DAFTAR PUSTAKA Alberto F, Santos R, and Leitao JM. 1999. Assessing patterns of geographic dispersal of Gelidium sesquipedale (Rhodophyta) through RAPD differentiation of populations.. Marine Ecologies Progress Series Vol. 191: 101-108. Alit IGK. 2009. Pengaruh padat penebaran terhadap pertambahan berat dan panjang badan belut sawah (Monopterus albus). Jurnal Biologi Vol. 13 (1) : 25-28. Arifin OZ dan Kurniasih T. 2007. Variasi genetik tiga populasi ikan nila (Oreochromis niloticus) berdasarkan polimorfisme mt-dna. Jurnal Riset Akuakultur Vol. 2 (1) : 67-75. Asih S, Nugroho E, Kristanto AH, dan Mulyasari. 2008. Penentuan variasi genetik ikan batak (Tor sorro) dari Sumatera Utara dan Jawa Barat dengan metode analisis Randomly Amplified Polymorphism DNA (RAPD). Jurnal Riset Akuakultur Vol. 3 (1) : 91-97. Bártfai R, Egedi S, Yue GH, Kovács B, Urbányi B, Tamás G, Horváth L, and Orbán L. Genetic analysis of two common carp broodstocks by RAPD and microsatellite markers. http://www.tll.org.sg/publications/0301_bartfai_aqua.pdf. [2 September 2008] Beaumont AR and Hoare K. 2003. Biotechnology and Genetics in Fisheries and Aquaculture. Blackwell Science, Ltd, UK. Budiharjo A. 2002. Seleksi dan potensi budidaya jenis-jenis ikan wader dari genus Rasbora. Biodiversitas Vol. 3 (2) : 225-230. Callejas C and Ochando MD. 2002. Phylogenetic relationships among Spanish Barbus species (Pisces, Cyprinidae) shown by RAPD markers. Heredity (89): 36 43. http://www.nature.com/hdy/journal/v89/n1/full/6800091a.html. [2 September 2008] Cholik F, Jagatraya AG, R.P. Poernomo, dan A. Jauzi. 2005. Akuakultur: Tumpuan Harapan Masa Depan Bangsa. Masyarakat Perikanan Nusantara dan Taman Akuarium Air Tawar-TMII, Jakarta. Corti M. Thorpe RS, Sola L, Sbodoni V, and Cataudella S. 1988. Multivariate morphometrics in aquaculture : a case study of six stocks of common carp (Cyprinus carpio) from Italy. Canadian Journal Fisheries Aquaculture Science (45) : 1548-1554. Dunham RA. 2004. Aquaculture and Fisheries Biotechnology : Genetic Approaches. CABI publishing, UK. 372 pp.
57 Gupta SD, Khan HA, Reddy VNGK and Kontal GV. 1986. Studies on the intergeneric hybrid, common carp, Cyprinus carpio Communish x mrigal cirrhinus mrigala (Hamilton). http://www.fao.org/docrep/field/003/ AC209E/ AC209E00. htm [8 Oktober 2009] Hadi W, Sumantadinata K, Carman O, dan Hadi LE. 2002. Pendugaan jarak genetik populasi udang galah (Macrobrachium rosenbergii) dari sungai Musi, sungai Kapuas dan sungai Citanduy dengan truss morphometric untuk mendukung program pemuliaan. Jurnal Penelitian Perikanan Indonesia, Vol. 8 (2) : 1-7. Hardjosubroto W. 1994. Aplikasi Pemuliabiakan Ternak di Lapangan. Penerbit PT Grasindo, Jakarta. 283 pp. Irwanto. 2006. Hubungan konseptual antara keragaman dan perolehan genetik. http://www.irwantoshut.com /pdf. [22 September 2008] Jayasangkar P. 2005. Application of RAPD and AFLP to detect genetic variation in fishes. In : Fish Genetic and Aquaculture Biotechnology, Eds: T.J. Pandian, C.A. Strussmann, M.P. Marian. Science Publisher, Inc., USA. p 29-36. Kholifah U, Trisyani N, dan Yuniar I. 2009. Pengaruh padat tebar yang berbeda terhadap kelangsungan hidup dan pertumbuhan pada polikultur udang windu (Penaeus monodon Fab) dan ikan bandeng (Chanos chanos) pada hapa di tambak Brebes Jawa Tengah. http : // puslit2. petra. ac. id/ ejournal/index.php/nep/article/view DownloadInterstitial/17130/17059. [25November2009]. Kottelat M, Whitten AJ, Kartikasari SN, dan Wirjoatmodjo S. 1993. Freshwater Fishes of Western Indonesia and Sulawesi. Periplus Editions (HK) Ltd. Lambert Y& Dutil JD. 2001. Food intake and growth of adult Atlantic cod (Gadus morhua L.) reared under different conditions of stocking density, feeding frequency and size-grading. Aquaculture 192: 233-247. Liu Z. 2007. Randomly amplified polymorphism DNA (RAPD). In : Aquaculture Genome Technologies, Eds: Z.Liu. Blackwell Publishing, USA. Mamangkey JJ, Sulistiono, Sjafei DS, Soedharma D, Sukimin S dan Nugroho E. 2007. Keragaman genetik ikan endemik butini (Glossogobius matanensis) berdasarkan penanda Randomly Amplified Polymorphism DNA (RAPD) di Danau Towuti Sulawesi Selatan. Jurnal Riset Akuakultur Vol. 2 (3) : 389-397. Mangampa, Busran M dan Suswoyo HS. 2008. Optimalisasi padat tebar terhadap sintasan tokolan udang windu dengan sistem aerasi di tambak. http: //www.yahoo.com. [02 juli 2008]
58 Miller MP. 1997. Tools for Population Genetic Analysis (TFPGA) version 1.3. Department of Biological Science. Northern Arizona University, Arizona, USA. Nelson JS. 1994. Fishes of the World. Third edition. John Wiley & Sons. Inc., New York, USA. Nugroho E, Hadie W, Subagja J, dan Kurniasih T. 2005. Keragaman genetik dan morfometrik pada ikan baung Mystus nemurus dari Jambi, Wonogiri dan Jatiluhur. Jurnal Penelitian Perikanan Indonesia Vol. 11 (7) : 1-6. Nugroho E, Subagja J, Asih S, dan Kurniasih T. 2006. Evaluasi keragaman genetik ikan kancra dengan menggunakan marker mt-dna D-loop dan Randomly Amplified Polymorphism DNA (RAPD). Jurnal Riset Akuakultur Vol. 1 (2) : 211-217. Parenrengi A, Sulaeman, Hadi W dan Tenriulo A. 2007. Keragaman morfologi udang pama (Penaeus simiculcatus) dari perairan Sulawesi Selatan dan Sulawesi Tenggara. Jurnal Riset Akuakultur Vol. 2 (1) : 389-397. Pollar M, Jaroensutasinee M, and Jaroensutasinee K. 2007. Morphometric analysis of Tor tambroides by Stepwise Discriminant and Neural Network Analysis. Proceedings of World Academy of Science, Engineering and Technology, Volume 21 January 2007.http://www.waset.org/pwaset/v19/v19-74.pdf. [12 Maret 2008] Rahardjo AA dan Marliani L. 2007. Nilem: Diolah Naik Derajat. Trubus. http://www.trubus.com. [21 Maret 2008] Setijaningsih L, Arifin OZ, dan Gustiano R. 2007. Karakterisasi tiga strain ikan gurame (Osphronemus gouramy Lac.) berdasarkan metode truss morfometriks. Jurnal Iktiologi Indonesia, Vol. 7 (1) : 23-30. Sherizan E. 2007. The Biodiversity and Systematic Relationships of The Labeoin Group of Fishes within Subfamily Cyprinidae in Peninsular Malaysia. [thesis]. Universiti Sains Malaysia. http : //eprints.usm.my / 8319 / 1 / the biodiversity and systematic relationships of the labeoin group of fishes within the sub-family cyprinidae. pdf. [10 Juni 2009] Silva A. 2003. Morphometric variation among sardine (Sardina pilchardus) populations from the northeastern Atlantic and the western Mediterranean. ICES Journal of Marine Science: Journal du Conseil 2003 60(6):1352-1360. http://icesjms.oxfordjournals.org/cgi/content/full/60/6/1352 [12 Maret 2008]. Syahid M, Subhan A dan Armando R. 2006. Budidaya Udang Organik Secara polikultur. Penebar swadaya: Jakarta. Syandri H. 2004. Penggunaan ikan nilem (Osteochilus hasselti CV) dan ikan tawes (Puntius javanicus CV) sebagai agen hayati pembersih perairan Danau Maninjau Sumatera Barat. Jurnal Natur Indonesia 6(2) : 87-90.
59 Soewardi K. 2007. Pengelolaan Keragaman Genetik Sumberdaya Perikanan dan Kelautan. Departemen Manajemen sumberdaya Perairan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor, Bogor. Subagja J, Gustiano R, dan Djajasewaka H. 2006a. Penentuan dosis hormon steroid dan teknik pemberian untuk feminisasi ikan nilem (Osteochilus hasselti). Laporan Hasil Riset Balai Riset Perikanan Budidaya Air Tawar Tahun Anggaran 2006. Balai Riset Perikanan Budidaya Air Tawar Bogor, Pusat Riset Perikanan Budidaya, Badan Riset Kelautan dan Perikanan, Departemen Kelautan dan Perikanan. Hal 300-312. Subagja J, Gustiano R, dan Winarlin L. 2006b. Pelestarian ikan nilem (Osteochilus hasselti CV) melalui teknologi perbenihannya. Prosiding Lokakarya Nasional Pengelolaan dan Perlindungan Sumberdaya Genetik di Indonesia, Bogor, 20 Desember 2006. Hal 279-286. Sugama K, Haryanti, dan Cholik F. 1996. Biochemical genetics of tiger shrimp Penaeus monodon : description electrophoresis detectable loci. Indonesian Fish Res. J. 11(1) : 19-28. Tave D. 1995. Selective Breeding Programme for Medium-Sized Fish Farms. FAO Fish Technical Paper. No. 352. Rome, Italy. 122 pp. Turan C. 1999. A note on the examination of morphometric differentiation among fish populations: the truss system. Turkey Journal of Zoology (23) : 259-263. http://journals.tubitak.gov.tr/veterinary/issues/vet-04-28-5/vet-28-5-13-0302- 28.pdf. [11 September 2008] Turan C. and Batusta N. 2001. Comparison of morphometric characters of Twaite shad (Alosa fallax nilotica, Geoffroy Saint-Hilaire, 1808) among three areas in Turkish seas.http://www.onema.fr/bfpp/bfpp/article/362_363/362p1027.pdf.[11 September 2008] Turan C, Erguden D, Gurlek M, Bafiusta N and Turan F. 2004. Morphometric structuring of the anchovy (Engraulis encrasicolus L.) in the Black Aegean and northeastern Mediterranean seas. Turkey Journal Veterinary Animal Science (28) : 865-871.http://journals.tubitak.gov.tr/veterinary/issues/vet-04-28- 5/vet-28-5-13-0302-28.pdf. [12 Maret 2008] Turan, C. 2007. http://journals.tubitak.gov.tr/veterinary/issues/vet-04-28-5/vet-28-5-13-0302-28.pdf. [11 September 2008] Unver, B, Tatlidil H, and Erk akan F. 2008. Biometrical features of intergeneric hybrid between lueciscus cephalus (L.) and Chalcalburnus chalcoides (G.) (osteichthyes- Cyprinidae) distributed in lake To durge (Sivas-Turkey). Turkish Journal of Fisheries and Aquatic Science 8 : 207-213.
60 Widiyati A. 2003. Keragaman fenotip dan genotip ikan nila (Oreochromis niloticus) dari Danau Tempe (Sulawesi Selatan) dan beberapa sentra produksi di Jawa Barat. [Tesis]. Program Pasca Sarjana, Institut Pertanian Bogor. Widiyati A, Subandriyo, Sumantadinata K, Hadi W dan Nugroho E. 2004. Keragaman morfologi dan fluktuasi asimetri ikan Nila (Oreochromis niloticus) dari danau Tempe (SulSel) dan beberapa sentra produksi di Jawa Barat. Jurnal Penelitian Perikanan Indonesia Vol 10 (5):47-53. Winarlin L, Setiadi E, Widiyati A dan Djajasewaka H. 2006. Pengaruh tingkat kedalaman air terhadap perkembangan pakan alami untuk pertumbuhan benih ikan nilem (Osteochilus hasselti CV). Laporan Hasil Riset Balai Riset Perikanan Budidaya Air Tawar Tahun Anggaran 2006. Balai Riset Perikanan Budidaya Air Tawar Bogor, Pusat Riset Perikanan Budidaya, Badan Riset Kelautan dan Perikanan, Departemen Kelautan dan Perikanan..
L A M P I R A N
Lampiran 1. Matrik korelasi enam populasi ikan nilem di Jawa Barat yang diukur menggunakan metode truss morfometrik A1 A2 A3 A4 A5 A6 B1 B3 B4 B5 B6 C1 C3 C4 C5 C6 D1 D3 D4 D5 D6 Correlation A1 1 A2-0.43 1 A3 0.29-0.05 1 A4 0.60 0.13 0.03 1 A5 0.58 0.19 0.33 0.65 1 A6 0.30 0.28 0.19 0.67 0.40 1 B1 0.10-0.08 0.06 0.16-0.01 0.19 1 B3 0.09-0.06-0.41 0.44 0.06 0.16 0.24 1 B4 0.40 0.20 0.18 0.60 0.45 0.54 0.42 0.03 1 B5 0.42 0.08-0.08 0.74 0.44 0.48 0.64 0.51 0.68 1 B6 0.52 0.08 0.16 0.80 0.50 0.69 0.30 0.30 0.66 0.62 1 C1-0.06 0.23 0.01-0.05 0.08 0.05-0.30-0.12-0.03-0.16 0.09 1 C3 0.31 0.06 0.22 0.19 0.28 0.16 0.17-0.23 0.55 0.31 0.22 0.11 1 C4 0.25 0.12 0.08 0.35 0.26 0.36 0.20-0.07 0.58 0.39 0.50 0.25 0.06 1 C5 0.38 0.16 0.17 0.42 0.42 0.35 0.35-0.13 0.80 0.59 0.55 0.28 0.65 0.65 1 C6 0.39 0.00 0.03 0.50 0.35 0.46 0.24 0.07 0.58 0.53 0.61 0.14 0.12 0.77 0.56 1 D1-0.17-0.06-0.21-0.12-0.12-0.20-0.15 0.11-0.04 0.01-0.17-0.08 0.05 0.00 0.04 0.06 1 D3-0.25 0.23-0.10-0.17-0.11-0.06 0.01-0.05-0.11-0.11-0.08 0.23-0.09 0.06-0.02-0.05 0.05 1 D4-0.05 0.14 0.27-0.19 0.00-0.05 0.12-0.35 0.10-0.10 0.04 0.08 0.19 0.15 0.21 0.02 0.01 0.29 1 D5-0.03 0.06 0.17-0.06 0.05 0.00-0.10-0.13-0.07-0.11-0.10 0.15 0.04-0.07-0.09-0.05 0.09 0.65 0.22 1 D6-0.23 0.04-0.04-0.09-0.12 0.02-0.07-0.11 0.02-0.06-0.13-0.22-0.03 0.02-0.04-0.03 0.43 0.26 0.19 0.24 1 A The covariance matrix has 76 degrees of freedom.
62 Lampiran 2. Uji signifikansi pada 21 karakter morfometrik enam populasi ikan nilem hijau di Jawa Barat Karakter yang diukur W ilks' Lambda F df1 df2 Sig, A1 0,468 25,868 5 114 0,000 A2 0,668 11,347 5 114 0,000 A3 0,653 12,101 5 114 0,000 A4 0,474 25,309 5 114 0,000 A5 0,542 19,273 5 114 0,000 A6 0,619 14,029 5 114 0,000 B1 0,334 45,391 5 114 0,000 B3 0,795 5,879 5 114 0,000 B4 0,913 2,178 5 114 0,061 tn B5 0,891 2,795 5 114 0,020 B6 0,845 4,194 5 114 0,002 C1 0,983 0,383 5 114 0,860 tn C3 0,838 4,412 5 114 0,001 C4 0,863 3,615 5 114 0,005 C5 0,920 1,986 5 114 0,086 tn C6 0,926 1,833 5 114 0,112 tn D1 0,578 16,669 5 114 0,000 D3 0,669 11,283 5 114 0,000 D4 0,640 12,852 5 114 0,000 D5 0,622 13,846 5 114 0,000 D6 0,857 3,820 5 114 0,003 Beda nyata P < 0,05 tn tidak beda nyata P>0,05
63 Lampiran 3. Uji signifikans i enam karakter meristik enam populasi ikan nilem hijau di Jawa Barat Karakter yang diukur Wilks' Lambda F df1 df2 Sig. Sirip Dorsal 0,94 1,4 5 114 0,399 tn Sirip Pektoral Kiri 0,96 0,9 5 114 0,157 tn Sirip Pektoral Kanan 0,95 1,1 5 114 0,357 tn Sirip Ventral Kiri 0,93 1,6 5 114 0,062 tn Sirip Ventral Kanan 0,95 1,3 5 114 0,121 tn Sirip Anal 0,95 1,2 5 114 tn tidak beda nyata p>0,05 0,421 tn Lampiran 4. Uji signifikansi 21 karakter morfometrik empat jenis ikan nilem di Tasikmalaya (Jawa Barat) Karakter yang diukur Wilks' Lambda F df1 df2 Sig. A1 0,870 3,779 3 76 0,014 A2 0,675 12,183 3 76 0,000 A3 0,723 9,712 3 76 0,000 A4 0,810 5,941 3 76 0,001 A5 0,873 3,688 3 76 0,015 A6 0,580 18,374 3 76 0,000 B1 0,746 8,604 3 76 0,000 B3 0,270 68,667 3 76 0,000 B4 0,469 28,632 3 76 0,000 B5 0,920 2,198 3 76 0,095 tn B6 0,811 5,919 3 76 0,001 C1 0,742 8,807 3 76 0,000 C3 0,044 547,709 3 76 0,000 C4 0,131 168,196 3 76 0,000 C5 0,266 69,973 3 76 0,000 C6 0,185 111,293 3 76 0,000 D1 0,746 8,615 3 76 0,000 D3 0,310 56,436 3 76 0,000 D4 0,816 5,698 3 76 0,001 D5 0,175 119,156 3 76 0,000 D6 0,638 14,376 3 76 0,000 Beda nyata P <0,05 tn tidak beda nyata P>0,05