Foto : Toufan GENETIKA POPULASI Manta alfredi (Krefft, 1868) ANTARA RAJA AMPAT, PULAU KOMODO DAN NUSA PENIDA BERDASARKAN DNA MITOKONDRIA Toufan Phardana 1), Yuli Naulita 1), Beginer Subhan 1), Hawis Madduppa 1), Abraham Sianipar 2), Mark Erdmann 2) 1 Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor 2 Conservation International Simposium Nasional Hiu dan Pari ke-2 Jakarta, 28, 29 Maret 218 Supported by Sponsor by
PENDAHULUAN Taxonomy Subclass : Elasmobranchii Family : Mobulidae Genus : Manta Species : Manta alfredi (Krefft, 1868) Ciri morfologi 1. Bentuk kepala sangat lebar dan memiliki sepasang cuping 2. Letak mulut di ujung/terminal melintang 3. Ekor tidak memiliki duri sengat 4. Ukurannya relatif lebih kecil daripada Manta birostris (Marshall et al. 29)
STATUS Manta alfredi (Reef Manta Ray) Status IUCN: Vulnerable/Rawan Pop trend: decreasing CITES : Appendik II KEPUTUSAN MENTERI KELAUTAN DAN PERIKANAN REPUBLIK INDONESIA NOMOR 4/KEPMEN-KP/214 TENTANG PENETAPAN STATUS PERLINDUNGAN PENUH IKAN PARI MANTA The IUCN Red List of Threatened Species: Manta alfredi published in 211 http://dx.doi.org/1.235/iucn.uk.211-2.rlts.t195459a896979.en
Penyebaran Manta alfredi di beberapa wilayah perairan Indonesia Pulau Pieh Sangalaki, Kepulauan Derawan Halmahera Selat Lembeh Raja Ampat Pulau Banyak Bar Taman Nasional Komodo Kep. Gili NTT Pulau Rote Pantai Wonokaka Nusa Penida
Mexico Japan Africa Indonesia Kashiwagi et al. (212) Perbedaan genetik dengan level yang rendah
Tujuan Penelitian Penelitian ini dilakukan untuk Penelitian ini dilakukan untuk 1. Mengetahui struktur populasi Manta alfredi 2. Mengetahui keragaman genetik Manta alfredi 3. Mengetahui konektivitas antar populasi Manta alfredi
METODOLOGI Penelitian ini dilaksanakan pada bulan April 216 Mei 217 Raja Ampat Pulau Komodo Nusa Penida ANALISIS MOLEKULER LABORATORIUM BIODIVERSITAS DAN BIOSISTEMETIK KELAUTAN, FAKULTAS PERIKANAN DAN ILMU KELAUTAN, INSTITUT PERTANIAN BOGOR
Foto ID Pengambilan sampel jaringan (biopsi) Underwater tissue collection (Robbins 26) Tentukan Kelamin
DNA Analisis Chelex 1% (Walsh et al. 1991) POP ART ( Bandel et al. 1999) (Tamura et al. 213) DnaSP 5.1 (Rozaz et al. 23) DNA Extraction Electrophoresis Sequence edit Data Analysis 1 2 3 4 5 6 7 PCR gen COI Cycle Sequencing Blast Annealing 5 o C 38 siklus Extention 72 o C Denaturation 95 o C F1 TCAACCAACCACAAAGACATTGGCAC R1 AGACTTCTGGGTGGCCAAAGAATCA (Ward et al. 25)
Keragaman Genetik 1% Manta alfredi Fragmen DNA yang diperoleh dari sampel Manta alfredi memiliki panjang 614 bp
Struktur Populasi Fst.35 (p=.179) Sumber Variasi d.f. Persentase variasi (%) Fst P-value Antar Populasi 2 3.56.35.179 Dalam Populasi 72 96.44 Total 74 Nilai ini mengindikasikan bahwa setiap populasi Manta alfredi memiliki karakteristik yang tidak berbeda signifikan
Rekonstruksi Filogenetik Manta alfredi COI JQ765532.1(Ningaloo Reef) Manta alfredi COI JQ765531.1(Ningaloo R 2516634 ITK RAM MA 7 R1 2516631 ITK RAM MA 6 R1 251663 ITK RAM MA 5 R1 2516627 ITK NPN MA 28 R1 2516625 ITK NPN MA 26 R1 2516623 ITK NPN MA 24 R1 2516622 ITK NPN MA 23 R1 2516621 ITK NPN MA 22 R1 251662 ITK NPN MA 21 R1 2516618 ITK NPN MA 19 R1 2516614 ITK NPN MA 15 R1 2516613 ITK NPN MA 14 R1 2516588 ITK KOM MA 13 R1 251668 ITK NPN MA 9 R1 251663 ITK NPN MA 4 R1 251662 ITK NPN MA 3 R1 251661 ITK NPN MA 2 R1 2516596 ITK KOM MA 21 R1 2516595 ITK KOM MA 2 R1 2516594 ITK KOM MA 19 R1 2516593 ITK KOM MA 18 R1 2516591 ITK KOM MA 16 R1 2516654 ITK RAM MA 3 R1 2516653 ITK RAM MA 29 R1 2516641 ITK RAM MA 14 R1 251664 ITK RAM MA 13 R1 2516639 ITK RAM MA 12 R1 2516637 ITK RAM MA 1 R1 2516636 ITK RAM MA 9 R1 2516635 ITK RAM MA 8 R1 2516648 ITK RAM MA 23 R1 2516645 ITK RAM MA 19 R1 2516644 ITK RAM MA 17 R1 2516643 ITK RAM MA 16 R1 1 2516647 ITK RAM MA 22 R1 Manta birostris COI JF493866.1 251665 ITK RAM MA 25 R1 2516649 ITK RAM MA 24 R1 2516642 ITK RAM MA 15 R1 2516638 ITK RAM MA 11 R1 Nei (1987) nilai jarak genetik rendah berkisar antara.1-.99 2516633 ITK RAM MA 4 R1 2516632 ITK RAM MA 3 R1 1 2516629 ITK NPN MA 3 R1 2516628 ITK NPN MA 29 R1 2516626 ITK NPN MA 27 R1 2516619 ITK NPN MA 2 R1 2516652 ITK RAM MA 28 R1 2516651 ITK RAM MA 26 R1 251658 ITK KOM MA 5 R1 2516581 ITK KOM MA 6 R1 2516587 ITK KOM MA 12 R1 2516584 ITK KOM MA 9 R1 2516586 ITK KOM MA 11 R1 2516617 ITK NPN MA 18 R1 2516616 ITK NPN MA 17 R1 2516615 ITK NPN MA 16 R1 65 2516612 ITK NPN MA 13 R1 2516611 ITK NPN MA 12 R1 251661 ITK NPN MA 11 R1 251669 ITK NPN MA 1 R1 251667 ITK NPN MA 8 R1 251664 ITK NPN MA 5 R1 25166 ITK NPN MA 1 R1 2516599 ITK KOM MA 24 R1 2516598 ITK KOM MA 23 R1 2516597 ITK KOM MA 22 R1 2516592 ITK KOM MA 17 R1 251659 ITK KOM MA 15 R1 2516585 ITK KOM MA 1 R1 2516583 ITK KOM MA 8 R1 2516579 ITK KOM MA 4 R1 2516578 ITK KOM MA 3 R1 2516577 ITK KOM MA 1 R1 Antar Populasi Populasi Raja Ampat Pulau Komodo Nusa Penida Raja Ampat. Pulau Komodo.64. Nusa Penida -.43.64.
Konektivitas Antar Populasi A B HAP 1,2 41 HAP 1,2 HAP 1,2 31 Konektivitas M. alfredi (A) Peta Indonesia yang menunjukan persentase kelompok populasi (B) Jaringan haplotipe Manta alfredi pada setiap populasi, garis lingkaran mempersentasikan perubahan nukleotida, ukuran lingkaran mempersentasikan frekuensi (jumlah) haplotipe.
Kesimpulan Struktur populasi genetik di tiga populasi menunjukan adanya hubungan genetik yang dekat antar populasi. Hasil analisis molekuler menunjukkan M.alfredi memiliki nilai haplotipe dan nilai keragaman genetik yang rendah, filogenetik yang terbentuk terbagi atas dua clade Secara keseluruhan memperlihatkan terjadinya pencampuran antar individu M.alfredi dari tiga populasi tersebut.
UCAPAN TERIMA KASIH