Simulasi Docking Molekular Senyawa Santorizol Sebagai Antiinflamasi Terhadap Enzim COX-1 dan COX-2
|
|
- Harjanti Lesmono
- 6 tahun lalu
- Tontonan:
Transkripsi
1 Simulasi Docking Molekular Senyawa Santorizol Sebagai Antiinflamasi Terhadap Enzim COX-1 dan COX-2 Deden Indra Dinata 1, Hardhi Suryatno 1, Ida Musfiroh 2 1 Sekolah Tinggi Farmasi Bandung 2 Fakultas Farmasi Universitas Padjadjaran idamusfiroh@unpad.ac.id Abstrak Enzim yang mempengaruhi proses inflamasi yaitu enzim COX-1 dan COX-2, kedua enzim tersebut berfungsi dalam pembentukan prostaglandin yang berkontribusi dalam pembentukan inflamasi. Santorizol diketahui mempunyai efek antiinflamasi sehingga dapat dilakukan uji simulasi docking xanthorrizol terhadap enzim COX-1 dan COX-2. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui interaksi senyawa santorizol yang berasal dari tanaman temulawak (Curcuma xanthorriza) dengan sisi aktif enzim COX-1 dan COX-2. Proses docking senyawa tersebut dilakukan menggunakan software Autodock 3.0. Hasil docking molekular antara santorizol dengan COX-1 yaitu atom O pada santorizol berinteraksi dengan Arg120 dan Tyr355. Sedangkan interaksi santorizol dengan COX-2 yaitu gugus OH dari santorizol berinteraksi dengan asam amino Gln178 dan Leu338. Leu338 merupakan salah satu asam amino spesifik pada kantung ikatan COX-2. Hasil penelitian menunjukkan bahwa santorizol dapat berinteraksi dengan sisi aktif enzim COX-1 dan COX-2, dan memiliki afinitas yang lebih tinggi untuk berikatan pada sisi aktif COX-2 dibandingkan pada COX-1. Kata Kunci: Docking, santorizol, antiinflamasi, COX-1, COX-2 Molecular Docking Simulation of Xanthorrizol Compounds Derived From Temulawak as Antiinflammatory on Enzymes COX-1 AND COX-2 Abstract There are two enzymes that influence inflammatory process, which are COX-1 and COX-2 enzymes, both of this enzymes have function in the establishment of prostaglandin that contribute in inflammation. Santorizol is known has antiinflammatory effect, so it can developed and tested by docking simulation to COX-1 and COX-2 enzymes. The aim of this research is to determine the interaction between santorizol that is derived from temulawak (Curcuma xanthorriza) with the active site of COX-1 and COX-2 enzymes. Docking simulation was done by using AutoDock Tools 4.0. The interactions between santorizol with COX-1 are O- santorizol interact with Arg120 and Tyr355. The interactions between santorizol with COX-2 are OH-santorizol interact with Gln178 and Leu338. Leu338 is specific amino acid in the binding pocket of COX- 2. Santorizol can interact with the active site of COX-1 and COX-2 enzymes, and show better affinity to COX-2. Keywords: Docking, santorizol, antiinflamasi, COX-1, COX-2 8
2 Pendahuluan Pada awal perkembangan obat, usaha penemuan obat baru pada umumnya bersifat coba-coba (trial and error) sehingga biaya pengembangan obat baru sangat mahal. Hal ini dapat dipahami mengingat bahwa dari hingga senyawa baru yang disintesis atau yang didapat dari sumber alam, setelah melalui berbagai uji kimia, fisika, aktivitas, farmakokinetik, toksisitas, farmakodinamik, dan uji klinik, kemungkinan hanya satu senyawa yang secara klinik dapat digunakan sebagai obat. 1 Waktu yang dibutuhkan, mulai dari proses sintesis atau ekstraksi, penapisan farmakologi, sampai evaluasi klinik dan persetujuan pendaftaran, memakan waktu lebih kurang 10 tahun. Hal tersebut juga disebabkan oleh ketatnya peraturanperaturan untuk obat baru untuk diijinkan dipasarkan. Ini berarti bahwa agar perkembangan obat baru tetap layak secara ekonomi, perlu terobosan pemikiran yang mendasar bagaimana melakukan penelitian dengan sejumlah kecil senyawa yang terpilih, dan bagaimana merancang senyawa dengan baik. 1 Untuk mengatasi masalah kekurangan dalam pengembangan obat baru sudah mulai mengurang dengan adanya teknik penemuan obat baru melalui studi komputasi, adalah cabang kimia yang menggunakan hasil kimia teori yang diterjemahkan ke dalam program komputer untuk menghitung sifatsifat molekul dan perubahannya maupun melakukan simulasi terhadap sistem-sistem besar (makromolekul seperti protein dan asam nukleat) dan sistem besar bisa mencakup kajian konformasi molekul dan perubahannya (misalnya proses denaturasi protein), perubahan fase, serta peramalan sifat-sifat makroskopik (seperti kalor jenis) berdasarkan perilaku di tingkat atom dan molekul. Istilah kimia teori dapat didefinisikan sebagai deskripsi matematika untuk kimia, sedangkan kimia komputasi biasanya digunakan ketika metode matematika dikembangkan dengan cukup baik untuk dapat digunakan dalam program komputer. Metode kimia komputasi tidak sepenuhnya dapat bisa di gunakan secara langsung, kimia komputasi dapat memprediksi bukan berarti dapat digunakan secara langsung, karena sedikit sekali aspek kimia yang dapat dihitung secara tepat. Hampir semua aspek kimia dapat digambarkan dalam skema komputasi kualitatif atau kuantitatif. 1 Santorizol merupakan komponen minyak atsiri dari rimpang temulawak. Santorizol diketahui memiliki aktivitas antiinflamasi. 2 Inflamasi adalah suatu respon organisme terhadap invasi oleh benda asing, seperti bakteri, parasit dan virus. Dalam konteks ini, respon inflamasi merupakan suatu reaksi protektif yang penting terhadap iritasi, luka, atau infeksi, yang ditandai dengan kemerahan, rasa panas, bengkak, hilangnya fungsi dan rasa sakit. 3 PGs (prostaglandin) merupakan suatu mediator endogen inflamasi dan dibentuk dari asam arakidonat oleh enzim konstitutif COX-1 dan enzim indusibel COX-2. Enzim COX-1 merupakan enzim konstitutif yang dapat mengkatalisis 9
3 pembentukan prostanoid regulatoris pada berbagai jaringan, terutama pada selaput lendir traktus gastrointestinal, ginjal, platelet dan epitel pembuluh darah. 4,5,6 Sedangkan, COX-2 tidak konstitutif tetapi dapat diinduksi, antara lain bila ada stimulus inflamasi, mitogenesis atau onkogenesis. 7, 8 Struktur santorizol mempunyai satu cincin aromatik yang dapat menimbulkan interaksi hidrofobik dengan reseptor dan satu gugus hidroksil yang dapat menjadi donor dan akseptor ikatan hydrogen. Interaksi santorizol dengan enzim COX-1 dan COX-2 belum dilaporkan. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui afinitas dan interaksi senyawa santorizol terhadap enzim COX-1 dan COX-2, mengetahui ikatan hidrogen yang terbentuk antara santorizol dengan enzim COX-1 dan COX-2, serta mengetahui selektivitas santorizol dengan enzim COX-1 dan COX-2 dengan metode simulasi docking molekular. Metode Alat Perangkat lunak : ChemDraw versi 8, Hyperchem versi 7, PDB viewer, ArgusLab, dan Autodock 4. 7 Bahan Bahan-bahan yang digunakan dalam penelitian ini adalah struktur ligan yang telah digambar melalui perangkat lunak ChemDraw versi 8, optimasi struktur menggunakan software HyperChem v 7. Struktur protein yang telah dikristalografi yang diperoleh dari Analisis kantung ikatan COX-1 melalui redocking a. Persiapan reseptor Persiapan reseptor enzim COX dilakukan dengan pengunduhan enzim COX melalui website kode PDB: 1EQG.8 b. Isolasi ligan (kristal) ibuprofen c. Analisis binding site Analisis binding site pada tahap ini ditujukan untuk melihat interaksi ibuprofen dengan enzim COX-1 d. Re- ligan ibuprofen pada COX-1 e. Analisis hasil docking dan visualiasi hasil docking Analisis kantung ikatan enzim COX-2 melalui redocking a. Persiapan reseptor Persiapan reseptor enzim COX-2 dilakukan dengan pengunduhan enzim COX melalui website kode PDB: 3LN1. 9 b. Isolasi ligan alami celecoxib c. Analisis binding site Analisis binding site pada tahap ini ditujukan untuk melihat interaksi celecoxib dengan enzim COX-2, dan pada tahap ini kita dapat mengetahui residu asam amino kantung ikatan enzim COX-2. d. Re-docking ligan celecoxib pada COX-2 10
4 e. Analisis hasil docking dan visualisasi. Docking senyawa santorizol pada kantung ikatan COX-1 dan COX-2 a. Penyiapan ligan santorizol menggunakan program chem draw untuk membuat ligan santorizol dalam bentuk dua dimensinya dalam format *.mol, kemudian hasil senyawa santorizol yang telah kita buat dibuka pada program HyperChem dan tambahkan rantai hidrogen kemudian energi semiempirical dipilih dan digunakan AM1. Optimasi geometrinya dengan polakribiere lalu save dengan format *.hin, hasil ligan yang telah di optimasi convert menjadi file *.pdb dengan program Arguslab. b. Docking santorizol pada kantung ikatan COX-1 dan COX-2. Setelah senyawa santorizol telah dibuat dalam Hasil file berformat *.pdb lalu kita docking terhadap kantung COX-1 dan COX-2 Pada Tabel 1 menunjukkan hasil validasi kantung ikatan enzim COX- 1 (kode pdb : 1EQG) melalui redocking ligan alami ibuprofen. Parameter docking dipilih dengan jumlah run 50, grid box 60³Å. Hasil redocking ibuprofen dengan enzim COX-1 yaitu ; Energi Docking = kkal/mol, Konstanta Inhibisi = 2.8 µm dan RMSD = Å, residu asam amino yaitu Ala527, Arg120, Gly526, Ile532, Met522, Phe518, Ser353, Try355, Val116, Val349. Ikatan hidrogen (Gambar 3) yang terbentuk antara ibuprofen dengan enzim COX-1 adalah Arg120 dengan jarak Å dan Å; Tyr355 dengan jarak Å.. Tabel 1 Hasil validasi docking ibuprofen dengan enzim COX-1 kode pdb 1EQG. Run Grid (ų) ED (Kkal/mol) Ki (µm) RMSD (Å) , Residu aa Ala527, Arg120, Gly526, Ile532, Met522, Phe518, Ser353, Try355, Val116, Val349 ED = Energi Docking, Ki = Konstanta inhibisi, RMSD = Root mean square deviation, Residua aa = Residu asam amino 11
5 Gambar 1 Ikatan hidrogen yang terbentuk antara Ibuprofen dengan enzim COX-1 Pada Tabel 2 merupakan hasil re-docking ligan alami celecoxib (gambar 4) terhadap enzim COX-2( kode pdb 3LN1) dengan parameter terpilih yaitu jumlah run 50, grid box yang digunakan 60³ dengan spasi 0,375 Å, menghasilkan data dengan Energi Docking = kkal/mol, Konstanta inhibisi = µm, RMSD = Å dengan residu asam amino yang berikatan yaitu His75, Arg106, Gln178, Val335, Leu338, Ser339, Try341, Leu345, Leu370, Trp373, Arg499, Ala502, Ile503, Phe504, Met508, Val509, Gly512, Ala513. Ikatan hidrogen (Gambar 4) yang terbentuk pada saat validasi adalah His75 dengan jarak 2,386 Å; Ser339 dengan jarak 3,476 Å; Leu338 dengan jarak 3,986 Å. Tabel 2 Hasil validasi docking celecoxib dengan enzim COX-2 kode pdb 3LN1 Run Grid (ų) ED (Kkal/mol) Ki (µm) RMSD (Å) Residu aa His75, Arg106, Gln178, Val335, Leu338, Ser339, Try341, Leu345, Leu370, Trp373, Arg499, Ala502, Ile503, Phe504, Met508, Val509, Gly512, Ala513 12
6 Gambar 2 Ikatan hidrogen yang terbentuk antara celecoxib dengan COX-2 Setelah dilakukan validasi kantung ikatan melalui re-docking, kemudian dilakukan docking senyawa santorizol pada kantung ikatan enzim COX-1 dan COX2. Hasil docking senyawa uji santorizol terhadap COX-1 (Gambar 5) menunjukkan residu asam amino yang berinteraksi yaitu Val116, Arg120, Val349, Leu352, Ser353, Tyr355, Phe381, Leu384, Tyr385, Trp387, Phe518, Met522, Ile523, Gly526, Ala527, Ser530, Leu531. Sedangkan, ikatan hidrogen terjadi dengan asam amino Arg120 dengan jarak ikatan 2,02 A ⁰, dan Tyr355 dengan jarak ikatan 1,92 A ⁰. Energi Docking = kkal/mol, Konstanta inhibisi = 1.63 µm (Tabel 3). Tabel 3 Hasil docking santorizol dengan enzim COX-1 kode pdb 1EQG ED (Kkal/mol) Ki (µm) Residu aa Tyr385, Trp387, Phe518, Met522, Ile523, Gly526, Ala527, Ser530, Leu531 Ikatan hidrogen Arg120 (2.019 A⁰) Tyr355 (1.917A⁰) 13
7 Gambar 3 Ikatan hidrogen yang terbentuk pada docking senyawa santorizol yang berikatan dengan COX-1 Hasil docking senyawa santorizol terhadap COX-2 (Tabel 4) menunjukkan residu asam amino yang berinteraksi yaitu : His75, Gln178, Val335, Leu338, Ser339, Phe367, Leu370, Tyr371, Trp373, Arg499, Ala502, Ile503, Phe504, Met508, Val509, Gly512, Ala513. Sedangkan ikatan hidrogen (gambar 6) yang terbentuk antara lain Gln178 dengan jarak Å; Leu338 dengan jarak Å. Energi Docking = kkal/mol, Konstanta inhibisi = µm (Tabel 8). Tabel 4 Hasil docking santorizol dengan enzim COX-2. ED (Kkal/mol) Ki (µm) Residu aa His75, Gln178, Val335, Leu338, Ser339, Phe367, Leu370, Tyr371, Trp373, Arg499, Ala502, Ile503, Phe504, Met508, Val509, Gly512, Ala513 Ikatan hidrogen Gln178 (2.060 Å). Leu338 (2.065 Å) 14
8 Gambar 4 Ikatan hidrogen yang terbentuk pada docking senyawa santorizol yang berikatan dengan COX-2 Pembahasan Pada Tabel 1 menunjukkan hasil validasi kantung ikatan enzim COX- 1 (kode pdb : 1EQG) melalui redocking ligan alami ibuprofen. Parameter docking yang dipilih run 50, grid box 60³ dengan spasi 0,375 Å. Hasil docking ibuprofen (Gambar 3) dengan enzim COX-1 yaitu ; Energi Bebas Ikatan = kkal/mol, Konstanta Inhibisi = 2.8 µm dan RMSD = Å. Ikatan hidrogen (Gambar 3) yang terbentuk antara ibuprofen dengan enzim COX-1 adalah Arg120 dengan jarak Å pada atom O dan Å pada atom C; Tyr355 dengan jarak Å pada atom C. Hasil docking ligan alami celecoxib terhadap enzim COX-2 kode pdb 3LN1 dengan variasi run 50 grid box yang digunakan 60³Å, menghasilkan data dengan Enegi Bebas Ikatan = kkal/mol, Konstanta Inhibisi = µm, RMSD = Å. Ikatan hidrogen (Gambar 4) yang terbentuk pada saat validasi adalah His75 dengan jarak Å pada atom N; Ser339 dengan jarak Å pada atom N; Leu338 dengan jarak Å pada atom N. Hasil docking senyawa uji santorizol terhadap COX-1 menunjukkan residu asam amino Val116, Arg120, Val349, Leu352, Ser353, Tyr355, Phe381, Leu384, Tyr385, Trp387, Phe518, Met522, Ile523, Gly526, Ala527, Ser530, Leu531 dan ikatan hidrogen dengan asam amino Arg120, Tyr355 dengan jarak ikatan 2.02, 1.92 Å dan Energi Bebas Ikatan kkal/mol, Konstanta Inhibisi 1.63 µm (Tabel 3). Hasil analisis interaksi santorizol dengan enzim COX-1 menunjukkan bahwa adanya ikatan hidrogen yang kuat antara santorizol dengan kantung ikatan COX-1 tetapi residu asam amino yang berikatan berbeda dengan ibuprofen, interaksi pada ibuprofen didapatkan residu asam amino Ala527, Arg120, Gly526, Ile532, Met522, Phe518, Ser353, Try355, Val116, Val349 pada senyawa santorizol hasil residu asam amino yang didapat adalah Val116, Arg120, Val349, Leu352, Ser353, Tyr355, Phe381, Leu384, Tyr385, 15
9 Trp387, Phe518, Met522, Ile523, Gly526, Ala527, Ser530, Leu531. Hasil tersebut menunjukkan bahwa santorizol mampu berinteraksi dengan residu asam amino penting pada kantung ikatan COX-1. Meskipun terdapat perbedaan jenis residu asam amino yang berikatan dengan ibuprofen, namun ikatan hidrogen yang terbentuk (gambar 5) antara lain Tyr335 dengan jarak Å pada atom O; Arg120 dengan jarak Å yang merupakan residu asam amino penting pada sisi aktif enzim COX-1, menunjukkan bahwa senyawa santorizol memiliki aktivitas antiinflamasi dengan menghambat enzim COX-1. Hasil docking senyawa santorizol terhadap COX-2 menunjukkan residu asam amino yang berinteraksi antara lain : His75, Gln178, Val335, Leu338, Ser339, Phe367, Leu370, Tyr371, Trp373, Arg499, Ala502, Ile503, Phe504, Met508, Val509, Gly512, Ala513. Ikatan hidrogen yang terbentuk antara lain dengan Gln178 dengan jarak 2.06 Å; Leu338 dengan jarak 2.07 Å; Energi docking kkal/mol, dan Konstanta inhibisi µm (Tabel 4). Hasil tersebut menunjukkan bahwa santorizol dapat berikatan dengan residu asam amino penting pada kantung ikatan COX-2 (Leu338) sebagaimana ikatannya dengan celecoxib. Simpulan Santorizol memiliki aktivitas sebagai antiinflamasi yang ditunjukkan dari hasil docking senyawa santorizol terhadap enzim COX-1 dan COX-2. Santorizol dapat berikatan dengan kantung ikatan COX-1 dan COX-2, namun lebih selektiv terhadap COX-2 dengan nilai energi docking yang lebih kecil dibandingkan pada interaksinya terhadap COX-1. Daftar Pustaka 1. Siswandono; Soekardjo, B., Kimia Medisinal Jilid 1. Pengembangan Obat. Surabaya: Airlangga University Press, 1-28; Chol Seung Lim, Da-Qing Jin, Hyejung Mok, Sang Jin Oh, Jung Uk Lee, Jae Kwan Hwang, Ilho Ha, Jung-Soo Han, Antioxidant and antiinflammatory activities of santorizol in hippocampal neurons and primary cultured microglia, J Neurosci Res Dec 15;82(6): McAdam, B.F., Lawson, F.C., Mardini, I.A., Kapoor, S., Lawson, J.A., Fitzgerald, G.A., Systemic Biosynthesis of Prostacyclin by Cyclooxygenase (COX-2): The Human Pharmacology of Selective Inhibitor of COX-2. Proc Natl Acad Sci, 96(1): McAdam, B.F., Lawson, F.C., Mardini, I.A., Kapoor, S., Lawson, J.A., Fitzgerald, G.A., Systemic Biosynthesis of Prostacyclin by Cyclooxygenase (COX-2): The Human Pharmacology of Selective Inhibitor of COX-2. Proc Natl Acad Sci, 96(1): Rajakariar, R., Yaqoob, M.M., Gilroy, D.W., COX-2 in 16
10 Inflammation and Resolution. Mol interv, 6(4): Zimmermann, K.C., M. Sarbia, K. Schror, A.A. Weber., Constitutive cyclooxygenase-2 expression in healthy human and rabbit gastric mucosa. Mol Pharmacol, 54(3): Garrett M. Moris., 5 Nov User guide AutoDock ver 4.2. Automated Docking of Flexible Ligands to Flexible Receptors : Selinsky BS, Gupta K, Sharkey CT, Loll PJ, Structural analysis of NSAID binding by prostaglandin H2 synthase: timedependent and time-independent inhibitors elicit identical enzyme conformations, Biochem, 2001 May 1;40(17): Wang JL, Limburg D, Graneto MJ, Springer J, Hamper JR, Liao S, Pawlitz JL, Kurumbail RG, Maziasz T, Talley JJ, Kiefer JR, Carter J, The novel benzopyran class of selective cyclooxygenase-2 inhibitors. Part 2: the second clinical candidate having a shorter and favorable human half-life. Boorg. Med. Chem. Lett. 2010, (20):
Simulasi Docking Molekuler Senyawa Xanthorrhizol sebagai Antiinflamasi terhadap Enzim COX-1 dan COX-2
Simulasi Docking Molekuler Senyawa Xanthorrhizol sebagai Antiinflamasi terhadap Enzim COX-1 dan COX-2 Deden I. Dinata 1, Hardhi Suryatno 1, Ida Musfiroh 2, Shelvy E. Suherman 2 1 Sekolah Tinggi Farmasi
Lebih terperinciPERBANDINGAN AFINITAS KURKUMIN-ENOL DAN KURKUMIN-KETO TERHADAP COX-2 Mohammad Rizki Fadhil Pratama
Artikel asil Penelitian PERBANDINGAN AFINITAS KURKUMINENL DAN KURKUMINKET TERADAP CX2 Mohammad Rizki Fadhil Pratama Fakultas Ilmu Kesehatan, Universitas Muhammadiyah Palangkaraya, Jl.RTA Milono Km. 1,5
Lebih terperinciRatih Aryani, Yedi Purwandi S Program Studi S1Farmasi Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan Bakti Tunas Husada. Abstrak
KAJIAN SENYAWA ELEUTHERINE DAN ISOELEUTHERINE SEBAGAI ANTIINFLAMASI TERHADAP ENZIM COX-1 DAN COX-2 SECARA IN SILIKO DENGAN METODE SIMULASI DOCKING MOLEKULAR Ratih Aryani, Yedi Purwandi S Program Studi
Lebih terperinciSTUDI IN SILICO BEBERAPA SENYAWA TURUNAN ASAM SINAMAT TERHADAP RESEPTOR HUMAN TYROSINASE SERLY YULIAWATI
STUDI IN SILICO BEBERAPA SENYAWA TURUNAN ASAM SINAMAT TERHADAP RESEPTOR HUMAN TYROSINASE SERLY YULIAWATI 2443009037 FAKULTAS FARMASI UNIVERSITAS KATOLIK WIDYA MANDALA SURABAYA 2013 ABSTRAK STUDI IN
Lebih terperinciBAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN. A. Validasi Metode Docking dengan Autodock Vina. dahulu dilakukan validasi dengan cara menambatkan ulang ligan asli (S58)
BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN A. Validasi Metode Docking dengan Autodock Vina Sebelum dilakukan proses seleksi ligan pada penelitian ini, terlebih dahulu dilakukan validasi dengan cara menambatkan ulang
Lebih terperinciKAJIAN BEBERAPA SENYAWA ANTIINFLAMASI : DOCKING TERHADAP SIKLOOKSIGENASE-2 SECARA IN SILICO
KAJIAN BEBERAPA SENYAWA ANTIINFLAMASI : DOCKING TERHADAP SIKLOOKSIGENASE-2 SECARA IN SILICO Mukhtasyam Zukhrullah, Muhammad Aswad, dan Subehan Fakultas Farmasi Universitas Hasanuddin, Makassar ABSTRAK
Lebih terperinciPrediksi Ikatan Molekular Kemenyan Jawa dan Adas Bintang terhadap Mutase Korismat Mycobacterium tuberculosis (2fp2, 3st6)
Prediksi Ikatan Molekular Kemenyan Jawa dan Adas Bintang terhadap Mutase Korismat Mycobacterium tuberculosis (2fp2, 3st6) Rani Wulandari 1, Broto Santoso 2 Fakultas Farmasi, Universitas Muhammadiyah Surakarta
Lebih terperinciBAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN. A. Hasil Penelitian Penambatan molekul (molecular docking) merupakan penelitian dengan
BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN A. Hasil Penelitian Penambatan molekul (molecular docking) merupakan penelitian dengan metode komputasi yang bertujuan untuk mendeteksi interaksi suatu ligan dengan suatu reseptor.
Lebih terperinciBAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN. 1. Uji pelarut DMSO terhadap kontraksi otot polos uterus
BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN A. Hasil penlitian dan pembahasan 1. Uji pelarut DMSO terhadap kontraksi otot polos uterus Senyawa 1-(2,5-dihidroksifenil)-(3-piridin-2-il)-propenon adalah senyawa sintetis
Lebih terperinciKAJIAN DOCKING 3-[(ASETILOKSI)METIL]-7-[(4-HIDROKSI-3- METOKSIFENIL)METILIDIN]AMINO]-8-OKSO-5-THIA- 1-AZABISIKLO[4.2
KAJIAN DOCKING 3-[(ASETILOKSI)METIL]-7-[(4-HIDROKSI-3- METOKSIFENIL)METILIDIN]AMINO]-8-OKSO-5-THIA- 1-AZABISIKLO[4.2.0]OCT-2-ENE-ASAM KARBOKSILAT MENGGUNAKAN DOCK6 SKRIPSI Diajukan untuk memenuhi salah
Lebih terperinciBAB IV HASIL PENELITIAN DAN PEMBAHASAN. 1. Identifikasi Tanaman dan Preparasi Ekstrak
BAB IV HASIL PENELITIAN DAN PEMBAHASAN A. Hasil Penelitian 1. Identifikasi Tanaman dan Preparasi Ekstrak Identifikasi tanaman secara determinasi tidak dilakukan, tetapi menggunakan identifikasi secara
Lebih terperinciPENILAIAN HASIL MOLECULAR DOCKING TURUNAN DIKETOPIPERAZIN SEBAGAI INHIBITOR HIV-1 PROTEASE SKRIPSI. Oleh: BAYU AJI NEGARA K
PENILAIAN HASIL MOLECULAR DOCKING TURUNAN DIKETOPIPERAZIN SEBAGAI INHIBITOR HIV-1 PROTEASE SKRIPSI Oleh: BAYU AJI NEGARA K 100 090 004 FAKULTAS FARMASI UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH SURAKARTA SURAKARTA 2014
Lebih terperinciPrediksi Mekanisme Kerja Obat Terhadap Reseptornya Secara in Silico(Studi pada Antibiotika Sefotaksim)
Prediksi Mekanisme Kerja Obat Terhadap Reseptornya Secara in Silico(Studi pada Antibiotika Sefotaksim) Sovia Aprina Basuki, Neva Melinda Program Studi Farmasi, Fakultas Ilmu Kesehatan, Universitas Muhammadiyah
Lebih terperinciPENILAIAN HASIL MOLECULAR DOCKING TURUNAN ZERUMBON SEBAGAI INHIBITOR PTP1B MENGGUNAKAN DOCK6
PENILAIAN HASIL MOLECULAR DOCKING TURUNAN ZERUMBON SEBAGAI INHIBITOR PTP1B MENGGUNAKAN DOCK6 Broto Santoso *, Muhammad R. As Sabiq, Muhammad Da i, Dedi Hanwar, Andi Suhendi Fakultas Farmasi, Universitas
Lebih terperinciSTUDI DOCKING MOLEKULAR SENYAWA ASAM SINAMAT DAN DERIVATNYA SEBAGAI INHIBITOR PROTEIN 1J4X PADA SEL KANKER SERVIKS
STUDI DOCKING MOLEKULAR SENYAWA ASAM SINAMAT DAN DERIVATNYA SEBAGAI INHIBITOR PROTEIN 1J4X PADA SEL KANKER SERVIKS MOLECULAR DOCKING STUDY OF CINNAMATE ACID COMPOUND AND ITS DERIVATIVES AS PROTEIN 1J4X
Lebih terperinciSTUDI POTENSI KURKUMIN DAN ANALOGNYA SEBAGAI SELECTIVE ESTROGEN RECEPTOR MODULATORS (SERMs): DOCKING PADA RESEPTOR ESTROGEN β
STUDI POTENSI KURKUMIN DAN ANALOGNYA SEBAGAI SELECTIVE ESTROGEN RECEPTOR MODULATORS (SERMs): DOCKING PADA RESEPTOR ESTROGEN β SELECTIVE ESTROGEN RECEPTOR MODULATORS (SERMs) POTENCY OF CURCUMIN AND ITS
Lebih terperinciPEMODELAN TIGA DIMENSI (3D) IKATAN HASIL DOCKING MOLEKULAR TURUNAN DIKETOPIPERAZIN (DKP) DENGAN Bcl-2 PADA SEL MCF-7 SKRIPSI
PEMODELAN TIGA DIMENSI (3D) IKATAN HASIL DOCKING MOLEKULAR TURUNAN DIKETOPIPERAZIN (DKP) DENGAN Bcl-2 PADA SEL MCF-7 SKRIPSI Oleh: YUNIYATI LUTHFIYAH K 100 090 010 FAKULTAS FARMASI UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH
Lebih terperinciBAB I PENDAHULUAN Latar Belakang Masalah
BAB I PENDAHULUAN A. Latar Belakang Masalah Kasus infeksi bakteri semakin meningkat setiap tahunnya. Infeksi bakteri dapat diobati dengan antibiotika yang sesuai. Namun terdapat penyalahgunaan antibiotika
Lebih terperinciMetabolisme Protein - 2
Protein Struktur asam amino Asam amino essensial Metabolisme asam amino Pengaruh hormon dalam metabolisme asam amino Anabolisme asam amino Katabolisme asam amino Keseimbangan nitrogen Siklus urea Perubahan
Lebih terperinciAPLIKASI MOLECULAR DOCKING MENGGUNAKAN SOFTWARE AUTODOCK TUTORIAL MOLECULAR DOCKING DENGAN APLIKASI AUTODOCK VINA
APLIKASI MOLECULAR DOCKING MENGGUNAKAN SOFTWARE AUTODOCK TUTORIAL MOLECULAR DOCKING DENGAN APLIKASI AUTODOCK VINA Tujuan Menentukan interaksi yang terjadi antara kompleks ligand-protein hasil dockings
Lebih terperinci10/30/2015. Protein adalah makromolekul. Mereka dibangun dari satu atau lebih rantai asam amino. Protein dapat mengandung asam amino.
Protein Struktur asam Asam essensial Metabolisme asam Pengaruh hormon dalam metabolisme asam Anabolisme asam Katabolisme asam Keseimbangan nitrogen Siklus urea Perubahan rangka karbon asam menjadi zat
Lebih terperinciPHARMACY, Vol.13 No. 02 Desember 2016 ISSN
ANALISIS PENAMBATAN MOLEKUL SENYAWA FLAVONOID BUAH MAHKOTA DEWA (Phaleria macrocarpa (Scheff.) Boerl.) PADA RESEPTOR α-glukosidase SEBAGAI ANTIDIABETES MOLECULAR DOCKING ANALYSIS OF FLAVONOIDS OF Phaleria
Lebih terperinciBAB III METODE PENELITIAN. Penelitian ini dilakukan di Fakultas Kedokteran Universitas Sebelas Maret
digilib.uns.ac.id BAB III METODE PENELITIAN A. Jenis Penelitian Penelitian ini merupakan penelitian bioinformatika yang menganalisis ikatan reseptor estrogen α terhadap fitokimia tumbuhan famili Asteraceae
Lebih terperinciMOLECULAR DOCKING SENYAWA FITOKIMIA Piper longum (L.) TERHADAP RESEPTOR SIKLOOKSIGENASE-2 (COX-2) SEBAGAI ANTIINFLAMASI
MOLECULAR DOCKING SENYAWA FITOKIMIA Piper longum (L.) TERHADAP RESEPTOR SIKLOOKSIGENASE-2 (COX-2) SEBAGAI ANTIINFLAMASI Dwi Koko Pratoko Bagian Kimia Farmasi Fakultas Farmasi Universitas Jember Jl. Kalimantan
Lebih terperinciPENAPISAN VIRTUAL SENYAWA TURUNAN METIL SINAMAT PADA ENZIM SIKLOOKSIGENASE-2 (COX-2)
PENAPISAN VIRTUAL SENYAWA TURUNAN METIL SINAMAT PADA ENZIM SIKLOOKSIGENASE-2 (COX-2) Teni Ernawati Pusat Penelitian Kimia-Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia Kawasan Puspiptek, Tangerang Selatan, Banten
Lebih terperinciStudi Interaksi Senyawa Turunan 1,3-Dibenzoiltiourea sebagai Ribonukleotida Reduktase Inhibitor
Artikel Penelitian Studi Interaksi Senyawa Turunan 1,3-Dibenzoiltiourea sebagai Ribonukleotida Reduktase Inhibitor Tresna Lestari ABSTRACT: In this research, docking process was carried out from 1,3-dibenzoylthiourea
Lebih terperinciSIMULASI EFEKTIVITAS SENYAWA OBAT ERITROMISIN F DAN 6,7 ANHIDROERITROMISIN F DALAM LAMBUNG MENGGUNAKAN METODE SEMIEMPIRIS AUSTIN MODEL 1 (AM1)
SIMULASI EFEKTIVITAS SENYAWA OBAT ERITROMISIN F DAN 6,7 ANHIDROERITROMISIN F DALAM LAMBUNG MENGGUNAKAN METODE SEMIEMPIRIS AUSTIN MODEL 1 (AM1) Agung Tri Prasetya, M. Alauhdin, Nuni Widiarti Kimia FMIPA
Lebih terperinciSTUDI IN SILICO SENYAWA ALKALOID DARI BUNGA TAPAK DARA (CATHARANTHUS ROSEUS (L) G. DON) PADA RESEPTOR ESTROGEN BETA SEBAGAI ANTIKANKER PAYUDARA
STUDI IN SILICO SENYAWA ALKALOID DARI BUNGA TAPAK DARA (CATHARANTHUS ROSEUS (L) G. DON) PADA RESEPTOR ESTROGEN BETA SEBAGAI ANTIKANKER PAYUDARA STUDY IN SILICO COMPOUND OF INTEREST VINCA ALKALOIDS OF (CATHARANTHUS
Lebih terperinci* Corresponding author, tel/fax : , UNESA Journal of Chemistry Vol. 6, No.
PENENTUAN AKTIVITAS SENYAWA TURUNAN MANGIFERIN SEBAGAI ANTIDIABETES PADA DIABETES MELLITUS TIPE 2 SECARA IN SILICO DETERMINATION OF MANGIFERIN DERIVED COMPOUNDS AS ANTIDIABETIC FOR TYPE 2 DIABETES MELLITUS
Lebih terperinciBAB 1 PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang Masalah
BAB 1 PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang Masalah Struktur kulit manusia mempunyai banyak lapisan yang berperan dalam pertahanan tubuh. Diantara lapisan tersebut terdapat suatu pigmen melanin yang disintesis
Lebih terperinciBAB I PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang
BAB I PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang Penggandaan dan penyediaan asam amino menjadi amat penting oleh karena senyawa tersebut dipergunakan sebagai satuan penyusun protein. Kemampuan jasad hidup untuk membentuk
Lebih terperinciRuswanto Program Studi Farmasi STIKes Bakti Tunas Husada, Tasikmalaya ABSTRAK
DESAIN DAN STUDI INTERAKSI SENYAWA N'-(3,5-DINITROBENZOYL)-ISONICOTINOHYDRAZIDE PADA MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS ENOYL-ACYL CARRIER PROTEIN REDUCTASE (INHA) Ruswanto Program Studi Farmasi STIKes Bakti Tunas
Lebih terperinciBAB I PENDAHULUAN A. Latar Belakang masalah
BAB I PENDAHULUAN A. Latar Belakang masalah Inflamasi adalah suatu respon jaringan terhadap rangsangan fisik atau kimiawi yang merusak. Rangsangan ini menyebabkan lepasnya mediator inflamasi seperti histamin,
Lebih terperinciPENAMBATAN MOLEKULER SENYAWA AKTIF TEMULAWAK (Curcuma xanthoriza) DENGAN ENZIM COX-2 SEBAGAI KANDIDAT OBAT ANTI KANKER PAYUDARA RIDHO PRATAMA
PENAMBATAN MOLEKULER SENYAWA AKTIF TEMULAWAK (Curcuma xanthoriza) DENGAN ENZIM COX-2 SEBAGAI KANDIDAT OBAT ANTI KANKER PAYUDARA RIDHO PRATAMA SEKOLAH PASCASARJANA INSTITUT PERTANIAN BOGOR BOGOR 2015 PERNYATAAN
Lebih terperinciQSAR DAN MOLECULAR DOCKING SENYAWA DERIVAT LUMIRACOXIB, INHIBITOR OKSIGENASI 2-AG PADA TERAPI INFLAMASI
QSAR DAN MOLECULAR DOCKING SENYAWA DERIVAT LUMIRACOXIB, INHIBITOR OKSIGENASI 2-AG PADA TERAPI INFLAMASI Nursalam Hamzah, Haeria, Nurul Muhlisa Mus Jurusan Farmasi, Fakultas Ilmu Kesehatan, Universitas
Lebih terperinciProtein. Kuliah Biokimia ke-3 PROTEIN
Protein Kuliah Biokimia ke-3 PS Teknologi Hasil Pertanian Univ.Mulawarman Krishna P. Candra, 2015 PROTEIN Protein berasal dari kata latin Proteus (penting) Makromolekul yang dibentuk dari satu atau lebih
Lebih terperinciKEGUNAAN. Merupakan polimer dari sekitar 21 jenis asam amino melalui ikatan peptida Asam amino : esensial dan non esensial
PROTEIN KEGUNAAN 1. Zat pembangun dan pengatur 2. Sumber asam amino yang mengandung unsur C, H, O dan N 3. Sumber energi Merupakan polimer dari sekitar 21 jenis asam amino melalui ikatan peptida Asam amino
Lebih terperinciPAH akan mengalami degradasi saat terkena suhu tinggi pada analisis dengan GC dan instrumen GC sulit digunakan untuk memisahkan PAH yang berbentuk
BAB I PENDAHULUAN I.I Latar Belakang Poliaromatik hidrokarbon (PAH) adalah golongan senyawa organik yang terdiri atas dua atau lebih molekul cincin aromatik yang disusun dari atom karbon dan hidrogen.
Lebih terperinciSTUDI IN SILICO SENYAWA ALKALOID DARI BUNGA TAPAK DARA (CATHARANTHUS ROSEUS (L) G. DON) PADA RESEPTOR ESTROGEN BETA SEBAGAI ANTIKANKER PAYUDARA
STUDI IN SILICO SENYAWA ALKALOID DARI BUNGA TAPAK DARA (CATHARANTHUS ROSEUS (L) G. DON) PADA RESEPTOR ESTROGEN BETA SEBAGAI ANTIKANKER PAYUDARA STUDY IN SILICO COMPOUND OF INTEREST VINCA ALKALOIDS OF (CATHARANTHUS
Lebih terperinciSTUDI MOLECULAR DOCKING TURUNAN N-FENILBENZAMIDA TERHADAP RESEPTOR DIHIDROOROTAT DEHIDROGENASE DARI Plasmodium falciparum
STUDI MOLECULAR DOCKING TURUNAN N-FENILBENZAMIDA TERHADAP RESEPTOR DIHIDROOROTAT DEHIDROGENASE DARI Plasmodium falciparum Indah Purnama Sary Fakultas Farmasi,Universitas Jember Email: indahpurnamasary.farmasi@unej.ac.id
Lebih terperinciBAB II TINJAUAN PUSTAKA. ataupun infeksi. Inflamasi merupakan proses alami untuk mempertahankan
BAB II TINJAUAN PUSTAKA A. Proses Terjadinya Inflamasi Inflamasi adalah salah suatu respon terhadap cedera jaringan ataupun infeksi. Inflamasi merupakan proses alami untuk mempertahankan homeostasis tubuh
Lebih terperinciStudi Farmakofor Reseptor COX-2 Sebagai Anti Inflamasi
Studi Farmakofor Reseptor COX-2 Sebagai Anti Inflamasi Nursalam Hamzah 1, Ahmad Najib 2, Nurshalati Thahir 1, Ika Misqawati 1 1 Jurusan Farmasi Fakultas Ilmu Kesehatan Universitas Islam Negeri Alauddin
Lebih terperinciBAB V PEMBAHASAN. pada residu Glu 205, Glu 206, dan Tyr 662. Ada dua jenis interaksi yang
digilib.uns.ac.id BAB V PEMBAHASAN A. Analisis Hasil Uji Molecular Docking Sitagliptin berikatan dengan binding site DPP-4 dan memiliki interaksi pada residu Glu 205, Glu 206, dan Tyr 662. Ada dua jenis
Lebih terperinciPEMODELAN TIGA DIMENSI (3D) IKATAN HASIL DOCKING MOLEKULAR TURUNAN DIKETOPIPERAZIN (DKP) DENGAN Bcl-2 PADA SEL MCF-7 NASKAH PUBLIKASI
PEMODELAN TIGA DIMENSI (3D) IKATAN HASIL DOCKING MOLEKULAR TURUNAN DIKETOPIPERAZIN (DKP) DENGAN Bcl-2 PADA SEL MCF-7 NASKAH PUBLIKASI Oleh: YUNIYATI LUTHFIYAH K 100 090 010 FAKULTAS FARMASI UNIVERSITAS
Lebih terperinciKAJIAN SECARA IN SILICO TERHADAP POTENSI EUGENOL DAN SITRONELAL SEBAGAI PESTISIDA NABATI UNTUK PENGENDALIAN SERANGGA HELOPELTIS ANTONII ABSTRAK
KIMIA.STUDENTJOURNAL, Vol. 2, No. 2, pp. 562-568, UNIVERSITAS BRAWIJAYA MALANG Received 6 November 2014, Accepted 6 November 2014, Published online 7 November 2014 KAJIAN SECARA IN SILICO TERHADAP POTENSI
Lebih terperinciGambar 1.1. Struktur asam asetilsalisilat (Departemen Kesehatan RI, 1995).
BAB 1 PENDAHULUAN 1.1. Latar Belakang Analgesik (obat penghilang rasa nyeri) merupakan suatu senyawa yang dalam dosis terapetik dapat meringankan atau menekan rasa nyeri yang timbul tanpa memiliki kerja
Lebih terperinciSIMULASI DOCKING SENYAWA KURKUMIN DAN ANALOGNYA SEBAGAI INHIBITOR ENZIM 12-LIPOKSIGENASE GITA SYAHPUTRA
SIMULASI DOCKING SENYAWA KURKUMIN DAN ANALOGNYA SEBAGAI INHIBITOR ENZIM 12-LIPOKSIGENASE GITA SYAHPUTRA SEKOLAH PASCASARJANA INSTITUT PERTANIAN BOGOR BOGOR 2014 PERNYATAAN MENGENAI TESIS DAN SUMBER INFORMASI
Lebih terperinciAnti Aterosklerosis Andrografolid dari Sambiloto melalui Mekanisme Antiinflamasi secara In Silico
Anti Aterosklerosis Andrografolid dari Sambiloto melalui Mekanisme Antiinflamasi secara In Silico Susanti, N. M. P. 1, Laksmiani, N. P. L. 1, Warditiani, N. K. 1, Sunariyani, P. E. A. 1 1 Jurusan Farmasi
Lebih terperinciBIOMOLEKUL II PROTEIN
KIMIA KELAS XII IPA - KURIKULUM GABUNGAN 22 Sesi NGAN BIOMOLEKUL II PROTEIN Protein dan peptida adalah molekul raksasa yang tersusun dari asam α-amino (disebut residu) yang terikat satu dengan lainnya
Lebih terperinciPenapisan Virtual dan Elusidasi Moda Ikatan Analog Kurkumin pada Enzim Siklooksigenase-2 Menggunakan Protokol EE_COX2_V.1.0
JURNAL ILMU KEFARMASIAN INDNESIA, September 2015, hlm. 235-241 ISSN 1693-1831 Vol. 13, No.2 Penapisan Virtual dan Elusidasi Moda Ikatan Analog Kurkumin pada Enzim Siklooksigenase-2 Menggunakan Protokol
Lebih terperinciSkrining Potensi Andrografolid dari Sambiloto (Andrographis paniculata (Burm F.) Ness.) sebagai Antikanker Payudara secara In Silico
Skrining Potensi Andrografolid dari Sambiloto (Andrographis paniculata (Burm F.) Ness.) sebagai Antikanker Payudara secara In Silico Laksmiani, N. P. L. 1, Widiastari, M. I. 1, Reynaldi, K. R. 1 1 Jurusan
Lebih terperinciAKTIVITAS ANTINOCICEPTIV DAN UJI IN SILICO TERHADAP CYCLOOXYGENASE DARI ASAM P-METOKSISINAMAT DAN ASAM M-METOKSISINAMAT
AKTIVITAS ANTINOCICEPTIV DAN UJI IN SILICO TERHADAP CYCLOOXYGENASE DARI ASAM P-METOKSISINAMAT DAN ASAM M-METOKSISINAMAT JUNI EKOWATI, NUZUL W. DIYAH Departement of Pharmaceutical Chemistry, Faculty of
Lebih terperinciBAB 1 PENDAHULUAN 1.1. Latar Belakang Penelitian
BAB 1 PENDAHULUAN 1.1. Latar Belakang Penelitian Prevalensi penyakit terkait inflamasi di Indonesia, seperti rematik (radang sendi) tergolong cukup tinggi, yakni sekitar 32,2% (Nainggolan, 2009). Inflamasi
Lebih terperinciThe 7 th University Research Colloqium 2018 STIKES PKU Muhammadiyah Surakarta
Interaksi Molekulersecara 3D Senya water kandung dalam Kemenyan Jawa dan Adas Bintang sebagai Inhibitor Protein Sintase 2dari 3-Oksoasil-[Protein- Pembawa-Asil]Mycobacterium tuberculosis Dina Octavia 1,
Lebih terperinciBAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN. identifikasi senyawa yang terdapat pada minyak atsiri Jahe (Zingiber
BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN A. Hasil Penelitian 1. Analisis Kandungan Kimia GC-MS Analisis kandungan kimia metode GC-MS dilakukan untuk identifikasi senyawa yang terdapat pada minyak atsiri Jahe (Zingiber
Lebih terperinciMODIFIKASI INHIBITOR SB-3CT UNTUK MENGHAMBAT KERJA MATRIKS METALLOPROTEINASE 2 DALAM PENYEBARAN SEL KANKER SECARA IN SILICO SKRIPSI
MODIFIKASI INHIBITOR SB-3CT UNTUK MENGHAMBAT KERJA MATRIKS METALLOPROTEINASE 2 DALAM PENYEBARAN SEL KANKER SECARA IN SILICO SKRIPSI Oleh Septi Anggraini NIM 071810301078 JURUSAN KIMIA FAKULTAS MATEMATIKA
Lebih terperinciPHARMACY, Vol.12 No. 02 Desember 2015 ISSN
ANALISIS IN-SILICO SENYAWA DITERPENOID LAKTON HERBA SAMBILOTO (Andrographis paniculata Nees) PADA RESEPTOR ALPHA-GLUCOSIDASE SEBAGAI ANTIDIABETES TIPE II IN-SILICO ANALYSIS OF DITERPENOID LACTONE COMPOUNDS
Lebih terperinciOleh : Ashfar Kurnia
Oleh : Ashfar Kurnia Penilaian % Kehadiran (5%) & keaktifan (5%) 10 Mini Quiz (2x) 10 Tugas Makalah + ppt + maju + diskusi TJ 30 UTS 30 UAS 20 Siswandono & Soekardjo, B. (2000). Kimia Medisinal. Surabaya:
Lebih terperinciSTUDI INTERAKSI LIGAN PEPTIDOID DAN PEPTIDA DENGAN ENZIM PROTEASE NS3/NS2B VIRUS DENGUE
Jurnal Sainstek Vol. VI No. 1: 24-29, Juni 2014 ISSN: 2085-8019 STUDI INTERAKSI LIGAN PEPTIDOID DAN PEPTIDA DENGAN ENZIM PROTEASE NS3/NS2B VIRUS DENGUE Fitri Amelia Jurusan Kimia FMIPA Universitas Negeri
Lebih terperinciPEMODELAN INTERAKSI TURUNAN POTENSIAL ASAM BENZOIL SALISILAT DENGAN RESEPTOR ENZIM SIKLOOKSIGENASE 2
PEMODELAN INTERAKSI TURUNAN POTENSIAL ASAM BENZOIL SALISILAT DENGAN RESEPTOR ENZIM SIKLOOKSIGENASE 2 ONGKI NATALIA 2443009088 FAKULTAS FARMASI UNIKA WIDYA MANDALA SURABAYA 2012 ABSTRAK PEMODELAN INTERAKSI
Lebih terperinciSTUDI FARMAKOFOR DAN DOCKING MOLEKUL RESEPTOR σ2 SEBAGAI TARGET PENGOBATAN KANKER PAYUDARA
STUDI FARMAKOFOR DAN DOCKING MOLEKUL RESEPTOR σ2 SEBAGAI TARGET PENGOBATAN KANKER PAYUDARA Nursalam Hamzah, Haeria, Kamsia Dg Paewa Jurusan Farmasi, Fakultas Ilmu Kesehatan, Universitas Islam Negeri Alauddin
Lebih terperinciDESAIN INHIBITOR KARBONAT ANHIDRASE II BERBASIS SENYAWA BAHAN ALAM GOLONGAN FENOLIK DAN SENYAWA ANALOG KURKUMIN
ABSTRAK DESAIN INHIBITOR KARBONAT ANHIDRASE II BERBASIS SENYAWA BAHAN ALAM GOLONGAN FENOLIK DAN SENYAWA ANALOG KURKUMIN Oleh: Reza Aditama NIM: 30511012 (Program Studi Doktor Kimia) Karbonat anhidrase
Lebih terperinciPokok Bahasan: Ekspresi gen
Pokok Bahasan: Ekspresi gen Sub Pokok Bahasan : 3.1. Regulasi Ekspresi 3.2. Sintesis Protein 3.1. Regulasi ekspresi Pengaruh suatu gen dapat diamati secara visual misalnya pada anggur dengan warna buah
Lebih terperinciStruktur dan Fungsi Protein
Struktur dan Fungsi Protein Protein merupakan makromolekul yang sangat serbaguna pada makluk hidup dan melakukan fungsi yang sangat vital dalam seluruh sistem biologis Proteins disusun oleh 20 jenis asam
Lebih terperinciProtein adalah sumber asam-asam amino yang mengandung unsur-unsur C, H, O, dan N yang tidak dimiliki oleh lemak atau karbohidrat.
PROTEIN Protein adalah sumber asam-asam amino yang mengandung unsur-unsur C, H, O, dan N yang tidak dimiliki oleh lemak atau karbohidrat. Sebagai zat pembangun, protein merupakan bahan pembentuk jaringanjaringan
Lebih terperinciPara-aminofenol Asetanilida Parasetamol Gambar 1.1 Para-aminofenol, Asetanilida dan Parasetamol (ChemDraw Ultra, 2006).
BAB 1 PENDAHULUAN Demam dapat disebabkan gangguan pusat pengaturan suhu tubuh pada hipotalamus dari kerusakan atau ketidakmampuan untuk menghilangkan peningkatan produksi panas. Keadaan suhu tubuh di atas
Lebih terperinciBAB 1 PENDAHULUAN 1.1. Latar Belakang Masalah
BAB 1 PENDAHULUAN 1.1. Latar Belakang Masalah Banyak faktor yang menyebabkan warna kulit manusia berbedabeda dari faktor genetik, usia, cahaya matahari dan lingkungan. Semua itu berhubungan dengan melanosom
Lebih terperinciSTUDI IN SILICO BEBERAPA SENYAWA TURUNAN ASAM SINAMAT TERHADAP RESEPTOR MUSHROOM TYROSINASE (3NQ1)
STUDI IN SILICO BEBERAPA SENYAWA TURUNAN ASAM SINAMAT TERHADAP RESEPTOR MUSHROOM TYROSINASE (3NQ1) OLIVIA YOUNG 2443009036 FAKULTAS FARMASI UNIVERSITAS KATOLIK WIDYA MANDALA SURABAYA 2013 ABSTRAK STUDI
Lebih terperinciBAB I PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang
BAB I PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang Banyak senyawa heterosiklik dengan aktivitas tertentu digunakan dalam pengobatan penyakit-penyakit menular. Penggunaan senyawa tersebut dalam pengobatan berkaitan dengan
Lebih terperinciREAKSI DEKOMPOSISI SENYAWA ERITROMISIN F DAN 6,7 ANHIDROERITROMISIN F SUATU KAJIAN MENGGUNAKAN METODE SEMIEMPIRIS AUSTIN MODEL 1 (AM1) ABSTRAK
1 REAKSI DEKMPSISI SENYAWA ERITRMISIN F DAN 6,7 ANHIDRERITRMISIN F SUATU KAJIAN MENGGUNAKAN METDE SEMIEMPIRIS AUSTIN MDEL 1 (AM1) Enokta Hedi Permana 1, Agung Tri Prasetya 2, Kasmui 3 1) Mahasiawa Jurusan
Lebih terperinciBAHAN PENYUSUN GENETIK
Materi Kuliah Bioteknologi Pertanian Prodi Agribisnis Pertemuan Ke 4 BAHAN PENYUSUN GENETIK Ir. Sri Sumarsih, MP. Email: Sumarsih_03@yahoo.com Weblog: Sumarsih07.wordpress.com Website: agriculture.upnyk.ac.id
Lebih terperinciBAB IV Hasil dan Pembahasan
BAB IV Hasil dan Pembahasan Bab ini akan membahas hasil PCR, hasil penentuan urutan nukleotida, analisa in silico dan posisi residu yang mengalami mutasi dengan menggunakan program Pymol. IV.1 PCR Multiplek
Lebih terperinciBAB I PENDAHULUAN 1.1. Latar Belakang Masalah
BAB I PENDAHULUAN 1.1. Latar Belakang Masalah Nyeri, demam dan radang merupakan gejala penyakit yang sering dialami manusia. Adanya rasa nyeri merupakan pertanda dimana terjadi kerusakan jaringan yang
Lebih terperinciSTUDI AB INITIO: STRUKTUR MEMBRAN NATA DE COCO TERSULFONASI
Prosiding Seminar Nasional Volume 02, Nomor 1 ISSN 2443-1109 STUDI AB INITIO: STRUKTUR MEMBRAN NATA DE COCO TERSULFONASI Sitti Rahmawati 1, Cynthia Linaya Radiman 2, Muhamad A. Martoprawiro 3 Universitas
Lebih terperinciTable of Contents Docking Dan Modifikasi Struktur Senyawa Baru Turunan Parasetamol 40-45
Table of Contents No. Title Page 1 Validasi Spektrofotometri Visible untuk Penentuan Kadar Formalin dalam Daging Ayam 2 Validasi Metode Kromatografi Gas-Spektrometri Massa untuk Penetapan Kadar Residu
Lebih terperinciDOCKING KURKUMIN DAN SENYAWA ANALOGNYA PADA RESEPTOR PROGESTERON: STUDI INTERAKSINYA SEBAGAI Selective Progesterone Receptor Modulators (SPRMs)
DOCKING KURKUMIN DAN SENYAWA ANALOGNYA PADA RESEPTOR PROGESTERON: STUDI INTERAKSINYA SEBAGAI Selective Progesterone Receptor Modulators (SPRMs) DOCKING OF CURCUMIN AND ITS ANALOGUES ON PROGESTERONE RECEPTOR:
Lebih terperinciBAB 1 PENDAHULUAN 1.1. Latar Belakang Penelitian
BAB 1 PENDAHULUAN 1.1. Latar Belakang Penelitian Nyeri adalah perasaan sensoris dan emosional yang tidak nyaman berkaitan dengan kerusakan jaringan (Tan dan Rahardja, 2007). Rasa nyeri merupakan suatu
Lebih terperinciMOLECULAR DOCKING TURUNAN KALKON TERHADAP RESEPTOR ESTROGEN β (ER- β) SEBAGAI ANTIKANKER PAYUDARA
MOLECULAR DOCKING TURUNAN KALKON TERHADAP RESEPTOR ESTROGEN β (ER- β) SEBAGAI ANTIKANKER PAYUDARA Dwi Koko Pratoko Dosen Kimia Farmasi Fakultas Farmasi Universitas Jember Jl. Kalimantan 1 No. 2 Kampus
Lebih terperinciturunan oksikam adalah piroksikam (Siswandono dan Soekardjo, 2000). Piroksikam mempunyai aktivitas analgesik, antirematik dan antiradang kuat.
BAB 1 PENDAHULUAN Nyeri adalah suatu mekanisme proteksi bagi tubuh yang timbul apabila jaringan mengalami kerusakan. Rasa nyeri sering disertai oleh respon emosional dan ambang toleransi nyeri berbeda-beda
Lebih terperinciINTERACTION BETWEEN ACTIVE COMPOUNDS FROM Aegle marmelos Correa. AS ANTI INFLAMMATION AGENT WITH COX-1 AND COX-2 RECEPTOR
Trad. Med. J., May 2013 Vol. 18(2), p 80-87 ISSN : 1410-5918 Submitted : 05-01-2013 Revised : 05-03-2013 Accepted : 15-04-2013 INTERACTION BETWEEN ACTIVE COMPOUNDS FROM Aegle marmelos Correa. AS ANTI INFLAMMATION
Lebih terperinciinflamasi non steroid turunan asam enolat derivat oksikam yaitu piroksikam (Mutschler, 1991; Gringauz, 1997). Piroksikam digunakan untuk pengobatan
BAB 1 PEDAHULUA Seiring dengan perkembangan zaman, banyak dilakukan pengembangan obat yang bertujuan untuk mendapatkan obat baru yang lebih baik sesuai dengan kebutuhan pasien. Modifikasi molekul pada
Lebih terperinciSTUDI FARMAKOFOR RESEPTOR ESTROGEN α SEBAGAI TARGET TERAPI KANKER SERVIKS
STUDI FARMAKOFOR RESEPTOR ESTROGEN α SEBAGAI TARGET TERAPI KANKER SERVIKS Nursalam Hamzah 1, Ahmad Najib 2, Fatmawati S. 1 1 Fakultas Ilmu Kesehatan Jurusan Farmasi UIN Alauddin Makassar 2 Fakultas farmasi
Lebih terperinciBAB I PENDAHULUAN Latar Belakang
BAB I PENDAHULUAN 1. 1 Latar Belakang Nyeri merupakan salah satu aspek yang penting dalam bidang medis, dan menjadi penyebab tersering yang mendorong seseorang untuk mencari pengobatan (Hartwig&Wilson,
Lebih terperinciAsam amino dan Protein
Asam amino dan Protein Protein berasal dari kata Yunani Proteios yang artinya pertama. Protein adalah poliamida dan hidrolisis protein menghasilkan asam- asam amino. ' suatu protein 2, + kalor 22 + 22
Lebih terperinciPengaruh Volume Gridbox pada Docking Senyawa dalam Stelechocarpus burahol terhadap Protein Homolog antiinflamasi TRPV1
Pengaruh Volume Gridbox pada Docking Senyawa dalam Stelechocarpus burahol terhadap Protein Homolog antiinflamasi TRPV1 Broto Santoso 1* 1 Fakultas Farmasi, Universitas Muhammadiyah Surakarta *Email: Broto.Santoso@ums.ac.id
Lebih terperincimenghilangkan kesadaran. Berdasarkan kerja farmakologinya, analgesik dibagi dalam dua kelompok besar yaitu analgesik narkotik dan analgesik non
BAB 1 PENDAHULUAN Perkembangan ilmu pengetahuan dan teknologi yang begitu pesat memberikan dampak terhadap peradaban manusia. Hal ini, menuntut manusia untuk bisa beradaptasi dengan perkembangan tersebut
Lebih terperinciSTUDI STABILITAS silna-protein ARGONAUTE DENGAN SIMULASI DINAMIKA MOLEKUL
STUDI STABILITAS silna-protein ARGONAUTE DENGAN SIMULASI DINAMIKA MOLEKUL DEVIANI AGUSTINA 2443009066 FAKULTAS FARMASI UNIVERSITAS KATOLIK WIDYA MANDALA SURABAYA 2013 ABSTRAK STUDI STABILITAS silna-protein
Lebih terperinciAsam nukleat dan Protein Aliran informasi genetik
Asam nukleat dan Protein Aliran informasi genetik Pustaka: Glick, BR and JJ Pasternak, 2003, Molecular Biotechnology: Principles and Applications of Recombinant DNA, ASM Press, Washington DC, hal. 23-46
Lebih terperinciAKAR KUNING (Arcangelisia flava) SEBAGAI INHIBITOR EGFR : KAJIAN IN SILICO. AKAR KUNING (Arcangelisia flava) AS EGFR INHIBITOR : IN SILICO STUDY
AKAR KUNING (Arcangelisia flava) SEBAGAI INHIBITOR EGFR : KAJIAN IN SILICO AKAR KUNING (Arcangelisia flava) AS EGFR INHIBITOR : IN SILICO STUDY Mohammad Rizki Fadhil Pratama Universitas Muhammadiyah Palangkaraya,
Lebih terperinciSIMULASI MOLECULAR DOCKING SENYAWA KURKUMIN DAN ANALOGNYA SEBAGAI SELECTIVE ANDROGEN RECEPTOR MODULATORS (SARMs) PADA KANKER PROSTAT
Jurnal Dinamika, September 2014, halaman 60-75 ISSN 2087-7889 Vol. 05. No. 2 SIMULASI MOLECULAR DOCKING SENYAWA KURKUMIN DAN ANALOGNYA SEBAGAI SELECTIVE ANDROGEN RECEPTOR MODULATORS (SARMs) PADA KANKER
Lebih terperinciPiroksikam merupakan salah satu derivat oksikam, dan merupakan obat anti inflamasi non steroid (AINS) yang berkhasiat sebagai antiinflamasi,
BAB 1 PENDAHULUAN Berkembangnya ilmu pengetahuan dan teknologi serta pola penyakit di dunia menyebabkan semakin perlunya pengembangan obat baru, di mana obat baru tersebut bertujuan untuk mengurangi rasa
Lebih terperinciABSTRACT
22 STUDI IN SILICO SENYAWA ANTIOKSIDAN ALAMI GOLONGAN STEROID PADA RESEPTOR SISTEM REPRODUKSI Dina Pratiwi 1, M. Insanu 2, dan Sophi Damayanti 2 1 Sekolah Tinggi Farmasi Muhammadiyah Tangerang 2 Sekolah
Lebih terperinciPENAMBATAN MOLEKULER BEBERAPA SENYAWA ANALOG KURKUMIN TURUNAN DIBENZILIDENASIKLOHEKSANON PADA SIKLOOKSIGENASE-2 REZI RIADHI SYAHDI
PENAMBATAN MOLEKULER BEBERAPA SENYAWA ANALOG KURKUMIN TURUNAN DIBENZILIDENASIKLOHEKSANON PADA SIKLOOKSIGENASE-2 REZI RIADHI SYAHDI 0305050523 UNIVERSITAS INDONESIA FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN
Lebih terperinciPENILAIAN HASIL MOLECULAR DOCKING TURUNAN DIKETOPIPERAZIN SEBAGAI INHIBITOR HIV-1 PROTEASE NASKAH PUBLIKASI
PENILAIAN HASIL MOLECULAR DOCKING TURUNAN DIKETOPIPERAZIN SEBAGAI INHIBITOR HIV-1 PROTEASE NASKAH PUBLIKASI Oleh: BAYU AJI NEGARA K 100 090 004 FAKULTAS FARMASI UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH SURAKARTA SURAKARTA
Lebih terperincibanyak digunakan tanpa resep dokter. Obat obat ini merupakan suatu kelompok obat yang heterogen secara kimiawi. Walaupun demikian obatobat ini
BAB 1 PENDAHULUAN Dewasa ini, perkembangan modifikasi molekul obat di dunia kefarmasian telah mengalami peningkatan yang cukup pesat. Hal ini dimaksudkan untuk memperoleh obat atau senyawa baru yang lebih
Lebih terperinciIdentifikasi Senyawa Herbal Penghambat Thymidylate Synthase Lebih Poten dari 5-Fluorouracil Menggunakan Berbagai Metode Molecular Docking SKRIPSI
Identifikasi Senyawa Herbal Penghambat Thymidylate Synthase Lebih Poten dari 5-Fluorouracil Menggunakan Berbagai Metode Molecular Docking SKRIPSI Untuk Memenuhi Persyaratan Memperoleh Gelar Sarjana Kedokteran
Lebih terperincigugus karboksilat yang bersifat asam sedangkan iritasi kronik kemungkinan disebabakan oleh penghambatan pembentukan prostaglandin E1 dan E2, yaitu
BAB 1 PENDAHULUAN Pada periode perkembangan bahan obat organik telah banyak diberikan perhatian untuk mencari kemungkinan adanya hubungan antara struktur kimia, sifat-sifat kimia fisika dan aktivitas biologis
Lebih terperinciANALISIS MOLECULAR DOCKING RESEPTOR ESTROGEN α TERHADAP FITOKIMIA FAMILI ASTERACEAE DIBANDINGKAN TAMOKSIFEN PADA KANKER PAYUDARA SKRIPSI
ANALISIS MOLECULAR DOCKING RESEPTOR ESTROGEN α TERHADAP FITOKIMIA FAMILI ASTERACEAE DIBANDINGKAN TAMOKSIFEN PADA KANKER PAYUDARA SKRIPSI Untuk Memenuhi Persyaratan Memperoleh Gelar Sarjana Kedokteran DZULFIAR
Lebih terperinciThe 4 th Univesity Research Coloquium 2016
KAJIAN DOCKING MOLEKULAR PADA BINDING SITE POCKET DARI FLAVOPIRIDOL DALAM MENGHAMBAT GLIKOGEN FOSFORILASE MENGGUNAKAN PyRx-AUTODOCK-VINA Miftah Farid Yoga Pratama 1), Subhan Rosyad Abidi 2), Khisma Arum
Lebih terperinciSIMULASI DARI. Skripsi FAKULTAS UNIVERSITAS UDAYANAA
SIMULASI IN SILICO ANTIHIPERLIPIDEMIA ANTOSIANIN DAN ANTOSIANIN TERASETILASI DARI UBI UNGU (Ipomoea batatas L.) Skripsi KADEKK AYU SANDRA DEWI 1208505028 JURUSAN FARMASI FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN
Lebih terperinci