UJI PENEGUHAN REAL TIME PCR AVIAN INFLUENZA DI BBKP SURABAYA TERHADAP METODE UJI STANDAR AVIAN INFLUENZA SESUAI STANDAR OIE.

dokumen-dokumen yang mirip
I. PENDAHULUAN. I.1. Latar Belakang. sangat akut dan mudah sekali menular. Penyakit tersebut disebabkan oleh virus

HASIL DAN PEMBAHASAN

Deteksi Antibodi Terhadap Virus Avian Influenza pada Ayam Buras di Peternakan Rakyat Kota Palangka Raya

METODE PENELITIAN. Kerangka Konsep. Kerangka konsep yang dibangun dalam penelitian ini digambarkan sebagai. berikut :

DETEKSI KEBERADAAN VIRUS AVIAN INFLUENZA PADA DOC YANG DILALULINTASKAN MELALUI BANDARA SOEKARNO HATTA MUJIATUN

PENDAHULUAN. Latar Belakang. Avian influenza (AI) dan Newcastle disease (ND) adalah penyakit

I. PENDAHULUAN. A. Latar Belakang. unggas yang dibudidayakan baik secara tradisional sebagai usaha sampingan

Perkembangan Kasus Avian Influenza (AI) pada Unggas Kondisi s/d 31 Mei 2014

I. PENDAHULUAN. Latar Belakang. yang dapat menimbulkan kerugian ekonomi (Wibowo, 2014). Hal ini disebabkan

BAB I PENDAHULUAN. influenza tipe A termasuk dalam famili Orthomyxoviridae. Virus AI tergolong

Selama ini mungkin kita sudah sering mendengar berita tentang kasus

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI VIRUS AVIAN INFLUENZA PADA BERBAGAI SPESIES UNGGAS SECARA SEROLOGIS DAN MOLEKULER

SURVEILANS SWINE INFLUENZA DI WILAYAH KERJA BBVET WATES JOGJAKARTA TH

3. METODE PENELITIAN

I PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang

Artikel Karya Tulis Ilmiah Diajukan untuk memenuhi tugas dan melengkapi syarat dalam menempuh Program Pendidikan Sarjana Fakultas Kedokteran

PERATURAN DAERAH PROVINSI DAERAH KHUSUS IBUKOTA JAKARTA NOMOR 4 TAHUN 2007 TENTANG PENGENDALIAN PEMELIHARAAN DAN PEREDARAN UNGGAS

METODELOGI PENELITIAN

BAB I PENDAHULUAN. A. Latar Belakang Penelitian. daging yang beredar di masyarakat harus diperhatikan. Akhir-akhir ini sering

DETEKSI FRAGMEN GEN NA

KEBIJAKAN PEMERINTAH DAERAH PROPINSI SULAWESI TENGAH DALAM PENANGGULANGAN PENYAKIT FLU BURUNG (AVIAN INFLUENZA) PADA AYAM RAS

METODE. Waktu dan Tempat Penelitian

SERODETEKSI PENYAKIT TETELO PADA AYAM DI TIMOR LESTE Muhammad Ulqiya Syukron 1, I Nyoman Suartha 2, Nyoman Sadra Dharmawan 3.

BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN. Deteksi genom virus avian influenza pada penelitian dilakukan

PERBANDINGAN METODE EKSTRAKSI REAL TIME PCR VIRUS INFLUENZA A ANTARA METODE GUANIDIUM,-THIOCYANATE-PHENOL- CHLOROFORM DAN METODE SPIN KOLOM

DIAGNOSIS VIRUS PENYAKIT JEMBRANA (VPJ) BERBASIS ASAM NUKLEAT

BERITA NEGARA REPUBLIK INDONESIA

HASIL DAN PEMBAHASAN

2 adanya standar alat dan mesin peternakan dan kesehatan hewan yang harus ditetapkan dengan Peraturan Menteri. Pada prinsipnya, setiap orang yang beru

DAFTAR KODE & TARIF PNBP BALAI BESAR UJI STANDAR KARANTINA PERTANIAN (berdasarkan PP No. 35/2016)

BAB I PENDAHULUAN. dengan gejala saraf yang progresif dan hampir selalu berakhir dengan kematian. Korban

BAB I PENDAHULUAN. A. Latar Belakang. dkk., 2009; Martin dkk., 2009; Koppel dkk., 2011).

PENDAHULUAN. Latar Belakang. Selama tiga dekade ke belakang, infeksi Canine Parvovirus muncul sebagai salah

DETEKSI VIRUS AVIAN INFLUENZA SUBTIPE H5 PADA BEBERAPA JENIS BURUNG DI JAKARTA DAN SUKABUMI

Sirkulasi Virus Flu Burung Subtipe H5 pada Unggas di Jawa Barat, Banten, dan Jawa Timur Sepanjang Tahun

HUBUNGAN ANTARA PENGETAHUAN KELUARGA DENGAN PERILAKU PENCEGAHAN FLU BURUNG DI DESA KIPING KECAMATAN SAMBUNGMACAN KABUPATEN SRAGEN

KARAKTERISASI DAN IDENTIFIKASI VIRUS AVIAN INFLUENZA (AI)

Deteksi Respon Antibodi dengan Uji Hemaglutinasi Inhibisi dan Titer Proteksi terhadap Virus Avian Influenza Subtipe H5N1

GUBERNUR JAWA TIMUR GUBERNUR JAWA TIMUR,

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI VIRUS Avian influenza ASAL BEBEK

DAFTAR ISI Halaman HALAMAN JUDUL... i HALAMAN PENGESAHAN... KATA PENGANTAR... DAFTAR ISI... DAFTAR TABEL... DAFTAR GAMBAR... DAFTAR LAMPIRAN...

DIAGNOSIS CEPAT VIRUS AVIAN INFLUENZA TIPE A SUBTIPE H5 DARI SPESIMEN LAPANGAN DENGAN METODE ONESTEP SIMPLEX RT-PCR

EVALUASI HASIL VAKSINASI AVIAN INFLUENZA (AI) DI KECAMATAN JATINANGOR KABUPATEN SUMEDANG ANI SITI NURFITRIANI

I. PENDAHULUAN. ekonomi yang tinggi. Ikan mas dibudidayakan untuk tujuan konsumsi, sedangkan

I. PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang

METODOLOGI PENELITIAN. Tempat dan Waktu Penelitian. Bahan dan Alat Penelitian

AVIAN INFLUENZA. Dr. RINALDI P.SpAn Bagian Anestesi/ICU Rumah Sakit Penyakit Infeksi Prof.DR.Sulianti Saroso

PERATURAN MENTERI PERTANIAN NOMOR : 06/Permentan/OT.140/1/2007 TENTANG PEMBENTUKAN UNIT PENGENDALI PENYAKIT AVIAN INFLUENZA REGIONAL

BAB I. PENDAHULUAN. A. Latar Belakang Penelitian. Indonesia serta negara-negara Asia lainnya berasal dari tumbuh-tumbuhan

KAJIAN VIRUS AVIAN INFLUENZA PADA ANAK BURUNG PUYUH (Coturnix coturnix japonica) NUR ISTI KHOMAH

I. PENDAHULUAN. Iridoviridae yang banyak mendapatkan perhatian karena telah menyebabkan

INDONESIA NOMOR 229/Kpts/PK.230/4/2016 TENTANG PEMBUKAAN PEMASUKAN UNGGAS DARI NEGARA JERMAN KE DALAM WILAYAH NEGARA REPUBLIK INDONESIA

GUBERNUR NANGGROE ACEH DARUSSALAM

MATERI DAN METODE. Lokasi dan Waktu. Materi

PERMASALAHAN DALAM PELAKSANAAN PENGENDALIAN FLU BURUNG DI JAWA BARAT. oleh : Ir. Koesmajadi TP Kepala Dinas Peternakan Provinsi Jawa Barat

BAB I PENDAHULUAN. 1.1 Latar Belakang

TINJAUAN PUSTAKA Avian Influenza

BAB I PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang Masalah

Prevalensi Virus Influenza (Influenza Like Illness) di Laboratorium Regional Avian Influenza Semarang

BAB I PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang

TARIF LAYANAN BADAN LAYANAN UMUM PUSAT VETERINARIA FARMA PADA KEMENTERIAN PERTANIAN

PENDAHULUAN. Latar Belakang. peningkatan jumlah penduduk Indonesia. Produksi susu segar dalam negeri hanya mampu

I. PENDAHULUAN. yang terbuat dari gelatin sapi (Sahilah dkk., 2012). Produsen akan memilih

BAB I PENDAHULUAN Latar Belakang

PENGUKURAN KINERJA DINAS PETERNAKAN PROVINSI JAWA TIMUR CAPAIAN TUJUAN

KEPUTUSAN MENTERI PERTANIAN NOMOR : 110/Kpts/PD.610/3/2006 TENTANG PEMBENTUKAN UNIT PENGENDALI PENYAKIT AVIAN INFLUENZA

Perkembangan Kasus AI pada Itik dan Unggas serta Tindakan Pengendaliannya

BAB I PENDAHULUAN Latar Belakang Masalah

HASIL DAN PEMBAHASAN. Gambar 4. Hasil Amplifikasi Gen FSHR Alu-1pada gel agarose 1,5%.

HASIL DAN PEMBAHASAN

BAHAN DAN METODE Waktu dan Tempat Penelitian Rancangan Percobaan

DETEKSI VIRUS AVIAN INFLUENZA (H5N1) PADA UNGGAS AIR DI PROPINSI LAMPUNG DENGAN UJI HAEMAGGLUTINATION INHIBITION

DAFTAR ISI. PENDAHULUAN... 1 Latar Belakang... 1 Tujuan Penelitian... 2 Manfaat Penelitian... 2 Hipotesis... 2

I. PENDAHULUAN. yang mempengaruhi prestasi belajar, yaitu yang berasal dari dalam diri

Biosaintifika 5 (2) (2013) Biosaintifika. Journal of Biology & Biology Education.

BAB 1 PENDAHULUAN. Influenza adalah suatu penyakit infeksi saluran pernafasan. akut yang disebabkan oleh virus influenza. Penyakit ini dapat

BAB 1 PENDAHULUAN. Diagnosis tuberkulosis (TB) paru pada anak masih menjadi masalah serius hingga saat ini. Hal

BAB I PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang

FLU BURUNG AVIAN FLU BIRD FLU. RUSDIDJAS, RAFITA RAMAYATI dan OKE RINA RAMAYANI

I. PENDAHULUAN. tanaman jagung di Indonesia mencapai lebih dari 3,8 juta hektar, sementara produksi

MATRIK RENSTRA DINAS PETERNAKAN PROVINSI JAWA TIMUR TAHUN

BAB 2 TINJAUAN PUSTAKA Pengertian dan epidemiologi Avian Influenza

BAB 1 PENDAHULUAN. Virus family Orthomyxomiridae yang diklasifikasikan sebagai influenza A, B, dan C.

BAB II TINJAUAN PUSTAKA

DIAGNOSTIK MIKROBIOLOGI MOLEKULER

BAHAN DAN METODE. Waktu dan Tempat

HASIL DAN PEMBAHASAN

SINTESIS cdna DAN DETEKSI FRAGMEN GEN EF1-a1 PADA BUNGA KELAPA SAWIT (Elaeis guineensis Jacq.)

BAB I PENDAHULUAN. Latar Belakang Penelitian. sapi secara maksimal masih terkendala oleh lambatnya pertumbuhan populasi sapi

BAB I PENDAHULUAN. penyakit zoonosis yang ditularkan oleh virus Avian Influenza tipe A sub tipe

RUMUSAN ROUNDTABLE DISCUSSION: ARAH PENELITIAN MENDUKUNG RENCANA BEBAS PENYAKIT AVIAN INFLUENZA PADA UNGGAS TAHUN Bogor, Kamis, 5 Desember 2013

PERSYARATAN DAN PROSEDUR PELAYANAN KARANTINA HEWAN BERDASARKAN KATEGORISASI MEDIA PEMBAWA HPHK DAN WAKTU PELAYANAN

TINJAUAN PUSTAKA. Virus Influenza A, B dan C

1.1 Latar Belakang Rumusan Masalah Tujuan Penelitian Manfaat Penelitian... 3

Kajian Vaksin Avian Influesa (AI) pada Ayam Buras dengan Sistem Kandang Kurung di Gunung Kidul Yogyakarta

Identifikasi Flu Burung H5N1 pada Unggas di Sekitar Kasus Flu Burung pada Manusia Tahun 2011 di Bekasi

BAHAN DAN CARA Pengambilan sampel Sampel diambil dari peternakan ayam petelur, umur minggu di Kabupaten Blitar (Jawa Timur), yang terserang waba

HASIL SURVEYLANS PENYAKIT AVIAN INFLUENZA DI KALIMANTAN TAHUN 2011 PENDAHULUAN

UNIVERSITAS AIRLANGGA DIREKTORAT PENDIDIKAN Tim Pengembangan Jurnal Universitas Airlangga Kampus C Mulyorejo Surabaya

WALIKOTA TASIKMALAYA

Transkripsi:

UJI PENEGUHAN REAL TIME PCR AVIAN INFLUENZA DI BBKP SURABAYA TERHADAP METODE UJI STANDAR AVIAN INFLUENZA SESUAI STANDAR OIE. OLEH: FITRIA ARDHIANI, ROFIQUL A LA, FIFIN KURNIA SARI, RETNO OKTORINA LABORATOIUM KARANTINA HEWAN BALAI BESAR KARANTINA PERTANIAN SURABAYA 2014

UJI PENEGUHAN REAL TIME PCR AVIAN INFLUENZA DI BBKP SURABAYA TERHADAP METODE UJI STANDAR AVIAN INFLUENZA SESUAI STANDAR OIE. FITRIA ARDHIANI, ROFIQUL A LA, FIFIN KURNIA SARI, DR. RETNO OKTORINA Laboratorium Uji Karantina Hewan BBKP Surabaya memainkan peran penting dalam mempertahankan kemampuan karantina hewan untuk dapat cepat mendiagnosa penyakit hewan yang dilalulintaskan. Hal ini dicapai melalui program-program yang sedang berlangsung untuk mengembangkan tes diagnostik yang sensitif paling akurat dan tepat waktu, merupakan hal yang penting untuk mendukung keberhasilan dalam pencegahan dan pemberantasan wabah penyakit. Pengujian Avian influenza di Laboratorium KH BBKP Surabaya dilakukan dengan metode HA-HI AI dan qrt-pcr tanpa melakukan isolasi virus karena kebutuhan waktu yang diperlukan sangat singkat untuk mengeluarkan hasil uji, sedangkan dalam prosedur OIE dan FAO deteksi antigen AI salah satu prosedur awal yaitu isolasi virus. Pengujian qrt-pcr AIyang dilakukan di laboratorium KH BBKP masih perlu dilakukan validasi metode untuk memastikan hasil yang didapat benar-benar valid (akurat).validasi metode akan dilakukan sesuai standar pengujian yang ada di OIE dan FAO, yang selama ini memang belum dilakukan sesuai runtutan standar OIE, karena kendala waktu dan tuntutan pengguna jasa dilapangan yang harus segera mengeluarkan laporan hasil uji dalam waktu cepat, maka pengujian dengan runtutan sesuai standar belum dilakukan di laboratotium KH BBKP Surabaya. Tujuan Mengetahui apakah hasil yang didapatkan dari pengujian qrt-pcr AI sesuai dengan hasil pengujian yang dilakukan sesuai standar uji Avian influenza di OIE dan FAO. Pengujian dilakukan di laboratorium uji karantina hewan balai besar karantina pertanian Surabaya di Jl. Raya Bandara Ir. H. Juanda-Sidoarjo. Waktu pengujian dilakukan pada bulan Juli sampai September 2014. Sampel adalah swab kloaka dan swab trakhea yang telah diuji qrt-pcr AI dengan hasil positif. Tahapan pengujian sebagai berikut Isolasi virus pada telur ayam bertunas (TAB) berumur antara 9 11 hari yang bersifat Specific Antibody Negative (SAN). Haemagglutination (HA), Haemagglutination Inhibition (HI), Polymerase Chain Reaction (PCR), Ekstraksi One step Reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR), Elektroforesis, Quntitative Real Timepolymerase chain reaction (qrt-pcr) Susunan primer Forward AACAGAGAGGAAATAAGTGGAGTAAAATT (Matrix). Reverse AAAGATAGACCAGCTACCATGATTGC (Matrix). Susunan primer Hemaglutinin (H5) forward AGCAAAAGCAGGGGTAATAAT, reverse CCCTGCCATCCTCCCTCTAT Tabel 1 Hasil inokulasi TAB No Sampel TAB TAB Hari 1 Hari 2 Hari 3 Hari 4 Hari 5 Hari 6 Hari 7 1 4758 1 hidup hidup mati - - - - 2 4533 1 hidup mati - - - - - 3 4531 1 hidup hidup mati - - - -

4 Kontrol (-) 1 hidup hidup hidup hidup hidup hidup hidup 2 hidup hidup hidup hidup hidup hidup hidup 3 hidup hidup hidup hidup hidup hidup hidup Tabel 2 Hasil uji Haemagglutination (HA) Haemagglutination Inhibition (HI) No. Sampel Haemagglutination (HA) AI Haemagglutination Inhibition (HI) AI 1 4758 2 6 10 0 2 4533 2 3 10 0 3 4531 2 5 10 0 4 Kontrol (-) 2 0 10 11 5 Kontrol (+) 2 6 10 0 One step Reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) Gambar 1. Hasil RT-PCR dengan elektroforesis Hasil elektroforesisi hasil RT-PCR menunjukkan untuk primer matrix keluar band pada marker 600 bp, dan untuk primer H5 keluar band pada marker 200 bp. Quntitative Real Timepolymerase chain reaction (qrt-pcr) Gambar 2 Hasil qrt-pcr

Hasil Quntitative Real Time polymerase chain reaction menunjukkan positif H5 dengan adanya kenaikan grafik pada plot amplifikasi dari hasil pembacaan mesin qrt-pcr. Gambar 4.3 Hasil qrt-pcr Hasil Quntitative Real Time polymerase chain reaction menunjukkan positif matrix dengan adanya kenaikan grafik pada plot amplifikasi dari hasil pembacaan mesin qrt-pcr. Hasil yang didapatkan dari pengujian qrt-pcr AI yang telah dilakukan laboratorium Karantina Hewan BBKP Surabaya sesuai dengan hasil pengujian yang dilakukan sesuai standar uji Avian influenza menurut OIE dan FAO. DAFTAR PUSTAKA 1. Badan Litbang Pertanian, 2013, http://www.litbang.deptan.go.id/special/ai, 07-02- 2014 2. Maulana H.R. 2011. Analisa Molekuler gen hemaglutinin virus Avian Influenza (H5N1) isolat ayam buras di Jawa Timur. Thesis. FKH Unair Surabaya. 3. Horimoto, T and Kawaoka, Y. 2005. Influenza : Lessons from Past Pandemics, Warnings from Current Incidents. Nature Rev 3: 591-598. 4. Asmara, W. 2005. Mutasi dan Reassortment Genetik, Shift dan Drift Antigen Virus Avian Influenza serta Pengaruhnya pada Patogenitas dan spesifisitas Hospes. Prosiding Seminar dan Diskusi Interaktif Flu Burung, 21-28. Medika Fakultas Kedokteran Hewn Universitas Gadjah Mada 5. Tabbu, Charles Rangga. 2000. Penyakit Ayam dan Penanggulangannya. Vol. 1. Kanisius. Yogyakarta 6. Badan Karantina Ikan, Pengendlian mutu dan keamanan hasil perikanan. 2014. Pelatihan validasi dan verifikasi metode uji SKIPM Kelas II Tanjungpinang. www.bkipm.kkp.go.id 7. Djumadi. 1998. Pengembangan teknik polymerase chain reaction (PCR) kuantitatif dengan standar internal untuk kuantitas DNA Mitokondria.Tesis. Program pasca sarjana Universitas Indonesia. Jakarta. 8. OIE. 2014. Avian Influenza Chapter 2.3.4 version adopted by the world assembly of delegates of the OIE in May 2014. 9. Yusuf, Muhammad. 2011. Penggunaan uji cepat (Rapid test) untuk deteksi dini virus Avian Influenza. Dunia binatang.com. 10. Hewaluji, Dyah Ayu et al. 2008. Karakterisasi dan identifikasi virus Avian Influenza (AI). Wartazoa Vol. 18 No. 2 tahun 2008. Balai besar penelitian veteriner. Bogor. 11. Purnama, Edy. 2014. Sekilas Flu Burung. Unicef. www.unicef.org

12. Ditjennak. 2013. Update Perkembangan Kasus Avian Influenza (AI) pada Unggas Kondisi s/d 31 Maret 2013. Direktorat Jendral Peternakan Kementerian Pertanian. www.ditjennak.pertanian.go.id