibahas berikutnya. Kuliah ini akan dilengkapi dengan materi praktikum untuk beberapa pokok bahasan, presentasi dan diskusi topik pilihan, maupun kunjungan ke instansi atau perusahaan yang proses kerjanya menggunakan prinsip dasar reproduksi tumbuhan. Ence Darmo Jaya Supena Katalog 2012

15 Meraih masa depan berkualitas bersama Sekolah Pascasarjana IPB BIO 746 Fisiologi Tumbuhan Lanjut 3 (3-0) 2 Kuliah ini menjelaskan tentang fisiologi tumbuhan C3, C4 dan CAM, struktur dan perkembangan fotosistem, respon fotosintesis terhadap CO2 dan suhu global, efek lingkungan terhadap tumbuhan, fisiologi perakaran, fisiologi tanaman epifit, fitoremediasi dan fisiologi tumbuhan penambang polutan. Diah Ratnadewi Triadiati BIO 747 Genetika Fisiologi Tumbuhan 3(3-0) 1 Organisasi genetik, ekson dan intron, gen struktural, regulasi ekspresi gen; elemen pengontrol dan fungsi gen; penyaringan selektif; isozim dan penggunaannya sebagai ciri dan alat genetik; fisiologi dan genetika interaksi parasit dan inangnya; pengontrol genetik pada protein biji; Mutan-mutan yang mempengaruhi fotorespirasi; flavonoid dan karotenoid; mutan dan zat pengatur tumbuh; transfer DNA ke dalam tumbuhan; mutan auksotropik pada tumbuhan; peranan genetika fisiologi dalam pemuliaan tanaman. Suharsono BIO 748 Produk Alami Tumbuhan dan Rekayasa Metabolik 3(2-3) 2 Membahas aspek-aspek metabolisme sekunder dari tumbuhan, termasuk di dalamnya tentang terpenoid, flavonoid, alkaloid dan metabolit sekunder lainnya. Teori dan metode rekayasa metabolit tumbuhan melalui aplikasi teknik-teknik biologi molekular dan bioteknologi untuk tujuan peningkatan kualitas pangan dan obat-obatan. Miftahudin, dan tim BIO 790 Seminar Biologi Tumbuhan 1(0-2) 1/2 Mempresentasikan topik khusus dalam biologi tumbuhan sesuai dengan minat mahasiswa di bawah arahan dosen pembimbing (ketua komisi pembimbing mahasiswa bersangkutan) dalam suatu seminar departemen biologi yang dihadiri oleh dosen dan mahasiswa pasca sarjana departemen biologi atau mayor biologi tumbuhan. Seminar ini bisa disubstitusi dengan presentasi seminar pada pertemuan ilmiah nasional atau internasional. Aris Tjahjoleksono Katalog