SKRIPSI STUDI IN SILICO GENDARUSIN A, B, C, D DAN E UNTUK PREDIKSI AKTIVITAS TERHADAP ENZIM CYP17A1 SEBAGAI AFRODISIAKA

dokumen-dokumen yang mirip
10 Jurnal Farmasi dan Ilmu Kefarmasian Indonesia, Vol.2 No.1, Juni 2015 NugrohoT.,et.al.

STUDI IN SILICO BEBERAPA SENYAWA TURUNAN ASAM SINAMAT TERHADAP RESEPTOR MUSHROOM TYROSINASE (3NQ1)

STUDI IN SILICO BEBERAPA SENYAWA TURUNAN ASAM SINAMAT TERHADAP RESEPTOR HUMAN TYROSINASE SERLY YULIAWATI

Studi In Silico Gendarusin A, B, C, D, Dan E Untuk Prediksi Absorbsi Dan Aktivitas Terhadap Hialuronidase (Ec )

STUDI MODEL FARMAKOFOR DAN SKRINING VIRTUAL SENYAWA PENGHAMBAT ACE TERHADAP RESEPTOR ACE

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga SKRIPSI

HUBUNGAN KUANTITATIF STRUKTUR DAN AKTIVITAS ANTIKANKER SENYAWA TURUNAN BAKTERIOFEOFORBID A

PEMODELAN INTERAKSI TURUNAN POTENSIAL ASAM BENZOIL SALISILAT DENGAN RESEPTOR ENZIM SIKLOOKSIGENASE 2

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga SKRIPSI JOHAN HARYADI

MODIFIKASI INHIBITOR SB-3CT UNTUK MENGHAMBAT KERJA MATRIKS METALLOPROTEINASE 2 DALAM PENYEBARAN SEL KANKER SECARA IN SILICO SKRIPSI

BAB 1 PENDAHULUAN 1.1. Latar Belakang Masalah

Prediksi Mekanisme Kerja Obat Terhadap Reseptornya Secara in Silico(Studi pada Antibiotika Sefotaksim)

PENGARUH KONSENTRASI INDUSER DAN PENAMBAHAN KOFAKTOR ENZIM TERHADAP PRODUKSI EKSTRAK KASAR ENZIM LIPASE EKSTRASELULER OLEH Pseudomonas aeruginosa

UJI TOKSISITAS SENYAWA ASAM O-(4-METOKSIBENZOIL)SALISILAT DAN ASAM O-(3-KLOROBENZOIL)SALISILAT MENGGUNAKAN LARVA AEDES AEGYPTI Linn.

PENDAHULUAN KIMIA MEDISINAL

ADLN-PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA TESIS

STUDI FITOKIMIA DAN POTENSI ANTIOKSIDAN EKSTRAK DAN FRAKSI KAYU MANIS (CINNAMOMUM SP.) DENGAN METODE PERKOLASI YOANITA EUSTAKIA NAWU

PENGARUH ORIENTASI PADA INTERAKSI TiO 2 - POLISTIRENA TERSULFONASI (PST) TERHADAP POTENSI TRANSFER PROTON

BAB I PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang

MODIFIKASI TIPRANAVIR UNTUK MENINGKATKAN KINERJA INHIBISI PADA ENZIM HIV-1 PROTEASE SECARA IN SILICO SKRIPSI. Oleh Ribka Wulandari NIM

RIRIS ZENI MUBASIROH K

ANALISIS KADAR PROTEIN TOTAL DAN NON PROTEIN NITROGEN PADA PAKKAT (Calamus caesius Blume.) DENGAN METODE KJELDAHL SKRIPSI

PENGARUH KEAKTIFAN BERORGANISASI TERHADAP KOMPETENSI INTERPERSONAL MAHASISWA PENDIDIKAN AKUNTANSI FKIP UNS TAHUN 2016

FAKTOR - FAKTOR YANG MEMPENGARUHI NILAI PERUSAHAAN (Studi Pada Perusahaan Non-Perbankan yang Tercatat di Bursa Efek Indonesia)

ANALISIS BENZO(a)PYRENE PADA DAGING SAPI, KAMBING DAN BABI YANG DIBAKAR DENGAN METODE GAS CHROMATOGRAPHY-MASS SPECTROSCOPY (GC-MS)

PENENTUAN AKTIVITAS ANALGESIK SENYAWA O-(3- KLOROBENZOIL) PARASETAMOL TERHADAP MENCIT (MUS MUSCULUS) DENGAN METODE PANAS (HOT PLATE)

SKRIPSI PENGARUH KONSENTRASI ETANOL DAN WAKTU MASERASI TERHADAP PEROLEHAN FENOLIK, FLAVONOID, DAN AKTIVITAS ANTIOKSIDAN EKSTRAK RAMBUT JAGUNG

KADAR KADMIUM DAN METALLOTHIONEIN PADA INSANG IKAN NILA (Oreochromis niloticus) YANG DIPAPAR KADMIUM DENGAN SALINITAS BERBEDA TESIS

UJI TOKSISITAS SENYAWA ASAM O-(3,5-DIKLOROBENZOIL)SALISILAT DAN ASAM O-(4-TRIFLUOROMETOKSIBENZOIL)SALISILAT MENGGUNAKAN LARVA AEDES AEGYPTI LINN.

LAPORAN PENELITIAN DOSEN MUDA

MODIFIKASI INHIBITOR ENALAPRIL UNTUK MENGHAMBAT KINERJA ANGIOTENSIN CONVERTING ENZYME PADA PENYAKIT HIPERTENSI SECARA IN SILICO SKRIPSI.

PENGARUH PENAMBAHAN MADU TERHADAP AKTIVITAS ANTIOKSIDAN MINUMAN BELUNTAS-TEH HITAM DENGAN PERBANDINGAN 25:75% (b/b)

ANALISIS PROFENOFOS DALAM KUBIS MENGGUNAKAN METODE EFFERVESCENCE-LPME DENGAN INSTRUMEN HPLC UV-Vis SKRIPSI

MATA KULIAH FARMAKOKIMIA II ( FAS 3521 )

SKRIPSI PENGGUNAAN TEKNOLOGI FITOSOM PADA... EKSTRAK ETANOL CABE JAWA (Piper Retrofractum. Vahl) UNTUK MENINGKATKAN AKTIVITAS AFRODISIAKNYA

PENGARUH REHABILITASI MEDIK TERHADAP SKOR GDS PADA PASIEN LANJUT USIA PASKA STROKE SKRIPSI

SKRIPSI. UJI AKTIVITAS ANTIOKSIDAN DAN ANTIDIABETES PADA EKSTRAK HASIL FRAKSINASI KULIT JERUK PURUT (Citrus hystrix)

PENGARUH PENGGUNAAN KAPSUL VITAMIN E TERHADAP TERJADINYA INTERFERENSI PADA PENETAPAN KADAR PROTEIN MENGGUNAKAN METODE LOWRY SKRIPSI

PENENTUAN NILAI PKA DARI SENYAWA ASAM 4-(KLOROMETIL)BENZOIL SALISILAT

PROGRAM STUDI SARJANA FARMASI FAKULTAS FARMASI UNIVERSITAS SUMATERA UTARA MEDAN 2014

UJI EFEK PENURUNAN KADAR GLUKOSA DARAH DAUN KUBIS (BRASSICA OLERACEA VAR. CAPITATA) TERHADAP TIKUS PUTIH HIPERGLIKEMIA

RENCANA PEMBELAJARAN SEMESTER (RPS) JURUSAN FARMASI PROGRAM STUDI S1 FARMASI FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS ISLAM SULTAN AGUNG

PENENTUAN NILAI PKA DARI SENYAWA ASAM 3-KLOROBENZOIL SALISILAT

Diajukan oleh : F.X. Riza Febri Kurniawan NIM: F

PENILAIAN HASIL MOLECULAR DOCKING TURUNAN DIKETOPIPERAZIN SEBAGAI INHIBITOR HIV-1 PROTEASE SKRIPSI. Oleh: BAYU AJI NEGARA K

SINTESIS O-(4-NITROBENZOIL)PIROKSIKAM DAN UJI AKTIVITAS ANALGESIK TERHADAP MENCIT (MUS MUSCULUS)

BAB 1 PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang Masalah

HUBUNGAN ANTARA MATHEMATICAL HABITS OF MIND (MHM) DENGAN KEMAMPUAN PEMECAHAN MASALAH MATEMATIKA SISWA SMP NEGERI 1 BANYUMAS

PENAMBAHAN ENZIM PAPAIN PADA PAKAN KOMERSIAL TERHADAP RETENSI PROTEIN DAN EFISIENSI PAKAN IKAN SIDAT (Anguilla bicolor)

PENENTUAN NILAI PKA DARI SENYAWA ASAM 4-(TRIFLUOROMETOKSI)BENZOIL SALISILAT

HALAMAN PENGESAHAN. : Tia Destyliana NIM : Menggunakan Spektrofotometer Visible

ETIL ASETAT DAN EKSTRAK METANOL

SKRIPSI. OLEH : Maria Letisia Lipat Tupen NRP:

FAKULTAS EKONOMI DAN BISNIS UNIVERSITAS AIRLANGGA SURABAYA 2016

BAB V PEMBAHASAN. pada residu Glu 205, Glu 206, dan Tyr 662. Ada dua jenis interaksi yang

PENGEMBANGAN SENSOR OKSIGEN TERLARUT MENGGUNAKAN ELEKTRODA KERJA KARBON-PALADIUM (C-Pd) SECARA VOLTAMMETRI SIKLIK SKRIPSI

Skripsi. Disusun Oleh: Gracia Asri Wulandari NIM: F

PERNYATAAN. Jember, 4 Juni 2010 Yang menyatakan, Siti Agus Mulyanti NIM

IDENTIFIKASI FITOKIMIA DAN AKTIVITAS ANTIOKSIDAN EKSTRAK BUAH RAMBUSA (Passiflora foetida)

SILFIANA NISA PERMATASARI FAKULTAS FARMASI UNIKA WIDYA MANDALASURABAYA

PENGARUH PROFITABILITAS TERHADAP NILAI PERUSAHAN DENGAN PROFILE PERUSAHAAN SEBAGAI VARIABEL MODERASI

SKRIPSI PENILAIAN KUALITAS TANAH SAWAH BERBASIS PRODUKTIVITAS PADI DI KABUPATEN DEMAK. Oleh : Nadhifah H

PENGUJIAN EKSTRAK n-heksana DAN ETANOL TERHADAP AKTIVITAS ANTIBAKTERI BIJI PEPAYA (Carica papaya L.) DARI DUA VARIETAS

PENGARUH PENAMBAHAN BIODIESEL KE DALAM BAHAN BAKAR SOLAR TERHADAP OPASITAS PADA MESIN DIESEL

TINGKAT PENGETAHUAN WARGA SURABAYA MENGENAI PESAN KAMPANYE SURABAYA SMART RIDING 2017 MELALUI MEDIA BANNER SKRIPSI

ANALISIS OKSIPURINOL DALAM URIN SECARA SPEKTROFOTOMETRI SINAR TAMPAK DENGAN MENGGUNAKAN PEREAKSI 2,3-DIKLORO-5,6-DISIANO-1,4-BENZOQUINON (DDQ) SKRIPSI

MODIFIKASI INHIBITOR METHOTREXATE TERHADAP KERJA ENZIM DIHYDROFOLATE REDUCTASE PADA SEL KANKER SECARA IN SILICO SKRIPSI

PENGARUH ROA, ROE, DER DAN EVA TERHADAP RETURN SAHAM PADA PERUSAHAAN MANUFAKTUR YANG TERDAFTAR DI BEI PERIODE

PENGARUH VISUAL MERCHANDISING

OLEH: MONICA SYLVIA HANDIWIJAYA

PENGARUH PERSEPSI SISWA MENGENAI KOMPETENSI

SKRIPSI PENGARUH PEMBERIAN EDUKASI PADA PASIEN PENGGUNA ANTIBIOTIK DALAM RESEP DI APOTEK X WILAYAH SURABAYA TIMUR

SKRIPSI. Disusun untuk Memenuhi Persyaratan Memperoleh Gelar Sarjana Derajat S-1. Program Studi Akuntansi Fakultas Ekonomi dan Bisnis

ANALISIS PENGARUH EVALUASI MEREK, KEPUASAN PELANGGAN DAN KEPERCAYAAN MEREK TERHADAP LOYALITAS MEREK YANG DIMEDIASI HUBUNGAN MEREK

PENGARUH UKURAN DIAMETER BUTIR ZEOLIT TERHADAP BEBERAPA NILAI SIFAT KIMIA DAN FISIKA TANAH SKRIPSI

PENGARUH KARAKTERISTIK DAERAH TERHADAP KINERJA PENYELENGGARAAN PEMERINTAH DAERAH. (Studi Empiris pada Pemerintah Daerah Kabupaten/Kota di.

UJI SITOTOKSI EKSTRAK ETANOL KULIT BUAH NAGA MERAH

MOTIF WANITA DEWASA MUDA DI SURABAYA DALAM PENGGUNAAN APLIKASI BLACKBERRY MESSENGER SKRIPSI

Magister Profesi Psikologi Fakultas Psikologi Universitas Airlangga Surabaya 2016

APLIKASI BAGGING UNTUK MENINGKATKAN KETEPATAN KLASIFIKASI PADA REGRESI MULTINOMIAL LOGISTIK

INFORMED CONSENT PADA PELAYANAN ALAT KONTRASEPSI BAWAH KULIT LAPORAN HASIL KARYA TULIS ILMIAH

SKRIPSI. Oleh: July Trianita Widya Rahayu K

AKTIVITAS ANTIOKSIDAN EKSTRAK ETANOL DAUN BANGUN-BANGUN (Plectranthus amboinicus (Lour.) Spreng.)

Oleh: ANDREAS CHRISTANTO PERMADI

YULITA MAYA SUSANTI

ADLN-PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

ABSTRAK. Kata kunci: kulit kacang tanah, ion fosfat, adsorpsi, amonium fosfomolibdat

FORMULASI SEDIAAN KRIM EKSTRAK ETANOL BUAH MAHKOTA DEWA

ANALISIS PENGARUH KUALITAS LAYANAN, KEPERCAYAAN, DAN KEPUASAN TERHADAP LOYALITAS KONSUMEN ONLSHOP DI SURABAYA OLEH : SAMUEL TANUWIDJOJO

INTERDEPENDENSI ANTARA MANAGERIAL OWNERSHIP, RISK, DEBT POLICY DAN DIVIDEND POLICY PADA PERUSAHAAN MANUFAKTUR YANG TERCATAT DI BURSA EFEK INDONESIA

ABSTRAK Vivi Noviyanti. Tesis. Program Magister Psikologi Universitas Kristen Maranatha

SKRIPSI. Diajukan Untuk Memenuhi Sebagian Syarat Mencapai Derajat Sarjana S-1. Oleh : TRI ANGGONO

Konsentrasi/Bidang Minat: Manajemen Keuangan

SKRIPSI. Disusun Oleh: Dian Kartika Sari NRP

ADLN-PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SRI WINARNI Q

ANALISIS FAKTOR-FAKTOR YANG MEMPENGARUHI KETEPATAN WAKTU PELAPORAN KEUANGAN PADA PERUSAHAAN MANUFAKTUR YANG TERDAFTAR DI BURSA EFEK INDONESIA

ANALISIS MODEL PREDIKSI KEBANGKRUTAN SEBAGAI EARLY WARNING SYSTEM PADA PERUSAHAAN PERTAMBANGAN YANG TERDAFTAR DI BEI PADA TAHUN

UJI DAYA INHIBISI α GLUCOSIDASE DARI KOMBINASI EKSTRAK ETANOL DAUN ANGSANA (PTEROCARPUS INDICUS W.) DAN ACARBOSE MEY ANDANI

Transkripsi:

STUDI IN SILICO GENDARUSIN A, B, C, D DAN E UNTUK PREDIKSI AKTIVITAS TERHADAP ENZIM CYP17A1 SEBAGAI AFRODISIAKA TAUFAN NUGROHO FAKULTAS FARMASI UNIVERSITAS AIRLANGGA DEPARTEMEN FARMAKOGNOSI DAN FITOKIMIA SURABAYA 2014

STUDI IN SILICO GENDARUSIN A, B, C, D DAN E UNTUK PREDIKSI AKTIVITAS TERHADAP ENZIM CYP17A1 SEBAGAI AFRODISIAKA TAUFAN NUGROHO 051011069 FAKULTAS FARMASI UNIVERSITAS AIRLANGGA DEPARTEMEN FARMAKOGNOSI DAN FITOKIMIA SURABAYA 2014

LEMBAR PERSETUJUAN PUBLIKASI KARYA ILMIAH Demi perkembangan ilmu pengetahuan, saya menyetujui skripsi / karya ilmiah saya, dengan judul : STUDI IN SILICO GENDARUS IN A, B, C, D DAN E UNTUK PREDIKSI AKTIVITAS TERHADAP ENZIM CYP17A1 SEBAGAI AFRODISIAKA untuk dipublikasikan atau ditampilkan di internet atau media lain yaitu Digital Library Perpustakaan Universitas Airlangga untuk kepentingan akademik sebatas sesuai dengan Undang Undang Hak Cipta. Demikian pernyataan persetujuan publikasi karya ilmiah ini saya buat dengan sebenarnya. Surabaya, 15 September 2014 Taufan Nugroho NIM : 051011069

SURAT PERNYATAAN Saya yang bertanda tangan dibawah ini Nama : Taufan Nugroho NIM : 051011069 Fakultas : Farmasi menyatakan dengan sesungguhnya bahwa hasil tugas akhir yang s aya tulis dengan judul : STUDI IN SILICO GENDARUS IN A, B, C, D DAN E UNTUK PREDIKSI AKTIVITAS TERHADAP ENZIM CYP17A1 SEBAGAI AFRODISIAKA adalah benar benar merupakan hasil karya saya sendiri. Apabila di kemudian hari diketahui bahwa skripsi ini merupakan hasil plagiatism, maka saya bersedia menerima sangsi berupa pembatalan kelulusan dan atau pencabutan gelar yang saya peroleh. Demikian surat pernyataan ini saya buat untuk digunakan sebagaimana mestinya. Surabaya, 15 September 2014 Taufan Nugroho NIM : 051011069

Lembar Pengesahan STUDI IN SILICO GENDARUS IN A, B, C, D DAN E UNTUK PREDIKSI AKTIVITAS TERHADAP ENZIM CYP17A1 SEBAGAI AFRODISIAKA Dibuat Untuk Memenuhi Syarat Mencapai Gelar Sarjana Farmasi Pada Fakultas Farmasi Universita Airlangga 2014 Oleh: TAUFAN NUGROHO NIM. 051011069 Skripsi ini telah disetujui Tanggal 17 September 2014 oleh : Pembimbing Utama, Pembimbing Serta, Prof. Dr. Bambang P.EW.MS.,Apt Prof. Dr. Siswandono, MS., Apt, NIP. 19561217 198503 1 004 NIP. 19521002 198002 1 001

KATA PENGANTAR Segala puji syukur saya panjatkan kehadirat Allah SWT, atas segala rahmat dan karunia-nya sehingga skripsi ini dapat diselesaikan dengan sebaik-baiknya. Dengan selesainya skripsi yang berjudul STUDI IN SILICO GENDARUSIN A, B, C, D DAN E UNTUK PREDIKSI AKTIVITAS TERHADAP ENZIM CYP17A1 SEBAGAI AFRODISIAKA sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Sarjana Farmasi di Fakultas Farmasi Universitas Airlangga Surabaya ini, perkenankan saya untuk mengucapkan terima kasih yang sebesar-besarnya kepada: 1. Prof. Dr. Bambang P.EW.MS.,Apt. selaku pembimbing utama atas segala bimbingan, pengajaran, dukungan, dan saran sehingga skripsi ini dapat diselesaikan dengan baik. 2. Prof. Dr. Siswandono, MS., Apt selaku pembimbing serta atas waktu, bimbingan, pengajaran, dukungan dan saran kepada saya dalam menyusun dan menyelesaikan skripsi ini. 3. Dr. Idha Kusumawati, M.Si dan Neny Purwitasari, S.Farm., M.Sc selaku dosen penguji atas setiap saran, masukan dan bimbingan yang bermanfaat dalam memperbaiki skripsi ini. 4. Prof. Dr. H. Purwanto, Apt. selaku dosen wali atas perhatian, bimbingan, dukungan dan semangat yang diberikan selama saya menempuh pendidikan di Fakultas Farmasi Universitas Airlangga. 5. Rektor Universitas Airlangga, Prof. Dr. H. Fasich, Apt. dan Dekan Fakultas Farmasi Universitas Airlangga, Dr. Hj. Umi Athijah, Apt, M.S, yang telah memberikan segala fasilitas selama menjalani vii

pendidikan maupun melakukan penelitian di Fakultas Farmasi Universitas Airlangga. 6. Kepala dan staf Departemen Farmakognosi dan Fitokimia, Departemen Kima Analisis Fakultas Farmasi Universitas Airlangga Surabaya yang telah memberi kesempatan untuk menggunakan sarana selama penelitian. 7. Semua dosen dan staf pengajar di Fakultas Farmasi Universitas Airlangga yang telah mendidik dan mengajarkan ilmu pengetahuan selama saya menempuh pendidikan sarjana di Universitas Airlangga Universitas Airlangga. 8. Keluarga besar, orang tua, kakak dan adik saya atas semua dukungan, semangat, kasih sayang dan doa yang selalu diberikan kepada saya. 9. Seluruh tim skripsi gendarusa 2014, Ahmad Syaifuddin, Wafi Mubarok dan Ega Widya Prayogo terima kasih atas dukungan dan semangat yang diberikan selama ini. 10. Teman-teman kelas A 2010, terima kasih atas semangat, doa dan dukungan yang selalu diberikan. 11. Teman-teman kontrakan kertajaya 9B no 11 Surabaya, terima kasih atas semangat, dan dukungan yang selalu diberikan. Saya berharap skripsi ini dapat memberikan manfaat bagi setiap Farmasis, Tenaga medis, mahasiswa dan berbagai pihak yang memiliki minat di bidang Farmakognosi dan fitokimia. Surabaya, 15 September 2014 viii Penulis

RINGKASAN STUDI IN SILICO GENDARUS IN A, B, C, D DAN E UNTUK PREDIKSI AKTIVITAS TERHADAP ENZIM CYP17A1 SEBAGAI AFRODISIAKA TAUFAN NUGROHO Dari hasil penelitian diketahui bahwa dalam fraksi n-butanol gandarusa terdapat 12 komponen flavonoid dengan komponen mayor 6,8- di-α-l-arabinopiranosil-4,5,7-trihidroksiflavon, yang kemudian dikenal dengan gendarusin A, salah satu bahan anti fertilitas. Selain gendarusin A, masih ada komponen lainnya antara lain gendarusin B, gendarusin C, gendarusin D dan gendarusin E yang telah diketahui strukturnya. Senyawa senyawa tersebut masuk dalam golongan flavonoid yang memiki dua gugus gula yang terikat pada atom C nomor 6 dan atom C nomor 8. Dari monitoring efek samping obat kontrasepsi Justicia gendarussa Burm. f, menyatakan bahwa obat kontrasepsi Justicia gendarussa Burm. f memiliki efek samping yaitu peningkatan libido. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi aktivitas afrodisiak dari kelima senyawa gendarusin tersebut dengan menggunakan program molegro dan menentukan Hubungan Kuantitatif Struktur-Aktivitas antara sifat fisikokimia dari senyawa turunan gendarusin dengan prediksi aktivitasnya secara in silico. Dengan metode uji in silico yang memanfaatkan teknologi komputasi, dapat diketahui interaksi antara senyawa turunan gendarusin dengan reseptor 3RUK seperti ikatan hidrogen dan ikatan van der waals. Selain itu juga didapatkan nilai rerank score atau energi ikatan yang merupakan perhitungan total dari semua ikatan yang ada. Semakin kecil atau semakin minus nilai energi ikatan berarti ikatan tersebut semakin stabil. Semakin stabil ikatan ligan dengan reseptor maka dapat diprediksikan bahwa aktivitasnya juga semakin besar. Bisa dikatakan bahwa energi ikatan mempunyai hubungan linier dengan besarnya aktivitas suatu ligan. Dari hasil docking didapatkan nilai rerata rerank score gendarusin A sebesar -53.0636, gendarusin B sebesar -53.0636, gendarusin C sebesar - 78.8324, gendarusin D sebesar -123.948 dan gendarusin E sebesar -105.626. Pada gendarusin D dan gendarusin E tidak ada interaksi dengan Ser441 yang bertindak sebagai sisi aktif modulator dari reseptor 3RUK walaup un memiliki rerank score yang cukup tinggi. Namun pada gendarusin A, B dan C memiliki interaksi dengan Ser441. Dari hasil tersebut bisa dikatakan ix

bahwa gendarusin A, B dan C memiliki prediksi aktivitas sebagai afrodisiak. Pada Hubungan Kuantitatif Struktur-Aktivitas, nilai parameter lipofilik dan sterik dari senyawa turunan gendarusin sama sehingga tidak bisa dilakukan pengolahan data, hanya bisa menggunakan parameter elektronik seperti ikatan hidrofobik, ikatan hidrogen dan ikatan van der waals. Nilai nilai parameter elektronik tersebut diolah menggunakan program SPSS dan telah didapatkan 3 persamaan regresi. Terdapat hubungan linier antara aktivitas in silico dengan parameter elektronik yang dinyatakan dengan persamaan sebagai berikut : Log A = -0.003vdw + 1.940 (n=5; r = 0.998; s = 0.0088; F = 880.308; Sig. = 0.000) x

ABSTRACT IN SILICO STUDY OF GENDARUSIN A, B, C, D AND E FOR THE PREDICTION OF ACTIVITY TO CYP17A1 ENZYME AS APHRODIS IAC TAUFAN NUGROHO 12 flavonoid compounds are found in n-butanol fraction of Justicia gendarusa Burm.f. However, only five of them have been structurally identified namely gendarusin A, B, C, D and E. These compounds are found in male contraception made from Justicia gendarusa Burm.f. whose one of the side effects is the increase in libido. This study aims to investigate the aphrodisiac activity of Gendarusin A, B, C, D and E as well as to investigate the quantitative relationship of structure-activity. The method used in this study was in silico using Molegro Virtual Docker and SPSS programs. The results of Molegro program showed the interaction between ligand and receptor as well as the rerank score which was the calculation of the total bonds. Docking was conducted to these five gendarusin compounds on the CYP17A1 enzyme (PDB ID: 3RUK). In the quantitative relationship of Structure-Activity, only the electronic parameters would be processed using SPSS program since the value of lipophilic and derivative steric parameters of gendarusin were equal. The electronic parameters to be analyzed were hydrophobic bond, van der waals bond and hydrogen bond. Upon the docking, Gendarusin A, B and C were predicted to have aphrodisiac activity. Gendarusin C had the highest activity. There was a linear correlation between in silico activity and electronic parameters stated in the following equation : Log A = -0.003vdw + 1.940 (n=5; r = 0.998; s = 0.0088; F = 880.308; Sig. = 0.000) The equation expresses that the electronic parameters have a meaningful linear correlation with the activity of gendarusin as aphrodisiac. Keywords : in silico, docking, gendarusin, aphrodisiac activity, QSAR xi

DAFTAR ISI KATA PENGANTAR... vii RINGKASAN... ix ABSTRACT... xi DAFTAR ISI... xii DAFTAR TABEL... xvi DAFTAR GAMBAR... xvii DAFTAR LAMPIRAN xix DAFTAR SINGKATAN... xxi BAB I. PENDAHULUAN... 1 1.1. Latar Belakang... 1 1.2. Rumusan Masalah... 6 1.3. Tujuan Penelitian... 7 1.4. Manfaat Penelitian... 7 BAB II. TINJAUAN PUSTAKA... 8 2.1. Tinjauan Tentang Marga Justicia... 8 2.1.1 Kegunaan... 8 2.1.2 Kandungan... 8 2.2. Tinjauan Tentang Justicia gendarussa Burm. f... 19 2.2.1 Klasifikasi Justicia gendarussa Burm. f... 19 2.2.2 Morfologi Tanaman... 20 2.2.3 Penyebaran dan tempat tumbuh... 21 2.2.4 Kandungan Tanaman... 21 2.2.5 Kegunaan Tanaman... 23 2.3. Tinjauan Tentang Flavonoid... 24 2.3.1 Flavonoid O-Glikosida... 25 2.3.2 Flavonoid C-Glikosida... 26 xii

2.4. Tinjauan Tentang Enzim... 26 2.4.1 Sitokrom P450 17A1... 30 2.5. Tinjauan Tentang Afrodisiak... 31 2.6. Tinjauan Tentang Dehidroepiandosteron... 34 2.6.1. Biosintesis Dehidroepiandosteron... 35 2.7. Tinjauan Tentang In silico... 36 2.7.1. Ligand Based Methode... 37 2.8. Tinjauan Tentang Interaksi Obat-Reseptor... 39 2.9. Tinjauan Tentang Ikatan Kimia... 40 2.9.1. Ikatan Kovalen... 40 2.9.2 Ikatan Ionik... 40 2.9.3. Ikatan Hidrogen... 42 2.9.4. Ikatan Van der Waal s... 43 2.9.5. Ikatan Hidrofob... 43 2.9.6. Interaksi Ion-Dipol dan Dipol-Dipol... 44 2.9.7. Transfer Muatan... 45 2.10. Hubungan Kuantitatif Struktur-Aktivitas... 46 2.10.1 Model Pendekatan HKSA Free Wilson 47 2.10.2 Model Pendekatan HKSA Hansch 48 2.10.2.1. Parameter Sifat Kimia Fisika dalam HKSA Model Hansch... BAB III. KERANGKA KONSEPTUAL... 51 3.1. Uraian Kerangka Konseptual... 51 3.2. Hipotesis... 51 3.3. Skema Kerangka Konseptual... 54 BAB IV. METODOLOGI PENELITIAN... 55 4.1. Bahan dan Alat... 55 4.2. Metodologi Penelitian... 55 xiii 49

4.2.1. Pembuatan struktur ligan 2 dan 3-dimensi... 55 4.2.2. Penentuan sifat kimia-fisika senyawa ligan 56 4.2.3. Preparasi struktur protein 3-D... 56 4.2.4 Docking dan Analisis Asam Amino... 57 4.2.4.1 Pengaturan docking 58 4.2.5 Analisis Hubungan Kuantitatif Struktur dan Aktivitas 59 4.2.6 Analisi Data... 59 4.3. Skema Kerja... 60 4.3.1 Penentuan Sifat Kimia Fisika Ligan... 60 4.3.2 Preparasi Ligan dalam bentuk 3D... 61 4.3.3 Docking dengan Menggunakan Molegro Virtual Docker... 62 4.3.4 Analisis Hubungan Kuantitatif Struktur dan Aktivitas 63 BAB V. HASIL PENGAMATAN... 64 5.1. Struktur 2D Senyawa Gendarusin 64 5.2. Struktur 3D Senyawa Gendarusin dan Perhitungan Energi Minimal... 65 5.3. Docking dan Analisis Asam Amino... 5.3.1. Protein 68 5.3.2. Penentuan cavity 69 5.3.3. Hasil docking. 70 5.3.3.1. Ligan kontrol (abiraterone) 71 5.3.3.2. Gendarusin A.. 72 5.3.3.3. Gendarusin B... 73 5.3.3.4. Gendarusin C... 74 5.3.3.5. Gendarusin D... 75 xiv 68

5.3.3.6. Gendarusin E... 76 5.3.3.7. Perbandingan Nilai Rerank Score dan Asam Amino yang Terlibat 77 5.4. Hubungan Kuantitatif Struktur-Aktivitas Senyawa Turunan Gendarusin 78 5.4.1. Persamaan regresi hubungan kuantitatif struktur-aktivitas 80 BAB VI. PEMBAHASAN... 81 BAB VII. KESIMPULAN DAN SARAN... 86 7.1. Kesimpulan... 86 7.2. Saran... 86 DAFTAR PUSTAKA... 87 LAMPIRAN... 92 xv

DAFTAR TABEL Tabel Halaman II.1 Kandungan senyawa kimia pada beberapa tanaman spesies dari 9 Justicia. II.2 Beberapa Ion Anorganik sebagai Kofaktor untuk Enzim... 27 II.3 Beberapa koenzim sebagai Pembawa Atom Spesifik atau Gugus 27 Fungsional... II.4 Klasifikasi Enzim menurut kesepakatan Internasional... 28 V.1 V.2 V.3 V.4 V.5 V.6 V.7 V.8 Nilai parameter sifat fisika kimia senyawa gendarusin... 65 Nilai energi minimal(kcal/mol) dari senyawa turunan gendarusin 67 Hasil docking antara Abiraterone dengan 3RUK 71 Hasil docking antara gendarusin A dengan 3RUK. 72 Hasil docking antara gendarusin B dengan 3RUK.. 73 Hasil docking antara gendarusin C dengan 3RUK.. 74 Hasil docking antara gendarusin D dengan 3RUK. 75 Hasil docking antara gendarusin E dengan 3RUK.. 76 V.9 Residu asam amino enzim Sitokrom P450 17A1 yang terlibat dalam interaksi ligan dengan reseptor.. V.10 V.11 V.12 Nilai rerank score dari kelima senyawa turunan gendarusin.. 78 Nilai parameter sifat fisika kimia senyawa gendarusin... 78 Nilai parameter elektronik senyawa gendarusin. 79 V.13 Persamaan regresi hubungan kuantitatif struktur-aktivitas. 80 77 xvi

DAFTAR GAMBAR Gambar Halaman 2.1 Tanaman Justicia gendarussa Burm f... 19 2.2 Struktur molekul alkaloid dalam daun J. Gendarussa. 21 2.3 Struktur molekul Alkaloid daun Justicia gendarussa Burm.f... 2.4 senyawa gendarusin kelompok flavonoid yang 23 ditemukan pada daun Justicia gendarussa Burm.f... 2.5 Penomoran untuk struktur inti flavonoid... 25 2.6 Kurva antara konsentrasi enzim (E) dengan Kecepatan reaksi katalisis (V) pada reaksi enzim 30 katalisis... 2.7 Jalur biosintesis steroidal... 31 2.8 prinsip bioaktif afrodisiak... 33 2.9 Jalur Steroidogenesis... 35 2.10 Gugus kation pada asam amino arginin... 41 2.11 Ikatan Ion... 41 2.12 2.13 Ikatan hidrogen antara basa komplementer guanin dan sitosin dalam DNA... Bentuk siklik metadon yang diakibatkan oleh interaksi dipol-dipol..... 2.14 Interaksi melalui transfer muatan 46 3.1 Alur Kerangka Konseptual... 54 22 43 44 4.1 Bagan prosedur penentuan sifat fisika kimia menggunakan ChemBioDraw Ultra 12.0 60 4.2 Bagan prosedur preparasi ligan dalam bentuk 3D... 61 4.3 Bagan prosedur docking menggunakan MVD... 62 4.4 bagan prosedur analisis HKSA 63 5.1 Struktur 2D senyawa turunan Gendarusin 65 5.2 Struktur a) 3D Gendarusin A, b) 2D Gendarusin A 66 xvii

5.3 Struktur a) 3D Gendarusin B, b) 2D Gendarusin B 66 5.4 Struktur a) 3D Gendarusin C, b) 2D Gendarusin C... 66 5.5 Struktur a) 3D Gendarusin D, b) 2D Gendarusin D 67 5.6 Struktur a) 3D Gendarusin E, b) 2D Gendarusin E. 67 5.7 Sitokrom P450 17A1 68 5.8 cavity pada Enzim Sitokrom P450 17A1 69 5.9 Cavity nomor 1 pada reseptor 3RUK. 70 5.10 5.11 tampilan a) 3D dan b) 2D ikatan hidrogen antara abiraterone dengan 3RUK 71 tampilan a) 3D dan b) 2D ikatan hidrogen antara gendarusin A dengan 3RUK 72 5.12 tampilan a) 3D dan b) 2D ikatan hidrogen antara gendarusin B dengan 3RUK 73 5.13 5.14 5.15 tampilan a) 3D dan b) 2D ikatan hidrogen antara gendarusin C dengan 3RUK 74 tampilan a) 3D dan b) 2D ikatan hidrogen antara gendarusin D dengan 3RUK 75 tampilan a) 3D dan b) 2D ikatan hidrogen antara gendarusin E dengan 3RUK 76 xviii

DAFTAR LAMPIRAN Lampiran Halaman Lampiran 1 Program ChemBioDraw Ultra 12.0 92 Gambar L.1 Tampilan Program ChemBioDraw Ultra 12.0... 92 Lampiran 2 Gambar struktur 2D senyawa gendarusin dan sifat fisika kimia... 93 Gambar L.2 Gambar L.3 Gambar L.4 Gambar L.5 Struktur 2D senyawa gendarusin A dan sifat fisika kimia... Struktur 2D senyawa gendarusin B dan sifat fisika kimia... Struktur 2D senyawa gendarusin C dan sifat fisika kimia... Struktur 2D senyawa gendarusin D dan sifat fisika kimia... Gambar L.6 Struktur 2D senyawa gendarusin E dan sifat fisika 97 kimia... Lampiran 3 Program ChemBio 3D Ultra 12.0... 98 Gambar L.7 Tampilan Program ChemBio 3D Ultra 12.0... 98 93 94 95 96 Lampiran 4 Energi minimal dan gambar 3D dari gendarusin A, B, C, D, dan E.. 99 Gambar L.8 Energi minimal dan gambar 3D gendarusin A... 100 Gambar L.9 Energi minimal dan gambar 3D gendarusin B... 101 Gambar L10 Energi minimal dan gambar 3D gendarusin C... 102 Gambar L11 Energi minimal dan gambar 3D gendarusin D... 104 Gambar L12 Energi minimal dan gambar 3D gendarusin E 105 Lampiran 5 Program Molegro Virtual Docker 5 106 Gambar L13 Tampilan Program Molegro Virtual Docker 5... 106 Lampiran 6 Posisi gendarusin A, B, C, D dan E pada cavity nomor 1 reseptor 3RUK. xix 107

Gambar L14 Posisi a) gendarusin A, b) gendarusin B, c) gendarusin C, d) gendarusin D dan e) gendarusin E pada cavity nomor 1 reseptor 3RUK.. Lampiran 7 Nilai Rerank Score pada gendarusin.. 108 107 Gambar L15 Nilai Rerank Score gendarusin A pada a) replikasi 1, b) replikasi 2 dan c) replikasi 3... Gambar L16 Nilai Rerank Score gendarusin B pada a) replikasi 1, b) replikasi 2 dan c) replikasi 3... Gambar L17 Nilai Rerank Score gendarusin C pada a) replikasi 1, b) replikasi 2 dan c) replikasi 3 Gambar L18 Nilai Rerank Score gendarusin D pada a) replikasi 1, b) replikasi 2 dan c) replikasi 3... Gambar L19 Nilai Rerank Score gendarusin E pada a) replikasi 1, b) replikasi 2 dan c) replikasi 3... 108 109 110 111 112 Lampiran 8 Ligand energy Inspector pada senyawa gendarusin... 113 Gambar L20 Lampiran 9 Tabel L.1 Tabel L.2 Tabel L.3 Nilai energy masing masing ikatan pada senyawa a) gendarusin A, b) gendarusin B, c) gendarusin C, d) gendarusin D, e) gendarusin E. Persamaan Regresi Hubungan Kuantitatif Struktur- Aktivitas... Pengolahan persamaan regresi Regresi linier parameter elektronik ikatan hidrofobik dengan program SPSS.. Pengolahan persamaan regresi Regresi linier parameter elektronik ikatan van der waals dengan program SPSS Pengolahan persamaan regresi Regresi linier parameter elektronik ikatan hidrogen dengan program SPSS. 115 116 116 117 118 xx

DAFTAR SINGKATAN DHEA HKSA IUPAC KB MVD PDB RSMD CYP17A1 P450C17 ES ED cgmp SSP NMDA GABA ACC StAR LFER : Dehidroepiandrosterone : Hubungan Kuantitatif Struktur Aktifitas : International Union of Pure and Applied Chemistry : Keluarga Berencana : Molegro Virtual Docker : Protein Data Bank : Root mean Squre Deviation : Sitokrom P450 17A1 : Sitokrom P450 17A1 : Enzim-Substrat : Erectile Disfunction : Cyclic guanosine monophosphate : Sistem saraf pusat : N-Methyl-D-aspartic acid : ɣ-amino butyric acid : anterior corteks cingulated : Steroidogenik acute regulatory : Linier free energy relationship xxi