ANALISIS FAKTOR RESIKO INFEKSI Escherichia coli O157:H7 PADA SAPI DI KECAMATAN PETANG KABUPATEN BADUNG SKRIPSI Diajukan untuk Melengkapi Tugas-Tugas dan Memenuhi Persyaratan untuk Mencapai Gelar Sarjana Kedokteran Hewan Oleh Andi Isma Lestari Amin NIM 1009005071 BAB I FAKULTAS KEDOKTERAN HEWAN UNIVERSITAS UDAYANA DENPASAR 2014
ANALISIS FAKTOR RESIKO PENYEBARAN Escherichia coli O157:H7 PADA SAPI DI KECAMATAN PETANG KABUPATEN BADUNG SKRIPSI Diajukan untuk Melengkapi Tugas-Tugas dan Memenuhi Persyaratan untuk Mencapai Gelar Sarjana Kedokteran Hewan Diajukan oleh Andi Isma Lestari Amin NIM 1009005071 Menyetujui/Mengesahkan Pembimbing I, Pembimbing II, Dr. drh. I Wayan Suardana, M.Si drh. Kadek Karang Agustina, SKH, M.P NIP. 19700122 199512 1 001 NIP. 19840804 200812 1 001 DEKAN FAKULTAS KEDOKTERAN HEWAN UNIVERSITAS UDAYANA Dr. drh. Nyoman Adi Suratma, M.P NIP. 19600305 198703 1 001 Tanggal Lulus : i
Setelah mempelajari dan menguji dengan sungguh sungguh kami berpendapat bahwa tulisan ini baik ruang lingkup maupun kualitasnya dapat diajukan sebagai skripsi untuk memperoleh gelar Sarjana Kedokteran Hewan. Ditetapkan di Denpasar, tanggal Panitia penguji Dr. drh. I Wayan Suardana. M.Si Ketua drh. Kadek Karang Agustina, SKH, M.P Sekretaris dr. Made Agus Hendrayana, M.Ked Anggota drh. Tjokorda Sari Nindhia, SKH, M.P Anggota Dr. drh. Hapsari Mahatmi, M.P Anggota ii
RIWAYAT HIDUP Penulis, Andi Isma Lestari Amin, dilahirkan di Tanahberu, Kabupaten Bulukumba Sulawesi Selatan pada tanggal 22 September 1990. Penulis merupakan anak kedua dari tiga bersaudara dari pasangan Andi Muhammad Amin, S.Pd, M.Pd dan Andi Batari Toja, S.Pd. Penulis menempuh Sekolah Dasar (SD) di Sekolah Dasar Negeri 155 Center Tanahberu dan lulus pada tahun 2003, kemudian lulus dari bangku Sekolah Menengah Pertama (SMP) di Sekolah Menengah Pertama Negeri 2 Kota Bulukumba pada tahun 2006, dan menamatkan Sekolah Menengah Atas (SMA) di Sekolah Menengah Atas Negeri 2 Kota Bulukumba pada tahun 2009. Penulis resmi terdaftar sebagai mahasiswa Kedokteran Hewan Universitas Udayana pada tahun 2010 melalui jalur Seleksi Nasional Masuk Perguruan Tinggi Negeri (SNMPTN). Selama berada di Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana, penulis aktif menjadi Pengurus Minat dan Profesi (Minpro) SULUH pada periode kepengurusan 2011-2013 dan aktif menjadi Pengurus BEM Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana tahun 2012-2014. Dalam rangka menyelesaikan tugas akhir dan untuk memenuhi salah satu persyaratan untuk mencapai gelar Sarjana Kedokteran Hewan penulis melakukan penelitian dengan judul Analisis Faktor Resiko Infeksi Escherichia coli O157:H7 Pada Sapi di Kecamatan Petang Kabupaten Badung. i
ABSTRAK Tujuan penelitian ini untuk mengetahui faktor resiko yang berperan dalam infeksi agen E. coli O157:H7 dan mengetahui asosiasi diantara faktor-faktor resiko terhadap infeksi E. coli O157:H7 pada ternak sapi. Sampel yang dipergunakan adalah sebanyak 58 sampel feses sapi yang dilengkapi dengan data epidemiologi. Sampel berasal dari tujuh desa di Kecamatan Petang Kabupaten Badung. Tahapan isolasi E. coli dilakukan dengan menumbuhkan bakteri pada media eosin methylene blue agar (EMBA). Selanjutnya dilakukan pewarnaan Gram untuk mengetahui bentuk dan warna dari E. coli. Untuk membedakan bakteri fecal coli dan non fecal coli maka dilakukan identifikasi isolat dengan uji indol, methyl red, voges-proskauer dan simon citrate (IMVIC). Selanjutnya untuk mengkonfirmasi E. coli O157 maka isolat ditumbuhkan pada media sorbitol macconkey agar (SMAC) yang dilanjutkan dengan uji aglutinasi latek O157. Tahapan akhir yang dilakukan untuk memastikan E. coli O157 tersebut adalah E. coli O157:H7 maka diuji dengan uji antiserum H7. Hasil analisis data epidemiologi dengan Odds ratio menunjukkan bahwa sapi jenis kelamin jantan memiliki nilai Odds ratio 4,1 yang berarti memiliki resiko menyebarkan E. coli O157:H7 4,1 kali lebih besar dibandingkan dengan sapi yang berjenis kelamin betina. Selain itu, sumber air minum ternak yang berasal dari non PAM memiliki nilai Odds ratio 2,4 yang berarti 2,4 kali beresiko menyebarkan E. coli O157:H7 dibandingkan dengan air minum yang bersumber dari PAM. Namun, setelah dilakukan uji Chi square belum ditemukan adanya signifikansi yang berpengaruh nyata (P>0,05) dari asosiasi diantara faktor- faktor resiko tersebut. Kata kunci : E. coli O157:H7, VTEC, Faktor resiko, Sapi, Petang ii
ABSTRACT The purpose of the research are to find out the risk factors that take part in the infection of E. coli O157:H7 agent and also the association between the risk factors toward the infection of E. coli O157:H7. The samples that are used in this research are the samples of cattle feces and completed by the epidemiologic data. The samples comes from seven villages in Petang subdistrict, Badung regency. The isolation stages of E. coli are proceeded by growing the bacteria on eosin methylene blue agar (EMBA) media. Then continued with the Gram coloring in order to identifythe sahpe and the color of E. coli. In oreder to differentiate fecal coli bacteria with non fecal coli, isolates identification with indole test, methyl red, voges-proskauer and simon citrrate (IMVIC) are needed. Next stage is to confirm the E. coli O157 by growing the isolates on sorbitol macconkey agar (SMAC) media nad continued by latex agglutination test of E. coli O157.the last stage is in order to ensure the E. coli O157 in needed E. coli O157:H7, then the antiserum H7 test is needed. The result from the epidemiologic data analysis with Odds ratio shows that the male cattle possess the Odds ratio of 4,1 which means there are 4,1 times more E. coli O157:H7 transmit risk than female cattle. More over, drinking water source for cattle that comes from non PAM source has odds ratio of 2,4, which means that there are 2,4 times more E. coli O157:H7 transmit risk than the drinking water from PAM. However, after Chi square test had been carried out, there is still no risk factors yet that has significant real impact (P>0,05) from the association among those risk factors. Keywords : E. coli O157:H7, VTEC, Risk factor, Cattle, Petang iii
UCAPAN TERIMA KASIH Puji syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT, Tuhan Yang Maha Esa, berkat rahmat dan karunia-nya penelitian dan penulisan skripsi yang berjudul Analisis Faktor Resiko Infeksi Escherichia coli O157:H7 Pada Sapi di Kecamatan Petang Kabupaten Badung dapat terselesaikan. Skripsi ini ditulis sebagai salah satu persyaratan untuk mencapai gelar Sarjana Kedokteran Hewan pada Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana. Pada kesempatan ini penulis menyampaikan ucapan terima kasih dan penghargaan yang setinggi-tingginya kepada : 1. Bapak Dr. drh. Nyoman Adi Suratma, M.P, selaku Dekan Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana. 2. Bapak Dr. drh. I Wayan Suardana, M.Si selaku pembimbing I yang telah banyak membimbing saya dan atas keikutsertaan saya dalam penelitian kerjasama Kemitraan Penelitian dan Pengembangan Pertanian Nasional (KP3N) yang didanai oleh Badan Pengembangan Pertanian Kementerian Pertanian 2014. 3. Bapak drh. Kadek Karang Agustina, SKH, M.P selaku pembimbing II yang dengan penuh kebesaran hati telah meluangkan waktu dan pikiran untuk membimbing penulis dalam penulisan skripsi sehingga skripsi ini dapat terselesaikan dengan baik. 4. Para dosen penguji Bapak dr. Made Agus Hendrayana, M.Ked, Ibu drh. Tjokorda Sari Nindhia, SKH, M.P, dan Ibu Dr. Drh. Hapsari Mahatmi, M.P, atas kesediaannya menjadi penguji skripsi dan telah memberikan saran dan kritik yang sangat baik dan membangun dalam rangka perbaikan skripsi ini. 5. Bapak drh. I Gusti Ketut Suarjana, M.P selaku pembimbing akademik yang telah membimbing penulis selama mengikuti perkuliahan di Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana. 6. Bapak dan Ibu dosen Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana yang telah mendidik dan membimbing penulis selama mengikuti masa perkuliahan. iv
7. Ibu Ni Wayan Nursini, S.Tp, M.P staf Laboratorium Biosains dan Bioteknologi Bukit Jimbaran yang telah membantu dalam penelitian saya. 8. Kedua orang tua tercinta, Ibunda Andi Batari Toja S.Pd dan Ayahanda Andi Muhammad Amin, S.Pd, M.Pd, yang tak henti-hentinya memanjatkan doa dan senantiasa memberikan nasehat dan dukungan moril maupun materi, serta kakak dan adik ku tercinta, Andi Primi Lestari dan Andi Nur Ilmi Tenri Dio serta Andi Dhadan Mirdan yang selalu menjadi penyemangat dan inspirasiku untuk maju. 9. Ruwaidah, Natazha Priski Deanasthi, Tri Suci Galingging, Ratna Bayuningsih, Sari Sartini, Yunita Sri Hastuti, Wahyu Hananto serta temanteman seperjuangan angkatan 2010, yang tidak dapat penulis sebutkan satu persatu. Terima kasih atas berbagai bantuan dan kerjasamanya. 10. Venny Johan, drh. Rasdiyanah, dan drh. Adriyani Ris serta semua anggota keluarga besar IKAMI (Ikatan Mahasiswa/Pelajar Indonesia) Sulsel Cab. Bali yang telah menjadi keluarga baru selama penulis tinggal di Bali. Penulis menyadari skripsi ini masih jauh dari sempurna dan untuk itu segala kritik dan saran penulis harapkan demi sempurnanya skripsi ini. Sebagai akhir kata penulis berharap skripsi ini dapat bermanfaat bagi kita semua. Denpasar, Mei 2014 P e n u l i s v
DAFTAR ISI Halaman RIWAYAT HIDUP... i ABSTRAK... ii ABSTRACT... iii UCAPAN TERIMA KASIH... iv DAFTAR ISI... vi DAFTAR TABEL... viii DAFTAR GAMBAR... ix DAFTAR LAMPIRAN... x BAB I PENDAHULUAN... 1 1.1 Latar Belakang... 1 1.2 Rumusan Masalah... 4 1.3 Tujuan Penelitian... 4 1.4 Manfaat Penelitian... 5 1.5 Kerangka Konsep... 5 1.6 Hipotesis Penelitian... 8 BAB II TINJAUAN PUSTAKA... 9 2.1 Escherichia coli... 9 2.2 Verotipe Escherichia coli... 11 2.3 Escherichia coli O157:H7... 14 2.3.1 Penularan Escherichia coli O157:H7... 17 2.3.2 Faktor Resiko Infeksi Escherichia coli O157:H7... 19 2.4 Kondisi Geografis Kecamatan Petang... 22 BAB III MATERI DAN METODE... 24 3.1 Bahan Penelitian... 24 3.2 Alat Penelitian... 24 3.3 Cara Pengumpulan Data Epidemiologi... 25 3.4 Prosedur Pengambilan Sampel Feses... 26 3.5 Isolasi dan Identifikasi Escherichia coli O157:H7... 27 3.6 Variabel Penelitian... 31 3.7 Analisis Data... 31 3.8 Lokasi Dan Waktu Penelitian... 32 BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN... 33 4.1 Isolasi dan Identifikasi Escherichia coli O157:H7... 33 4.2 Analisis Faktor Resiko Infeksi Escherichia coli O157:H7... 35 4.3 Pengujian Hipotesis... 42 vi
BAB V PENUTUP... 43 5.1 Kesimpulan... 43 5.2 Saran... 43 DAFTAR PUSTAKA... 44 LAMPIRAN... 49 vii
DAFTAR TABEL Tabel Halaman 1. Hasil Isolasi E. coli dan Identifikasi E. coli O157:H7 di Kecamatan Petang Kabupaten Badung... 34 2. Deskripsi Data Hasil Analisis Faktor-faktor yang Berpengaruh Terhadap Infeksi E. coli O157:H7 pada Sapi di Kecamatan Petang.. 35 3. Hasil Penghitungan Chi-square, P value dan Odds ratio Faktor yang Berpengaruh Terhadap Infeksi E. coli O157:H7... 37 viii
DAFTAR GAMBAR Gambar Halaman 1. Wilayah Kecamatan Petang... 3 2. Bagan Kerangka Konsep E. coli O157:H7... 6 3. Bentuk Bakteri Escherichia coli pada Mikroskop Elektron... 10 4. Transmisi Infeksi E. coli O157:H7 dari Ternak ke Manusia... 18 5. Bakteri Escherichia coli yang Tumbuh Pada Media EMBA... 28 6. Kondisi Sapi pada Beberapa Tempat Pemeliharaan... 36 ix
DAFTAR LAMPIRAN Lampiran Halaman 1. Kuisioner Penelitian... 49 2. Data Hasil Isolasi dan Identifikasi E. coli O157:H7 di Kecamatan Petang Kabupaten Badung... 50 3. Data Hasil Uji Chi square dan Uji Odds ratio... 52 4. Foto Hasil Uji Isolasi dan Identifikasi E. coli O157H7... 61 x