PENDAHULUAN. Latar Belakang. merpati umumnya masih tradisional. Burung merpati dipelihara secara ekstensif,

Transkripsi

1 PENDAHULUAN Latar Belakang Burung merpati merupakan salah satu unggas yang dekat dengan manusia. Merpati merupakan burung yang mudah beradaptasi di daerah liar atau di kondisi lingkungan pemukiman. Merpati tidak hanya dipelihara sebagai satwa kesayangan, yaitu sebagai ternak hias dan balap, melainkan termasuk salah satu penghasil daging yang cukup baik. Sampai saat ini, cara pemeliharaan burung merpati umumnya masih tradisional. Burung merpati dipelihara secara ekstensif, yaitu merpati dilepas dan sering berkeliaran mencari makan sendiri. Pakan burung merpati berupa jagung, beras merah dan terkadang sisa makanan yang ada di tanah. Manajemen pemeliharaan yang kurang baik, seperti pemberian pakan, kondisi kandang serta sanitasi yang kurang baik menyebabkan imunitas tubuh merpati menurun sehingga seringkali ditemukan burung merpati yang sakit atau rentan terhadap berbagai macam penyakit. Selain itu, wabah penyakit yang dibawa oleh hewan lain, adanya kontak dengan hospes intermedier dan kontaminasi dari makanan yang tercemar menyebabkan merpati mudah terinfeksi penyakit. Salah satu penyakit yang terjadi akibat manajemen pemeliharaan yang kurang baik adalah penyakit infestasi parasiter. Penyakit parasit yang sering terjadi pada burung merpati adalah helminthiasis, baik oleh cacing nematoda, trematoda maupun cestoda. 1

2 Saat ini sering dijumpai laporan adanya cacing trematoda pada ginjal burung merpati di wilayah DIY dan sekitarnya (Sahara et al., 2010). Trematoda yang berlokasi pada ginjal burung telah banyak dilaporkan di berbagai wilayah negara lain (Menezes, 2001). Salah satu cacing trematoda yang menyerang burung merpati adalah cacing trematoda Paratanaisia sp.. Prevalensi infestasi cacing Paratanaisia sp. pada burung merpati di wilayah Yogyakarta cukup tinggi, yaitu sekitar 28% (Sahara et al., 2010). Cacing Paratanaisia sp. ini berlokasi pada ginjal burung merpati dan menyebabkan kerusakan pada struktur ginjal. Intensitas perubahan patologi pada ginjal akibat infestasi cacing Paratanaisia sp. sangat bervariasi. Santos (1934) melaporkan tidak ditemukan reaksi keradangan akibat infestasi cacing. Pinto et al. (2004) melaporkan adanya potongan cacing pada duktus kolektivus tanpa diikuti reaksi keradangan, sedangkan perubahan berupa lesi mikroskopis kerapkali dilaporkan. Karakter morfologi Paratanaisia sp. bervariasi dan informasi tentang ciriciri morfologis cacing tersebut di Indonesia masih terbatas. Cacing Paratanaisia sp. asal Yogyakarta jika dibandingkan dengan cacing yang diteliti dari berbagai wilayah negara lain, memiliki variasi struktur morfologi sedikit berbeda (Sahara et al., 2010). Oleh karena itu, dirasakan perlu untuk dilakukan penelitian tentang identifikasi Paratanaisia sp. pada sampel yang berasal dari daerah yang berbeda sehingga diperoleh informasi tentang spesies cacing tersebut. 2

3 Penelitian untuk mengetahui spesies Paratanaisia sp. perlu dilakukan karena belum ada identifikasi secara tepat. Selama ini identifikasi masih terbatas pada karakter morfologi. Karakter morfologi sangat mudah dipengaruhi oleh faktor lingkungan, sehingga sangat rentan terhadap subyektivitas peneliti. Kesalahan dalam identifikasi akan menyebabkan kesalahan dalam klasifikasi. Teknik molekuler dapat digunakan untuk menentukan suatu spesies yang tidak dapat diidentifikasi berdasarkan ciri-ciri morfologi saja. Oleh karena itu identifikasi secara molekuler dapat digunakan sebagai penunjang sistem klasifikasi yang sebelumnya didasarkan pada karakter morfologi. Metode identifikasi molekuler yang dapat digunakan salah satunya adalah metode dengan menggunakan polymerase chain reaction (PCR). Perkembangan metode PCR memberikan alternatif identifikasi parasit secara lebih cepat. Teknik PCR merupakan salah satu metode genotyping yang mampu memberikan hasil yang lebih sensitif dan akurat (Sulistyaningsih, 2007). Karakter DNA diketahui relatif lebih konsisten dibandingkan karakter morfologi. Dalam penelitian ini, identifikasi dan analisis filogenetik dilakukan menggunakan DNA ribosomal (rdna). Ribosomal DNA (rdna) pada organisme eukariotik terdiri dari susunan berulang (tandem arrays) yang dapat mencapai beberapa ratus hingga beberapa ribu pengulangan dalam setiap susunannya (Wasco et al., 2003). Pengamatan rdna pada vertebrata dan invertebrata mempunyai 3 coding region yaitu 18S, 5.8S dan 28S, sedangkan non coding region terdiri dari external transcribed spacer, dua internal transcribed spacer 3

4 dan non transcribed spacer. Internal transcribed spacer (ITS1 dan ITS2) terletak di antara 18S, 5,8S dan 28S, sangat variatif dan sering digunakan untuk indikator yang menentukan hubungan antara spesies (Lutton et al., 1992). Perumusan Masalah 1. Bagaimana sekuen nukleotida penyusun ITS1 cacing Paratanaisia sp. yang berasal dari merpati wilayah Kulon Progo, Yogyakarta, Magelang dan Klaten? 2. Bagaimana hubungan filogenetik cacing Paratanaisia sp. wilayah Kulon Progo, Yogyakarta, Magelang dan Klaten berdasarkan ITS1? Tujuan Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakter secara molekuler serta hubungan filogenetik cacing Paratanaisia sp. yang berasal dari merpati wilayah Kulon Progo, Magelang, Yogyakarta dan Klaten dengan mendapatkan sekuen nukleotida penyusun ITS1. Manfaat Penelitian ini dapat digunakan sebagai dasar untuk penelitian lebih lanjut mengenai parasit cacing Paratanaisia sp. dan dapat digunakan sebagai acuan diagnosa. Selain itu dapat digunakan sebagai masukan bagi peternak dalam pemeliharaan merpati yang lebih baik. 4

5 Keaslian Penelitian Penelitian yang berhubungan dengan Paratanaisia sp. pernah dilakukan oleh Brener et al. (2006) mengenai prevalensi dan perubahan patologi pada kalkun yang disebabkan oleh cacing trematoda Paratanaisia bragai. Perubahan patologi pada ginjal burung kakatua berupa nefritis granulomatous pernah diteliti oleh Luppi et al. (2007) dan diketahui berkaitan dengan parasit trematoda P. bragai. Di Indonesia, penelitian mengenai P. bragai baru dilakukan oleh Sahara et al. (2010) mengenai identifikasi dan patologi cacing trematoda ginjal pada burung merpati (Columbia livia). 5