DAFTAR ISI Bab Halaman DAFTAR TABEL... x DAFTAR GAMBAR... xi DAFTAR LAMPIRAN... xiii I. PENDAHULUAN 1.1 Latar Belakang... 1 1.2 Identifikasi Masalah... 3 1.3 Tujuan Penelitian... 3 1.4 Kegunaan Penelitian... 4 1.5 Kerangka Pemikiran... 4 1.6 Hipotesis... 10 II. III. KAJIAN PUSTAKA 2.1 Mangrove Avicennia marina... 11 2.2 Potensi Antibiotik dari Mangrove Avicennia marina... 12 2.3 Mikroba Endofit... 14 2.3.1 Mekanisme Kerja Mikroba Endofit... 17 2.3.2 Potensi Antibiotik dari Bakteri Endofit... 19 2.3.3 Kurva Pertumbuhan Bakteri Endofit... 22 2.2 Bakteri Vibrio harveyi... 24 2.3 Bakteri Staphylococcus aureus... 25 BAHAN DAN METODE 3.1 Waktu dan Tempat Penelitian... 27 3.2 Alat dan Bahan... 27 3.3 Metode Penelitian... 31 3.4 Prosedur Penelitian... 31 3.4.1 Pengambilan Sampel Batang Mangrove... 31 3.4.2 Sterilisasi Alat... 32 3.4.3 Isolasi Bakteri Endofit dari Batang Mangrove... 32 3.4.4 Isolasi Biakan Murni Bakteri Endofit... 33 3.4.5 Produksi Metabolit Bakteri Endofit... 33 3.4.6 Uji Kandungan Senyawa Metabolit Sekunder Bakteri Endofit... 34 3.4.7 Ekstraksi Kulit Batang Mangrove... 35 3.4.8 Uji Aktivitas Antibiotik... 35 3.4.9 Karakterisasi dan Identifikasi Bakteri Endofit... 36 3.4.9.1 Pengamatan Morfologi Bakteri... 36 3.4.9.2 Pewarnaan Bakteri... 37 3.4.9.3 Uji Biokimia... 38 viii
ix 3.4.9.4 Identifikasi Isolat Bakteri Endofit... 40 3.5 Parameter Pengamatan... 40 3.6 Analisis Data... 42 IV. IV. HASIL DAN PEMBAHASAN 4.1 Isolasi dan Pemurnian Bakteri Endofit dari Batang mangrove..... 43 4.2 Produksi Metabolit Bakteri Endofit... 44 4.3 Kandungan Metabolit Hasil Fermentasi Bakteri Endofit... 46 4.4 Ekstraksi Kulit Batang Mangrove Avicennia marina... 51 4.5 Hasil Uji Aktivitas Antibiotik... 52 4.6 Karakterisasi dan Identifikasi Bakteri Endofit..... 59 4.6.1 Morfologi dan Sifat Gram Bakteri Endofit... 59 4.6.2 Karakterisasi Biokimia..... 61 KESIMPULAN DAN SARAN 4.1 Kesimpulan..... 72 4.2 Saran... 73 DAFTAR PUSTAKA... 74 LAMPIRAN... 79 RIWAYAT HIDUP... 97
DAFTAR TABEL Nomor Judul Halaman 1. Kandungan Fitokimia dalam Mangrove Avicennia marina... 13 2 Daya Hambat Beberapa Spesies Mangrove terhadap Bakteri Vibrio sp.14 3. Potensi Mikroba Endofit (Radji 2005)... 21 4. Senyawa Metabolit Sekunder yang dimiliki oleh Mikroba Endofit Batang Mangrove Avicennia marina...47 5. Hasil Ekstraksi Batang Mangrove Avicennia sp.... 52 6. Hasil Pengukuran Zona Hambat Vibrio harveyi... 54 7. Hasil Pengukuran Zona Hambat Staphylococcus aureus... 55 8. Morfologi Isolat Bakteri Endofit Batang Mangrove Avicennia marina. 61 x
DAFTAR GAMBAR Nomor Judul Halaman 1. Alur Kerangka Pemikiran... 9 2. Avicennia marina... 12 3. Kurva Pertumbuhan Bakteri Endofit... 22 4. Uji Aktivitas Biokimia dari Mikroorganisme... 39 5. Morfologi Koloni Bakteri... 40 6. Bentuk Zona Hambat... 42 7. Cawan Petri yang Berisi Batang Mangrove Avicennia... 44 8. Supernatan Hasil Fermentasi Bakteri Endofit... 46 9. Hasil Uji Alkaloid dari Kiri ke Kanan (kontrol, isolat 1, isolat 2, isolat 3, isolat 4.1, isolat 4.2, isolat 5, isolat 6, isolat 7.1, isolat 7.2... 48 10. Hasil Uji Terpenoid dan Steroid... 49 11. Hasil Uji Senyawa Tanin dari Kiri ke Kanan (kontrol, isolat 1, isolat 2, isolat 3, isolat 4.1, isolat 4.2, isolat 5, isolat 6, isolat 7.1, isolat 7.2... 50 12. Hasil Uji Saponin... 50 13. Hasil Ekstrak Metanol Batang Mangrove Avicennia marina...51 14. Ilustrasi Pembagian Cawan Petri menjadi 6 Zona...52 15. Grafik Perbandingan Diameter Zona Hambat Bakteri V.harveyi dan S.aureus... 57 16. Hasil Uji Fermentasi karbohidrat...63 17. Hasil Pengujian Methyl Red dari kiri ke kanan (Isolat 2, 4.1, 4.2...64 18. Hasil Uji Voges-Proskauer dari kiri ke kanan (Isolat 2, 4.1, 4.2)...65 19. Hasil Uji Reduksi Nitrat dari kiri ke kanan (Isolat 2, 4.1, 4.2)...65 20. Hasil Uji Urease dari kiri ke kanan (Isolat 2, 4.1, 4.2... 66 21. Hasil Uji Hidrolisis Gelatin dari kiri ke kanan (Isolat 2, 4.1, 4.2...67 22. Hasil Uji SIM dari kiri ke kanan (Isolat 2, 4.1, 4.2...68 23. Hasil Hidrolisis Pati... 68 24. Hasil Hidrolisis Lipid... 69 xi
25. Cawan Petri yang berisi Bakteri Endofit... 69 xii
DAFTAR LAMPIRAN Nomor Judul Halaman 1 Alur Prosedur Penelitian... 80 2. Lokasi Penelitian dan Nilai Parameter Lingkungan... 81 3 Pengukuran Parameter Lingkungan... 82 4 Tahapan Isolasi Bakteri Endofit Batang Mangrove Avicennia marina... 83 5 Tahapan Produksi Metabolit Bakteri Endofit... 84 6 Tahapan Ekstraksi Batang Mangrove Avicennia marina... 85 7 Hasil Uji Aktivitas Hasil Fermentasi Bakteri Endofit isolat (1, 2, 3) dengan Kontrol Antibiotik terhadap Bakteri Vibrio harveyi dengan 2 kali pengulangan... 86 8 Hasil Uji Aktivitas Hasil Fermentasi Bakteri Endofit isolat (4.1, 4.2, 5) dengan Kontrol Antibiotik terhadap Bakteri Vibrio harveyi dengan 2 kali pengulangan... 87 9 Hasil Uji Aktivitas Hasil Fermentasi Bakteri Endofit isolat (6, 7.1, 7.2) dengan Kontrol Antibiotik terhadap Bakteri Vibrio harveyi dengan 2 kali pengulangan... 88 10 Hasil Uji Aktivitas Hasil Fermentasi Bakteri Endofit isolat (1, 2, 3) dengan Kontrol Antibiotik terhadap Bakteri Staphylococcus aureus dengan 2 kali pengulangan... 89 11 Hasil Uji Aktivitas Hasil Fermentasi Bakteri Endofit isolat (4.1, 4.2, 5) dengan Kontrol Antibiotik terhadap Bakteri Staphylococcus aureus dengan 2 kali pengulangan... 90 12 Hasil Uji Aktivitas Hasil Fermentasi Bakteri Endofit isolat (6, 7.1, 7.2) dengan Kontrol Antibiotik terhadap Bakteri Staphylococcus aureus dengan 2 kali pengulangan... 91 13 Koloni Bakteri Endofit... 92 14 Preparat dan Bentuk Morfologi Sel... 93 15 Laporan Identifikasi Bakteri... 96 xiii