ESTIMASI pk a dan pk b BERDASARKAN PENDEKATAN KIMIA KOMPUTASI DENGAN METODA SEMIEMPIRIK PM3

dokumen-dokumen yang mirip
SIMULASI EFEKTIVITAS SENYAWA OBAT ERITROMISIN F DAN 6,7 ANHIDROERITROMISIN F DALAM LAMBUNG MENGGUNAKAN METODE SEMIEMPIRIS AUSTIN MODEL 1 (AM1)

PAH akan mengalami degradasi saat terkena suhu tinggi pada analisis dengan GC dan instrumen GC sulit digunakan untuk memisahkan PAH yang berbentuk

BAB 1 PENDAHULUAN 1.1. Latar Belakang Penelitian

BAB 17 ALKOHOL DAN FENOL

INTISARI. Kata kunci : QSAR, fungisida, thiadiazolin

KIMIA DASAR JOKO SEDYONO TEKNIK MESIN UMS 2015

REAKSI DEKOMPOSISI SENYAWA ERITROMISIN F DAN 6,7 ANHIDROERITROMISIN F SUATU KAJIAN MENGGUNAKAN METODE SEMIEMPIRIS AUSTIN MODEL 1 (AM1) ABSTRAK

Aplikasi Kimia Komputasi

KIMIA. Sesi HIDROKARBON (BAGIAN II) A. ALKANON (KETON) a. Tata Nama Alkanon

MAKALAH PENGABDIAN PADA MASYARAKAT TEORI ASAM - BASA. Oleh : M. PRANJOTO UTOMO

LAPORAN PRAKTIKUM KIMIA ORGANIK (KI2051)

BAB I PENDAHULUAN I.1 Latar Belakang

LAPORAN PRAKTIKUM KIMIA ORGANIK

PEMODELAN INTERAKSI ETER MAHKOTA BZ15C5 TERHADAP KATION Zn 2+ BERDASARKAN METODE DENSITY FUNCTIONAL THEORY

Chapter 20 ASAM KARBOKSILAT

BAB II TINJAUAN PUSTAKA. akan berlangsung selama sintesis, serta alat-alat yang diperlukan untuk sintesis.

RENCANA PEMBELAJARAN SEMESTER. Mata Kuliah : KIMIA KOMPUTASI Semester: VI (ENAM) sks: 3 Kode: D

Reaksi Esterifikasi. Oleh : Stefanus Dedy ( ) Soegiarto Adi ( ) Cicilia Setyabudi ( )

REAKSI-REAKSI ALKOHOL DAN FENOL

Studi Adsorpsi Molekul Nh 3 Pada Permukaan Cr(111) Menggunakan Program Calzaferri

D. 2 dan 3 E. 2 dan 5

GUGUS FUNGSI

Paper submitted to the Komputasi Sains of the Indonesia Computational Society

ANALISIS SPEKTRA TRANSISI ELEKTRONIK BENTUK DIMER SENYAWA TABIR SURYA AVOBENZON DAN OKSIBENZON AKIBAT PENGARUH INTERAKSI IKATAN HIDROGEN

Pemodelan senyawa turunan p-aminofenol sebagai analgetik anti-inflamasi berdasarkan hubungan struktur dan aktivitas biologisnya

PREDIKSI TIPE AKTIVITAS SENYAWA TABIR SURYA HOMOSALAT BERDASARKAN ANALISIS SPEKTRA TRANSISI ELEKTRONIK PADA KONFIGURASI BENTUK DIMER DAN SOLUT-SOLVEN

PANDUAN PRAKTIKUM KIMIA TERPADU GRUP IMC (INTERMOLECULAR CHEMISTRY) OLEH : Dr. Parsaoran Siahaan, MS

Insektisida Baru Turunan Karbamat Menggunakan Metoda Semiempirik PM3

KOMPUTASI KIMIA SEBAGAI ALTERNATIF DALAM PENELITIAN PADA MASA KRISIS DAN MASA DEPAN 1 Eva Vaulina Yulistia Delsy 2

Hasil dan Pembahasan

KAJIAN PERUBAHAN UKURAN RONGGA ZEOLIT RHO BERDASARKAN VARIASI RASIO Si/Al DAN VARIASI KATION ALKALI MENGGUNAKAN METODE MEKANIKA MOLEKULER

parakor (P), tetapan sterik Es Taft, tetapan sterik U Charton dan tetapan sterimol Verloop (Siswandono & Susilowati, 2000). Dalam proses perubahan

III. SIFAT KIMIA SENYAWA FENOLIK

BAB 4 HASIL PERCOBAAN DAN PEMBAHASAN

),parakor (P), tetapan sterik Es Taft, tetapan sterik U Charton dan tetapan sterimol Verloop (Siswandono & Susilowati, 2000). Dalam proses perubahan

BAB I PENDAHULUAN I.1

STUDI AB INITIO: STRUKTUR MEMBRAN NATA DE COCO TERSULFONASI

APLIKASI PEMISAHAN DATA SECARA ACAK PADA ANALISIS HUBUNGAN KUANTITATIF STRUKTUR ELEKTRONIK DAN AKTIVITAS SENYAWA INDOLILALKILAMINA

STUDI TOKSISITAS FLOROANILIN BERDASARKAN HUBUNGAN KUANTITATIF STRUKTUR AKTIFITAS (HKSA) BEBERAPA AMINA AROMATIS

KIMIA KOMPUTASI Pengantar Konsep Kimia i Komputasi

LAPORAN PRAKTIKUM KIMIA ORGANIK (KI2051)

Austrian-Indonesian i Centre (AIC) for Computational ti lchemistry, Jurusan Kimia i. KIMIA KOMPUTASI Konsep Perhitungan Mekanika Kuantum 2 (Basis Set)

Protein adalah sumber asam-asam amino yang mengandung unsur-unsur C, H, O, dan N yang tidak dimiliki oleh lemak atau karbohidrat.

Tembaga 12/3/2013. Tiga fasa materi : padat, cair dan gas. Fase padat. Fase cair. Fase gas. KIMIA ZAT PADAT Prinsip dasar

ASAM KARBOKSILAT. Deskripsi: Struktur, tata nama, penggolongan dan manfaat asam karboksilat

Kelompok G : Nicolas oerip ( ) Filia irawati ( ) Ayndri Nico P ( )

Untuk mengetahui pengaruh ph medium terhadap profil disolusi. atenolol dari matriks KPI, uji disolusi juga dilakukan dalam medium asam

GUGUS AMINA, AMIDA DAN SULFONAT

TERHADAP PERUBAHAN UKURAN WINDOW

Pokok Bahasan. Teori tentang asam, basa dan garam Kesetimbangan asam-basa Skala ph Sörensen (Sörensen ph scale) Konstanta keasaman

TINJAUAN MATA KULIAH MODUL 1. TITRASI VOLUMETRI

I BAB I PENDAHULUAN I.1

Dikenal : - Asidimetri : zat baku asam - Alkalimetri : zat baku basa DASAR : Reaksi penetralan Asam + Basa - hidrolisis - buffer - hal lain ttg lart

BAB I PENDAHULUAN I.1

I. PENDAHULUAN. Kanker merupakan penyebab kematian paling banyak kedua setelah serangan

BAB I PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang

PEMODELAN DAN ANALISIS QSAR TURUNAN AMINOSULFENIL METILKARBAMAT SEBAGAI INSEKTISIDA MENGGUNAKAN METODE SEMIEMPIRIK AUSTIN MODEL 1

KAJIAN QSPR TEMPERATUR TRANSISI GELAS DAN SIFAT KIMIA FISIK DARI POLIMER TURUNAN POLIETILEN

QUANTITATIF STRUCTURE-ACTIVITY RELATIONSHIP ANALYSIS OF A CARBAZOLE ANALOG COMPOUNDS AS ANTIBACTERIAL USING ELECTRONICAL DESCRIPTORS

REAKSI SUBSTITUSI ALFA KARBONIL

SENYAWA AROMATIK. Tim dosen kimia dasar FTP

PENDEKATAN QSAR DALAM PEMODELAN SENYAWA TURUNAN ASAM KARBAMAT SEBAGAI ANTI KANKER DENGAN METODE PARAMETERIZATION MODEL 3

KISI UJI KOMPETENSI 2013 MATA PELAJARAN KIMIA

I. Pendahuluan II. Agen Penitrasi

D. 8 mol S E. 4 mol Fe(OH) 3 C. 6 mol S Kunci : B Penyelesaian : Reaksi :

I. PENDAHULUAN. Kanker adalah penyakit degeneratif yang ditandai dengan keadaan sel yang

RENCANA PROGRAM KEGIATAN PEMBELAJARAN SEMESTER (RPKPS) MATA KULIAH KIMIA ORGANIK I

QUANTITATIVE STRUCTURE AND ACTIVITY RELATIONSHIP ANALYSIS OF 1,2,4- THIADIAZOLINE FUNGICIDES BASED ON MOLECULAR STRUCTURE CALCULATED BY AM1 METHOD

PENGEMBANGAN DAN PENGGUNAAN KONSEP ANIMASI KOMPUTER MENGGUNAKAN MACROMEDIA DIRECTOR UNTUK PEMBELAJARAN KIMIA

SAP DAN SILABI KIMIA DASAR PROGRAM STUDI TEKNOLOGI PANGAN UNIVERSITAS PASUNDAN

KAJIAN MEKANISME REAKSI HIDROLISIS N-FENIL-3- HIDROKSI PIKOLINAMIDA DALAM KONDISI BASA MENGGUNAKAN METODE DFT DAN POST-SCF

HUBUNGAN KUANTITATIF STRUKTUR-AKTIVITAS ANTIRADIKAL SENYAWA TURUNAN FLAVON / FLAVONOL BERDASARKAN PENDEKATAN FREE-WILSON

BAB I PENDAHULUAN I.1

PERCOBAAN I ANALISIS BUTANA

Wardaya College. Latihan Soal Olimpiade KIMIA SMA. Spring Camp Persiapan OSN Departemen KIMIA - Wardaya College

OLIMPIADE SAINS NASIONAL Medan, 1-7 Agustus 2010 BIDANG KIMIA. Ujian Praktikum KIMIA ANALISIS. Waktu 150 menit

Gugus Fungsi Senyawa Karbon

ANALISIS INSTRUKSIONAL GARIS-GARIS BESAR PROGRAM PENGAJARAN (GBPP) KONTRAK PERKULIAHAN MATA KULIAH KIMIA UMUM TIM DOSEN KIMIA UMUM

BAB I PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang 1.2 Tujuan

SEMINAR NASIONAL BASIC SCIENCE II

IJCR-Indonesian Journal of Chemical Research p. ISSN: Vol.3 No.1-2, Hal

Kelarutan & Gejala Distribusi

1. Pendahuluan 2. Intermediate reaktif 3. Nukleofil and elektrofil 4. Tipe reaksi 5. Ions versus radicals

BAHAN BAKAR KIMIA. Ramadoni Syahputra

KISI-KISI UN KIMIA SMA/MA

KONSEP DASAR KIMIA ORGANIK YANG MENUNJANG PEMBELAJARAN KIMIA SMA GEBI DWIYANTI

4. Hasil dan Pembahasan

ANALISIS HUBUNGAN KUANTITATIF STRUKTUR ELEKTRONIK DAN AKTIVITAS SENYAWA BENZELSULFONAMIDA DENGAN PEMISAHAN DATA CARA ACAK

IV. HASIL DAN PEMBAHASAN. NaOH dalam metanol dengan waktu refluks 1 jam pada suhu 60 C, diperoleh

1.3 Pemodelan Molekul dalam Kurikulum A. Mengapa pemodelan molekul penting untuk pembelajaran kimia?

GUGUS FUNGSI, TATA NAMA, SIFAT, DAN SINTESIS SEDERHANA SENYAWA HIDROKARBON

Jurusan Kimia, Fakultas MIPA UGM INTISARI

LAPORAN PRAKTIKUM KIMIA ORGANIK (KI2051)

Bab IV Hasil dan Diskusi

Skala ph dan Penggunaan Indikator

MAKALAH KARAKTERISTIK POTENSIAL BADAN-3: SISTEM Zn(II)-AIR-AMONIAK

KISI UJI KOMPETENSI 2014 MATA PELAJARAN KIMIA

STUDY OF DOUBLE PROTONS MIGRATION MECHANISM IN SUPRAMOLECULAR STRUCTURES OF ACETIC ACID-WATER AND ACETIC ACID-AMMONIA BY AB INITIO METHOD

ANALISIS SPEKTRA TRANSISI ELEKTRONIK SENYAWA TABIR SURYA AVOBENZON DAN OKSIBENZON MELALUI KAJIAN INTERAKSI DENGAN PELARUT ETANOL

Struktur Molekul:Teori Orbital Molekul

Transkripsi:

ESTIMASI pk a dan pk b BERDASARKAN PENDEKATAN KIMIA KOMPUTASI DENGAN METODA SEMIEMPIRIK PM3 Suwardi Jurusan Pendidikan Kimia, FMIPA UNY Yogyakarta e-mail : sainswar@yahoo.com Abstrak Telah dilakukan pemodelan molekul kelompok asam organik dan kelompok basa anilin. Prediksi keasaman atau kebasaan molekul tersebut dilakukan menggunakan pendekatan kimia komputasi berdasarkan muatan pada H untuk kelompok asam dan muatan pada N untuk kelompok basa dengan metoda semiempirik PM3. Data muatan ini dibuat grafik lawan pka atau pkb yang telah diketahui. Hasil analisis grafik menunjukkan adanya korelasi yang baik antara muatan tersebut dengan keasaman atau kebasaan dan bermanfaat untuk memprediksi kecenderungan sifat asam atau basa molekul organik. Kata kunci : Semiempirik, HyperChem, Keasaman/kebasaan Pendahuluan Beberapa artikel dalam Chemical and engineering News menyebutkan bahwa kimia komputasi telah menjadi alat (tool) dalam laboratorium. Apabila piranti lunak komputasi masuk ke bidang kimia, maka perlu untuk membawa pemodelan molekular ke dalam kuliah kimia komputasi untuk mahasiswa S-1 (Whisnant et. al, 2000 : 1999). Keasaman atau kebasaan tapak (site) suatu molekul adalah sangat penting untuk proses kimia dan biologis yang mungkin terjadi pada tapak itu. Keasaman memainkan peranan penting dalam katalisis ion hidrogen dalam suatu proses. Kebasaan, disamping terkait dengan keasamaan, juga mudah dikaitkan dengan nukleofilisitas tapak yang bersifat basa. Apakah akan diterapkan dalam polimer atau farmasi, pemahaman keasaman atau kebasaan suatu molekul adalah dasar bagi pemahaman disain molekular dan mekanisme. Jika keasaman dan kebasaan dapat diestimasi secara cepat tanpa sintesis normal dan penentuan eksperimen, efisiensi dan produktifitas ahli kimia meningkat. Penelitian ini menggambarkan metoda dan hasil-hasil yang diperoleh menggunakan HyperChem untuk mengestimasi keasaman dan kebasaan. Beberapa pendekatan komputasi nampaknya memiliki potensi yang sangat berharga dalam mengestimasi keasaman dan kebasaan. Salah satu pendekatan adalah penentuan panas pembentukkan bagi spesies terprotonasi dan terdeprotonasi untuk memperkirakan energi disosiasi. Perbedaan energi ini dapat dikorelasikan dengan Ka atau pka yang telah diketahui. Dalam kelompok asam atau basa tertentu, metoda ini memberikan hasil yang sungguh baik. Namun demikian, membandingkan kelompok asam yang berbeda (seperti fenol dan asam benzoat) atau basa dapat gagal karena efek pelarut yang berlainan. Dengan demikian anion (A - ) akan memiliki energi K-20

solvasi yang berbeda jika ion fenoksida dibandingkan dengan ketika menjadi benzoat. Solvasi dapat dimodelkan tetapi menambahkan kerumitan persoalan. CO 2 H - CO 2 + H 2 O + H 3 O + HA A - Suatu pendekatan yang lebih sederhana adalah dengan meninjau muatan atomik parsial pada hidrogen yang berpotensi bersifat asam atau akseptor ion hidrogen. Zat-zat dengan muatan parsial positif pada hidrogen diharapkan bersifat asam. Untuk sederetan molekul yang telah diketahui, suatu korelasi dapat dibuat antara muatan parsial pada hidrogen bersifat asam dan pka eksperimen. Suatu pka molekul baru dapat diestimasi dengan menggunakan grafik korelasi atau persamaan. Seperti telah disebutkan sebelumnya, solvasi adalah pertimbangan yang penting dan hasil-hasil akurat umumnya untuk jenis asam atau basa tertentu. Bila dilihat pada semua asam, korelasi masih sangat baik, tetapi kisaran pka yang lebar yang dikorelasi, simpangan baku akan lebih tinggi. Pembuatan grafik korelasi dapat dilakukan secara langsung (Currie, J, 1993 : 1). Pembahasan Senyawa kimia yang dipergunakan untuk kajian adalah kelompok asam karboksilat dan basa anilin. Alat-alat untuk komputasi meliputi perangkat keras komputer pentium 233 MMX dengan RAM 98 MB, dan piranti lunak HyperChem for windows versi 6.0. Perhitungan dilakukan pada program HyperChem yang dalam sistem operasi Windows PC. Optimasi geometri dilakukan dengan metoda semiempirik menggunakan parameter PM3 pada tingkat Restricted Hartree-Fock (RHF). Algoritma Polak-Rebiere digunakan untuk optimasi struktur. Optimasi struktur yang terbangun dalam program HyperChem menghitung struktur asam atau basa yang mungkin dimana gaya-gaya net pada setiap atom direduksi sampai nol. Muatan pada H dan N dicatat, lalu hubungannya dengan pka atau pkb dianalisis (Tugawin, R.J, 2000 : 2.) Struktur anilin, asam benzoat, dan fenol hasil optimasi geometri dengan metoda semiempirik dan menggunakan algoritma Polak-Ribiere ditunjukkan pada gambar berikut, K-21

anilin asam benzoat fenol Data muatan pada atom H dari berbagai jenis asam dan muatan pada N dari berbagai macam basa hasil perhitungan semiempirik dengan metoda PM3 melalui optimasi geometrik dengan menggunakan algoritma Polak-Ribiere disajikan dalam tabel-tabel berikut. Contoh tampilan yang menunjukkan besar muatan parsial H asam pada fenol diperlihatkan pada gambar berikut. Grafik korelasi muatan parsial H asam lawan pka atau muatan parsial N pada kelompok basa lawan pkb juga ditunjukkan pada gambar 1, 2, 3, dan 4 K-22

Tabel 1 Data muatan parsial H asam untuk kelompok asam karboksilat alifatik NO asam PKa eksperimen Muatan pada H 1 asetat 4,76 0,2269 2 kloroasetat 2,87 0,2303 3 dikloroasetat 1,26 0,2332 4 trikloroasetat 0,63 0,2357 5 butanoat 4,82 0,2273 6 2-klorobutanoat 2,86 0,2296 7 3-klorobutanoat 4,05 0,2300 8 4-klorobutanoat 4,53 0,2270 pka 6 5 y = -493.9x + 116.82 R 2 = 0.9264 4 3 2 1 0 0.226 0.228 0.23 0.232 0.234 0.236 0.238 Muatan pada H Gambar 1. Grafik korelasi antara muatan parsial H dan pka asam karboksilat alifatik. Tabel 2 Data muatan pada H untuk kelompok asam benzoat NO asam pka Muatan pada H eksperimen 1 asam benzoat 4,20 0,2287 2 p-nitrobenzoat 3,44 0,2343 3 m-nitrobenzoat 3,49 0,2344 4 p-klorobenzoat 3,99 0,2299 5 m-klorobenzoat 3,82 0,2300 6 p-metilbenzoat 4,38 0,2282 7 m-metilbenzoat 4,27 0,2284 8 p-metoksibenzoat 4,48 0,2281 9 m-metoksibenzoat 4,09 0,2285 10 p-hidroksibenzoat 4,59 0,2284 11 m-hidroksibenzoat 4,08 0,2287 K-23

pka 5 4 3 y = -144.55x + 37.29 2 R 2 = 0.8235 1 0 0.226 0.228 0.23 0.232 0.234 0.236 Muatan pada H Gambar 2. Grafik korelasi antara muatan pada H dan pka asam benzoat tersubstitusi Tabel 3 Data muatan parsial H asam untuk kelompok fenol NO Asam pka eksperimen Muatan pada H 1 Fenol 10,00 0,1963 2 m-klorofenol 9,02 0,1983 3 p-klorofenol 9,38 0,1980 4 m-metilfenol 10,08 0,1961 5 p-metilfenol 10,26 0,1958 6 m-metoksifenol 9,66 0,1971 7 p-metoksifenol 10,21 0,1945 8 m-nitrofenol 8,39 0,2017 9 p-nitrofenol 7,15 0,2060 pka 12 10 8 6 4 2 0 y = -285.15x + 65.867 R 2 = 0.9751 0.19 0.195 0.2 0.205 0.21 Muatan pada H Gambar 3. Grafik korelasi antara muatan parsial H asam dan pka fenol K-24

Tabel 4 Data muatan parsial N untuk kelompok basa anilin NO Asam pkb eksperimen Muatan pada N 1 Anilin 9,38 0,0709 2 p-metoksianilin 8,70 0,0705 3 m-metoksianilin 9,70 0,0718 4 p-metilanilin 8,92 0,0709 5 m-metilanilin 9,30 0,0698 6 p-kloroanilin 10,00 0,0754 7 m-kloroanilin 10,52 0,0753 8 p-nitroanilin 13,00 0,0969 9 m-nitroanilin 11,54 0,0826 pkb 14 13 12 11 10 9 8 y = 151.57x - 1.4032 R 2 = 0.928 0.065 0.075 0.085 0.095 0.105 muatan parsial N Gambar 4. Grafik korelasi antara muatan parsial N dan pkb basa anilin Gambar 1 dan 2 menunjukkan adanya korelasi yang baik antara muatan pada H karboksil yang bersifat asam dengan pka asam. Gambar tersebut menunjukkan korelasi dengan pka dari asam alifatik tersubstitusi dan asam benzoat menggunakan muatan atomik parsial pada hidrogen gugus karboksil. Hal yang sama juga ditunjukkan gambar 3, korelasi dengan pka untuk fenol terhadap muatan atomik parsial pada hidrogen gugus hidroksil. Untuk asam benzoat dan fenol, hanya isomer meta dan para yang ditinjau karena melalui interaksi ruang akan menyebabkan masingmasing ortho menjadikan kasus khusus. Kebasaan dapat diuji dalam cara yang mirip. Sebagai contoh, anilin tersubstitusi memberikan korelasi yang baik dengan pkb dengan meninjau muatan pada nitrogen ion anilinium atau pada nitrogen anilin. Gambar 4 menunjukkan korelasi pkb eksperimen dengan muatan nitrogen dari anilin tersubstitusi meta dan para. Harga pka dan pkb yang diprediksi dapat dihitung menggunakan rumus korelasi yang ditunjukkan pada grafik. Tabel 1, 2, 3, dan 4 memberikan semua hasil yang digunakan untuk mempersiapkan grafik. K-25

Penutup Korelasi muatan parsial dengan pka atau pkb adalah keduanya cukup tinggi. Data terhitung yang sesuai dengan pka atau pkb eksperimen adalah baik dan dapat bermanfaat dalam meramal kecenderungan sifat asam-basa molekul organik. Disarankan untuk mencoba kelompok asam dan basa yang lain. Daftar Pustaka Currie, J.1993. Estimating pka. CAChe Scientific, Inc : Oregon Mitsunaga, T., Conner, A.H., Hill, C.G. 2002. Predicting the Reactivity of Phenolic Compounds with Formaldehyde. II. Conyinuation of an Ab Initio Study. Journal of Applied Polymer Science, 86 : 135-140 Tugawin, R.J., Bacala, A.M., Dahili, A.S., Vequizo, R.M. 2000. A semiemprical Study on The structure of polyaniline dimer. MSU-Iligan Institute : Illigan City Whisnant, D.M., Howe, J.H, Lever, L.S. 2000. Collaborative Physical Chemistry Projects Involving Computational Chemistry. Journal of Chemical Education, 77(2) : 199-201 K-26