POLA KEPEKAAN ANTIBIOTIK BAKTERI EXTENDED SPECTRUM BETA LAKTAMASES-PRODUCING ESCHERICHIA COLI DARI SPESIMEN URIN DI RSUP H ADAM MALIK PERIODE JULI 2013-JUNI 2014 NANCY I SIAHAAN 110100235 FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS SUMATERA UTARA MEDAN 2014
POLA KEPEKAAN ANTIBIOTIK BAKTERI EXTENDED SPECTRUM BETA LAKTAMASES-PRODUCING ESCHERICHIA COLI DARI SPESIMEN URIN DI RSUP H ADAM MALIK PERIODE JULI 2013-JUNI 2014 KARYA TULIS ILMIAH Karya Tulis Ilmiah ini diajukan sebagai salah satu syarat untuk memperoleh kelulusan Sarjana Kedokteran NANCY I SIAHAAN 110100235 FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS SUMATERA UTARA MEDAN 2014
i LEMBAR PENGESAHAN Judul : Pola Kepekaan Antibiotik Bakteri Extended Spectrum Beta Laktamases-producing Escherichia coli dari Spesimen Urin di RSUP H. Adam Malik Periode Juli 2013-Juni 2014 Nama : Nancy Intanna Siahaan NIM : 110100235 Pembimbing Penguji 1 (dr. Cherry Siregar, M.Kes) (dr. T. Helvi Mardiani, M.Kes) NIP: 19740410 200812 2 002 NIP: 19720107 200112 2 002 Penguji 2 (dr. Mila Darmi, Sp.KK) NIP: 19690828 200012 2 001 Medan, 12 Januari 2015 Dekan Fakultas Kedokteran (Prof. dr. Gontar Alamsyah Siregar, Sp.PD-KGEH) NIP: 19540220 198011 1 001
ii ABSTRAK Infeksi saluran kemih merupakan salah satu masalah infeksi terbanyak yang mengenai wanita. Penyebab tersering infeksi saluran kemih adalah bakteri Escherichia coli. Penggunaan antibiotik yang kurang rasional menyebabkan timbulnya resistensi terhadap berbagai antibiotik, seperti juga terjadi pada Escherichia coli yang memicu timbulnya strain Extended-Spectrum-Beta- Laktamases-producing Escherichia coli (ESBLs-producing E.coli). Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui gambaran pola kepekaan antibiotik bakteri ESBLs-producing E.coli yang diambil dari sampel urin di RSUP H Adam Malik pada periode Juli 2013-Juni 2014. Penelitian ini menggunakan metode penelitian deskriptif dengan pendekatan cross-sectional dan sampel diambil dari rekam medis pasien. Data yang diambil dari tiap pasien adalah hasil pengujian kultur bakteri terhadap 26 antibiotik selama periode waktu tersebut. Jumlah sampel yang didapat adalah sebanyak 98 sampel. Dari penelitian ini ditemukan sensitifitas tertinggi adalah terhadap antibiotik amikacin (100%) dan resistensi tertinggi adalah terhadap antibiotik amoxicillin, ampicillin, cefazolin, cefotaxime, ceftazidime, ceftriaxone, cefepime, aztreonam (100%). Angka kejadian infeksi ESBLs-producing E.coli urin adalah 63,2%. Sebagian besar sampel adalah wanita (54,1%) dan sampel terbanyak berumur 26-45 tahun (45,9%). Kejadian ESBLs-producing E.coli ditemukan paling banyak di instalasi penyakit dalam (29,6%). Penggunaan antibiotik yang tidak rasional terbukti dapat memicu timbulnya resistensi terhadap berbagai antibiotik seperti pada ESBLs-producing E.coli. Kata Kunci : ESBL, E.coli, Urin, Kepekaan
iii ABSTRACT Urinary tract infection is one of the most infectious problems affecting women. The most common agent caused of urinary tract infection is Escherichia coli. Less rationality of using antibiotics led to bacterial resistance to various antibiotics, and this also happens to Escherichia coli strain triggers Extended- Spectrum Beta-Laktamases-producing Escherichia coli (ESBLs-producing E. coli). The purpose of this study is to describe the pattern of antibiotic sensitivity of ESBLs-producing E. coli from urine samples taken from the Adam Malik Hospital in the period July 2013-June 2014. This study used a descriptive research method with cross-sectional design and data taken from patient's medical record. Data that taken from each patient was a bacterial culture test results against 26 antibiotics during this time period. The number of samples obtained are as many as 98 samples. Results of this study found that the highest sensitivity was found to antibiotics amikacin (100%) and the highest resistance was found to antibiotics amoxicillin, ampicillin, cefazolin, cefotaxime, ceftazidime, ceftriaxone, cefepime, and aztreonam (100%). Prevalence of ESBLs-producing E.coli was 63,2%. Majority of the sample was female (54.1%) and most samples aged 26-45 years (45.9%).. Using of antibiotics that less rational are proven to trigger resistance to various antibiotics such as ESBLs-producing E.coli. Key words : ESBL, E.coli, Urine, Sensitivity
iv KATA PENGANTAR Puji dan syukur penulis panjatkan kepada Tuhan Yesus Kristus karena atas berkat dan penyertaannya senantiasa sehingga akhirnya Karya Tulis Ilmiah ini dapat penulis selesaikan. Karya Tulis Ilmiah ini adalah salah satu syarat untuk menyelesaikan program Pendidikan Dokter dan memperoleh gelar Sarjana Kedokteran di Fakultas Kedokteran. Judul Karya Tulis Ilmiah ini adalah Pola Kepekaan Antibiotik Bakteri Extended Spectrum Beta Laktamases-producing Escherichia coli dari Spesimen Urin di RSUP H. Adam Malik Periode Juli 2013-Juni 2014. Dalam proses penulisan Karya Tulis Ilmiah ini, penulis telah banyak memperoleh dukungan dan bantuan dari berbagai pihak. Untuk itu penulis ingin mengucapkan terima kasih dan penghargaan yang setinggi-tingginya kepada: 1. Prof. Dr. dr. Syahril Pasaribu, DTM&H, M.Sc (CTM), Sp.A(K), selaku Rektor yang telah memberikan kesempatan kepada penulis untuk mengikuti program studi Pendidikan Dokter di Fakultas Kedokteran. 2. Prof. dr. Gontar Alamsyah Siregar, Sp.PD-KGEH, selaku Dekan Fakultas Kedokteran. 3. dr. Cherry Siregar, M.Kes, selaku Dosen Pembimbing yang telah banyak memberikan arahan, bimbingan, serta bantuan kepada penulis sehingga Karya Tulis Ilmiah ini dapat terselesaikan dengan baik. 4. dr. Johannes H. Saing, Sp.A(K), dr. Mila Darmi, Sp.KK, dan dr.t.helvi Mardiani, M.Kes, selaku Dosen Penguji yang telah banyak memberikan masukan untuk penyempurnaan Karya Tulis Ilmiah ini. 5. Orangtua penulis, Darwin Siahaan dan Magdalena Suryani Manullang yang telah memberikan doa dan motivasi baik secara moril maupun materiil sehingga penulis dapat menyelesaikan Karya Tulis Ilmiah ini.
v 6. Adik-adik penulis, Conrad W. Siahaan, Cynthia Y. Siahaan, dan Nanda S. Siahaan yang telah memberikan doa dan semangat dalam penyelesaian Karya Tulis Ilmiah ini. 7. Teman-teman penulis, Hilferia, Pretty, Santa, Betty, Alen, Glen, dan Arya yang telah memberikan motivasi dalam menyelesaikan Karya Tulis Ilmiah ini. 8. Yang terkasih, Hary R. Hasugian, untuk semangat dan suka yang selalu hadir di dalam setiap duka. 9. Instalasi Mikrobiologi dan Rekam Medik RSUP H Adam Malik. 10. Teman dan pihak-pihak yang tidak dapat disebutkan satu persatu dalam membantu penyelesaian Karya Tulis Ilmiah ini. Semoga Karya Tulis Ilmiah ini dapat bermanfaat bagi semua pihak yang membacanya. Penulis Nancy I Siahaan
vi DAFTAR ISI Halaman HALAMAN PERSETUJUAN... i ABSTRAK... ii ABSTRACT... iii KATA PENGANTAR... iv DAFTAR ISI... vi DAFTAR TABEL...viii DAFTAR GAMBAR... ix DAFTAR LAMPIRAN... xi BAB 1 PENDAHULUAN... 1 1.1. Latar Belakang... 1 1.2. Rumusan Masalah... 3 1.3. Tujuan Penelitian... 3 1.3.1 Tujuan Umum... 3 1.3.2 Tujuan Khusus... 3 1.4. Manfaat Penelitian... 4 BAB 2 TINJAUAN PUSTAKA... 5 2.1. Extended Spectrum Beta Laktamases-producing Escherichia coli... 5 2.1.1 Karakteristik Escherichia coli... 5 2.1.2 Patogenisitas Escherichia coli... 9 2.2. Resistensi Obat... 10 2.2.1 Mekanisme Resistensi Obat... 10 2.2.2 Etiologi Resistensi Bakteri terhadap Obat... 11 2.2.3 Faktor Resiko Resistensi Obat... 13 2.2.4 Metode Uji Resistensi Obat... 13 2.2.5 Pembatasan Resistensi Obat... 14 2.3. Resistensi ESBLs-producing Escherichia coli... 15 2.4. Metode Deteksi ESBLs-producing Escherichia coli... 16
vii BAB 3 KERANGKA KONSEP DAN DEFINISI OPERASIONAL... 20 3.1. Kerangka Konsep Penelitian... 20 3.2. Definisi Operasional... 20 BAB 4 METODE PENELITIAN... 21 4.1. Jenis Penelitian... 21 4.2. Waktu dan Tempat Penelitian... 21 4.2.1. Waktu Penelitian... 21 4.2.2. Tempat Penelitian... 21 4.3. Populasi dan Sampel Penelitian... 21 4.3.1. Populasi Penelitian... 21 4.3.2. Sampel Penelitian... 21 4.4. Teknik Pengumpulan Data... 22 4.5. Alur Penelitian... 22 4.6. Pengolahan dan Analisis Data... 22 4.7. Ethical Clearance... 23 BAB 5 HASIL DAN PEMBAHASAN... 24 5.1. Hasil Penelitian... 24 5.1.1 Deskripsi lokasi penelitian... 24 5.1.2 Deskripsi karakteristik umum sampel... 24 5.1.3 Deskripsi kepekaan ESBLs-producing E.coli terhadap antibiotik... 27 5.1.4 Deskripsi ruang rawat inap... 33 5.2. Pembahasan... 34 BAB 6 KESIMPULAN DAN SARAN... 38 6.1. Kesimpulan... 38 6.2. Saran... 38 DAFTAR PUSTAKA... 39 LAMPIRAN
viii DAFTAR TABEL Nomor Judul Halaman Tabel 2.1 Kriteria Minimum Inhibitory Concentration (MIC) dan 17 Zona Hambatan untuk Deteksi ESBL pada E. coli Tabel 3.2 Definisi Operasional 20 Tabel 5.1 Distribusi Frekuensi Karakteristik Sampel 25 Berdasarkan Jenis Kelamin Tabel 5.2 Distribusi Frekuensi Karakteristik Sampel 26 Berdasarkan Umur Tabel 5.3 Distribusi Frekuensi Karakteristik Jenis Kelamin 26 terhadap Umur Tabel 5.4 Distribusi Uji Kepekaan ESBLs-producing E.coli 28 terhadap Antibiotik Tabel 5.5 Distribusi Frekuensi Ruang Rawat Inap 33
ix DAFTAR GAMBAR/SKEMA Nomor Judul Halaman Gambar 2.1 Gambaran mikroskopis Escherichia coli 6 Gambar 2.2 Pewarnaan Gram Escherichia coli 7 Gambar 2.3 Pemecahan laktosa oleh Escherichia coli pada Endo 8 Agar Gambar 2.4 Escherichia coli pada agar Mac Conkey 8 Gambar 2.5 Escherichia coli pada medium EMB 8 Gambar 2.6 Double disc method 18 Gambar 2.7 Konfirmasi ESBLs-producing Escherichia coli 19 Gambar 3.1 Kerangka Konsep 20 Gambar 4.1 Alur Penelitian 22 Gambar 5.1 Diagram Isolat Mikroorganisme dari Spesimen Urin 25 Gambar 5.2 Diagram Persentasi ESBLs-producing E.coli terhadap 25 Isolat E.coli Gambar 5.3 Diagram Uji Kepekaan Bakteri ESBLs-producing 29 E.coli terhadap Antibiotik Golongan Penicillin Gambar 5.4 Diagram Uji Kepekaan Bakteri ESBLs-producing 29 E.coli terhadap Antibiotik Golongan Cephalosporine Gambar 5.5 Diagram Uji Kepekaan Bakteri ESBLs-producing 30 E.coli terhadap Antibiotik Golongan Carbapenem Gambar 5.6 Diagram Uji Kepekaan Bakteri ESBLs-producing 30 E.coli terhadap Antibiotik Golongan Fluoroquinolone Gambar 5.7 Diagram Uji Kepekaan Bakteri ESBLs-producing 31 E.coli terhadap Antibiotik Golongan Aminoglikosida Gambar 5.8 Diagram Uji Kepekaan Bakteri ESBLs-producing 31 E.coli terhadap Antibiotik Golongan Monobactam Gambar 5.9 Diagram Uji Kepekaan Bakteri ESBLs-producing E.coli terhadap Antibiotik Golongan Sulfonamida 32
x Gambar 5.10 Diagram Uji Kepekaan Bakteri ESBLs-producing E.coli terhadap Antibiotik Golongan Tetrasiklin 32
xi DAFTAR LAMPIRAN Lampiran 1 Lampiran 2 Lampiran 3 Lampiran 4 Lampiran 5 Daftar Riwayat Hidup Data Induk Output SPSS Surat Ethical Clearance Surat Izin Penelitian