ANALISIS KANDUNGAN BABI PADA KORNET DAGING SAPI DI WILAYAH PURWOKERTO DENGAN METODE REAL TIME PCR SKRIPSI Untuk memenuhi sebagai persyaratan Mencapai Derajat Sarjana S-1 Diajukan Oleh PARADHITA 0908010152 FAKULTAS FARMASI UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO PURWOKERTO 2013 i
iii
INTISARI PARADHITA. Analisis Kandungan Babi pada Kornet Daging Sapi Di Wilayah Purwokerto dengan Metode Real time PCR. Dibawah bimbingan Wiranti Sri Rahayu, M.Si., Apt dan Suparman, M.Sc., Apt Latar Belakang : Indonesia sebagai negara dengan mayoritas penduduk beragama Islam selayaknya terus meningkatkan kualitas makanan sesuai dengan syariat Islam pada Quran surat An Nahl Ayat 115 yang mengharamkan daging babi. Pada peraturan pemerintah nomor 69 ahun 1999 pasal 10 mengatur pencantuman lebel halal pada produk makanan, namun masih ditemukan kasus pencampuran daging babi pada produk makanan. Salah satu produk makanan yang mempunyai potensi dicampur dengan daging babi adalah kornet daging sapi. Metode yang digunakan adalah Real-Time PCR menggunakan primer spesies spesifik DNA mitokondria ND5, metode tersebut mempunyai kelebihan dibandingkan dengan teknik PCR biasa, Real Time PCR memiliki waktu pengerjaan yang lebih cepat, akurasi dan sensitivitas yang lebih tinggi. Tujuan Penelitian : Penelitian ini bertujuan menganalisis adanya kandungan babi dalam kornet daging sapi yang dijual di wilayah Purwokerto melalui amplifikasi DNA menggunakan Real-Time PCR. Metode Penelitian : Jenis penelitian adalah non-eksperimental dan sampel produk yang di analisis menggunakan Real Time PCR di kumpulkan dari pasar tradisional dan swalayan di wilayah Purwokerto. Hasil : Pada Hasil analisis kualitatif elektroforesis gel agarosa menunjukkan DNA berhasil terisolasi dengan terlihatnya pita-pita (band) yang masing-masing sampel berbeda ketebalannya. Sampel pembanding yang dicampuri daging babi dengan konsentrasi 5%, 10%, 25% dan 50% berhasil teramplifikasi. Kurva amplifikasi Real Time PCR, 5 sampel produk kornet daging sapi di wilayah purwokerto tidak ada yang teramplifikasi atau tidak mengandung daging babi.. Kesimpulan : seluruh produk kornet daging sapi di wilayah Purwokerto tidak ada yang mengandung daging babi. Kata Kunci : halal haram, ND5 dan Real Time PCR v
Abstract Paradhita, ANALYSIS OF PORK CONTAIN IN BEEF CORNETS IN PURWOKERTO BY REAL TIME PCR METHOD Supervisor Wiranti Sri Rahayu, M.Si.,Apt and Suparman, M.Sc., Apt Background: Indonesia as Muslims country suppose increase food quality which is appropriate within Islam s.role in Quran surah An Nahl verse 115 which forbids pork. On government regulation number 69 ahun 1999 article 10 set inclusion halal labels on food products, but still found the case of mixing pork in food products. One of the food potential mixed with pork is beef cornet. The sample of the product analyzed by Real Time PCR taken from traditional market and supermarket in Purwokerto. The method used is a Real-Time PCR using primers specific species ND5 mitochondrial DNA, the method has advantages compared with regular PCR, Real Time PCR has a faster processing time, accuracy and higher sensitivity Objective: the purpose of his research is to analyze pork contaminations on the beef cornet sold in Purwokerto through DNA amplification using Real Time PCR. Method: this non-exsperimental research is using Real Time PCR uses specific species primer of DNA mitochondria ND5. The method is better than usual PCR, it is faster, more accurate and more sensitive than usual PCR. Results: On qualitative result analyzing of electrophoresis agarose gel shows that DNA isolated by seen of the bands which has different thickness in each. While comparator sample which mix pork in concentration of 5%, 10%, 25% and 50% are able to be amplified. Sample based on the Real Time PCR amplification curve, there are no amplifications or pork contaminations on five samples of beef cornet sold in Purwokerto. Conclusion: There are no pork contaminations in all of beef cornets sold in Purwokerto. Keywords: halal haram, ND5, Real time PCR. vi
PERSEMBAHAN Alhamdullilah puji syukur atas nikmat yang telah diberikan Allah SWT, yang senantiasa memberikan pertolongannya, motivasi serta energi yang luar biasa besar dalam menyelesaikan tahap demi tahap dalam skripsi ini. Maka dengan segala kerendahan hati dan dengan segenap energi, kupersembahkan skripsi ini untuk: Kedua Orang tuaku, yang teramat aku cintai, yang telah memberikan motivasi yang begitu luar biasa besar, yang telah berjuang keras untuk mensukseskan-ku dan membahagiakan hidupku, terimakasih atas kasih-sayang dan perjuangan yang luar biasa besar, yang telah diberikan untukku. Untuk kedua adik saya Laksmita Tanjung dan Monita Dea Delima untuk segenap dosen fakultas farmasiump, serta dosen pembimbingku yang telah mendidikku, dan memberikan motivasi, inspirasi serta semangat kegigihan yang luar biasa besar, bagi masa depan ku kelak. Fakultas Farmasi, semoga penelitian ini bisa menjadi pertimbangan untuk penelitian selanjutnya. Untuk seluruh sahabat bakso pekih dan sahabat ganesha yang sangat luar biasa memberikan saya support vii
PRAKATA Puji syukur kehadirat Allah SWT yang telah melimpahkan rahmat serta hidayahnya sehingga penulis dapat menyelesaikan penulisan skripsi yang berjudul Analisis Kandungan Babi pada Kornet Daging Sapi Di Wilayah Purwokerto dengan Metode Real time PCR. Skripsi ini disusun sebagai salah satu syarat untuk mencapai gelai Sarjana Farmasi di Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto. Penulis sepenuhnya menyadari bahwasanya terselesaikannya skripsi ini tidak terlepas dari bantuan berbagai pihak. Oleh karena itu penulis ingin mengucapkan rasa terimakasih kepada : 1. Dr. H Susilo Bambang Yudhoyono selaku Presiden Republik Indonesia. 2. Dr. Nunuk Aries Nurlita, M.Si., Apt selaku Dekan Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto. 3. Wiranti Sri Rahayu, M.Si., Apt selaku Pembimbing I yang telah memberikan bimbingan, saran dan petunjuk dalam penyusunan skripsi. 4. Suparman, M.Sc., Apt selaku Pembimbing II yang telah memberikan bimbingan, saran dan petunjuk dalam penyusunan skripsi. 5. Seluruh Dosen dan Staf Karyawan Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto. 6. Teman teman Farmasi angkatan 2009. 7. Teman teman seperjuangan penelitian handri, isna, lina, agil dan iim. 8. Seluruh sahabat BAKSO PEKIH handry, kukuh,aji, ihsan, toro, heru, budi, gilang yang selalu memberi keceriaan. 9. Sahabat Panican aditya rahman yang terus memberikan fasilitas sewaktu penelitian di Jogjakarta 10. Sahabat Ganesha lupus, Tony, yofi, ufan, ranti dan lain lain. 11. Kawan komunitas Stand up comedy Purwokerto yang selalu memeberikan tawa dan canda. viii
12. Untuk seseorang spesial selalu memberikan warna baru dalam langkah perjalanan saya. 13. Semua pihak yang telah membantu selama penulis melaksanakan penelitian dan penulisan skripsi ini hingga selesai yang tidak dapat disebutkan satu persatu. Penulis menyadari bahwa skripsi ini masih jauh dari kesempurnaan oleh karena itu saran dan kritik yang membangun sangat diharapkan demi penyempurnaannya. Semoga penelitian ini dapat bermanfaat bagi penulis khususnya dan pembaca umumnya. Purwokerto, 5 Juli 2013 Paradhita ix
RIWAYAT HIDUP A. IDENTITAS N a m a : Paradhita N I M : 0908010152 Tempat / Tanggal Lahir : Purbalingga / 18 Februari 1991 A g a m a : Islam Jenis Kelamin : Laki- laki A l a m a t : Panican Rt 19 Rw 07 Kec. Kemangkon Kab. Pubalingga B. RIWAYAT PENDIDIKAN 1. TK Pertiwi Panican : Lulus tahun 1997 2. SD 2 Panican : Lulus tahun 2003 3. SMP Negri 1 Purbalingga : Lulus tahun 2006 4. SMA Negri 1 Purbalingga : Lulus tahun 2009 5. Fakultas Farmasi UMP : 2009 - sekarang C. RIWAYAT PRESTASI 1. Juara 2 lomba Stand Up Comedy antar perguruan tinggi se- Jawa Tengan dalam rangka memperingati hari anti tembakau di UDINUS 2012 2. Juara 2 Stand Up Comedy Competation Amild Tasikmalaya 2012 3. Juara 3 stand Up Comedy Banyumasan koran Satelit Post Purwokerto 2012 D. RIWAYAT KELUARGA Nama orang tua : 1. Nama ayah : Sudiman (alm) 2. Nama ibu : Oneng Wakhyuni, S.Pd. x
DAFTAR ISI Halaman HALAMAN JUDUL. I HALAMAN PERSETUJUAN... Ii HALAMAN PERNYATAAN... Iii INTISARI.. Iv ABSTRACT.. V HALAMAN PERSEMBAHAN.. Vi PRAKATA Vii RIWAYAT HIDUP.. Viii DAFTAR ISI.. Ix DAFTAR TABEL. X DAFTAR GAMBAR. Xi DAFTAR LAMPIRAN. Xiv BAB I PENDAHULUAN.. 1 A. Latar Belakang... 1 B. Perumusan Masalah... 2 C. Tujuan Penelitian... 3 D. Manfaat Penelitian. 3 BAB II TINJAUAN PUSTAKA 4 A. Hewan Babi... 4 B. Hukum Daging Babi Dalam Islam... 4 C. Kornet Daging Sapi... 5 D. DNA... 6 E. Polymerase Chain Reaction ( PCR )... 7 F. Real Time PCR... 10 G. Elektroforesis Gel Agarosa 11 xi
BAB III METODE PENELITIAN.. 12 A. Jenis dan Rancangan Penelitian. 12 B. Waktu dan Tempat Penelitian 12 C. Bahan dan Alat Penelitian.. 12 D. Cara Penelitian... 13 E. Analisis Data.. 15 BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN. 16 A. Pengumpulan Sampel Kornet Bermerk... 16 B. Pembuatan kornet Daging Sapi dan daging Babi (Pembanding)... 16 C. Isolasi DNA... 16 D. Pengujian Kualitas DNA... 17 E. Pengujian Kuantitas DNA... 18 F. Amplifikasi DNA dengan Real Time PCR... 20 BAB V KESIMPULAN DAN SARAN 23 A. Kesimpulan 23 B. Saran.. 23 DAFTAR PUSTAKA 24 LAMPIRAN... 28 xii
DAFTAR TABEL Tabel 1. Hasil pengujian Kuantitas DNA... 19 xiii
DAFTAR GAMBAR Gambar 1. DNA mitokondria... 7 Gambar 2. Hasil Elektroforeasis... 17 Gambar 3. Kurva Amplifikasi DNA dengan Real Time PCR... 20 Gambar 4. Kurva Melt Curve... 22 xiv
DAFTAR LAMPIRAN Lampiran 1. Perhitungan konsentrasi DNA untuk Real Time PCR... 28 Lampiran 2. Tabel komposisi bahan master mix Real time PCR... 29 Lampiran 3. Gambar alat dan bahan... 30 xv