LAMPIRAN
17 Lampiran 1 Bagan alir penelitian Penyemaian benih galur BC 1 F 1 Isolasi DNA galur BC 1 F 1 Uji kualitatif dan kuantitatif DNA Analisis SSR Pemeliharaan tanaman hasil analisis SSR Pengamatan karakter agronomi Lampiran 2 Diagram persilangan x IR64-NILs- [YP1] x 1 F 1 25 BC 1 F 1 136 BC 1 F 1 5 BC 1 F 1 x BC 1 F 2 BC 2 F 1
18 Lampiran 3 Elektroforegram DNA padi RM5556 ( 1-25) 1 76 63 96 97 148 147 19 191 25
19 Lampiran 3 Elektroforegram DNA padi (Lanjutan) RM6838 ( 1-25) 1 73 61 96 97 154 155 19 191 223
2 Lampiran 3 Elektroforegram DNA padi (Lanjutan) 225 25 RM2582 ( 1-25) 1 69 61 96 97 154 155 19
21 Lampiran 3 Elektroforegram DNA padi (Lanjutan) 191 25 Lampiran 4 Informasi primer yang digunakan dalam penelitian Kromosom Lokus Sekuen RM5556 8 F-ATCTCCCTCCCTCTCCTCAC R-TCCACACCTTCACAGTTGAC RM6838 8 F-ATTAATACCGCTACCACGCG R-TCCTCCTCCACCTCAATCAC RM2582 6 Xa7 F-AGAGCGTCGTCCTTCACCATCC R-GGCCAATACGACGATACATTACACG Lampiran 5 Tabel scoring analisis molekuler padi BC 1 F 1 RM5556 RM6838 RM2582 RM5556 RM6838 RM2582 1 H H A 126 A H A 2 H H H 127 H A H 3 H H A 128 A H A 4 A A H 129 H H A 5 A A A 13 H A A 6 H H H 131 A A H 7 H H H 132 A A H 8 A A H 133 A A H 9 A H A 134 A H A 1 H H H 135 H A A 11 A A H 136 H A H 12 - - - 137 A A H 13 H H H 138 A H A 14 H H A 139 H A H 15 A A A 14 A A A 16 H H H 141 A A H 17 H H A 142 A A H 18 H H H 143 A H A 19 A A H 144 H A H 2 H H A 145 A H A 21 H H H 146 H A H 22 H H A 147 A H H 23 A A H 148 H H H 24 H A A 149 H H H 25 H H H 15 H H A 26 A H H 151 A A A 27 A A H 152 A A A
22 Lampiran 5 Tabel scoring analisis molekuler padi BC 1 F 1 (Lanjutan) RM5556 RM6838 RM2582 RM5556 RM6838 RM2582 28 A A H 153 H H A 29 H H A 154 H H H 3 H H A 155 H H H 31 A A A 156 A A A 32 H H A 157 A A A 33 H H A 158 H H A 34 H H H 159 A A A 35 H H A 16 H H H 36 H H A 161 H H A 37 A A A 162 A A H 38 A A A 163 A A H 39 H H A 164 A A H 4 - - - 165 H H A 41 H H H 166 H H H 42 A A H 167 H H A 43 H H A 168 H H A 44 H H H 169 H H A 45 A H A 17 A A A 46 H H H 171 A A A 47 A A H 172 A A H 48 H H H 173 H H H 49 A A A 174 H H A 5 H H A 175 A A A 51 A A A 176 H H H 52 A A H 177 H H A 53 A A A 178 A A A 54 H H A 179 H H H 55 A A H 18 A A H 56 H H A 181 A A H 57 A A H 182 A A H 58 A A A 183 A A H 59 H H A 184 H H A 6 A A H 185 H H H 61 H H A 186 H H A 62 A A A 187 A A A 63 H H A 188 H H A 64 A A A 189 H H A 65 A H H 19 H A A 66 A A H 191 A H H 67 A A H 192 A A H 68 A A A 193 H H H 69 H A H 194 H H A 7 A A H 195 H A A 71 H H A 196 A A A 72 H H H 197 H H H 73 A A H 198 H H A 74 H H H 199 H H H 75 H H A 2 A A H
23 Lampiran 5 Tabel scoring analisis molekuler padi BC 1 F 1 (Lanjutan) RM5556 RM6838 RM2582 RM5556 RM6838 RM2582 76 A A H 21 H A H 77 A A H 22 A A A 78 H H H 23 A A H 79 H H H 24 H A A 8 A A A 25 A A H 81 H A H 26 H H A 82 H H A 27 H H A 83 A A H 28 A A H 84 A A A 29 H H A 85 H H A 21 H H A 86 H H A 211 A A A 87 A A H 212 A A H 88 A A H 213 A A H 89 H H A 214 A A H 9 A A H 215 H H H 91 A A A 216 A A H 92 H H A 217 H H H 93 H H A 218 A A H 94 A A A 219 H H A 95 H H A 22 A A A 96 H A A 221 H H H 97 H H A 222 A A A 98 H H H 223 A H H 99 H H A 224 - - - 1 A A H 225 A H H 11 A A A 226 H B A 12 A A H 227 A B H 13 A A H 228 A A H 14 H H H 229 A A A 15 A A H 23 A A A 16 A A A 231 H H A 17 H H H 232 H H A 18 A A H 233 A A A 19 A A H 234 H H A 11 H H A 235 H H H 111 A A H 236 H H A 112 A A A 237 H H A 113 H H A 238 H H A 114 H H H 239 H H A 115 H H H 24 A A A 116 A A A 241 H H H 117 H H A 242 H H A 118 A A H 243 A A H 119 H H H 244 A A H 12 H H H 245 H H A 121 A B A 246 A A A 122 H H H 247 H A A 123 A A H 248 H H H
24 Lampiran 5 Tabel scoring analisis molekuler padi BC 1 F 1 (Lanjutan) RM5556 RM6838 RM2582 RM5556 RM6838 RM2582 124 A H A 249 A H H 125 H A H 25 A A H Keterangan: A = Genotipe B = Genotipe IR64-NILs- H = Heterozigot - = Kosong Lampiran 6 Sebaran Data Karakter Agronomi BC 1 F 1 6 5 4 3 2 1 75 8 85 9 95 1 15 6 5 4 3 2 1 6 1 14 18 22 26 3 Tinggi Tanaman (cm) Jumlah Anakan Total 5 4 3 2 1 5 8 11 14 17 2 23 12 1 8 6 4 2 74 75 76 77 78 79 8 Jumlah Anakan Produktif Umur Berbunga (Hari) 5 4 3 2 1 22 23 24 25 26 27 28 4 3 2 1 7 8 9 1 11 12 13 Panjang Malai (cm) Jumlah Gabah Isi 8 6 4 2 1 2 3 4 5 6 8 6 4 2 1 2 3 4 5 6 Jumlah Gabah Hampa Berat Gabah Total (gram)
25 Lampiran 7 Analisis varian (ANOVA) dan uji lanjut Dunnett terhadap data pengamatan karakter agronomis (panjang malai, jumlah gabah isi, jumlah gabah hampa, dan bobot gabah 1 butir) beberapa galur BC 1 F 1 Karakter: Panjang Malai (PM) Sumber Df Jumlah kuadrat Kuadrat tengah F Pr>F Model 136 545.93 4.1 2.7 <.1 Kesalahan 274 47.53 1.48 Total terkoreksi 41 953.47 R-Kuadrat Ragam koefisien MSE Root Rata-rata PM.57 4.87 1.21 25 Sumber df Jumlah kuadrat Kuadrat tengah F Pr>F Perlakuan 136 545.93 4.1 2.7 <.1 Karakter: Jumlah Gabah Isi (JGI) Sumber Df Jumlah kuadrat Kuadrat tengah F Pr>F Model 136 11995.57 749.96 2.49 <.1 Kesalahan 274 82412. 3.77 Total terkoreksi 41 18447.57 R-Kuadrat Ragam koefisien MSE Root Rata-rata JGI.55 16.32 17.34 16.23 Sumber Df Jumlah kuadrat Kuadrat tengah F Pr>F Perlakuan 136 11995.57 749.96 2.49 <.1 Karakter: Jumlah Gabah Hampa (JGH) Sumber Df Jumlah kuadrat Kuadrat tengah F Pr>F Model 136 52125.44 383.27 4.85 <.1 Kesalahan 274 21662.67 79.6 Total terkoreksi 41 73788.1 R-Kuadrat Ragam koefisien MSE Root Rata-rata JGH.7 42.53 8.89 2.9 Sumber df Jumlah kuadrat Kuadrat tengah F Pr>F Perlakuan 136 52125.44 383.27 4.85 <.1 Karakter: Berat Gabah 1 Butir (BG) Sumber df Jumlah kuadrat Kuadrat tengah F Pr>F Model 136 75.25.55 2.71 <.1 Kesalahan 274 55.91.2 Total terkoreksi 41 131.17 R-Kuadrat Ragam koefisien MSE Root Rata-rata BG.57 17.4.45 2.65
26 Lampiran 7 Analisis varian (ANOVA) dan uji lanjut Dunnett terhadap data pengamatan karakter agronomis (panjang malai, jumlah gabah isi, jumlah gabah hampa, dan bobot gabah 1 butir) beberapa galur BC 1 F 1 (Lanjutan) Sumber df Jumlah kuadrat Kuadrat tengah F Pr>F Perlakuan 136 75.25.55 2.71 <.1 Uji lanjut Dunnett Galur BC 1 F 1 Panjang malai (cm) Jumlah gabah isi (butir) Jumlah gabah hampa (butir) Berat gabah 1 butir (gram) 3 26.17 126 43 a+ 2.53 8 26.83 124 48 a+ 2.64 26 24.83 9 45 a+ 2.4 27 25. 19 44 a+ 2.54 31 22.83 a- 5 a- 52 a+ 2.47 a- 32 22.83 a- 93 35 2.57 41 23.33 99 44 a+ 2.52 55 26.17 119 51 a+ 2.56 98 26.5 114 49 a+ 2.58 1 25.67 118 44 a+ 2.53 11 22.83 a- 99 4 2.52 129 22.17 a- 88 16 2.44 Keterangan: Angka yang diikuti huruf a + dan a - berbeda nyata lebih tinggi dan lebih rendah dari tetua berdasarkan uji Dunnett pada taraf nyata 5%.