- PDF Download Gratis

Ukuran: px

Mulai penontonan dengan halaman:

Download ""

Erlin Kartawijaya
6 tahun lalu
Tontonan:

7 Seminar Nasional Biologi 2010 I. Bidang Keanekaragaman Hayati SB/P/KR/01 IDENTIFIKASI GENOTIP HIBRIDA HASIL PERSILANGAN ANGGREK LOKAL Vanda tricolor Lindl. var suavis ASAL MERAPI DAN Vanda limbata Blume. DENGAN PCR-RFLP PADA DAERAH INTERGENIK trnl-f DNA KLOROPLAS Aries Bagus Sasongko 1, Ari Indrianto 1,2, Endang Semiarti 1,2 * 1. Sekolah Pasca Sarjana, Pusat Studi Bioteknologi, UGM. Jl. Teknika Utara, Yogyakarta 55281, Indonesia. Correspondence author : bagusbiologi@yahoo.co.id 2. Fakultas Biologi, UGM, Jl. Teknika Selatan, Sekip Utara, Yogyakarta 55281, Indonesia *Correspondence author, esemiart@yahoo.com PENDAHULUAN Anggrek merupakan tanaman hias berbunga bernilai ekonomi dengan ragam bentuk, warna dan aroma. Dari spesies anggrek di dunia, Indonesia memiliki sekitar 5000 spesies anggrek alam (Irawati, 2002; Tsai, et al., 2008). Kemampuan anggrek untuk dikawinsilangkan dengan spesies yang sama, antar spesies dalam genus yang sama, antar genus, antar subtribe, antar tribe, bahkan antar subfamili, menjadikannya berpotensi untuk ditingkatkan keragaman genetiknya dan kualitasnya. Perakitan sifat-sifat unggul berbagai anggrek lokal Indonesia diharapkan akan dihasilkan hibrida anggrek unggul, unik dan khas. Keberhasilan persilangan anggrek ditentukan oleh beberapa faktor, antara lain memiliki hubungan evolusi atau kekerabatan yang dekat (Topik dan Pancoro, 2008). Hibrida atau kultivar baru yang dihasilkan dari persilangan anggrek lokal perlu diidentifikasi. Dikarenakan siklus hidup anggrek yang panjang menyebabkan identifikasi fenotip pada tahap awal kurang efektif sehingga perlu dilakukan identifikasi secara genotip. PCR-RFLP pada DNA kloroplas adalah salah satu metode identifikasi genotip untuk menjelaskan hubungan persilangan antara dua spesies (Handa, 1998). Penelitian ini difokuskan pada perakitan kultivar anggrek lokal Indonesia yaitu Vanda tricolor Lindl.var.suavis asal Merapi dan Vanda limbata Blume serta identifikasi genotipenya berdasarkan PCR- RFLP pada daerah intergena trnl-f. DNA kloroplas (CpDNA). 754 Fakultas Biologi UGM, Yogyakarta September 2010

8 Seminar Nasional Biologi 2010 METODE PENELITIAN Bahan Tanaman Tanaman anggrek V. tricolor Lindl. var.suavis asal Merapi dan V. limbata Blume yang digunakan dalam penelitian ini adalah koleksi Laboratorium Kultur Jaringan Tumbuhan, Fakultas Biologi UGM. Tanaman dipelihara pada kondisi optimal pertumbuhan di dalam rumah kaca Laboratorium Kultur Jaringan Tumbuhan Fakultas Biologi UGM. Persilangan Anggrek dan Keberhasilan Persilangan Bunga anggrek V. tricolor dan V. limbata masing-masing berjumlah 3-5 kuntum pada saat mekar sempurna berumur dua hari dilakukan persilangan sendiri maupun bastar. Keberhasilan persilangan diukur dengan membandingkan jumlah bunga yang berhasil membentuk buah dengan total bunga yang disilangkan. Identifikasi Genotip dengan PCR-RFLP Daerah Intergenik trnl-f CpDNA DNA genom tanaman tetua dan protokorm anggrek berumur 1 bulan diamplifikasi pada daerah intergena trnl-f CpDNA menggunakan primer C= 5 - CGAAATCGGTAGACGCTACG dan primer F=5 ATTTGAACTGGTGACACGAG. Amplifikasi dilakukan dengan program: initial denaturation 3 menit pada 94 0 C, denaturasi 94 0 C sela 1 menit, annealing pada suhu 58 0 C selama 1 menit, elongasi pada suhu 72 0 C selama 10 menit, hold 4 0 C dan 35 siklus (dengan modifikasi, Semiarti et al.,2008). PCR produk dipotong menggunakan EcoR1. PCR produk dan pemotongannya dengan EcoR1 dielektroforesis menggunakan agarose 2%. HASIL DAN PEMBAHASAN Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa frekuensi keberhasilan persilangan V. tricolor dan V. limbata pada semua persilangan adalah sebesar 100% dengan sebaran tipe V. tricolor 100.%, tipe V. limbata 100% dan tipe hibrida keduanya adalah 100%. Waktu masak buah pada semua persilangan adalah hari. Analisis PCR-RFLP dengan primer spesifik daerah intergenik spacer trnl-f menunjukkan adanya polimorfisme. Fragmen DNA hasil amplifikasi daerah trnl-f intergenik spacer V. tricolor dan V.tricolor x V.limbata panjangnya ±1206 bp dan V. Limbata dan V.limbata x V.tricolor panjangnya ±1141 bp. Pemotongan hasil amplifikasi pada daerah trnl-f dengan EcoR1 pada V.tricolor dan V.limbata menghasilkan 3 fragmen dengan polimorfik. Fakultas Biologi UGM, Yogyakarta September

9 Seminar Nasional Biologi Fakultas Biologi UGM, Yogyakarta September 2010

10 Seminar Nasional Biologi 2010 KESIMPULAN Frekuensi keberhasilan persilangan V.tricolor Lindl.var.suavis asal Merapi dan V.limbata Blume sangat tinggi yaitu sebesar 100%. Waktu masak buah adalah hari. Anggrek hibrida hasil persilangan V.tricolor dan V.limbata memiliki pola daerah trnl-f dan RFLP seperti induk betinanya. UCAPAN TERIMA KASIH Penelitian ini didanai dengan dana Proyek Penelitian RUSNAS UGM untuk KP4 tahun Topik, H. and Pancoro, A Kajian Filogenetika Molekular dan Peranannya dalam Menyediakan Informasi Dasar untuk Meningkatkan Kualitas Sumber Genetik Anggrek. Jurnal AgroBiogen 4 (1):35-40 REFERENSI Handa, T Utilization of Molecular Marker for Ornamental Plants. J.Japan.Soc.Hort.Sci. 67 (6) : Irawati, The Conservation of Orchid Species in Indonesia. Proceeding of Indonesian Orchid Seminar, at Yogyakarta, October , p Semiarti, E., Machida, Y., and Machida, C A New Method for Identifying the Progeny of Intergeneric Orchid Breeding Based on Its Chloroplast TrnL-F Sequences as a Molecular Marker. Proceding of the 4 th Indonesian Biotechnology Conference (IBC), 5-7 August Tsai, W.C., Hsiao, Y.Y., Pan, Z.N., Hsu, C.C., Chen, W.H., and Chen, H.H Molecular Biology of Orchid Flowers: With Emphasis on Phalaenopsis. Advances in Botanical Research vol. 47, Incorporating Advances in Plant Pathology Fakultas Biologi UGM, Yogyakarta September

$sebagai PEMAKALAH Dalam acara SEMINAR NASIONAL BIOLOGI 2010 dengan tema "Prrs7"k( 8,i/oV, {a/a^ Prryrloku S*l"rlaya #ayat' &uol*lagiotu " yang diselenggarakan dalam rangka Lustrum Xl Fakultas Biologi$

13 SEMINAR NASIONAL BIOLOGI SERTIFII(AT Diberikan Kepada: Cahya Kurnia Fusianto Aries Bagus Sasongko, M.Biotech. sebagai PEMAKALAH Dalam acara SEMINAR NASIONAL BIOLOGI 2010 dengan tema "Prrs7"k( 8,i/oV, {a/a^ Prryrloku S*l"rlaya #ayat' &uol*lagiotu " yang diselenggarakan dalam rangka Lustrum Xl Fakultas Biologi UGM sekaligus menghantarkan purna tugas bagi Prof. Dr. Jusup Subagja, M.Sc., Prof. Dr. Mammed Sagi, M.S., dan Prof. Dr. lssirep Sumardi pada24-25 September 2010 di Fakultas Biologi UGM Yogyakarta, 25 September 2010 Dekan Fakultas Biologi Universitas Gadjah Mada Lustrum Xl F Ketua Panitia Ketua Panitia 20to Dr. Suwarno Hadisusanto, S.U NtP A NrP

dokumen-dokumen yang mirip

Seminar Nasional Biologi 2010 SB/P/BF/08 GREEN FLUORESCENT PROTEIN PADA UBUR-UBUR LOKAL SEBAGAI ALTERNATIF MARKA DNA Cahya Kurnia Fusianto 1, Zulfikar Achmad Tanjung 1,Nugroho Aminjoyo 1, dan Endang Semiarti