LAPORAN AKUNTABILITAS KINERJA INSTANSI PEMERINTAH (LAKIP) TAHUN 2011

Transkripsi

1 LAPORAN AKUNTABILITAS KINERJA INSTANSI PEMERINTAH (LAKIP) TAHUN 2011 BALAI BESAR PENELITIAN DAN PENGEMBANGAN BIOTEKNOLOGI DAN SUMBERDAYA GENETIK PERTANIAN BADAN PENELITIAN DAN PENGEMBANGAN PERTANIAN KEMENTERIAN PERTANIAN Januari 2012

2 IKHTISAR EKSEKUTIF Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian (BB-Biogen) merupakan Unit Pelaksana Teknis di bawah Badan Litbang Pertanian yang berdasarkan Surat Keputusan Menteri Pertanian No. 631/Kpts/OT.140/12/2003 mempunyai (1) mandat penyusunan program dan evaluasi penelitian dan pengembangan bioteknologi dan sumberdaya genetik pertanian; (2) pelaksanaan penelitian konservasi dan karakterisasi yang meliputi fisik, kimia, biokimia, metabolisme biologis dan biomolekuler sumberdaya genetik pertanian; (3) pelaksanaan penelitian bioteknologi sel, bioteknologi jaringan, rekayasa genetik dan bioprospeksi sumberdaya genetik pertanian; (4) pelaksanaan penelitian keamanan hayati dan keamanan pangan produk bioteknologi; (5) pelaksanaan pengembangan sistem informasi hasil penelitian dan pengembangan bioteknologi sumberdaya genetik pertanian; (6) pelaksanaan pengembangan komponen teknologi sistem dan usaha agribisnis produk bioteknologi pertanian; (7) pelaksanaan kerjasama dan pendayagunaan hasil penelitian bioteknologi dan sumberdaya genetik pertanian; dan pengelolaan tata usaha dan rumah tangga BB-Biogen. Dalam Rencana Strategi BB-Biogen , Visi BB-Biogen ialah: menjadi pusat unggulan dalam penelitian dan pengembangan bioteknologi dan sumberdaya genetik pertanian berkelas dunia yang mampu mendukung ketahanan pangan yang berkelanjutan dan agribisnis yang berdaya saing tinggi berbasis sumber daya lokal. Untuk mewujudkan visi tersebut, maka misinya ialah: (1) Meningkatkan kuantitas sumber daya manusia (SDM) berkualitas di bidang bioteknologi dan sumber daya genetik pertanian, (2) mengelola dan memanfaatkan sumber daya genetik pertanian untuk mendukung penelitian di bidang bioteknologi dan pemuliaan tanaman, (3) mengembangkan suatu program penelitian yang kuat dalam perbaikan sifat genetik tanaman dan mikroba, serta komponen teknologi budidaya pertanian dengan pendekatan bioteknologi untuk menghasilkan produk BB-Biogen berdaya saing tinggi, (4) berkontribusi pada pengembangan pembangunan nasional pertanian dengan mengembangkan dan mendiseminasikan teknologi yang sesuai untuk meningkatkan daya saing produk pertanian Indonesia di pasar nasional dan global untuk mendukung program Badan Litbang menjadi lembaga penelitian dan pengembangan pertanian berkelas dunia dalam menghasilkan dan mengembangkan inovasi pertanian mendukung terwujudnya sistem pertanian industrial. Program utama BB-Biogen adalah Program Penciptaan Teknologi dan Varietas Unggul Berdaya Saing, melalui Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian. Keberhasilan yang dicapai pada tahun 2011 sebagai berikut: (A) Sasaran 1: Tersedianya jumlah aksesi SDGP yang dikonservasi atau diiremajakan sebanyak aksesi, pada sasaran ini capaiannya sebesar 99,4%. Disamping itu, diperoleh capaian lain berupa: (1) Data viabilitas benih aksesi plasma nutfah yang disimpan dalam Bank gen yaitu terhadap sampel: Padi (500 aksesi), jagung (317 aksesi), sorgum (100 aksesi), gandum (83 aksesi ), kedelai (200 aksesi ), kacang tanah (100 aksesi), kacang hijau (100 aksesi ), kacang tunggak (161 aksesi); (2) Database mikroba pertanian (termasuk katalog) yang memuat 600 nomor aksesi; dan Menyempurnakan 1 database serangga pertanian dengan 6000 spesimen; dan (3) Pengkayaan koleksi mikroba pertanian lainnya dari beberapa lokasi telah diampulkan untuk penyimpanan jangka panjang (62 isolat). (B) Sasaran 2: Tersedianya jumlah varietas atau galur harapan komoditas pertanian sebanyak 364 galur, pada sasaran ini capaiannya sebesar 21,4%. Disamping itu, diperoleh capaian lain berupa: (1) Diperoleh satu data karakter agronomi tanaman M2 dari varietas Grobogan, Baluran, Burangrang dan Wilis; (2) i

3 Diperoleh 1000 tanaman M3 berumur genjah, hasil/tanaman 10 g; (3) Diperoleh minimal 300 butir benih padi hibrida galur A (CMS-WA) maupun galur R (Restorer) nya, dari galur A dan galur R yang terseleksi; (4) Diperoleh Satu metode regenerasi kalus manggis; dan (5) Diperoleh tunas manggis dan tunas durian pada media seleksi. (C) Sasaran 4: Tersedianya Jumlah klon gen pengendali sifat-sifat penting komoditas pertanian sebanyak 6 klon gen, pada sasaran ini capaiannya sebesar 88,3%. (D) Sasaran 5: Tersedianya Jumlah sidik jari DNA plasma nutfah pertanian sebanyak 288 aksesi, pada sasaran ini capaiannya sebesar 62,5%. Hambatan, Permasalahan dan Kegagalan yang dialami pada tahun 2011 adalah perpanjangan waktu untuk mencapai sasaran yang ditetapkan dengan perincian sebagai berikut: (1) 300 galur mutan kedelai M4 siap untuk evaluasi karakter agronomi belum diperoleh walaupun demikian pekerjaan fisik lapang telah mencapai 55%. (2) Pembentukan 10 galur BC4F1-Ciherang belum diperoleh walaupun demikian pekerjaan fisik lapang telah mencapai 86%. (3) Tanaman kentang transgenik hasil persilangan dan hasil transformasi gen yang tahan terhadap penyakit hawar daun (P. infestans) di Lapangan Uji Terbatas belum diperoleh walaupun demikian pekerjaan fisik lapang telah mencapai 42%. (4) Satu peta genetik sekuen kelapa sawit Tenera yang sudah diolah secara bioinformatik seperti sequence assembly dan contigs belum diperoleh walaupun demikian pekerjaan fisik lapang telah mencapai 43,5%. (5) Satu peta genetik sekuen jarak pagar IP3 yang sudah diolah secara bioinformatik seperti sequence assembly dan contigs belum diperoleh walaupun demikian pekerjaan fisik lapang telah mencapai 43,5%. (6) Satu peta genetik marka SNP terkait erat dengan hasil, komponen hasil, dan umur genjah pada padi belum diperoleh walaupun demikian pekerjaan fisik lapang telah mencapai 50,5%. (7) 1 gen kandidat berdasarkan homologi sekuen dari marka molekuler masing-masing untuk karakter umur genjah belum diperoleh walaupun demikian pekerjaan fisik lapang telah mencapai 88%. (8) stok enzim Taq polymerase habis dan primer M13 berlabel yang tersedia terbatas sehingga target untuk menganalisis profil sidik jari DNA plasma nutfah padi, kedelai dan mangga tidak mencapai target. ii

4 KATA PENGANTAR Dengan mengucap puji dan syukur ke khadhirat Allah SWT atas segala rahmat dan karunia-nya, sehingga Laporan Akuntabilitas Kinerja Instansi Pemerintah (LAKIP) tahun 2011 pada Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian (BB-Biogen) dapat diselesaikan. Laporan ini disusun berdasarkan Rencana Strategis (Renstra) BB-Biogen tahun , Rencana Kinerja Tahunan (RKT) BB-Biogen tahun 2011, Penetapan Kinerja Tahunan (PKT) BB-Biogen tahun 2011, data Pengukuran Kinerja Kegiatan (PKK) BB-Biogen tahun 2011, Laporan pelaksanaan kegiatan yang dibiayai DIPA BB-Biogen tahun 2011, Laporan kemajuan Indikator kinerja utama BB-Biogen tahun 2011, Laporan realisasi anggaran bersumber data SAI dan Laporan SIMONEV BB-Biogen tahun 2011, dan data Sistem Informasi Kepegawaian BB- Biogen tahun Akuntabilitas kinerja BB-Biogen 2011 menyajikan (1) Perkembangan pencapaian indikator kegiatan utama, (2) Evaluasi hasil pengukuran kinerja kegiatan, (3) Analisis akuntabilitas kinerja kegiatan dan kinerja sasaran, (4) Analisis akuntabilitas keuangan, (5) Analisis efisiensi pencapaian indikator kinerja utama. Saya mengucapkan terima kasih dan penghargaan yang setinggi-tingginya kepada semua pihak yang telah mencurahkan tenaga dan pikirannya dalam merangkum data-data tersebut di atas sehingga dapat terwujudnya laporan ini. Mudah-mudahan laporan ini dapat memberi manfaat kepada semua pihak yang berkepentingan dan dapat digunakan sebagaimana mestinya. Bogor, Januari 2012 Kepala Balai Besar Dr. Karden Mulya NIP iii

5 DAFTAR ISI Halaman IKHTISAR EKSEKUTIF... i KATA PENGANTAR... iii DAFTAR ISI iv DAFTAR TABEL... v DAFTAR LAMPIRAN vi I. PENDAHULUAN. 1 A. LATAR BELAKANG B. ORGANISASI DAN TUGAS FUNGSI II. PERENCANAAN DAN PERJANJIAN KINERJA. 4 A. PERENCANAAN STRATEGIS BB-BIOGEN TAHUN B. RENCANA KINERJA TAHUNAN (RKT) BB-BIOGEN TAHUN C. PENETAPAN KINERJA BB-BIOGEN TAHUN III. AKUNTABILITAS KINERJA A. EVALUASI KINERJA BB-BIOGEN TAHUN B. ANALISIS AKUNTABILITAS KINERJA BB-BIOGEN TAHUN C. ANALISIS AKUNTABILITAS KEUANGAN BB-BIOGEN TAHUN IV. PENUTUP iv

6 DAFTAR TABEL Halaman Tabel 1. Hasil Pemantauan Pelaksanaan Kegiatan Utama BB-Biogen Tahun Tabel 2. Evaluasi Pengukuran Kinerja Kegiatan BB-Biogen Tahun Tabel 3. Tabel 4. Realisasi Anggaran DIPA Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian sampai dengan 31 Desember Realisasi Jenis Belanja Pada DIPA Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian, TA Tabel 5. Target Penerimaan Negara Bukan Pajak (PNBP) BB-Biogen Tahun Tabel 6. Penerimaan dan Penyetoran dari Penerimaan Negara Bulan Pajak (PNBP) BB-Biogen Tahun Tabel 7. Efisiensi Penggunaan Anggaran untuk Pelaksanaan Kegiatan Penelitian Guna Mencapai Indikator Kegiatan Utama BB- Biogen Tahun Tabel 8. Keragaan Pegawai Negeri Sipil (PNS) BB-Biogen Tahun v

7 DAFTAR LAMPIRAN Halaman Lampiran 1. Formulir Rencana Strategis (RS) BB-Biogen Tahun 2010 s/d Lampiran 2. Formulir Rencana Kinerja Tahunan (RKT) BB-Biogen Tahun Lampiran 3. Formulir Pengukuran Kinerja Kegiatan (PKK) BB-Biogen Tahun Lampiran 4. Keragaan Pegawai Negeri Sipil (PNS) di BB-Biogen pada Januari Tahun Lampiran 5. Keragaan Pegawai Negeri Sipil (PNS) di BB-Biogen pada Desember Tahun Lampiran 6. Keragaman Sumber Daya Manusia Berdasarkan Jabatan Fungsional di BB-Biogen Tahun Lampiran 7. Bagan Struktur Organisasi BB-Biogen Tahun vi

8 I. PENDAHULUAN A. Latar Belakang Tujuan akhir pembangunan pertanian periode yang dicanangkan oleh pemerintah adalah terwujudnya kesejahteraan masyarakat melalui sistem pertanian industrial karena pertanian industrial dinilai paling relevan dalam menjawab tantangan global. Untuk mewujudkan pertanian industrial, diperlukan dukungan inovasi teknologi dan optimalisasi sumber daya lahan yang lebih efektif, efisien dan ramah lingkungan. Salah satu teknologi inovatif baru tersebut adalah bioteknologi pertanian, karena dapat memberikan terobosan dalam memecahkan masalah ketahanan pangan dan ketersediaan energi. Sebagai negara tropis dan sebagian besar penduduknya mempunyai mata pencaharian pertanian, peran bioteknologi sangat diharapkan untuk meningkatkan produktivitas dan mutu melalui penggunaan sarana produksi yang ramah lingkungan. Di samping itu bioteknologi pertanian harus mampu merespon perubahan iklim yang ditandai dengan musim kering dan banjir yang sudah semakin sering terjadi. Indonesia berlimpah dengan keanekaragaman hayati tanaman/tumbuhan maupun mikroba yang berpotensi untuk dimanfaatkan dalam peningkatan produktivitas dan produksi tanaman yang pada gilirannya akan meningkatkan ketahanan pangan. Peningkatan keragaman jenis pangan yang dapat dikonsumsi masyarakat dapat bersumber dari kekayaan hayati tanaman lokal maupun jenis tanaman introduksi. Mikroba telah banyak digunakan untuk berbagai tujuan dalam bidang pertanian, diantaranya sebagai agen pupuk hayati, agen pengendali hama dan penyakit, agen bioremediasi dan biodegaradasi bahan pencemar, agen penghasil protein maupun enzim-enzim penting untuk pertanian dan industri. Karena nilai penting yang berhubungan langsung sebagai sumber utama dalam pengembangan bioteknologi, maka perlu dilakukan pelestarian microbial gene pools, sehingga pencarian terhadap strain-strain baru tetap perlu dilakukan. Riset berbasis eksplorasi dan konservasi yang perlu dilakukan untuk memperkuat ketahanan pangan antara lain: (1) eksplorasi, karakterisasi, identifikasi, domestikasi, dan evaluasi plasma nutfah tanaman/tumbuhan atau mikroba, yang berpotensi menghasilkan sumber pangan baru atau sumberdaya genetik yang berpotensi dalam perakitan varietas unggul baru; (2) pelestarian dan perlindungan plasma nutfah tanaman/tumbuhan dan mikroba lokal, baik yang telah terdomestikasi maupun kerabat liarnya, serta mencegah terjadinya erosi genetik, kerusakan, dan pembajakan kekayaan hayati (biopiracy) oleh pihak asing. Sebagai konsekuensi logis dari upaya pelestarian ini

9 perlu dilakukan penelitian dan preservasi yang berkesinambungan terhadap kekayaan hayati secara in situ maupun ex situ. Untuk mendukung pencapaian pertanian industrial yang berkelanjutan selama tahun , Balai Besar Litbang Biogen (BB-Biogen) membuat rencana startegis (renstra) yang mengacu pada mandat BB-Biogen dan renstra Badan Litbang Pertanian yang memprioritaskan pada ketersediaan SDM, teknologi, sarana dan prasarana, serta kerja sama kelembagaan di tingkat nasional atau internasional. Diharapkan renstra yang disusun dapat mendukung tercapainya sasaran yang telah ditetapkan oleh Badan Litbang Pertanian. Prioritas penelitian bioteknologi dan sumberdaya genetik di BB-Biogen mencakup: a. Penelitian dan pengambangan konservasi, karakterisasi dan dokumentasi sumberdaya genetik tanaman pangan/pertanian; b. Pemetaan, eksplorasi gen-gen penting dan sekuen genom hewan, tanaman dan mikroba yang berguna dalam perbaikan genetik komoditas pertanian; c. Perakitan varietas atau galur-galur unggul yang berproduktivitas tinggi, berumur genjah, efisien penggunaan pupuk, tahan cekaman biotik, dan toleran kondisi lingkungan ekstrim seperti kekeringan d. Pengungkapan biokimia dan molekuler pada tanaman, mikroba dan hewan yang berpotensi dalam pengembangan komoditas pertanian unggul B. Organisasi dan Tugas Fungsi Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian (BB-Biogen) dibentuk berdasarkan SK Mentan No. 631/Kpts/OT.140/12/2003, tanggal 30 Desember Balai Besar ini merupakan UPT Eselon 2 yang berfungsi mulai Januari 2004 sampai sekarang. Tugas pokok BB-Biogen berdasarkan SK Menteri Pertanian No. 631/Kpts/OT.140/12/2003, tanggal 30 Desember 2003 pasal 3 adalah sebagai berikut : a. Penyusunan program dan evaluasi penelitian dan pengembangan bioteknologi dan sumberdaya genetik pertanian; 2

10 b. Pelaksanaan penelitian konservasi dan karakterisasi yang meliputi fisik, kimia, biokimia, metabolisme biologis dan biomolekuler sumberdaya genetik pertanian; c. Pelaksanaan penelitian bioteknologi sel, bioteknologi jaringan, rekayasa genetik dan bioprospeksi sumberdaya genetik pertanian; d. Pelaksanaan penelitian keamanan hayati dan keamanan pangan produk bioteknologi; e. Pelaksanaan pengembangan sistem informasi hasil penelitian dan pengembangan bioteknologi sumberdaya genetik pertanian; f. Pelaksanaan pengembangan komponen teknologi sistem dan usaha agribisnis produk bioteknologi pertanian; g. Pelaksanaan kerjasama dan pendayagunaan hasil penelitian bioteknologi dan sumberdaya genetik pertanian; h. Pengelolaan tata usaha dan rumah tangga BB-Biogen. 3

11 II. PERENCANAAN DAN PERJANJIAN KINERJA A. PERENCANAAN STRATEGIS BB-BIOGEN TAHUN a. Visi Visi BB-Biogen ialah menjadi lembaga litbang berkelas dunia dalam mengembangkan sumberdaya lokal Indonesia berbasis bioteknologi. b. Misi Untuk mewujudkan visi tersebut secara spesifik misi BB-Biogen adalah (1) memperkuat kapasitas sumberdaya institusi dalam bidang pemanfaatan sumberdaya genetik (SDG) lokal berbasis bioteknologi, (2) menghasilkan dan mendiseminasikan teknologi dan rekomendasi bioteknologi dan pengelolaan SDG, (3) melakukan analisis kebijakan dan rekomendasi tentang pengembangan dan penerapan bioteknologi modern dan pengelolaan SDG, (4) mengembangkan jejaring kerjasama dalam rangka pengembangan ipteks dan pengembangan peran BB- Biogen dalam pembangunan pertanian. c. Strategi Dasar Strategi utama BB-Biogen untuk tahun ditetapkan sebagai berikut: 1. Menumbuhkembangkan kapasitas dan kreativitas semua komponen BB-Biogen. 2. Membangun dan mengembangkan aliansi strategis antara semua komponen BB-Biogen dengan berbagai lembaga penelitian pertanian dari dalam dan dari luar. 4

12 d. Tujuan Tujuan utama kegiatan BB-Biogen untuk tahun sebagai berikut: (1) menghasilkan, mengembangkan, dan memanfaatkan teknologi rekombinasi DNA, marka molekuler dan informasi genom untuk perbaikan komoditas pertanian, (2) mengelola dan memanfaatkan SDG pertanian (SDGP) seperti tanaman dan mikroba untuk menghasilkan informasi tentang bahan baku dan sumber-sumber gen unggul yang dapat digunakan dalam usaha perbaikan potensi genetik komoditas pertanian, (3) mengembangkan teknik sel dan jaringan untuk perbaikan dan perbanyakan tanaman pangan, hortikultura, dan perkebunan, (4) menyebarluaskan hasil penelitian dan pengembangan bioteknologi dan SDGP berupa publikasi dan produk unggulan, dan (5) memelihara dan meningkatkan sistem manajerial yang terkoordinasi dan transparan. e. Sasaran Sasaran kegiatan BB-Biogen untuk tahun adalah peningkatan inovasi dan adopsi hasil penelitian dan pengembangan bioteknologi pertanian dan pemanfaatan SDGP untuk mendukung ketahanan pangan dan peningkatan daya saing produk pertanian. f. Strategi Utama, dan Kebijakan f1. Strategi Utama Berbagai strategi yang akan dikembangkan untuk mencapai sasaran yang telah ditetapkan, yaitu (1) menumbuhkembangkan kapasitas dan kreativitas semua komponen SDM BB-Biogen (peneliti, staf, teknisi, dan administrasi), (2) meningkatkan daya guna dan memelihara fasilitas (sarana dan prasarana) yang dimiliki agar mampu memecahkan permasalahan yang secara konvensional sulit atau tidak mungkin dilakukan, (3) meningkatkan dan memelihara proses penelitian di BB-Biogen dan terbuka dalam memperbaiki relevansi penelitian agar sesuai dengan permasalahan aktual yang dihadapi industri pertanian, (4) mengusulkan program penelitian yang berkelanjutan sesuai dengan tugas fungsi (tusi) BB-Biogen dan prioritas penelitian yang telah ditetapkan oleh Badan Litbang Pertanian dalam mendukung pertanian industrial unggul berkelanjutan, (5) membangun dan mengembangkan aliansi strategis antara semua komponen BB-Biogen dengan berbagai lembaga penelitian dan masyarakat industri pertanian dari dalam dan dari luar negeri sehingga dapat selalu menyesuaikan prioritas penelitian, (6) 5

13 berperan serta dalam penyusunan kebijakan pembangunan pertanian untuk mendukung terwujudnya pertanian industrial unggul berkelanjutan yang berbasis SDG lokal yang didukung bioteknologi, (7) mempublikasikan ilmu dan teknologi serta mendiseminasikan informasi dan produk hasil penelitian bioteknologi dan SDGP baik di level nasional maupun internasional, dan (8) menjalankan sistem managerial yang terkoordinasi dan transparan untuk mendukung kelancaran pengelolaan SDM, kegiatan penelitian dan diseminasi hasil penelitian yang menjadi tusi BB-Biogen. f2. Kebijakan Kebijakan penelitian bioteknologi pertanian di Kementerian Pertanian pada tahun disusun berdasarkan kebijakan umum, berbagai masalah dan tantangan yang dihadapi atau yang diperkirakan akan timbul, serta peluang yang tersedia bagi pembangunan pertanian. Kebijakan ini mencakup: (1) kemampuan mengembangkan teknologi rekombinasi DNA dan marka molekuler agar mampu bersaing dalam kompetisi global, (2) kemampuan mengembangkan informasi genom (tanaman, mikroba dan ternak) untuk membuka penemuan baru dalam bidang bioteknologi dan SDGP, (3) pengelolaan koleksi plasma nutfah tanaman pangan dan mikroba melalui kegiatan konservasi, karakterisasi, evaluasi dan rejuvenasi, untuk menghasilkan informasi (pangkalan data) tentang bahan baku dan sumber-sumber gen unggul; serta pengelolaan koleksi serangga kering (insektarium) untuk menghasilkan informasi referensi serangga pertanian, (4) pemanfaatan plasma nutfah sebagai usaha perbaikan potensi genetik tanaman dan mikroba, (5) pengembangan teknik kultur sel dan jaringan untuk tanaman pangan, hortikultura, dan perkebunan, dan (6) pengembangan sistem informasi hasil penelitian dan pengembangan bioteknologi dan SDGP dengan tujuan untuk mendukung program penelitian dan pengembangan selanjutnya. 6

14 f3. Langkah Operasional Program atau kegiatan prioritas dari penelitian BB-Biogen beserta sasaran dan target yang akan dicapai untuk tahun sebagai berikut: No Program/ Kegiatan Prioritas Sasaran Indikator Target Program penciptaan teknologi dan varietas unggul berdaya saing, melalui penelitian dan pengembangan bioteknologi dan sumber daya genetik pertanian (SDGP) Peningkatan inovasi dan adopsi hasil bioteknologi dan pemanfaatan SDGP untuk mendukung ketahanan pangan dan peningkatan daya saing produk pertanian 1. Jumlah aksesi SDGP yang dikonservasi atau diremajakan 2. Jumlah Varietas atau Galur Harapan Komoditas Pertanian 3. Jumlah Peta Genetik Sifat-Sifat Penting Komoditas Pertanian Jumlah Klon Gen Sifat- Sifat Penting Komoditas Pertanian Jumlah Sidik Jari DNA Plasma Nutfah Pertanian Jumlah produk bioprospeksi SDG pertanian

15 B. RENCANA KINERJA TAHUNAN (RKT) BB-BIOGEN TAHUN 2011 Rencana kinerja tahunan BB-Biogen pada tahun 2010 yang diukur adalah : (1) Rencana kinerja sasaran; dan (2) Rencana kinerja kegiatan. B.1. Rencana kinerja sasaran yang ingin dicapai adalah Peningkatan inovasi dan adopsi hasil bioteknologi dan pemanfaatan sumberdaya genetik pertanian (SDGP) untuk mendukung ketahanan pangan dan peningkatan daya saing produk pertanian, sedangkan indikator sasarannya sebagai berikut : I. Jumlah aksesi SDGP yang dikonservasi atau diremajakan sebanyak aksesi, terdiri dari: 1. Tersedianya 20 nomor isolat fungi dan bakteri entomopatogen yang dikonservasi. 2. Tersedianya 30 nomor isolat koleksi patogen tanaman yang direjuvenasi dan disimpan kembali dengan teknik penyimpanan jangka panjang. 3. Tersedianya benih baru hasil rejuvenasi aksesi plasma plasma nutfah padi, jagung, sorgum, gandum, kedelai, kacang tanah, kacang hijau, kacang potensial, dan padi liar. 4. Tersedianya tanaman baru aksesi plasma nutfah ubi-ubian (ubikayu, ubijalar, dan ubi-ubian potensial) yang dikonservasi di lapang. 5. Tersedianya tanaman baru 210 aksesi plasma nutfah ubi-ubian (ubikayu, ubijalar, dan ubi-ubian potensial) yang dikonservasi secara in-vitro. II. Jumlah varietas atau galur harapan komoditas pertanian sebanyak 364 galur, terdiri dari: 1. Tersedianya 300 galur M4 kedelai siap untuk evaluasi karakter agronomi 2. Tersedianya 5 galur kedelai transgenik putatif generasi T1 varietas Tidar, Anjasmoro atau Wilis yang membawa gen untuk produktivitas tinggi dan diketahui jumlah kopi dari gen tersebut. 3. Tersedianya 10 galur BC4F1-Ciherang 8

16 4. Tersedianya 10 galur BC4F1-Situbagendit 5. Tersedianya satu informasi penampilan 30 hibrida jagung padi kondisi pupuk N rendah. 6. Tersedianya 5 tanaman jagung yang positif mengandung gen CsNitr1-L. 7. Tersedianya dua galur tanaman kentang transgenik hasil persilangan yang tahan terhadap penyakit hawar daun (P. infestans) di Lapangan Uji Terbatas. 8. Tersedianya dua galur tanaman kentang transgenik hasil transformasi yang tahan terhadap penyakit hawar daun (P. infestans) di Lapangan Uji Terbatas. III. Jumlah peta genetik sifat-sifat penting komoditas pertanian sebanyak 3 peta genetik, terdiri dari: 1. Tersedianya satu peta genetik kelapa sawit Tenera hasil analisis sekuen secara bioinformatik. 2. Tersedianya satu peta genetik jarak pagar IP3 hasil analisis sekuen secara bioinformatik. 3. Tersedianya satu peta genetik marka SNP terkait erat dengan hasil, komponen hasil, dan umur genjah pada padi. IV. Jumlah klon gen pengendali sifat-sifat penting komoditas pertanian sebanyak 6 klon gen, terdiri dari: 1. Tersedianya dua klon gen kandidat untuk toleran kekeringan, produktivitas tinggi atau umur genjah yang diisolasi dari padi transgenik penanda aktivasi terpilih menggunakan teknik TAIL-PCR. 2. Tersedianya dua klon gen kandidat yang diover-ekspresikan pada tanaman padi cv.nipponbare atau Kasalat (sebagai model) masingmasing untuk karakter kekeringan, produktivitas tinggi atau umur genjah. 3. Tersedianya dua gen kandidat berdasarkan homologi sekuen dari marka molekuler masing-masing untuk karakter produktivitas tinggi atau umur genjah. V. Jumlah sidik jari DNA plasma nutfah pertanian sebanyak 288 sidik jari DNA, terdiri dari: 1. Tersedianya 96 sidik jari DNA aksesi padi, 9

17 2. Tersedianya 96 sidik jari DNA aksesi kedelai, dan 3. Tersedianya 96 sidik jari DNA aksesi mangga. LAKIP BB-BIOGEN TAHUN 2011 B.2. Rencana kinerja kegiatan tahun 2011 yang diukur adalah 12 rencana penelitian tim peneliti (RPTP) yang dipayungi oleh Program Penciptaan Teknologi dan Varietas Unggul Berdaya Saing, melalui penelitian dan pengembangan bioteknologi dan sumber daya genetik pertanian. Kinerja kegiatan yang diukur dalam pelaksanaan RPTP adalah (1) Kinerja masukan, (2) Kinerja keluaran, dan (3) Kinerja hasil. Kinerja masukan hampir sama untuk setiap RPTP yang terdiri dari (a) Dana/anggaran, (b) Sumber daya manusia yang terlibat, dan (c) Fasilitas yang digunakan (lapang, rumah kaca, dan laboratorium). Kinerja BB-Biogen tahun 2011 ditetapkan dan diukur berdasarkan program utama penelitian dalam Renstra BB-Biogen dan rencana kinerja kegiatan utama BB-Biogen tahun Program utama BB-Biogen tahun 2011 adalah Program penciptaan teknologi dan varietas unggul berdaya saing melalui: Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian. Kegiatan utama BB-Biogen tahun 2011 dengan rincian sebagai berikut: Kegiatan penelitian 1. Konservasi 50 Mikroba Pertanian dan Dokumentasi 600 Nomor Aksesi Mikroba dan Aksesi Serangga Pertanian. Keluaran yang akan dicapai adalah a. 20 nomor isolat fungi dan bakteri entomopatogen yang dikonservasi dan dikarakterisasi. b. 30 nomor koleksi patogen tanaman yang direjuvenasi dan disimpan kembali dengan teknik penyimpanan jangka panjang. c. Satu database mikroba pertanian (termasuk katalog) yang memuat 600 nomor aksesi. d. Satu database serangga pertanian yang disempurnakan memuat 6000 spesimen. Kegiatan penelitian 2. Penelitian dan Pengembangan Konservasi, Karakterisasi, dan Dokumentasi 4610 Plasma Nutfah Tanaman Pangan. Keluaran yang akan dicapai adalah a. Satu data viabilitas benih-benih plasma nutfah yang akan direjuvenasi dan disimpan di dalam bank gen. 10

18 b aksesi plasma plasma nutfah padi, jagung, sorgum, gandum, kedelai, kacang tanah, kacang hijau dan kacang potensial yang direjuvenasi. c aksesi plasma nutfah ubijalar, ubikayu, dan ubi potensial yang dikonservasi di lapang. d. 210 aksesi ubi kayu, ubi jalar, dan talas yang dikonservasi secara in vitro. e. Satu katalog plasma nutfah tanaman pangan yang di up date. Kegiatan penelitian 3. Pembentukan 300 Mutan M3 dan M4 Tanaman Kedelai Varietas Baluran, Grobogan, Wilis dan Burangrang serta 5 Galur Putatif Generasi T1 dan 30 Transforman Kedelai Putatif Generasi T0 untuk Karakter Umur Genjah dari Varietas Tidar, Wilis atau Anjasmoro. Keluaran yang akan dicapai adalah a. Satu data karakter agronomi tanaman M2 dari varietas Grobogan, Baluran, Burangrang dan Wilis. b tanaman M3 berumur genjah, hasil/tanaman 10 g. c. 500 bibit M4 siap untuk evaluasi karakter agronomi. d. Lima galur kedelai transgenik putatif generasi T1 varietas Tidar, Wilis, atau Anjasmoro yang membawa gen untuk produktivitas tinggi dan diketahui jumlah kopi dari gen tersebut. e. 30 transforman kedelai transgenik putatif generasi T0 dari 3 varietas (Tidar, Wilis, atau Anjasmoro) untuk karakter umur genjah. Kegiatan penelitian 4. Pembentukan 20 Galur Padi BC4F1-Ciherang dan BC4F1-Situbagendit untuk Efisiensi Pupuk N dan P 30% serta Potensi Hasil 6-8,5 ton/ha. Keluaran yang akan dicapai adalah a. 10 galur BC4F1 Ciherang dan BC4F1 Situbagendit. b. Satu data molekular masing-masing 10 galur BC3F1-Ciherang dan BC3F1-Situ Bagendit yang positif mengandung gen target. c. Satu data molekular masing-masing 10 galur BC3F1-Ciherang dan BC3F1-Situ Bagendit yang positif mengandung gen target. Kegiatan penelitian 5. Pembentukan 5 Galur Jagung Transgenik dan Evaluasi 30 Galur Hibrida Jagung Efisiensi Pupuk N Produktivitas Tinggi dan Berumur Genjah <85 hari. Keluaran yang akan dicapai adalah a. 30 hibrida jagung terevaluasi. b. 10 hibrida jagung diperoleh. 11

19 c. Benih inbrida diperbanyak. d. Lima tanaman transforman jagung hasil tranformasi dengan gen CsNitr1-L Kegiatan penelitian 6. Produksi 300 Butir Benih Galur Mandul Jantan, 15 g Benih 10 Galur Padi Hibrida (F1) Potensial yang Dirakit dari Pemulih Kesuburan Dihaploid Hasil Kultur Antera dan Uji Daya Hasil Pendahuluan Hibrida Tersebut. Keluaran yang akan dicapai adalah a. Minimal 300 butir benih galur A maupun R nya, dari A (CMS-WA) dan R yang terseleksi. b. Minimal 15 g benih masing-masing galur padi hibrida (F1) potensial yang terseleksi. c. Data potensi daya hasil 10 galur padi hibrida (F1) hasil UDHP. Kegiatan penelitian 7. Pembentukan Empat Galur Tanaman Transgenik Kentang Tahan Penyakit Hawar Daun (Phytophthora infestans) yang dapat Mengurangi 50% Aplikasi Fungisida. Keluaran yang akan dicapai adalah a. Minimal dua galur tanaman kentang transgenik hasil persilangan dan minimal dua galur tanaman kentang transgenik hasil transformasi yang tahan terhadap penyakit hawar daun (P. infestans) hasil LUT. Kegiatan penelitian 8. Pengembangan Metode Transformasi Manggis dan Durian Menggunakan Gen defh9-iaam serta Pembentukan 20 CalonTunas Transforman Manggis dan Durian pada Media Seleksi. Keluaran yang akan dicapai adalah a. Satu metoda induksi tunas dari kalus manggis melalui kultur in vitro. b. Satu metoda induksi tunas dari kalus durian durian melalui kultur in vitro. c. Satu metoda insersi gen defh9-iaam pada kalus manggis. d. Satu metoda insersi gen defh9-iaam pada kalus durian. Kegiatan penelitian 9. Perakitan 20 Transforman Putatif Gandum yang Mengandung Gen ZmDREB2A dan Ekspresi 10 T1 yang Mengandung Gen OsDREB1A. Keluaran yang akan dicapai adalah a. 20 galur generasi T0 yang mengandung gen ZmDREB2A. b. 10 galur T1 yang mengekspresikan gen OsDREB1A. 12

20 Kegiatan penelitian 10. Pembentukan 3 Peta Genetik Sawit, Jarak Pagar, dan Padi dan Identifikasi Marka SNP Kakao, Kedelai dan Sapi. Keluaran yang akan dicapai adalah a. Satu data sekuen mentah (raw sequences) kelapa sawit Tenera dan jarak pagar IP3. b. Satu data resequence 2 genotipe sawit,2 genotipe jarak pagar dan 2 genotipe kakao. c. Satu data marka SNP yang berasosiasi dengankarakter umur genjah, hasil, dan komponen hasil pada padi. d. Satu data keragaan hasil dan komponen hasil 300 genotipe kedelai hasil uji lapang dan data resequence 3 genotipe kedelai. e. Satu data analisis genom sapi untuk laju pertumbuhan dan pembentukan kit berbasis DNA yang dapat mendeteksi sapi betina dengan potensi kembar. Kegiatan penelitian 11. Kloning 6 Gen Kandidat Untuk Toleran Kekeringan, Produktivitas Tinggi dan Umur Genjah. Keluaran yang akan dicapai adalah a. Dua klon gen kandidat untuk tolerankekeringan produktivitas tinggi atau umur genjah yang diisolasi dari padi transgenik penanda aktivasi menggunakan teknik TAIL-PCR. b. Tiga gen kandidat yang telah diover-ekspresikan pada tanaman padi cv. Nipponbare atau Kasalat yang terdiri dari satu gen toleran kekeringan (gen OsERA1), satu gen untuk produktivitas tinggi (gen OsGS3 atau OsCKX), dan satu gen untukumur genjah (gen OsMADS18). c. Dua gen kandidat berdasarkan homologi sekuen dari marka molekuler terpilih untuk karakter produktivitas tinggi atau umur genjah. Kegiatan penelitian 12. Analisis Sidik Jari DNA 288 Aksesi Plasma Nutfah Pertanian (Padi, Kedelai,dan Mangga) dan Hubungan Kekerabatan Sebagai Penciri Spesifik Plasma Nutfah. Keluaran yang akan dicapai adalah a. 96 sidik jari DNA padi. b. 96 sidik jari DNA kedelai. c. 96 sidik jari DNA mangga. 13

21 C. PENETAPAN KINERJA BB-BIOGEN TAHUN 2011 Untuk mencapai sasaran yang telah ditetapkan dalam Renstra BB-Biogen , maka pada tahun 2011 BB-Biogen menetapkan kinerja sebagai berikut: Sasaran Strategis Indikator Kinerja Target (1) (2) (3) Peningkatan inovasi dan adopsi hasil bioteknologi dan pemanfaatan SDGP untuk mendukung ketahanan pangan dan peningkatan daya saing produk pertanian. 1. Jumlah aksesi SDGP yang dikonservasi atau diremajakan aksesi - Isolat fungi dan bakteri entomopatogen dikonservasi. 20 aksesi - Koleksi patogen tanaman direjuvenasi dan disimpan kembali dengan teknik. 30 aksesi - Aksesi plasma nutfah tanaman pangan (padi, jagung, kedelai, kacang tanah, kacang hijau, sorgum, kacang-kacangan minor dan padi liar) aksesi - Konservasi lapang plasma nutfah ubi-ubian (ubikayu, ubijalar, dan talas) aksesi - Konservasi secara in-vitro plasma nutfah ubi-ubian (ubikayu, ubijalar, dan talas). 200 aksesi 2. Jumlah Varietas atau Galur Harapan Komoditas Pertanian 364 galur - Galur M4 siap untuk evaluasi karakter agronomi 300 galur - Galur kedelai putatif transgenik generasi T1 Varietas Tidar, Wilis atau Anjasmoro yang membawa gen untuk produktivitas tinggi dan diketahui jumlah kopi dari gen tersebut. 5 galur - Galur BC4F1-Ciherang 10 galur - Galur BC4F1-Situ Bagendit 10 galur - Informasi penampilan 30 hibrida jagung pada kondisi N rendah 30 galur - Tanaman jagung yang positif mengandung gen CsNitr1-L. 5 galur 14

22 Sasaran Strategis Indikator Kinerja Target (1) (2) (3) - Galur tanaman kentang transgenik hasil persilangan yang tahan terhadap penyakit hawar daun (P. infestans) di Lapangan Uji Terbatas. - Galur tanaman kentang transgenik hasil transformasi yang tahan terhadap penyakit hawar daun (P. infestans) di Lapangan Uji Terbatas. 2 galur 2 galur 3. Jumlah Peta Genetik Sifat-Sifat Penting Komoditas Pertanian 3 peta genetik - Peta genetik sawit Tenera hasil analisis sekuen secara bioinformatik seperti sequence assembly dan contigs. - Peta genetik jarak pagar IP3 hasil analisis sekuen secara bioinformatik seperti sequence assembly dan contigs. - Marka SNP terkait erat dengan hasil, komponen hasil, dan umur genjah pada padi. 1 peta genetik 1 peta genetik 1 peta genetik 4. Jumlah klon gen pengendali sifat-sifat penting komoditas pertanian 6 klon gen - Klon gen kandidat untuk toleran kekeringan, produktivitas tinggi atau umur genjah yang diisolasi dari padi transgenik penanda aktivasi terpilih menggunakan teknik TAIL-PCR. - Klon gen kandidat yang diover-ekspresikan pada tanaman padi cv.nipponbare atau Kasalat (sebagai model) masing-masing untuk karakter kekeringan, produktivitas tinggi atau umur genjah. - Gen kandidat berdasarkan homologi sekuen dari marka molekuler masingmasing untuk karakter produktivitas tinggi atau umur genjah. 2 klon gen 2 gen 2 gen 5. Profil sidik jari DNA plasma nutfah pertanian. 288 aksesi - Profil sidik jari DNA masing-masing 96 varietas/aksesi plasma nutfah padi, kedelai dan mangga dengan menggunakan marka SSR. 288 aksesi 15

23 III. AKUNTABILITAS KINERJA Akuntabilitas kinerja BB-Biogen tahun 2011 dilakukan dengan cara membandingkan antara target dengan realisasi yang dicapai sampai dengan 31 Desember 2011 masing-masing indikator kinerja. Ada beberapa indikator kinerja sasaran dan kegiatan yang dibandingkan realisasi capaian tahun-tahun sebelumnya maupun dengan hasil penelitian lembaga lainnya. Untuk mendorong pencapaian maksimal dari realisasi target indikator kinerja kegiatan dan sasaran yang telah ditetapkan maka dilakukan pemantauan secara berkala (setiap bulan) kemajuan pelaksanaan kegiatan tersebut. Secara ringkas sebagian besar indikator kinerja kegiatan utama BB-Biogen tahun 2011 yang telah ditetapkan sampai dengan akhir Desember 2011 dapat dicapai secara maksimal. Walaupun demikian ada beberapa indikator kinerja kegiatan utama yang waktu pencapaiannya mundur. Akuntabilitas kinerja BB-Biogen pada tahun 2011 yang disajikan adalah (A) Evaluasi Kinerja BB-Biogen Tahun 2011, (B) Analisis Akuntabilitas Kinerja BB-Biogen Tahun 2011, dan (C) Analisis Akuntabilitas Keuangan BB-Biogen Tahun A. Evaluasi Kinerja BB-Biogen Tahun 2011 Pada evaluasi kinerja BB-Biogen tahun 2011 dilakukan terhadap (1) Perkembangan Pencapaian Kinerja Kegiatan dan Sasaran BB-Biogen tahun 2011, dan (2) Pencapaian indikator kinerja kegiatan. A.1. Perkembangan Pencapaian Kinerja Kegiatan dan Sasaran BB-Biogen tahun 2011 Perkembangan pencapaian kinerja kegiatan dan sasaran BB-Biogen Tahun 2011 dapat ditelusuri berdasarkan hasil pemantauan setiap triwulan terhadap pelaksanaan kegiatan utama di BB-Biogen. 16

24 Tabel 1. Hasil Pemantauan Pelaksanaan Kegiatan Utama BB-Biogen Tahun No Sasaran Indikator Kegiatan 1. Jumlah aksesi SDGP yang dikonservasi atau diremajakan. (4.650 aksesi) 2. Jumlah Varietas atau Galur Harapan Komoditas Pertanian. (364 galur) 1. Isolat fungi dan bakteri entomopatogen dikonservasi. 2. Koleksi patogen tanaman direjuvenasi dan disimpan kembali dengan teknik penyimpanan jangka panjang. 3. Aksesi plasma nutfah tanaman pangan (padi, jagung, kedelai, kacang tanah, kacang hijau, sorgum, kacang-kacangan minor dan padi liar). 4. Konservasi lapang plasma nutfah ubi-ubian (ubikayu, ubijalar, dan talas). 5. Konservasi secara in-vitro plasma nutfah ubiubian (ubikayu, ubijalar, dan talas). 1. Galur mutan kedelai M4 siap untuk evaluasi karakter agronomi. 2. Galur kedelai putatif transgenik generasi T1 Varietas Tidar, Wilis atau Anjasmoro yang membawa gen untuk produktivitas tinggi dan diketahui jumlah kopi dari gen tersebut. Target 1 tahun Realisasi Fisik (%) Trw-1 Trw-2 Trw-3 Trw-4 20 aksesi aksesi aksesi aksesi aksesi Rata-rata Sasaran galur galur Galur BC4F1-Ciherang. 10 galur Galur BC4F1-Situ Bagendit. 10 galur Informasi penampilan 30 hibrida jagung pada kondisi N rendah. 30 galur

25 No Sasaran Indikator Kegiatan 3. Jumlah peta genetik sifatsifat penting komoditas pertanian. (3 peta genetik) 4. Jumlah klon gen pengendali sifat-sifat penting komoditas pertanian. (6 klon gen) 6. Tanaman jagung yang positif mengandung gen CsNitr1-L. 7. Tanaman kentang transgenik hasil persilangan yang tahan terhadap penyakit hawar daun (P. infestans) di Lapangan Uji Terbatas. 8. Tanaman kentang transgenik hasil transformasi yang tahan terhadap penyakit hawar daun (P. infestans) di Lapangan Uji Terbatas. 1. Sekuen kelapa sawit Tenera yang sudah diolah secara bioinformatik seperti sequence assembly dan contigs. 2. Sekuen jarak pagar IP3 yang sudah diolah secara bioinformatik seperti sequence assembly dan contigs. 3. Marka SNP terkait erat dengan hasil, komponen hasil, dan umur genjah pada padi. 1. Klon gen kandidat untuk toleran kekeringan, produktivitas tinggi atau umur genjah yang diisolasi dari padi transgenik penanda aktivasi terpilih menggunakan teknik TAIL-PCR. 2. Klon gen kandidat yang diover-ekspresikan pada tanaman padi cv. Nipponbare atau Kasalat (sebagai model) masing-masing untuk karakter toleran kekeringan, produktivitas tinggi atau umur genjah. Target 1 tahun Realisasi Fisik (%) Trw-1 Trw-2 Trw-3 Trw-4 5 galur galur galur Rata-rata Sasaran peta genetik 1 peta genetik 1 peta genetik Rata-rata Sasaran klon klon

26 No Sasaran Indikator Kegiatan 3. Gen kandidat berdasarkan homologi sekuen dari marka molekuler masing-masing untuk karakter produktivitas tinggi atau umur genjah. Target 1 tahun Realisasi Fisik (%) Trw-1 Trw-2 Trw-3 Trw-4 2 klon Rata-rata Sasaran Jumlah sidik jari DNA plasma nutfah pertanian. (288 aksesi) 1. Profil sidik jari DNA masing-masing 96 varietas/aksesi plasma nutfah padi, kedelai dan mangga dengan menggunakan marka SSR. 288 aksesi Rata-rata Sasaran Rata-rata Sasaran Pada tahun 2011 capaian pelaksanaan fisik dari sasaran dan indikator kegiatan sampai dengan triwulan ke IV sebagian besar (75.5%) telah selesai, walaupun demikian masih ada beberapa indikator kegiatan yang realisasi fisiknya baru mencapai % (Tabel 1). Pencapaian pelaksanaan fisik yang masih rendah disebabkan adanya hambatan/masalah/kendala sebagai berikut: 1. Tanaman galur mutan kedelai M4 pada saat laporan ini dibuat masih stadium pengisian polong sehingga target memperoleh 300 galur mutan kedelai M4 belum tercapai. 2. Musim penghujan tahun 2011 terjadi pada penghujung tahun, intensitas hujan yang turun belum menyebabkan serangan P. infestans di lapang pada pertanaman kentang tidak muncul sehingga pengujian kentang transgenik toleran patogen hawar daun bakteri dilapang belum berhasil diperoleh target 4 galur kentang transgenik tahan hawar daun. 3. Alat sekuenser HiSeq2000 telah divalidasi dan training personal pengguna alat sequencer baru selesai dilakukan pada tanggal 29 April Alat SNP microarray reader juga sudah divalidasi, namun training personal pengguna alat baru selesai dilakukan pada tanggal 6 Mei Dengan demikian penelitian 2010 pelaksanaannya terlambat yang kelihatannya akan berpengaruh dalam pelaksanaan 19

27 penelitian Hasil sequencing sawit belum optimal karena jumlah cluster/mm 2 Flow Cell masih relative rendah. Kit Qiagen yang direkomendasikan Illumina untuk isolasi DNA menghasilkan DNA dengan konsentrasi sangat rendah. Hal ini menghambat pelaksanaan penelitian genotyping. Telah dicoba kit isolasi DNA dari Thermo Scientific yang menghasilkan DNA dengan kuantitas yang lebih tinggi. Tenaga Bioinformatik belum berpengalaman dalam analisis data sekuen de novo. Sehingga analisis data sekuen agak terhambat. 4. Stok enzim Taq polymerase habis dan primer M13 berlabel yang tersedia terbatas sehingga target untuk menganalisis profil sidik jari DNA plasma nutfah padi, kedelai dan mangga tidak mencapai target. A.2. Evaluasi Pencapaian Indikator Kinerja Kegiatan Utama BB-Biogen tahun 2011 Evaluasi pengukuran tingkat capaian kinerja kegiatan BB-Biogen Tahun 2011 dilakukan dengan cara membandingkan antara target indikator kinerja kegiatan dengan realisasinya. Tabel 2. Evaluasi Pengukuran Kinerja Kegiatan BB-Biogen Tahun No Sasaran 1. Jumlah aksesi SDGP yang dikonservasi atau diremajakan. (4.650 aksesi) Indikator Kinerja Kegiatan Uraian Satuan Target Realisasi Capaian (%) 1. Isolat fungi dan bakteri entomopatogen dikonservasi. aksesi Koleksi patogen tanaman direjuvenasi dan disimpan kembali dengan teknik penyimpanan jangka panjang. aksesi Aksesi plasma nutfah tanaman pangan (padi, jagung, kedelai, kacang tanah, kacang hijau, sorgum, kacangkacangan minor dan padi liar). 4. Konservasi lapang plasma nutfah ubi-ubian (ubikayu, ubijalar, dan talas). 5. Konservasi secara in-vitro plasma nutfah ubi-ubian (ubikayu, ubijalar, dan talas). aksesi aksesi ,9 aksesi Rata-rata Capaian Sasaran 1 99,4 20

28 No Sasaran 2. Jumlah Varietas atau Galur Harapan Komoditas Pertanian. (364 galur) Indikator Kinerja Kegiatan Uraian Satuan Target Realisasi Capaian (%) 1. Galur M4 siap untuk evaluasi karakter agronomi. galur harapan 2. Galur kedelai putatif transgenik generasi T1 Varietas Tidar, Wilis atau Anjasmoro yang membawa gen untuk produktivitas tinggi dan diketahui jumlah kopi dari gen tersebut galur Galur BC4F1-Ciherang. galur Galur BC4F1-Situ Bagendit. galur Informasi penampilan 30 hibrida jagung pada kondisi N rendah. galur Tanaman jagung yang positif mengandung gen CsNitr1-L. galur Tanaman kentang transgenik hasil persilangan yang tahan terhadap penyakit hawar daun (P. infestans) di Lapangan Uji Terbatas. 8. Tanaman kentang transgenik hasil transformasi yang tahan terhadap penyakit hawar daun (P. infestans) di Lapangan Uji Terbatas. galur galur Rata-rata Capaian Sasaran Jumlah peta genetik sifatsifat penting komoditas pertanian. (3 peta genetik) 1. Sekuen kelapa sawit Tenera yang sudah diolah secara bioinformatik seperti sequence assembly dan contigs. 2. Sekuen jarak pagar IP3 yang sudah diolah secara bioinformatik seperti sequence assembly dan contigs. peta genetik peta genetik Marka SNP terkait erat dengan hasil, komponen hasil, dan umur genjah pada padi. peta genetik

29 No Sasaran 4. Jumlah klon gen pengendali sifat-sifat penting komoditas pertanian. (6 klon gen) 5. Jumlah sidik jari DNA plasma nutfah pertanian. (288 aksesi) Indikator Kinerja Kegiatan Uraian Satuan Target Realisasi Capaian (%) 1. Klon gen kandidat untuk toleran kekeringan, produktivitas tinggi atau umur genjah yang diisolasi dari padi transgenik penanda aktivasi terpilih menggunakan teknik TAIL-PCR. 2. Klon gen kandidat yang diover-ekspresikan pada tanaman padi cv. Nipponbare atau Kasalat (sebagai model) masingmasing untuk karakter toleran kekeringan, produktivitas tinggi atau umur genjah. 3. Gen kandidat berdasarkan homologi sekuen dari marka molekuler masing-masing untuk karakter produktivitas tinggi atau umur genjah. 1. Profil sidik jari DNA masing-masing 96 varietas/aksesi plasma nutfah padi, kedelai dan mangga dengan menggunakan marka SSR. Rata-rata Capaian Sasaran 3 0 klon klon Set data Rata-rata Capaian Sasaran aksesi ,5 Rata-rata Capaian Sasaran Rata-rata Capaian Seluruh Sasaran 73 Hasil pengukuran indikator kinerja kegiatan di BB-Biogen tahun 2011 rata-rata capaian kinerjanya sebesari 73% (20 indikator kinerja kegiatan), Capaian kinerja yang mencapai 100% atau lebih sebanyak 10 indikator kinerja kegiatan, sedangkan indikator kinerja kegiatan yang belum tercapai sebanyak 10 indikator kinerja (Tabel 2). Indikator kinerja kegiatan yang saat ini capaiannya 0% bukan berarti tidak tercapai tetapi karena terjadi hambatan dalam pelaksanaan kegiatan sehingga penyelesaian kegiatan menjadi mundur, hambatan/masalah/kendala sebagai berikut: 1. Tanaman galur mutan kedelai M4 pada saat laporan ini dibuat masih stadium pengisian polong sehingga target memperoleh 300 galur 22

30 mutan kedelai M4 belum tercapai. 5. Saat ini baru diperoleh Galur BC3F1-Ciherang terseleksi yang mengandung gen CsNitr1-L dan gen Pup1, sedangkan target untuk memperoleh 10 galur BC4F1-Ciherang belum diperoleh karena masih pada tahap pengamatan pertumbuhan. 6. Musim penghujan tahun 2011 terjadi pada penghujung tahun, intensitas hujan yang turun belum menyebabkan serangan P. infestans di lapang pada pertanaman kentang tidak muncul sehingga pengujian kentang transgenik toleran patogen hawar daun bakteri dilapang belum berhasil diperoleh target 4 galur kentang transgenik tahan hawar daun. 7. Alat sekuenser HiSeq2000 telah divalidasi dan training personal pengguna alat sequencer baru selesai dilakukan pada tanggal 29 April Alat SNP microarray reader juga sudah divalidasi, namun training personal pengguna alat baru selesai dilakukan pada tanggal 6 Mei Dengan demikian penelitian 2010 pelaksanaannya terlambat yang kelihatannya akan berpengaruh dalam pelaksanaan penelitian Hasil sequencing sawit belum optimal karena jumlah cluster/mm 2 Flow Cell masih relative rendah. Kit Qiagen yang direkomendasikan Illumina untuk isolasi DNA menghasilkan DNA dengan konsentrasi sangat rendah. Hal ini menghambat pelaksanaan penelitian genotyping. Telah dicoba kit isolasi DNA dari Thermo Scientific yang menghasilkan DNA dengan kuantitas yang lebih tinggi. Tenaga Bioinformatik belum berpengalaman dalam analisis data sekuen de novo. Sehingga analisis data sekuen agak terhambat. 8. Amplikon gen kandidat berdasarkan homologi sekuen dari marka molekuler terkait umur genjah pada padi belum berhasil diligasikan ke vector kloning karena adanya kontaminasi pada vektor kloning (sudah terligasi sendiri sebelumnya), Melakukan ligasi kembali amplikon kandidat umur genjah ke vector kloning pgem-t easy sampai berhasil mencapai target. 9. Stok enzim Taq polymerase habis dan primer M13 berlabel yang tersedia terbatas sehingga target untuk menganalisis profil sidik jari DNA plasma nutfah padi, kedelai dan mangga tidak mencapai target. 23

31 B. Analisis Akuntabilitas Kinerja BB-Biogen Tahun 2011 BB-Biogen sebagai salah satu satker eselon 2 Badan Penelitian dan Pengembangan Pertanian melaksanakan Program penciptaan teknologi dan varietas unggul berdaya saing melalui: Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumberdaya Genetik Pertanian. Sasaran yang harus dicapai BB-Biogen pada tahun 2011 adalah: 1. Tersedianya jumlah aksesi sumber daya genetik pertanian (SDGP) yang dikonservasi atau diiremajakan sebanyak aksesi. 2. Tersedianya jumlah varietas atau galur harapan komoditas pertanian sebanyak 364 galur. 3. Tersedianya jumlah peta genetik sifat-sifat penting komoditas pertanian sebanyak 3 peta genetik. 4. Tersedianya jumlah klon gen pengendali sifat-sifat penting komoditas pertanian sebanyak 6 klon gen. 5. Jumlah sidik jari DNA plasma nutfah pertanian sebanyak 288 aksesi. B.1. Analisis Akuntabilitas Kinerja Kegiatan BB-Biogen Tahun 2011 Analisis dan evaluasi capaian kinerja kegiatan tahun 2011 di BB-Biogen dapat dijelaskan sebagai berikut : Sasaran 1 : Jumlah aksesi SDGP yang dikonservasi atau diremajakan sebanyak aksesi. Untuk mencapai sasaran tersebut, diukur dengan 5 indikator kinerja kegiatan. Adapun pencapaian target dari masing-masing indikator kinerja kegiatan dapat digambarkan sebagai berikut: Indikator Kegiatan Target Realisasi Capaian (%) 1. Isolat fungi dan bakteri entomopatogen dikonservasi Koleksi patogen tanaman direjuvenasi dan disimpan kembali dengan teknik penyimpanan jangka panjang

32 Indikator Kegiatan Target Realisasi Capaian (%) 3. Aksesi plasma nutfah tanaman pangan (padi, jagung, kedelai, kacang tanah, kacang hijau, sorgum, kacang-kacangan minor dan padi liar) Konservasi lapang plasma nutfah ubi-ubian (ubikayu, ubijalar, dan talas) Konservasi secara in-vitro plasma nutfah ubi-ubian (ubikayu, ubijalar, dan talas) Indikator kinerja kegiatan BB-Biogen yang telah ditargetkan dalam Tahun 2011 yang telah tercapai maupun yang belum tercapai dapat dilihat secara detail pada Formulir Pengukuran Kinerja Kegiatan (PKK) terlampir. Keberhasilan yang dicapai sasaran 1 sebagai berikut: 1) Telah dikonversi atau diremajakan sebanyak 20 aksesi isolat fungi dan bakteri entomopatogen; 2) Telah dikonversi atau diremajakan sebanyak 30 aksesi koleksi patogen tanaman direjuvenasi dan disimpan kembali dengan teknik penyimpanan jangka panjang: (a) 10 nomor isolat bakteri patogen tanaman, (b) 10 nomor isolat jamur patogen padi dan (c) 10 nomor virus; 3) Telah dikonversi atau diremajakan sebanyak aksesi plasma nutfah tanaman pangan terdiri dari 400 aksesi padi; 50 aksesi padi liar; 150 aksesi jagung; 200 aksesi Sorgum; 80 aksesi Gandum; 250 aksesi kedelai; 100 aksesi kedelai edamame; 200 aksesi kacang tanah; 227 aksesi kacang hijau; 143 aksesi kacang potensial; 4) Telah dikonversi atau diremajakan sebanyak aksesi plasma nutfah ubi-ubian dilapang terdiri dari 520 aksesi ubikayu; 1750 aksesi ubijalar; dan 120 aksesi ubi potensial; 5) Telah dikonversi atau diremajakan sebanyak in vitro 210 aksesi plasma nutfah ubikayu, ubijalar, talas, dan gembili. Disamping target yang telah ditetapkan juga diperoleh: 25