ISOLASI DAN KARAKTERISASI PROTEASE DARI BAKTERI TANAH RAWA INDRALAYA, SUMATERA SELATAN

dokumen-dokumen yang mirip
ISOLASI DAN KARAKTERISASI PROTEASE DARI BAKTERI TANAH RAWA INDRALAYA, SUMATERA SELATAN

KARAKTERISASI PROTEASE DARI ISOLAT BAKTERI ASAL TUMBUHAN RAWA DARI INDRALAYA

Isolasi Bakteri dan Karakterisasi Protease dari Sumber Air Rawa Indralaya

KARAKTERISTIK PROTEASE DARI BAKTERI PATOGEN Staphylococcus epidermidis

KARAKTERISASI PROTEASE DARI BAKTERI Aeromonas hydrophila

IURNAL PENGOLAHAN HA'IL PERIKANAN INDONE'IA

PURIFIKASI DAN KARAKTERISASI PROTEASE DARI BAKTERI PATOGEN Pseudomonas aeruginosa

BAHAN DAN METODE Tempat dan Waktu Bahan Pertumbuhan dan Peremajaan Isolat Pengamatan Morfologi Isolat B. thuringiensis

LAMPIRAN. Lampiran 1. Foto Lokasi Pengambilan Sampel Air Panas Pacet Mojokerto

PURIFIKASI DAN KARAKTERISASI PROTEASE DARI BAKTERI PATOGEN Pseudomonas aeruginosa

Analisis kadar protein

Lampiran 1 Metode pengujian aktivitas protease (Walter 1984)

III. METODE PERCOBAAN. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Februari sampai April 2014 di

4 Hasil dan Pembahasan

TERHADAP PRODUKSI INHIBITOR PROTEASE YANG DIHASILKAN OLEH

Lampiran 1 Prosedur uji aktivitas protease (Walter 1984, modifikasi)

IV. HASIL DAN PEMBAHASAN

4 Hasil dan Pembahasan

BAB III METODE PENELITIAN. Biologi dan Laboratorium Biokimia, Departemen Kimia Fakultas Sains dan

4 HASIL DAN PEMBAHASAN

Metode Pengukuran Spektrofotometri (Bergmeyer et al. 1974) Pembuatan Media Heterotrof Media Heterotrof Padat. Pengaruh ph, Suhu, Konsentrasi dan

IV. HASIL DAN PEMBAHASAN. Enzim α-amilase dari Bacillus Subtilis ITBCCB148 diperoleh dengan

3. METODOLOGI 3.1 Waktu dan Tempat Penelitian 3.2 Alat dan Bahan

I. METODOLOGI PENELITIAN. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan April - Juli 2012 di Laboratorium. Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Lampung.

BAB III METODE PENELITIAN. A. Waktu dan Tempat Penelitian. Penelitian dilaksanakan pada bulan Maret-November 2012 di

4. HASIL DAN PEMBASAN

BAB III BAHAN DAN CARA KERJA. Penelitian dilakukan di Laboratorium Teknologi Bioindustri, Pusat

PRODUKSI ENZIM AMILASE

PENGARUH KONSENTRASI SUMBER KARBON DAN NITROGEN TERHADAP PRODUKSI PROTEASE ALKALI DARI Bacillus sp. M TERMOFILIK

Molekul, Vol. 6. No. 2. Nopember, 2011: AMOBILISASI PROTEASE DARI Bacillus sp. BT 1 MENGGUNAKAN POLIAKRILAMIDA. Zusfahair* dan Amin Fatoni

III. BAHAN DAN METODE

BAB 1 PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang Masalah

KARAKTERISASI BEBERAPA ION LOGAM TERHADAP AKTIVITAS ENZIM TRIPSIN (THE CHARACTERIZATION OF SEVERAL METAL IONS TOWARDS THE ENZYME TRYPSIN ACTIVITY)

AKTIVITAS ENZIM PROTEASE DALAM LAMBUNG DAN USUS IKAN KERAPU MACAN SETELAH PEMBERIAN PAKAN

HASIL DAN PEMBAHASAN. Pemilahan Isolat Penghasil Kolagenase Tertinggi

3. METODOLOGI 3.1 Pelaksanaan Penelitian 3.2 Bahan dan Alat Penelitian

Kata kunci: Acinetobacter, inhibitor protease, produksi, simbiosis sponge,

PENGARUH AKTIVATOR SISTEIN DAN NATRIUM KLORIDA TERHADAP AKTIVITAS PAPAIN

BAB III METODE PENELITIAN. Alat-alat yang digunakan dalam penelitian ini, antara lain: waterbath,

Isolasi Dan Karakterisasi Bakteri Termo-Proteolitik Sumber Air Panas Sungai Medang, Sungai Penuh, Jambi

PENGARUH PENAMBAHAN ZnSO 4 TERHADAP AKTIVITAS ENZIM TRIPSIN

LAMPIRAN Lampiran 1: Komposisi dan Penyiapan Media Skim Milk Agar, Komposisi Media Feather Meal Agar, Komposisi Media Garam Cair.

BAB III METODE PENELITIAN. Rancangan penelitian yang digunakan adalah rancangan penelitian deskriptif

3. METODOLOGI 3.1 Waktu dan Tempat Penelitian 3.2. Alat dan Bahan 3.3 Metode Penelitian

LACTOBACILLUS BULGARICUS SEBAGAI PROBIOTIK GUNA PENINGKATAN KUALITAS AMPAS TAHU UNTUK PAKAN CACING TANAH

THE ADDITION EFFECT OF THE METAL ION K + ON THE PAPAIN ENZYME ACTIVITIES

BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN. pemotongan hewan Pacar Keling, Surabaya. dengan waktu pengamatan setiap 4 jam

BAB III METODOLOGI PENELITIAN. Percobaan yang dilakukan pada penelitian ini yaitu penggunaan amonium

METODOLOGI PENELITIAN. Penelitian ini dilakukan pada bulan April 2012 sampai dengan bulan Juni 2012 di

I. PENDAHULUAN. meningkat dari tahun ke tahun, peningkatan diperkirakan mencapai 10 15% per

BAB III METODE PENELITIAN. adalah Bacillus subtilis dan Bacillus cereus yang diperoleh di Laboratorium

PURIFIKASI DAN KARAKTERISASI PROTEASE DARI BAKTERI HASIL ISOLASI DARI WHEY TAHU

Pengaruh Faktor Abiotik terhadap Produksi Protease dari Isolat Bakteri M1-23

1 ml enzim + 1 ml larutan pati 1% (dalam bufer) Diinkubasi (suhu optimum, 15 menit) + 2 ml DNS. Dididihkan 5 menit. Didinginkan 5 menit

Pengaruh Penambahan CaCl 2 Terhadap Produksi Enzim Protease dari Bacillus licheniformis HSA3-1a

PENGUJIAN STABILITAS ENZIM BROMELIN YANG DIISOLASI DARI BONGGOL NANAS SERTA IMOBILISASI MENGGUNAKAN KAPPA KARAGENAN

BAB III METODE PENELITIAN. Jurusan Biologi Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri Maulana

DETERMINATION of OPTIMUM CONDITION of PAPAIN ENZYME FROM PAPAYA VAR JAVA (Carica papaya )

Aktivitas Proteolitik Lactobacillus acidophilus dalam Fermentasi Susu Sapi

PENGARUH PENAMBAHAN SORBITOL TERHADAP STABILITAS ph ENZIM PROTEASE DARI Bacillus subtilis ITBCCB148

METODOLOGI Waktu dan Tempat Penelitian Bahan dan Alat

PEMURNIAN DAN KARAKTERISASI PROTEASE INTRASELULER DARI BAKTERI Pseudomonas cocovenenans B 154

PENGARUH SUHU PADA PROTEASE DARI Bacillus subtilis. Mukhamad Kosim a, Surya Rosa Putra

3. METODE 3.1 Waktu dan Tempat 3.2 Bahan dan Alat

BAB III BAHAN, ALAT DAN METODA

BAB III METODE PENELITIAN

III. METODOLOGI PENELITIAN. Penelitian ini dilakukan pada bulan Juli 2012 sampai bulan Desember 2012 di

Penyerapan Logam Berat Timbal (PB) Dengan Enzim Protease Dari Bakteri Bacillus Subtilis

Karakterisasi Protease Ekstrak Kasar Bacillus sp 31. Characterization of Crude Protease Bacillus sp 31

III. METODE. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Januari-April 2015 di Laboratorium

III. METODE. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Januari - April 2015 di Laboratorium

BAB I PENDAHULUAN. 1.1 Latar Belakang

4 Hasil dan Pembahasan

3 Metode Penelitian Alat

III. METODE PENELITIAN. Penelitian dilakukan di Laboratorium Biokimia dan Laboratorium Instrumentasi

HASIL DAN PEMBAHASAN. Hasil Produksi Enzim β-galaktosidase dari Enterobacter cloacae

Sampel air panas. Pengenceran 10-1

BAB I PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang Masalah

BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN. 4.1 Pengaruh Suhu Terhadap Aktivitas Enzim Protease dari Penicillium sp.

Bab IV Hasil dan Pembahasan

PENAPISAN DAN KARAKTERISASI PROTEASE BAKTERI TERMOFILIK ASAL MATA AIR LAUT PANAS POSO SULAWESI TENGAH ABSTRAK

UJI AKTIVITAS ENZIM PROTEASE DARI ISOLAT Bacillus sp. GALUR LOKAL RIAU

Protein ENZIM Mempercepat reaksi dengan jalan menurunkan tenaga aktivasi Tidak mengubah kesetimbangan reaksi Sangat spesifik

III. METODE PENELITIAN. Penelitian ini dilakukan di Laboratorium Mikrobiologi Jurusan Biologi

BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN. 1. Hasil pengukuran Nilai OD pada Media NB. Tabel 1. Pengukuran Nilai OD pada Media NB. Waktu OD (Optical Density)

BAB IV. HASIL PENELITIAN

BAB III METODE PENELITIAN. Pendidikan Biologi FPMIPA UPI dan protease Bacillus pumilus yang diperoleh

III. METODE PENELITIAN. Waktu penelitian dilakukan pada bulan Februari Oktober. penelitian dilakukan di Laboratorium Biokimia Universitas Lampung.

Lampiran 1 Lokasi pengambilan sampel tanah di Pulau Gili Meno, Lombok Utara

Isolasi dan uji aktivitas protease dari aktinobakteri isolat lokal (AKJ-09) Aceh

ISOLASI DAN KARAKTERISASI AMILASE DARI BIJI DURIAN (DURIO

MATERI DAN METODE Lokasi dan Waktu Materi Prosedur Karakterisasi Isolat L. plantarum dan Bakteri Indikator

III. METODOLOGI PENELITIAN. Penelitianini dilaksanakandaribulanagustus - Desember 2015 di

Bab IV Hasil dan Pembahasan

Purifikasi dan Karakterisasi Protease Yang Dihasilkan Lactobacillus acidophilus dalam Fermentasi Susu Sapi Perah. Oleh:

Aktivitas Protease Dari Bacillus circulans Pada Media Pertumbuhan Dengan ph Tidak Terkontrol

III. METODOLOGI PENELITIAN. Penelitian ini dilakukan pada bulan Juni-November Penelitian ini

PRODUKSI ENZIM MANANASE

III. METODE PENELITIAN

BAB III METODE PENELITIAN. dengan mengadakan manipulasi terhadap objek penelitian serta adanya kontrol

Transkripsi:

ISOLASI DAN KARAKTERISASI PROTEASE DARI BAKTERI TANAH RAWA INDRALAYA, SUMATERA SELATAN [Isolation and Characterization Protease from Indralaya Soil Swamp Bacteria, South Sumatera] Ace Baehaki *, Rinto, Arief Budiman Program Studi Teknologi Hasil Perikanan, Fakultas Pertanian Universitas Sriwijaya Diterima 25 November 2009 / Disetujui 12 Agustus 2011 ABSTRACT In an effort of obtaining indigenous protease producing bacteria, screening bacterial protease was conducted from samples collected from Indralaya soil swamp, South Sumatera. Three of 31 colonies showed high protease activity with proteolytic index >1.00. T1S1 produced enzyme with the highest activity. The crude enzyme activity after 48 hours incubation was 0.391 IU/ml. The optimum ph of the extraceluller proteases from T1S1, T3S2 and T3S3 were 8.0, 8.0, and 7.5, respectively. The optimum temperature of T1S1, T3S2 and T3S3 proteases were 40, 50, and 50 0 C, respectively. All metal ions tested (Na +, K +, Mn 2+, Zn 2+ and Fe 2+ ) inhibited proteases except Fe 2+ which activates the T3S3 protease at 5 mm. EDTA (1 and 5 mm) inhibited all proteases. Study on the effect of metals ion and spesific inhibitors indicated that all protease are metaloprotease. Moleculer weights was determinited using SDS-PAGE and zymogram technique. The moleculer weight of T1S1 protease was 121 kd, whereas for T3S2 protease were 51, 71, and 119 kd and T3S3 protease were 49, 70, and 116 kd. Key words: Protease, isolation, characterization, bacteria 1PENDAHULUAN Protease merupakan satu diantara tiga kelompok enzim komersial yang diperdagangkan dengan nilai mencapai 60% total penjualan enzim yang aplikasinya sebagai katalisator hayati, digunakan didalam industri pangan, detergen dan kulit (Suhartono, 2000). Protease memegang peran utama didalam banyak fungsi hayati, mulai dari tingkat sel, organ sampai organisme, yaitu dalam melangsungkan reaksi metabolisme, fungsi regulasi dan reaksi-reaksi yang menghasilkan sistem berantai (cascade) untuk menjaga normal homeostatis maupun kondisi patofisiologis abnormal serta proses kematian sel terencana (Rao at al, 1998). Dalam dasa warsa terakhir ini terjadi peningkatan lebih pesat dalam pemakaian enzim karena sifatnya yang efisien, selektif, mengkatalisis reaksi tanpa produk samping dan ramah lingkungan. Salah satu sumber protease adalah mikroba. Protease mikroba dapat diklasifikasikan sebagai protease serin (E.C. 3.4.21), protease sulfhydril (E.C.3.4.22), protease asam (E.C.3.4.23) dan metaloprotease (E.C.3.4.24). Beberapa mikroorganisme yang telah diketahui sebagai penghasil protease untuk aplikasi komersial adalah Bacillus, Lactobacillus, Pyrococcus, Termonospora Rhizopus, Mucor, Endothia and Aspergillus (Rao, et al., 1998; Ward et al., 2009). Begitu pentingnya enzim ini sehingga perlu mencari enzim dari mikroba dengan habitat yang berbeda sehingga diharapkan enzim yang dihasilkan memiliki karakter yang unik untuk memenuhi kebutuhan industri baik industri produk pertanian, kimia dan medis. Salah satu sumber enzim ini adalah mikroba dari rawa Indralaya, Sumatera Selatan dimana daerah ini 1 Korespondensi Penulis : Email : ace76_none@yahoo.com 37 memiliki rawa yang luas yang memungkinkan terdapatnya beranekaragam mikroba yang berpotensi menghasilkan enzim. METODOLOGI Bahan dan Alat Bahan utama adalah tiga isolat bakteri yang memiliki indeks proteolitik yang tinggi dari hasil pemilhan dari tanah rawa Indralaya, Sumatera Selatan. Bahan kimia penting yang digunakan adalah kasein hammersten (merck), standar L-tirosin (merck), pereaksi elektroforesis SDS-PAGE dan zimogram. Alat utama yang digunakan adalah sentrifugasi dingin model MRX- 152, spektrofotometer Phramacia LKB-Novaspec II dan inkubator model Certomat WR. Metode Isolasi Mikroba Rawa Isolasi mikroba dilakukan dengan mengambil sampel tanah rawa dari daerah Indralaya Sumatera Selatan secara aseptik. Sampel sebanyak 0,1 ml ditumbuhkan dalam cawan petri dengan media Luria Bertani Agar (LBA) yang sebelumnya dilakukan pengenceran dari 10-1 sampai 10-5 untuk mendapatkan biakan bakteri murni, selanjutnya diinkubasi pada suhu 37 0 C. Uji Proteolitik Uji proteolitik dilakukan dengan menggunakan media skim milk agar (SMA) yaitu media LBA yang ditambah dengan susu skim 2%. Isolat ditusukkan dalam media SMA, lalu diinkubasi selama 24 jam pada suhu 37 0 C. Aktivitas proteolitik dari bakteri rawa yang ditumbuhkan pada media SMA ditunjukan dengan terlihatnya areal bening yang muncul di sekitar koloni yang

terbentuk. Indeks proteolitik dihitung dengan cara mengukur diameter areal bening dan diameter koloni bakteri. Perhitungan indeks proteolitik adalah perbandingan diameter areal bening dengan diameter koloni bakteri. Penentuan Waktu Optimum Produksi Protease Bakteri diinokulasi sebanyak 1-2 ose pada media Luria Bertani Broth (LB) dengan komposisi tripton 1%, NaCl 1% dan yeast extract 0,5%. Proses diawali dengan penentuan umur prekultur produksi protease (dalam media LB). Produksi protease dilakukan pada suhu 37 0 C. Pengamatan dilakukan dengan mengukur optical density (OD) sampai nilai OD = 0,8 pada λ = 620 nm. Media LB yang sudah mempunyai OD = 0,8 diambil 10% dari jumlah media kemudian ditambahkan pada media LB yang baru sebagai media untuk memproduksi protease. Pengambilan sampel dilakukan setiap 8 jam selama 64 jam dan diukur nilai OD, aktivitas protease dan kadar protein. Ekstraksi enzim protease dilakukan dengan cara sentrifugasi media pertumbuhan bakteri dengan kecepatan 3000 rpm selama 15 menit pada suhu 4 0 C. Dengan teknik ini, sel akan mengendap oleh adanya gaya gravitasi sedangkan enzim tetap terdapat pada supernatan. Supernatan sebagai sampel diuji aktivitas protease dan kadar proteinnya. Pengukuran Aktivitas Protease Aktivitas protease diukur dengan metode Bergmeyer et al. (1983) dengan menggunakan substrat kasein Hammerstein 2% (b/v). Prosedur pengujian aktivitas protease adalah: mereaksikan 0,2 ml enzim dengan 1 ml substrat kasein Hammerstein dan 1 ml bufer. Campuran reaksi diinkubasi pada suhu 37 0 C selama 10 menit, kemudian ditambahkan 0,2 M TCA. Selanjutnya larutan diinkubasi kembali pada suhu 37 0 C selama 10 menit, dilanjutkan dengan sentrifugasi pada kecepatan 5000 rpm 10 menit. Dari campuran hasil sentrifugasi diambil supernatan dan ditambahkan ke dalam tabung reaksi yang berisi Na2CO3 0,4 M kemudian ditambahkan pereaksi folin Ciocalteau (1:2) dan diinkubasi pada suhu 37 0 C selama 20 menit. Hasil inkubasi diukur dengan spektrofotometer pada λ=578 nm. Satu unit aktivitas protease didefinisikan sebagai jumlah enzim yang dapat menghasilkan satu µmol produk tirosin per menit pada kondisi optimum pengukuran. Pengukuran Kadar Protein Kadar protein ditentukan dengan metode Bradford (1976) menggunakan Bovine Serum Albumin (BSA) Fraction V sebagai standar protein. Sebanyak 100 mg BSA ditimbang dan ditambahkan 25 ml aquades. Larutan kemudian dikocok pelanpelan, setelah larut, diencerkan sampai 50 ml. Konsentrasi akhir larutan stok untuk standar ini adalah 2 mg/ml. Kemudian sederetan larutan standar dibuat dengan menggunakan larutan stok di atas. Langkah selanjutnya adalah memipet masingmasing larutan sampel dalam tiap tabung sebanyak 0,1 ml dan sebanyak 5 ml pereaksi Bradford ditambahkan ke dalam masing-masing tabung reaksi. Blanko dibuat dengan cara mencampurkan 0,1 ml dan direaksikan dengan 5 ml pereaksi Bradford. Setelah sekitar 5 menit, masing-masing campuran reaksi diukur absorbansinya pada λ= 595 nm. Karakterisasi protease Uji karakterisasi protease yang meliputi pengaruh ph (6,5; 7; 7,5; 8; 8,5; 9), pengaruh suhu (30; 40; 50; 60; 70 0 C), ion logam (NaCl; KCl; MnCl2; ZnCl2 dan FeCl2) dan inhibitor spesifik (EDTA) dilakukan menggunakan buffer Tris-HCl. Konsentrasi ion logam dan inhibitor spesifik yang digunakan masing-masing adalah 1 dan 5 mm. Penentuan Berat Molekul Penentuan berat molekul dilakukan menggunakan SDS PAGE (Laemmli 1970) dan zimogram (Choi et al., 2001). Pada metode SDS PAGE, pewarnaan dilakukan dengan silver staining yaitu : gel direndam dalam larutan fikasasi (25% metanol dan 12% asam asetat) selama 1 jam kemudian direndam dalam 50% etanol selama 20 menit, kemudian diganti dengan 30% etanol selama 2 x 20 menit, larutannya diganti dengan enhancer kemudian dicuci dengan akuadestilata, setelah dicuci ditambahkan larutan silver nitrat selama 30 menit kemudian dicuci lagi dengan akuadestilata 2 x 20 detik dan ditambahkan larutan campuran Na2CO3 dan formaldehida dan terakhir dengan larutan fiksasi. Prosedur zimogram adalah: gel akrilamid 8% dikopolimerisasi dengan substrat kasein 2%, selanjutnya gel dilakukan elektroforesis, gel direndam dengan Triton X-100 2,5% selama 1 jam dan dilakukan inkubasi dalam buffer Tris-Cl 10 mm, ph 8 selama 24 jam. Setelah diinkubasi gel diwarnai dengan pewarna comassie brilliant blue R-250. HASIL DAN PEMBAHASAN Sifat Proteolitik Isolasi Bakteri Penghasil Protease Pada proses isolasi didapatkan 31 isolat, yang kemudian diuji indeks proteolitiknya. Aktivitas proteolitik dari bakteri rawa yang ditumbuhkan pada media SMA terlihat dari adanya areal bening di sekitar koloni yang terbentuk. Indeks proteolitik bakteri dari tanah (lumpur) rawa Indralaya yang mempunyai nilai lebih besar dari 1 dipilih untuk dianalisis aktivitas proteasenya (Tabel 1). Tabel 1. Hasil uji proteolitik bakteri dari tanah rawa Isolat Indeks proteolitik T1S1 1,1 T3S3 1,5 T3S2 2,0 Waktu Optimum Produksi Protease Hasil waktu optimum produksi protease dari isolat bakteri tanah rawa ini dapat dilihat pada Gambar 1. Gambar A 38

Gambar B Gambar C Gambar 1. Waktu produksi optimum protease dari isolat bakteri tanah rawa (A= isolat T1S1, B=T3S2 dan C=T3S3) Produksi protease dari bakteri air rawa memiliki waktu produksi optimum untuk isolat T1S1 dan T3S2 adalah 48 jam dan untuk isolat T3S3 adalah 56 jam pada suhu 37 0 C. Protease isolat T1S1 memiliki aktivitas tertinggi (0,391 U/ml) setelah diinkubasi selama 48 jam dalam media LB, protease diproduksi seiring dengan pertumbuhan sel dan mencapai aktivitas tertinggi pada fase stasioner. Pada Gambar 1 tampak bahwa protease isolat T3S2 memiliki aktivitas tertinggi (0,385 U/ml) setelah diinkubasi selama 48 jam pada suhu 37 0 C, protease diproduksi pada fase menjelang penurunan sel bakteri. Untuk protease isolat T3S3 memiliki waktu produksi optimum selama 56 jam pada 37 0 C dengan aktivitas tertinggi 0,320 U/ml. Penelitian lain pada produksi protease bakteri didapatkan bakteri dengan waktu produksi protease optimum yang sama dengan protease isolat T1S1 dan T3S2 (48 jam) adalah Bacillus subtilis PE-11 (Adinarayana et al, 2003) dan Bacillus licheniformis Lbbl-11 (Olajuyigbe and Ajele 2008). Karakter Ekstrak Kasar Protease Pengaruh ph Profil aktivitas ph dari suatu enzim menggambarkan ph pada saat gugus pemberi atau penerima proton yang penting pada sisi katalitik enzim berada dalam tingkat ionisasi yang diinginkan. Gambar 2 memperlihatkan ph optimum aktivitas protease isolat bakteri tanah rawa. Gambar 2. Pengaruh ph pada aktivitas protease dari isolat bakteri tanah rawa Protease dari isolat T1S1 dan T2S3 memiliki ph optimum 8 sedangkan isolat T3S3 memiliki ph optimum 7,5. Vazquez et al. (2008) melaporkan protease Psudoalteromonas sp strain P96-47 yang berasal dari laut Antartik memiliki ph optimum 7-9. Protease dari bakteri laut Alteromonas sp strain O-7 memiliki ph optimum 10 (Miyamoto et al., 2002). Protease bakteri Pseudomonas aeruginosa memiliki ph yang sama dengan isolat T1S1 dan T3S2 yaitu pada ph 8 (Baehaki et al., 2008). Diperkirakan perubahan keaktivan enzim diakibatkan oleh ionisasi pada gugus ionik enzim, pada sisi aktifnya atau sisi lain yang secara tidak langsung mempengaruhi sisi aktif. Gugus ionik berperan dalam menjaga konformasi sisi aktif dalam mengikat substrat dan dalam mengubah substrat menjadi produk. Ionisasi juga dapat dialami oleh substrat atau kompleks enzim-substrat, yang juga berpengaruh terhadap aktivitas enzim (Muchtadi et al., 1996). Perubahan ph yang ekstrim, enzim dapat mengalami denaturasi akibat gangguan terhadap berbagai interaksi non kovalen yang menjaga kestabilan struktur 3 dimensi enzim (Hames dan Hooper, 2000) Pengaruh Suhu Pada umumnya setiap enzim memiliki aktivitas maksimum pada suhu tertentu, aktivitas enzim akan semakin meningkat dengan bertambahnya suhu sampai suhu optimum tercapai. Setelah itu kenaikan lebih lanjut akan menyebabkan aktivitas enzim menurun. Pengaruh suhu terhadap aktivitas protease dari isolat bakteri tanah rawa terdapat pada Gambar 3. Gambar 3. Pengaruh suhu pada aktivitas protease dari isolat bakteri tanah rawa Suhu optimum protease isolat T1S1 dan T3S3 adalah 50 0 C, sedangkan isolat T2S3 memiliki suhu optimum 40 0 C. Hasil 39

tersebut menunjukkan bahwa protease yang berasal dari isolat T1S1 dan T3S3 bersifat tahan panas sehingga dapat diaplikasikan pada proses produksi yang menggunakan suhu 50 0 C. Penelitian protease bakteri lain menujukkan bakteri yang berasal dari perairan memiliki suhu optimum yang tinggi, yaitu protease bakteri laut Alteromonas sp strain O7 memiliki suhu optimum 60 0 C (Miyamoto et al., 2002), protease Chromohalobacter memiliki suhu optimum 75 0 C (Vidyasagar et al., 2009), dan protease Pseudoalteromonas sp strain P96-47 dari laut Artartik yang memiliki suhu optimum 45 0 C (Vazquez et al., 2008). Gambar 3 menunjukkan aktivitas protease semakin meningkat dengan bertambahnya suhu sampai suhu optimum tercapai, setelah itu kenaikan lebih lanjut akan menyebabkan aktivitas protease menurun. Pada suhu yang lebih rendah dari suhu optimum, aktivitas enzim juga rendah, hal ini disebabkan rendahnya energi aktivasi yang tersedia. Energi tersebut dibutuhkan untuk menciptakan kondisi tingkat kompleks aktif, baik dari molekul enzim maupun dari molekul substrat. Peningkatan suhu juga berpengaruh terhadap perubahan konformasi substrat sehingga sisi aktif substrat mengalami hambatan untuk memasuki sisi aktif enzim dan menyebabkan turunnya aktivitas enzim. Kedua, peningkatan energi termal molekul yang membentuk struktur protein enzim itu sendiri menyebabkan rusaknya interaksi-interaksi non kovalen (ikatan hidrogen, ikatan van der walls, ikatan hidrofobik dan interaksi elektrostatik) yang menjaga struktur 3D enzim secara bersamasama sehingga enzim mengalami denaturasi. Denaturasi menyebabkan struktur lipatan enzim membuka pada bagian permukaannya sehingga sisi aktif enzim berubah dan mengakibatkan terjadi penurunan aktivitas enzim (Hames & Hooper, 2000). Pengaruh ion logam dan inhibitor spesifik Beberapa enzim membutuhkan ion logam sebagai kofaktor untuk mendukung efisiensi katalitik enzim. Logam tersebut membantu reaksi katalitik dengan cara mengikat substrat pada sisi pemotongan. Selain berperan dalam pengikatan enzim dengan substrat, beberapa logam juga dapat mengikat enzim secara langsung untuk menstabilkan konformasi aktifnya atau menginduksi formasi situs pengikatan atau situs aktif suatu enzim. Gambar 4 memperlihatkan pengaruh ion logam terhadap aktivitas protease isolat bakteri tanah rawa. Aktifitas Protease Relatif (%) 120 100 80 60 40 20 0 Aktivitas Protease Relatif (%) 140 120 100 80 60 40 20 0 Gambar B Kontrol FeCl2 KCl MnCl2 ZnCl2 Ion Logam Gambar C Kontrol FeCl2 KCl MnCl2 ZnCl2 Ion Logam 1 mm 5 mm 1 mm 5 nm Gambar 4. Pengaruh ion logam pada protease dari isolat bakteri tanah rawa (A= isolat T1S1, B=T3S2 dan C=T3S3) Semua ion logam yang yang ditambahkan berfungsi inhibitor kecuali Fe 2+ (5 mm) sebagai aktivator terhadap protease T3S3 (Gambar 4C). Sebagian besar ion logam yang ditambahkan dapat menghambat aktivitas protease. Adanya penghambatan ion logam terhadap aktivitas protease pada konsentrasi tertentu berkaitan dengan kekuatan ion, dimana kekuatan ion itu sendiri mempengaruhi konformasi atau struktur tiga dimensi dari protein enzim atau protein substrat (Suhartono 1989). Dari pengaruh ion logam terhadap aktivitas protease hanya ion logam Fe 2+ (5 mm) sebagai aktivator terhadap protease T3S3. Adanya peningkatan keaktivan karena penambahan logam tertentu menunjukkkan bahwa ion logam diperlukan sebagai komponen dalam sisi aktif enzim. Mekanisme ion logam dapat memperbesar aktivitas enzim yaitu a) menjadi bagian integral dari sisi aktif, b) merubah konstanta kesetimbangan dari reaksi enzimatis, c) merubah muatan listrik, d) mengusir ion inhibitor, e) menukar ion yang kurang efektif pada sisi aktif enzim atau substrat. Pada konsentrasi tertentu ion logam tertentu dapat bertindak sebagai inhibitor, tetapi dapat juga bertindak sebagai aktivator pada konsentrasi lain (Richardson & Hyslop 1985). Berdasarkan mekanisme reaksi yang dikatalisis, endopeptidase dapat dikelompokkan menjadi empat yaitu: protease serin, protease aspartat, protease sistein dan protease logam. Dalam penelitian ini penggolongan protease hasil produksi dilakukan dengan cara mereaksikan dengan senyawasenyawa inhibitor spesifik. Adapun pengaruh inhibitor spesifik EDTA pada protease isolat bakteri tanah rawa terdapat pada Tabel 2. 40

Tabel 2. Pengaruh inhibitor spesifik pada protease isolat bakteri tanah rawa Aktivitas residu (%) Jenis bakteri EDTA (mm) 1 5 Kontrol 100 100 Isolat T1S1 16,4 10,2 Isolat T3S2 19,8 0 Isolat T3S3 22,9 0 Tabel 2 menunjukkan EDTA (1 dan 5 mm) dapat menghambat protease dari isolat bakteri tanah rawa hal ini dimungkinkan karena EDTA mengkelat logam-logam yang berperan penting menjaga stabilitas serta logam yang berperan sebagai kofaktor enzim protease. Hal ini juga diperkuat dengan pemberian ion logam yang menunjukkan dengan pemberian ion logam dapat mempengaruhi aktivitas protease. Karena protease dari bakteri tanah rawa ini dipengaruhi oleh ion logam dan dihambat oleh EDTA, protease ini digolongkan sebagai metaloprotease. Protease bakteri lain dari perairan yang termasuk metalloprotease adalah Aeromonas hydrophilla (Baehaki et al., 2004) dan Alteromonas sp O-7 (Miyamoto et al., 2002). Berat molekul dengan SDS PAGE dan Zimogram Penentuan berat molekul dilakukan dengan teknik SDS- PAGE (Sodium dodesil sulfat-poliakrilamide gel elektroforesis) dan Zimogram merupakan metode yang sudah digunakan secara luas. Hasil SDS-PAGE dan Zimogram protease isolat bakteri tanah rawa dapat dilihat pada Gambar 5. M T1S1 T2S3 T3S3 97 KDa 66 KDa 45 KDa 24 KDa 97 KDa 66 KDa 45 KDa 24 KDa Gambar A M T1S1 T2S3 T3S3 Gambar B Gambar 5. Hasil SDS PAGE dan Zimogram protease isolat bakteri tanah rawa (M=marker, A=SDS-PAGE, B=Zimogram) Analisis SDS-PAGE pada protease ekstrak kasar didapatkan protease isolat T1S1 memiliki 7 pita dengan berat molekul 19-127 kd, isolat T3S2 memiliki 9 pita dengan berat molekul antara 18 kd sampai dengan 119 kd dan isolat T3S3 memiliki 8 pita dengan berat molekul 18 kd sampai dengan 119 kd. Analisis zimogram pada protease ekstrak kasar didapatkan protease isolat T1S1 memiliki 1 pita dengan berat molekul 121 kd, isolat T3S2 memiliki 3 pita dengan berat molekul masingmasing 51, 71 dan 119 kd dan isolat T3S3 juga memiliki 3 pita dengan berat molekul masing-masing 49, 70 dan 116 kd. Bakteri TPS-2 yang diisolasi dari kawah Tangkupan Perahu memiliki 2 pita dengan berat molekul 80 kd dan 45 kd (Wahyuntari et al., 2000). Berat molekul dari metaloprotease dari bakteri Alteromonas sp strain O-7 adalah 56 kd (Miyamoto et al., 2002) dan metaloprotease dari Heliobacter pyori memiliki berat molekul yang tinggi yaitu 200 kd (Windle dan Kelleher,1997). KESIMPULAN Protease isolat T1S1 dan T3S2 memiliki waktu produksi optimum protease adalah 48 jam, sedangkan waktu produksi optimum protease isolat T3S3 adalah 56 jam. ph optimum protease isolat T1S1 dan T3S2 adalah 8, sedangkan T3S3 adalah 7,5. Suhu optimum protease T1S1 adalah 40 0 C sedangkan isolat T3S2 dan T3S3 adalah 50 0 C. Pengaruh ion logam terhadap aktivitas protase menunjukkkan semua ion logam yang yang ditambahkan berfungsi inhibitor kecuali Fe 2+ (5 mm) terhadap protease isolat T3S3. Karena dipengaruhi ion logam maka protease digolongkan metaloprotease. EDTA dapat menghambat protease isolat bakteri tanah rawa ini sehingga memperkuat hasil pengaruh ion logam bahwa protease isolat bakteri tanah rawa termasuk metaloprotease. Analisis SDS-PAGE pada protease ekstrak kasar didapatkan protease isolat T1S1 memiliki 7 pita dengan berat molekul 19-127 kd, isolat T3S2 memiliki 9 pita dengan berat molekul antara 18-119 kd dan isolat T3S3 memiliki 8 pita dengan berat molekul 18-119 kd. Analisis Zimogram pada protease ekstrak kasar didapatkan protease isolat T1S1 memiliki 1 pita dengan berat molekul 121 kd, isolat T3S2 memiliki 3 pita dengan berat molekul 51, 71 dan 119 kd dan isolat T3S3 juga memiliki 3 pita dengan berat molekul 49, 70 dan 116 kd. UCAPAN TERIMA KASIH Peneliti berterima kasih kepada Direktorat Jenderal Pendidikan Tinggi Depdiknas yang telah membiayai penelitian ini melalui program Hibah Bersaing XVI tahun 2008. DAFTAR PUSTAKA Adinarayana K, Sllaiah P, Prasad DS. 2003. Production and partial characterization of thermostable serine alkaline protease from a newly isolated Bacillus subtilis PE-11. AAPS PharmSciTech. 4:E56-64. Baehaki A, Suhartono MT, Palupi NS, Nurhayati T. 2008. Purifikasi dan karakterisasi protease dari bakteri patogen 41

Psudomonas aeruginosa. J. Teknol. dan Industri Pangan, 19(1): 80-86. Baehaki A, Suhartono MT, Nurhayati T. 2004. Karakterisasi Protease dari bakteri patogen ikan Aeromonas hydrophilla. Buletin Teknologi Hasil Perikanan, 8(2):60-72. Bergmeyer HU, Bergmeyer J, Graβl M. 1983. Methods of Enzymatic Analysis Vol 2. Weinheim : Verlag Chemie. Bradford MM. 1976. A rapid and sensitive methodfor quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein dye-binding. Anal Biochem, 72:234-254. Choi NS, Yoon KS, Lee JY, Han KY, & Kim SH. 2001, Comparision of three substrates (casein, fibrin, and gelatin) in zimographic gel. J Biochim Mol Biol 34:531-536. Hames BD, Hooper NM. 2000, Biochemistry: The Instant Notes. Ed.ke-2. Hongkong:Springer-Verlag. Laemmli UK. 1970. Cleavage of structural protein during the assembly of the heat of bacteriophag T4. Nature, 227:680-685. Miyamoto K, Tsujibo H, Nukui E, Itoh H, Kaidzu Y, Inamori Y. 2002. Isolation and characterization of the genes encoding two metalloproteases (MprI and MprII) from a marine bacterium, Alteromonas sp. strain O-7. Biosci Biotecnol Biochem 66(2):416-21. Muchtadi D, Palupi NS, Astawan M. 1996, Enzim dalam Industri Pangan. Bogor: PAU Pangan dan Gizi IPB. Olajuyigbe FM, Ajele JO. 2008. Some properties of extracelullar protease from Bacillus licheniformis Lbbl-1 isolated from iru, a traditionally fermented African locust bean condiment. Glob. J. Biotechnol. Biochem. 3 (1): 42-46. Rao MM, Tanksale AM, Gatge MS, Desphande VV. 1998. Molecular and biotechnological aspects of microbial proteases. Microbiol. And Mol. Biol. Rev. 62(3):597-635. Richardson T, Hyslop DB. 1985. Enzyme. Didalam: Fennema, O.R (Ed). Food Chemistry. New York: Mac Kerel Bekker. Suhartono MT. 1989. Enzim dan Bioteknologi. Bogor: Pusat Antar Universitas Bioteknologi IPB-Depdikbud. Suhartono MT. 2000. Pemahaman Karakteristik Biokimia Enzim Protease dalam Menunjang Industri Berbasis Bioteknologi. Buku Orasi Ilmiah Guru Besar Ilmu Dasar-Dasar Biokimia Dasar. Fateta IPB. Bogor. Vázquez SC, Hernández E, Cormack WPM. 2008. Extracellular proteases from the Antarctic marine Pseudoalteromonas sp. P96-47 strain. Revista Argentina de Microbiologia 40:63-71. Vidyasagar M, Prokash S, Mahajan V, Shouche YS, Screermulu K. 2009. Purification and Characterization of an extreme halothermophilic protease from a halophilic bacterium Chromohalobacter sp TVSP101. Braz. J. Microbiol 40(1). Wahyuntari B, Suhartono MT, Pyun Y. 2000. Properties of extracelullar protease from an extreme thermophilic microorganism isolated from Tangkupan Prahu crater. Hayati 7(1): 6-10. Ward OP, Rao MB, Kulkarni A. 2009. Proteases production. Appli.Microbiol. Industrial 495-511. Windle HJ, Kelleher D. 1997. Identification and characterization of a metalloprotease activity from Helicobacter pylori. Infect Immun 65(8): 3132-3137. 42