1 BIOKIMIA Prof. Mulyadi, Apt 1. Siklus Krebs: a. merupakan jalur metabolisme bersama untuk oksidasi molekul bahan bakar seperti asam amino, asam lemak, dan karbohidrat b. mempunyai nama lain daur asam trikarboksilat atau daur asam sitrat (DAS) c. terjadi di mitokondria d. sebagian besar molekul masuk siklus sebagai asetil KoA e. semua jawaban benar 2. Komponen piruvat DH terdiri dari 3 enzim yaitu: a. komponen piruvat DH, dihidrolipoil transasetilase, dan dihidrolipoil DH b.? c.? 3. Ada 4 macam reaksi redoks yaitu di mana saja? 4. Reaksi yang terjadi di sitosol: a. glikolisis b. DAS c. fosforilasi oksidatif d. jalur pentosa fosfat 5. Daur glioksilat: a. ada dua enzim berbeda dari DAS yang terlibat yaitu : isositrat liase dan malat sintetase b. asetil KoA masuk 2 kali sedangkan pada DAS satu kali c. memintas 2 langkah dekarboksilasi pada DAS d. berlangsung di glioksisom e. all benar 6. Senyawa organik yang mudah terdisosiasi disebut: a. koenzim b. aktivator c. prostetik d. enzim logam 7. DAS: a. disebut juga daur asam trikarboksilat karena... (alesan salah) b.? c.terjadi di mitokondria d.? 8. Reaksi yang tidak dapat balik: a. reaksi aldolkondensasi b.?
2 9. Senyawa 6 karbon: a. dibentuk dari asetil KoA dan oksaloasetat b. dipecah manjadi atom 2 C dan 4 C 10. DAS a. menghasilkan ATP secara tidak langsung b. tidak ada hubungan dengan metabolik lain c.? 11. Jalur pentosa fosfat selain menghasilkan ribosa 5-Posfat juga: 1.? 2.? 3.? 4. NADPH 12. Glukoneogenesis: 1. terjadi di otot 2. terjadi di hati 3.? 4. benar... 13. Glikogem 1. sumber energi yang mudah dimetabolisme 2. besar dan bercabang 3. benar 4. benar 14. Glikogen: a. sumber penyimpanan energi pada hewan b.? c.? d.? 15. Siklus Cori: 1. terjadi glikolisis dan glukoneogenesis 2.? 16. Debranching enzim: 17. GOT... SEBAB... 18. GPT...SEBAB... 19. Epimerase sama dengan isomerase SEBAB isomerase ribulosa ribose 20. Asetil KoA adalah unit 2 karbon SEBAB dihasilkan dari karboksilasi oksidatif oksidasi asam lemak 21. Asetil KoA adalah unit 3 karbon SEBAB dihasilkan dari dekarboksilasi oksidatif dan reduksi asam lemak 22. Fosfolipase sebagai enzim berperan dalam pencernaan SEBAB fosfolipase termasuk enzim oksidasi 23. Rhizobium...SEBAB ada nitogenase dan reduktase 24. Biosintesis steroid dan...adalah sama SEBAB memerlukan biotin
3 25. fosfatidil kolin dan fosfatidil serin adalah komponen... SEBAB mempunyai komponen sisa asam lemak, gliserol, dan alkohol 26. Fo... SEBAB donor... pada pembentukan purin 27....SEBAB donor metil 28. NADH dan NADPH adalah reducing agent SEBAB NADH energi, NADPH biosintesis 29. Glikogen sumber energi besar SEBAB diperhitungkan dari jumlah ATP yang dihasilkan 30. Lovastatin bisa mengurangi kolestrol SEBAB penghambatan HMG KoA reduktase 31. Kompleks nitrogenasi terdiri dari: 1. reduktase (Mo-protein) 2. reduktase (Fe-protein). 3. nitrogenase (Fe-Protein) 4. nitrogenase (Mo-Fe-protein). 32. Piruvat + glutamate alanin + alfa ketogluatarat. Enzim yang berperan: a. GOT b. Transaminase c. GPT. d.? e.? 33. GOT dan GPT termasuk enzim: a. transaminase. c. oksidase e. liase b. reduktase d. dehidrogenase 34. Piridoksil fosfat termasuk kofaktor:. (hafalkan yang bagan 4 itu!!) 35. Enzim yang berperan pada pengubahan fenilalanin menjadi tirosin: a. hidroksilasi c.? e.? b. fenilalanin hidroksilase. d.? 36. Untuk sintesis serin dari 3-fosfogliserol diperlukan enzim: 1. oksidasi. 2. trnsaminasi. 3. hidrolase. 4.?
4 PAK EDY MEiyanto 1. Di bawah ini termasuk makromolekul, kecuali: a. glukosa b. DNA c. RNA d. protein e. glikogen 2. Karakteristik asam amino: a. punya gugus hidroksil pada C alfa b.? c. punya gugus karbonil pada C alfa d. punya gugus amida pada C alfa e. ujungnya N 3. Asam amino yang polar: a. fenilalanin b. serin, threonin, tirosin, leusin (salah, harusnya lisin) c. serin, threonin, tirosin, asam glutamat d. 4. Struktur primer menunjukkan: a. urutan asam amino 5. Sttuktur skunder distabilkan oleh : ikatan hidrogen 6. protein serat/fibrous: 1. satu variasi struktur 2. kurang larut dalam air 3. contoh : kolagen 4. disusun oleh beta sheet saja 7. Ikatan yang menyetabilkan kuarterner: 1. hidrogen 2. van der walls 3. hidrofobik 4. ionik 8. reaksi + H2O : enzim hidrolase 9. Protein integral a. bersifat polar b. bersifat nonpolar c. mempunyai domain hidrofobik 10. Km tetap, V max turun: a. nonkompetitif
5 b. kompetitif c. lupa 11. [E] + [S] [ES] E + P Persamaan : a. b. c. k+1[e] + [S] k+2[es] k-1[es] 12. nanti ada persamaan michaelis menten, jika apa... maka... a. V = 1/3 V max (ini jawabannya) 13. Protein integral: 1. kanal ion 2. informasi... 14. Protein yang terikat karbohidrat: 1. 2. 3. 4. 15. Yang bukan penyusun membran: C. Asam butirat 16. Yang bukan amfilik: A. Asam asetat 17. Pengaruh ph: 1. hidrogen 2. kuarterner 18. Yang meningkatkan fluiditas membran: 1. rantai yang panjang 2. kolestrol 3. 4. tidak jenuh Jawab: C 19. Sifat membran a. statis b. dinamis c. stabil 20. Tempat terjadinya glikolisis: A. Sitosol 21. Senyawa awal pembentuk glikolisis : a. glukosa 6-pospat b. fruktosa 6-posfat c. glukosa 1-posfat 22. Dari glukosa fruktosa 1,6 bisfosfat : C. Memerluakan 2 ATP 23.... 1...
6 2. 2 NADH 3. 2 NAD+ dan H= 4. 2 piruvat 24. Vitamin termasuk: a. holoenzim b. koenzim c. regulator d. katalisator 25. Ada gambar protein bentuk panah: 1. heliks back heliks 2. beta sheet 3. C terminus 4. C terminus Jawab: C 26. Asam lemak yang jenuh: 1. A 2,3,4 2. A1 3. A2 4. 18:O 27. Bilayer disebabkan oleh: hidrofobik 28. Enzim gliseraldehid 3 pospat DH 1. mengkatalisis pembentukan glukosa 3 pospat 2. mengkatalisis pembentukan 1,3-gli... 3.... 4. termasuk reduktooksidase Jawab : C
7 Pembahasan 1. Jawab : E DAS (Daur asam sitrat) merupakan kelanjutan dari glikolisis yaitu pengubahan glukosa menjadi piruvat. Kemudian piruvat mengalami dekarboksilasi oksidatif menjadi asetil koenzim A (asetil KoA) dan CO2. Piruvat + KoA + NAD+ asetil KoA + CO2 + NADH Reaksi di atas berlangsung dalam matriks mitokondria dikatalisis oleh piruvat DH (degidrogenase). Gambaran umum DAS: a. Senyawa 4 karbon (oksaloasetat) berkondensasi dengan unit 2 karbon (asetil KoA di atas) membentuk unit 6 karbon (sitrat). H 2 C COO - HO C COO - Tuh, ada 3 asam karboksilat khan??? H 2 C COO - SITRAT b. Sitrat mengalami isomerisasi menjadi isositrat yang memungkinkan unit 6 C tersebut bisa melakukan dekarboksilasi. Isomerisasi berlangsung melalui tahap dehidrasi diikuti hidrasi dengan snyawa antara sis-akonitat. c. Oksidasi dan dekarboksilasi pertama : isositrat menjadi alfa ketoglutarat Jadi, dalam DAS ada 4 reaksi redoks. Nah, ini reaksi redoks yang pertama. Kalau mendengar dekarboksilasi atau ada kompleks NAD+, FAD berarti raksi redoks. Dalam hal ini, isositrat diubah dengan bantuan enzim isositrat dehidrogenase. Isositrat + NAD+ alfa ketoglutarat + CO2 + NADH d. Dekarboksilasi oksidatif kedua : alfa ketoglutarat menjadi suksinil KoA alfa ketoglutara + NAD+ + KoA suksinil KoA + CO2 + NADH Katalis : kompleks alfa ketoglutarat dehidrogenase (terdiri dari 3 enzim, mekanisme mirip kompleks piruvat DH) e. pembentukan senyawa fosfat energi tinggi dari suksinil KoA suksinil KoA + Pi + GDP suksinat + GTP + KoA
8 Reaksi ini merupakan stu-satunya langkah dalam DAS yang langsung menghasilkan senyawa fosfat berenergi tinggi yaitu GTP (digunakan sebagai donor pospat pada sintesis protein dan transduksi sinyal). f. Pembentukan kembali oksaloasetat melalui oksidasi suksinat. Suksinat ----------------- oksaloasetat Ada 3 langkah penting yaitu : Oksidasi Hidrasi Oksidasi kedua Tuh bener kan, reaksi redoksnya ada 4 macem (yang digaris bawah). FAD H2O NAD+ Suksinat ------- Fumarat --------------- Malat ----------------- oksaloasetat Suksinat fumarat : enzim suksinat DH. Digunakan agen pereduksi FAD, mengapa tidak NAD+? Karena energi bebas tidak cukup untuk mereduksi NAD+. Pada FAD, dipindahkan 2 atom H dari substrat, makanya terbentuk FADH2. Fumarat Malat, enzim yaitu fumerase Malat oksaloasetat, oleh enzim malat DH. Malat + NAD+ oksaloasetat + NADH + H+ 2. Jawab : A piruvat mengalami dekarboksilasi oksidatif menjadi asetil koenzim A (asetil KoA) dan CO2. Piruvat + KoA + NAD+ asetil KoA + CO2 + NADH Reaksi di atas berlangsung dalam matriks mitokondria dikatalisis oleh piruvat DH (degidrogenase). Komplek piruvat DH Enzim Gugus prostetik Reaksi yang dikatalisis 1. komponen piruvat DH TPP Dekarboksilase oksidatif piruvat 2. dihidrolipoil transasetilase Lipoamida Transfer gugus asetil kepada KoA 3. dihidrolipoil DH FAD Pembentukan kembali lipoamida bentuk teroksidasi
9 3. Reaksi redoks terjadi di: a. isositrat menjadi alfa ketoglutarat b. alfa ketoglutarat menjadi suksinil KoA c. suksinat fumarat, hanya ini saja yg pakai FAD, lainya pakai NAD+ d. malat oksaloasetat 4. Jawab: A dan D DAS terjadi mitokondria Fosforilasi oksidatif terjadi di membran dalam mitokondria 5. Jawab : E Daur glioksilat: a. kondensasi asril KoA + oksaloasetat menjadi sitrat (enzim : sitrat sintetase) b. isomerisasi : sitrat menjadi isositrat. Nah, yang ini gak mengalami dekarboksilasi c. isositrat oleh isositrat liase diubah menjadi suksinat dan glioksilat. d. setelah ini, asetil KoA yang kedua masuk ke siklus, bereaksi dengan glioksilat dengan bantuan enzim malat sintetase membentuk malat. e. malat kemudian diubah menjadi oksaloasetat 6. Jawab : A Hafalakan tabel berikut ya! KOFAKTOR TERDISOSIASI SULIT Organik NAD+ prostetik NADH koenzim NADP Anorganik Br- aktivator Enzim logam, misal pada sitokrom ada Fe 7. Jawab : C 8. Jawab : A 9. Jawab : A 10. Jawab : A DAS menghasilkan NADH dan FADH2 yang meuapakan molekul berenergi tinggi karena masing-masing molekul tersebut mengandung seoasang elektron yang mempunyai potensial transfer yang tinggi. Jika elektron2 tsb diberikan kepada oksigen, sejumlah besar energi dilepaskan, dan dapat digunakn untuk menghasilkan ATP. 11. Jawab : D 12. C 13. E 14. A 15. 16. 17. B 18. C 19. D
20. C 21. E 22. D 23. A 24.? 25. D 26. A 27. A 28.? 29.? 30. A 31. C 32. C 33. A 34. 35. B 36. A 10