Kimia Komputasi LANGKAH-LANGKAH MENDOWNLOAD, MENGISTAL DAN MENGGUNAKAN APLIKASI CHEMSKETCH

Transkripsi

1 LANGKAH-LANGKAH MENDOWNLOAD, MENGISTAL DAN MENGGUNAKAN APLIKASI CHEMSKETCH 1. Langkah-langkah mendownload aplikasi Chemsketch Awalnya buka link google.com dan masukkan kata kunci situs download chemsketch kolom pencarian maka akan mencul tampilan sebagai berikut. Kemudian klik chemsketch download seperti pada tanda panah. Setelah mengklik, maka mencul tampilan sebagai berikut, kemudian klik free download Modul Page 1

2 Setelah halaman terbuka, klik download maka akan mencul proses download seperti pada gambar dibawah ini. Setelah mengklik download, maka akan mencul gambar untuk menyimpan file dan klik star download maka aplikasi mulai didownload seperti pada gambar di bawah ini dan tunggu sampai proses ini selesai. Modul Page 2

3 Kemudian, setelah proses download telah selesai simpan file dan memulai proses penginstalan. 2. Cara Menginstal Aplikasi Chemsketch Klik 2 kali file Chemsk11 yang telah selesai didownload, setelah mengklik maka akan muncul tampilan seperti pada gambar dibawah ini, dan klik next untuk memulai proses download. Modul Page 3

4 Setelah klik next maka akan muncul jendela dialog instal lalu pilih I accept the terms in the license agreement, kemudian pilih next. Setelah itu, akan mencul jendela seperti pada gambar, maka klik lagi next untuk melanjutkan proses pengistalan. Modul Page 4

5 Kemudian klik lagi next untuk melanjutkan pengistalan. Proses selanjutnya, setelah muncul jendela baru klik instal pada kotak dialog. Proses penginstalan telah berjalan, tunggu sampai selesai. Modul Page 5

6 Kemudian klik finish untuk mengakhiri proses penginstalan. 3. Cara Menggunakan Aplikasi Chemsketch Modul Page 6

7 Buka aplikasi chemskecth yang telah terinstal sebelumnya dengan cara buka tampilan dekstop, kemudian klik star dan pilih all program. Setelah mengklik all program maka akan muncul tampilan seperti pada gambar dibawah ini, pilih folder Chemsketch dan klik folder Chemsketch. Setelah klik folder Chemsketch, maka akan muncul tampilan seperti pada gambar dibawah ini. Berikut beberapa menu file dari Chemsketch yang penting untuk membuat struktur. Modul Page 7

8 Hal yang harus diperhatikan sebelum melakukan yaitu: 1. Telah didapatkan struktur yang diinginkan 2. Menyimpan semua file dalam satu direktori kerja agar mudah untuk mencarinya. Contohnya struktur steroid: Dengan menggunakan aplikasi Chamsketch kita bisa merangkai secara manual dengan memanfaatkan beberapa menu file dari aplikasi ini, jadi kita bisa menggambarkan struktur steroid persis dengan gambar diatas. Berikut hasil yang dibuat: Modul Page 8

9 Struktur ligan yang dibuat dalam bentuk 2D dan akan diubah ke dalam bentuk 3D dengan cara klik ACD/LABS, kemudian mencentang 3D Viewer (Freeware). Modul Page 9

10 Setelah itu, akan mencul tampilan seperti pada gambar dibawah ini. Setelah itu copy struktur yang kita buat ke dalam 3D Viewer. Sebelumnya kembalikan tampilan struktur ke 2D dengan mengklik 1-Chemsketch seperti pada gambar dibawah ini. Modul Page 10

11 Maka tampilan akan menjadi 2D. Kemudian klik 2-copy to 3D Setelah itu, akan muncul gambar seperti dibawah ini. Setelah selesai proses membuat struktur, simpan truktur yang selesai dibuat dengan mengklik file dan plih menu file klik save as. Modul Page 11

12 Setelah mengklik save as, maka muncul tampilan seperti dibawah ini. Kemudian ubah isian pada kolom "Safe As Type dengan GIF Images. Kemudian langkah selanjutnya klik save pada tampilan. Modul Page 12

13 Setelah itu, kita bisa lihat hasilnya pada folder penyimpanan.hasilnya seperti dibawah ini. LANGKAH-LANGKAH MENDOWNLOAD, MENGINSTAL DAN MENGGUNAKAN APLIKASI CHEMSKETCH Modul Page 13

14 1. Langkah-Langkah Mendownload Aplikasi Chemsketch Awalnya buka link google.com dan masukkan kata kunci download marvinsketch pada kolom pencarian, maka akan muncul tampilan sebagai berikut. setelah situs terbuka, maka double klik untuk marvinsketch-advanced chemical drawing software yang ditunjuk arah panah. setelah mengklik marvinsketch-advanced chemical drawing software, maka akan muncul tampilan seperti dibawah ini.kemudian klik DOWNLOAD Modul Page 14

15 Setelah itu, klik softpedia secare download (US) dan tunggu perintah selanjutnya. Kemudian akan muncul tampilan seperti berikut, klik start download. Modul Page 15

16 Kemudian akan muncul tampilan seperti dibawah ini dan klik download marvin. Setelah muncul tampilan seperti di bawah ini, klik I accept the lisence agreement. Modul Page 16

17 Setelah itu geser kursor kebawah hingga muncul tampilan get archive, namun sebelum itu ganti terlebih dlu angka pada kotak select archive version menjadi Lalu klik menu get archive untuk menuju ke proses selanjutnya. Kemudian akan muncul tampilan seperti dibawah ini (kotak pengisian). Awalnya kita harus memiliki akun dan password Modul Page 17

18 Kemudian isi kolom user name lalu isi Jika belum memiliki akun, maka kita bisa membuat akun baru dengan cara klik register pada bagian bawah samping kiri, dan isi data yang diminta serta ikuti petunjuk selanjutnya. Kemudian setelah terbuka halaman seperti dibawah ini, kita bisa klik I angree untuk melanjutkan ke tahap berikutnya. Modul Page 18

19 Selanjutnya isi tampilan dibawah ini sesui dengan apa yang diinginkannya. Kemudian setelah selesai mengisi centang I agree to the tema of servis dan klik sumit Selanjutnya, kita akan menuju ketampilan berikutnya yaitu proses pemilihan tipe, seperti pada gambar, cari marvinbeans-6.0.0_windows_jre.exe mb, kemudian klik pilihan tersebut maka akan muncul kontak pemberitahuan proses pengunduhan, jadi silahkan tunggu sejenak. Modul Page 19

20 Kemudian akan muncul tampilan untuk memulai download aplikasi marvinsketch, klik star download untuk memulai mendownload aplikasi. Proses download telah berjalan, tunggu sebentar sampai proses ini telah selesai. Modul Page 20

21 2. Cara Menginstal Marvinsketch Setelah proses pengunduhan selesai, buka file yang telah terinstal. Setelah terbuka, lakikan double klik pada file tersebut. Kemudian muncul tampilan seperti dibawah ini bertanda aplikasi sedang memulai untuk menginstal. Modul Page 21

22 Setelah muncul tampilan seperti dibawah ini maka klik next. Dan seterusnya klik next untuk melanjutkannya. Proses dibawah ini mengakhiri proses penginstalan aplikasi Marvinsketch. Modul Page 22

23 3. Cara Menggunakan Aplikasi Marvinsketch Awalnya nyalakan komputer dan cari aplikasi marvinsketch yang telah terinstal. Klik aplikasi marvinskrtch. Kemudian, akan muncul lembar kerja seperti dibawah ini. Modul Page 23

24 Cari struktur atau senyawa yang ingin di gambar pada tampilan ini. sebagai contoh senyawa flavonoid sebagai berikut: Dengan menggunakan aplikasi Chamsketch kita bisa merangkai secara manual dengan memanfaatkan beberapa menu file dari aplikasi ini, jadi kita bisa menggambarkan struktur steroid persis dengan gambar diatas. Berikut hasil yang dibuat: Modul Page 24

25 Kemudian untuk mengubah dalam bentuk yang lebih menarik, kita bisa mengklik view kemudian pilih structure display, kemudian klik ball and stick. Kemudian struktur akan brubah seperti pada tampilan dibawah ini. Langkah selanjutnya kita dapat menyimpan file dengan mengklik file kemudian klik save as. Modul Page 25

26 Setelah muncul tampilan seperti dibawah ini, kita dapat memilih dimana file dapat disimpan ditempat yang aman dan mudah terjangkau. Modul Page 26

27 LANGKAH-LANGKAH MENDOWNLOAD LIGAN DAN PROTEIN Awalnya buka geogle.com kemudian ketik pdb.org pada kolom pencarian. Setelah muncul tampilan seperti berikut, klik RCSB Protein Data Bank-RCSB PDB. Setelah mengklik RCSB Protein Data Bank-RCSB PDB maka akan muncul tampilan seperti dibawah ini. Modul Page 27

28 Kemudian ketik ligan yang ingin dicari contohnya ligan Steroid pada kolom pencarian. Setelah mengketik ligan, klik Go dan perhatikan tanda panah dibawah ini. Setelah itu akan muncul hasil pencarian berupa beberapa struktur senyawa steroid yang bisa digunakan, pilih beberapa ligan dari senyawa steroid yang ingin diambil. Modul Page 28

29 Klik Download PDB File seperti pada gambar dibawah ini dan simpan ditempat yang mudah dijangkau. Setelah itu, muncul tampilan seperti dibawah ini dan klik oke pada gambar tersebut untuk memulai menyimpan file yang telah didownload. Modul Page 29

30 Berikut hasil yang diperoleh. Kimia Komputasi Modul Page 30