POTENSI BAKTERI ENDOFIT SEBAGAI PENGHASIL ENZIM KITINASE, PROTEASE DAN SELULASE SECARA IN VITRO SKRIPSI. Oleh: NUR FIANTY YUNI FATICHAH NIM.

Transkripsi

1 POTENSI BAKTERI ENDOFIT SEBAGAI PENGHASIL ENZIM KITINASE, PROTEASE DAN SELULASE SECARA IN VITRO SKRIPSI Oleh: NUR FIANTY YUNI FATICHAH NIM JURUSAN BIOLOGI FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI UNIVERSITAS ISLAM NEGERI (UIN) MAULANA MALIK IBRAHIM MALANG 2011

2 POTENSI BAKTERI ENDOFIT SEBAGAI PENGHASIL ENZIM KITINASE, PROTEASE DAN SELULASE SECARA IN VITRO SKRIPSI Diajukan Kepada: Fakultas Sains Dan Teknologi Universitas Islam Negeri (UIN) Maulana Malik Ibrahim Malang Untuk Memenuhi Salah Satu Persyaratan Dalam Memperoleh Gelar Sarjana Sains (S.Si) Oleh: NUR FIANTY YUNI FATICHAH NIM JURUSAN BIOLOGI FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI UNIVERSITAS ISLAM NEGERI (UIN) MAULANA MALIK IBRAHIM MALANG 2011

3

4 POTENSI BAKTERI ENDOFIT SEBAGAI PENGHASIL ENZIM KITINASE, PROTEASE DAN SELULASE SECARA IN VITRO SKRIPSI Oleh: NUR FIANTY YUNI FATICHAH NIM Telah disetujui oleh: Dosen Pembimbing I Dosen Pembimbing II Dr. Hj. Ulfah Utami, M.Si NIP Dr. drh. Bayyinatul M, M.Si NIP Tanggal, 28 Januari 2011 Mengetahui Ketua Jurusan Biologi Dr. Eko Budi Minarno, M.Pd NIP

5 POTENSI BAKTERI ENDOFIT SEBAGAI PENGHASIL ENZIM KITINASE, PROTEASE DAN SELULASE SECARA IN VITRO SKRIPSI Oleh: NUR FIANTY YUNI FATICHAH NIM Telah Dipertahankan di Depan Dewan Penguji Tugas Akhir dan Dinyatakan Diterima Sebagai Salah Satu Persyaratan Untuk Memperoleh Gelar Sarjana Sains (S.Si) Tanggal 28 Januari 2011 Susunan dewan penguji Tanda Tangan 1. Penguji utama : Liliek Hariani, M.Si ( ) 2. Ketua : Amalia fitri andriani, M.Si ( ) 3. Sekretaris : Dr. Ulfah Utami, M.Si ( ) 4. Anggota : Dr. drh. Bayyinatul, M. M.Si ( ) Mengetahui dan Mengesahkan Ketua Jurusan Biologi Dr. Eko Budi Minarno, M.Pd NIP

6 SURAT PERNYATAAN ORISINALITAS PENELITIAN Saya yang bertanda tangan dibawah ini: Nama : Nur Fianty Yuni Fatichah NIM : Fakultas/jurusan : SAINTEK / Biologi Judul penelitian : Potensi Bakteri Endofit Sebagai Penghasil Enzim Kitinase, Protease, Dan Selulase Secara In Vitro Menyatakan dengan sebenar-benarnya bahwa hasil penelitian saya tidak terdapat unsure-unsur penjiplakan karya penelitian atau karya ilmiah yang dilakukan atau dibuat oleh orang lain, kecuali yang secara tertulis dikutip dalam naskah ini dan disebutkan dalam sumber kutipan dan daftar pustaka. Apabila ternyata hasil penelitian ini terbukti terdapat unsure-unsur penjiplakan, maka saya bersedia mempertanggung jawabkan, serta diproses sesuai peraturan yang berlaku. Malang, 18 Januari 2011 Yang Membuat Pernyataan, Nur Fianty Yuni Fatichah NIM

7 KATA PENGANTAR Assalamu alaikum Wr. Wb Puji syukur kehadirat Allah SWT yang telah memberikan rahmat, taufik serta hidayah-nya sehingga penulis dapat menyelesaikan penyusunan skripsi ini dengan judul Potensi Bakteri Endofit dalam Menghasilkan Enzim Kitinase, Protease, dan Selulase secara In Vitro. Sholawat serta salam semoga senantiasa tercurahkan kepada junjungan nabi Muhammad SAW. Selanjutnya penulis skripsi ini tidak lupa mengucapkan terimakasih yang sebesar-besarnya disampaikan kepada: 1. Prof. Dr Imam Suprayogo, selaku rektor UIN Maliki Malang. 2. Prof. Drs. Sutiman Bambang Sumitro S.U., D.Sc. selaku dekan fakultas Sains dan teknologi UIN Maliki Malang. 3. Dr. Eko Budi Minarno, M.Si, selaku ketua jurusan biologi UIN Maliki Malang. 4. Dr. Ulfah Utami, M.Si. dan Dr. Bayyinatul, M., M.Si. selaku dosen pembimbing yang telah memberikan arahan dan meluangkan waktu untuk membimbing penulis. 5. Ir. Lilik Harianie, MP. Selaku penguji utama skripsi, dan Amalia Fitri Andriani, M.Si., selaku dosen wali sekaligus ketua penguji yang telah memberikan arahan, dan nasehat untuk penulis. 6. Ayahanda Nugroho dan ibunda Siti Fatimah terimakasih atas dukungan moril maupun spiritual yang diberikan selama ini. 7. Semua pihak yang telah membantu dan memberikan dukungan, yang tidak bisa penulis sebutkan satu persatu. Semoga skripsi ini dapat bermanfaat dan menambah khasanah ilmu pengetahuan bagi peneliti dan pembaca. Amin. Wassalammu alaikum Wr.Wb Malang, 28 Januari 2011 Penulis

8 DAFTAR ISI KATA PENGANTAR... i DAFTAR ISI... ii DAFTAR TABEL... iv DAFTAR GAMBAR... v DAFTAR LAMPIRAN... vi ABSTRAK... vii BAB I PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang Rumusan Masalah Tujuan Penelitian Hipotesis Manfaat Penelitian Batasan Masalah... 8 BAB II KAJIAN PUSTAKA 2.1 Bakteri Endofit Pengertian Bakteri Endofit Asosiasi Bakteri Endofit dengan Tanaman Karakteristik Bakteri Endofit Dari Tanaman Kentang Bacillus mycoides Pseudomonas pseudomallei Klebsiella ozaenae Enzim-enzim yang Dihasilkan Oleh Bakteri Endofit Enzim Kitinase Enzim Protease Enzim Selulase Enzim Faktor-faktor yang Mempengaruhi Aktivitas Enzim BAB III METODE PENELITIAN 3.1 Rancangan Penelitian Tempat Dan Waktu Instrumen Penelitian Alat-alat Bahan Kegiatan Penelitian Sterilisasi Alat dan Bahan Peremajaan Bakteri Endofit Uji Aktvitas Enzim Kitinase Uji Aktvitas Enzim Protease Uji Aktvitas Enzim Selulase Pengumpulan Data... 42

9 BAB IV PEMBAHASAN 4.1 Pengukuran Aktivitas Hidrolitik Enzim Kitinase yang Dihasilkan oleh Bakteri Endofit Secara Kualitatif Pengukuran Aktivitas Hidrolitik Enzim Protease yang Dihasilkan oleh Bakteri Endofit Secara Kualitatif Pengukuran Aktivitas Hidrolitik Enzim Selulase yang Dihasilkan oleh Bakteri Endofit Secara Kualitatif BAB V 1.1 Kesimpulan Saran Daftar Pustaka Lampiran-lampiran... 71

10 DAFTAR TABEL Tabel Tabel Tabel 4.1 Rata-rata Indeks Kitinase yang Dihasilkan oleh Bakteri Endofit Rata-rata Indeks Protease yang Dihasilkan oleh Bakteri Endofit Rata-rata Indeks Selulase yang Dihasilkan oleh Bakteri Endofit... 58

11 DAFTAR GAMBAR Gambar 2.1 Bentuk bakteri Bacillus mycoide Gambar 2.2 Bentuk bakteri Pseudomonas pseudomallei Gambar 2.3 Struktur Kitin Gambar 2.4 Proses pemecahan kitin menjad N-asetil glukosaminida Gambar 2.5 Reaksi enzim protease Gambar 2.6 Aktivitas selulolitik fungi Chatomium sp Gambar 2.7 Kerja enzim dalam Memecah Substratnya Gambar 4.1 a. Bakteri endofit K.ozaenae. b. Bakteri endofit kombinasi (P. pseudomallei dan K. ozaenae) keduanya menunjukkan aktivitas kitinase setelah di tumbuhkan pada media kitin agar selama 120 jam Gambar 4.2 Struktur Kitin Gambar 4.3 a. Bakteri tunggal K. ozaenae, b. Bakteri kombinasi B. mycoides, P. pseudomallei dan K. ozaenae. keduanya menunjukkan aktivitas protease pada media SMA setelah diinkubasi selama 24 jam Gambar 4.4 Proses Proteolisis Enzim Protease Menjadi Asam Amino Gambar 4.5 a. Bakteri tunggal B. mycoides, b. Bakteri kombinasi B. mycoides dan K. ozaenae. keduanya menunjukkan aktivitas selulolitik pada media CMC-agar setelah 24 jam Gambar 4.6 Potensi Bakteri Endofit Dalam Menghasilkan Enzim Kitinase, Protease dan Selulase secara in vitro... 61

12 DAFTAR LAMPIRAN Lampiran 1. Aktivitas Enzim Kitinase yang Dihasilkan Bakteri Endofit pada Media Kitin Agar Lampiran 2. Hasil Pengukuran Aktivitas Enzim Kitinase yang dihasilkan oleh Bakteri Endofit Lampiran 3. Aktivitas Enzim Protease yang Dihasilkan Bakteri Endofit Pada Media SMA (Skim Milk Agar) Lampiran 4. Hasil Pengukuran Aktivitas Enzim Protease yang Dihasilkan oleh Bakteri Endofit Lampiran 5. Aktivitas Enzim Selulase Yang Dihasilkan Bakteri Endofit Pada Media CMC-agar (Carboxy-Methyl Cellulose) Lampiran 6. Hasil Pengukuran Aktivitas Enzim Selulase Yang Dihasilkan Oleh Bakteri Endofit Lampiran 7. Klasifikasi Reaksi Enzim Berdasarkan Uji Terbentuknya Zona Bening Pada Media Padat Lampiran 8. Pembuatan Koloidal Kitin Dengan Cara Hidrolisis Parsial Lampiran 9. Pembuatan Media Susu Skim... 79