Rekonstruksi 4D Citra MRI Aliran Darah dan Trombus pada Pasien Aneurisma Aorta Abdominalis

dokumen-dokumen yang mirip
Implementasi Intensity Transfer Function(ITF) Untuk Peningkatan Intensitas Citra Medis Hasil Pemeriksaan MRI

Prediksi Evolusi Diameter Aorta Berdasarkan Sinyal Trombus dari Magnetic Resonance Images pada Small Abdominal Aortic Aneurysms

Manual Book. Evolusi Diameter Aneurisma Aorta. Tentang Aplikasi. Menjalankan Program

Manual Book. Kecepatan Aliran Darah pada Aneurisma Aorta. Tentang Aplikasi. Menjalankan Program

SKRIPSI SEGMENTASI PEMBULUH DARAH PADA CITRA FUNDUS RETINA MATA DENGAN ALGORITMA FILTER GABOR. Oleh: NUR AHMAD FAUZAN

HALAMAN PERNYATAAN. Yogyakarta, 22 Agustus 2017 Yang menyatakan, Sitti Fadillah Umayah

EKSTRAKSI CIRI TRANSFORMASI CURVELET DISKRIT UNTUK MENDETEKSI KERUSAKAN PERMUKAAN BUAH MANGGIS SKRIPSI

APLIKASI PEMROSESAN CITRA UNTUK PENTAPISAN, DETEKSI TEPI, DAN PENGABURAN PADA KASUS CITRA MIKROSKOP ELEKTRON

DETEKSI CACAT PERMUKAAN BUAH MANGGIS BERBASIS PENGOLAHAN CITRA MENGGUNAKAN METODE KLASIFIKASI SUPPORT VECTOR MACHINE

LAPORAN SKRIPSI DETEKSI KANKER OTAK PADA DATA MRI MELALUI JARINGAN SYARAF TIRUAN DENGAN EKSTRAKSI FITUR DISCRETE WAVELET TRANSFORM

SISTEM PENGENALAN PENGUCAPAN HURUF VOKAL DENGAN METODA PENGUKURAN SUDUT BIBIR PADA CITRA 2 DIMENSI ABSTRAK

Perancangan Prototipe Sistem Pencarian Tempat Parkir Kosong dengan Kamera Web Sebagai Pemantau

KLASIFIKASI PENDARAHAN OTAK MENGGUNAKAN METODE EXTREME LEARNING MACHINE SKRIPSI AULIYA DOLI RIZKI S

PENERAPAN METODE DETEKSI TEPI CANNY UNTUK SISTEM PENGENALAN PLAT NOMOR KENDARAAN TUGAS AKHIR

OPTIMASI CITRA RADIOGRAFI PADA PEMERIKSAAN PELVIS MENGGUNAKAN COMPUTED RADIOGRAPHY (CR)

HALAMAN PERNYATAAN. Yogyakarta, 26 Juli 2017 Yang menyatakan, Jaenudin

PENGUKURAN KECEPATAN OBYEK DENGAN PENGOLAAN CITRA MENGGUNAKAN METODE THRESHOLDING SKRIPSI. Disusun Oleh : Hery Pramono NPM.

HALAMAN SAMPUL SKRIPSI PENGENALAN POLA TELAPAK TANGAN DENGAN MENGGUNAKAN ALGORITMA BACK PROPAGATION NEURAL NETWORK

SKRIPSI SISTEM PREDIKSI KONDISI KELAHIRAN BAYI MENGGUNAKAN METODE KLASIFIKASI NAÏVE BAYES. Oleh : WAHYUNINGSIH

ANALISIS PERBANDINGAN HASIL ALGORITMA HOMOGENEITY DAN ALGORITMA PREWITT UNTUK DETEKSI TEPI PADA CITRA BMP SKRIPSI ZULFADHLI HARAHAP

SISTEM INFORMASI GEOGRAFIS PEMILIHAN KELURAHAN TERBAIK UNTUK LOKASI TPSS DI KOTA PEKANBARU MENGGUNAKAN METODE AHP TUGAS AKHIR

EKSTRAKSI DAN PENGENALAN PLAT NOMOR KENDARAAN BERMOTOR DI INDONESIA

SEGMENTASI CITRA MENGGUNAKAN LEVEL SET UNTUK ACTIVE CONTOUR BERBASIS PARALLEL GPU CUDA

ANALISIS SELEKSI ATRIBUT PADA ALGORITMA NAÏVE BAYES DALAM MEMPREDIKSI PENYAKIT JANTUNG

HUBUNGAN PERILAKU PETUGAS KESEHATAN DI BAGIAN PENDAFTARAN PASIEN RAWAT JALAN DENGAN TINGKAT KEPUASAN PASIEN DI RSUD IDI KABUPATEN ACEH TIMUR TESIS

PENINGKATAN KUALITAS PEMBELAJARAN IPA PADA MATERI SISTEM PENCERNAAN MANUSIA DENGAN STRATEGI JIGSAW-LESSON STUDY

TUGAS AKHIR ANALISA PERUBAHAN KUALITAS AIR BAKU DENGAN MENGGUNAKAN MODEL KOAGULASI FLOKULASI SEDIMENTASI DAN FILTRASI

RANCANG BANGUN PEMODELAN 3D GEDUNG FAKULTAS TEKNIK UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO MENGGUNAKAN VIRTUAL REALITY

PENGEMBANGAN APLIKASI PERHITUNGAN JUMLAH OBJEK PADA CITRA DIGITAL DENGAN MENGGUNAKAN METODE MATHEMATICAL MORPHOLOGY

HALAMAN PERNYATAAN. Yogyakarta, Yang menyatakan, Fiddin Yusfida A la

SISTEM INFORMASI KESEHATAN TENTANG PENGOLAHAN DATA SP3 (SISTEM PENCATATAN DAN PELAPORAN PUSKESMAS) DI DINAS KESEHATAN KOTA BANDUNG

ANALISIS JARINGAN KOMPUTER DENGAN MENGGUNAKAN SISTEM VLAN

LAPORAN TUGAS AKHIR APLIKASI KATALOG BUTIK BERBASIS MULTIMEDIA. Diajukan Untuk Menyusun Tugas Akhir dalam Program Diploma III Ilmu Komputer

PENGARUH ETIKA KERJA ISLAMI TERHADAP JOB SATISFACTION, ORGANIZATIONAL COMMITMENT, DAN TURNOVER INTENTION

SISTEM PENDUKUNG KEPUTUSAN UNTUK MENETUKAN TERAPI HERBAL PADA PENYAKIT DALAM DENGAN METODE AHP (ANALITYC HIERARCHY PROCESS) TUGAS AKHIR

IMPLEMENTASI PEMROGRAMAN PARALEL DALAM DETEKSI TEPI MENGGUNAKAN METODE OPERATOR SOBEL TUGAS AKHIR

TESIS. Disusun Oleh : NAMA : RAKHMAT BASUKI : P

SISTEM INFORMASI PERPUSTAKAAN PADA SMAN 1 KWADUNGAN NGAWI

PERANCANGAN SISTEM INFORMASI MONITORING PENGELUARAN KAS KECIL PROYEK PADA PT. RAJAWALI MEGAH PERKASA BERBASIS WEB ASLAMIYAH

PENINGKATAN KUALITAS PROSES PENGOLAHAN LARUTAN PEMBERSIH DAUR ULANG DENGAN METODE DESIGN OF EXPERIMENTS (DOE) (STUDI KASUS PT.

KLASIFIKASI POLA BATIK DENGAN DETEKSI TEPI (LAPLACIAN DAN ROBERT) BERBASIS JARINGAN SYARAF TIRUAN

DETEKSI MATA UANG KOIN MENGGUNAKAN SHAPE CONTEXT UNTUK ORANG BUTA

IMPLEMENTASI METODE ELEMEN HINGGA DALAM PERSOALAN ALIRAN DARAH PADA PEMBULUH DARAH SKRIPSI ABNIDAR HARUN POHAN

DIAGNOSA PENYAKIT PARU EFUSI PLEURA DENGAN PENDEKATAN POSSIBILISTIC FUZZY LEARNING VECTOR QUANTIZATION SKRIPSI

ANALISIS PRODUKTIVITAS PRODUKSI DI PERUSAHAAN KECAP MANALAGI DENPASAR SKRIPSI. Oleh: ALFIANA AFIFI NIM:

SIMULASI PERAMBATAN GELOMBANG SUARA DENGAN METODE STAGGERED GRID FINITE DIFFERENCE TIME DOMAIN MENGGUNAKAN ARSITEKTUR CUDA GPU

APLIKASI PENGARSIPAN DATA MAHASISWA PENERIMA DANA KASIH DI UNIVERSITAS SEBELAS MARET

PERNYATAAN KEASLIAN SKRIPSI

PERBANDINGAN HIDROGRAF SATUAN TERUKUR DENGAN HIDROGRAF SATUAN SINTETIS PADA DAS WAY KUALA GARUNTANG DAN DAS WAY SIMPANG KIRI. Oleh RINA FEBRINA.

ANALISA ALIRAN FLUIDA DAN DISTRIBUSI TEMPERATUR DI SEKITAR SUMBER PANAS DI DALAM SEBUAH CAVITY DENGAN METODE BEDA HINGGA

LAPORAN SKRIPSI DETEKSI JENIS KULIT WAJAH BERDASARKAN WARNA YCBCR DENGAN ALGORITMA FUZZY SUBTRACTIVE CLUSTERING

SISTEM PENDUKUNG KEPUTUSAN DIAGNOSIS PENYAKIT SKIZOFRENIA DENGAN METODE POHON KEPUTUSAN TUGAS AKHIR

ANALISIS MODEL MSLIR PENYEBARAN PENYAKIT TUBERKULOSIS DENGAN POPULASI TERBUKA TUGAS AKHIR

SKRIPSI BOHO SURIANTO NAIBAHO

APLIKASI PROGRAM LINIER DALAM MENENTUKAN PRODUKSI OPTIMAL PADA PT. SIHITANG RAYA BARU SKRIPSI WINDY PUSPA WULANDARI

PERHITUNGAN BREAK EVEN POINT (BEP) SEBAGAI DASAR UNTUK MENENTUKAN VOLUME PENJUALAN (STUDI KASUS PADA BAKSO DAN MIE AYAM MIDUN PALEMBANG)

DESAIN PENCAHAYAAN RUANGAN DENGAN MENGGUNAKAN SOFTWARE DIALux V 4.9

PENGARUH MOTIVASI DAN KOMPETENSI SUMBER DAYA MANUSIA TERHADAP KINERJA SISTEM KEUANGAN BERBASIS TEKNOLOGI INFORMASI

PENGENALAN POLA HURUF HIJAIYAH MENGGUNAKAN SUPPORT VECTOR MACHINE (SVM) SKRIPSI NADYA AMELIA

PENENTUAN PARAMETER PENTING DALAM PENYEBARAN MALARIA MELALUI ANALISIS SENSITIVITAS MODEL MATEMATIKA

SKRIPSI. Oleh Nurul Khasanah NIM

EKSTRAKSI FITUR TEKSTUR CITRA TEMPE MENGGUNAKAN METODE GRAY LEVEL CO-OCCURENCE MATRIX

ANALISIS PERBANDINGAN ONLINE DAN OFFLINE TRAINING PADA JARINGAN BACKPROPAGATION PADA KASUS PENGENALAN HURUF ABJAD TESIS

Metode Segmentasi Paru-Paru dan Jantung Pada Citra X-Ray Thorax

PENERAPAN METODE ECONOMICAL ORDER QUANTITY

Penulisan Hukum (Skripsi)

PELABELAN OTOMATIS CITRA MENGGUNAKAN FUZZY C MEANS UNTUK SISTEM TEMU KEMBALI CITRA MARSANI ASFI

SISTEM ADMINISTRASI BERBASIS WEB DI LABORATORIUM PUSBANG BIOTEK UNIT JAMUR UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH MALANG

ANALISIS KEPADATAN PENDUDUK DAN PROYEKSI KEBUTUHAN PERMUKIMAN KECAMATAN DEPOK SLEMAN TAHUN

PENGAMBILAN DATA 2,5D UNTUK VISUALISASI KOTA 3D

SISTEM PENDUKUNG KEPUTUSAN PEMILIHAN LOKASI OBJEK WISATA KABUPATEN PONOROGO MENGGUNAKAN METODE SAW

TUGAS AKHIR Diajukan sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Sarjana Teknik. Ade Kusnady

SISTEM PAKAR DIAGNOSA KERUSAKAN KAMERA DIGITAL SINGLE LENS REFLEX (DSLR) MENGGUNAKAN METODE CERTAINTY FACTOR BERBASIS WEB

IMPLEMENTASI STEGANOGRAFI HOPPING SPREAD SPECTRUM KE DALAM FILE VIDEO SKRIPSI

KLASIFIKASI KELAINAN BENTUK SEL DARAH MERAH MENGGUNAKAN RADIAL BASIS FUNCTION NETWORK ANITA RATNA SARI

KATA PENGANTAR. Esa atas berkat dan karunia-nya sehingga saya pelaku penulis dapat. menyelesaikan penyusunan Tesis ini yang berjudul IMPLEMENTASI

ANALISIS HASIL PEMERIKSAAN TROMBUS PADA PERIPHERAL LOWER DENGAN TEKNIK RUN OFF LOWER CT SCAN 128 SLICE SKRIPSI BERTI MONO ADEVENTI GAJAH

MODEL ESTIMASI REGRESI NONPARAMETRIK DENGAN METODE KERNEL

PERBANDINGAN 3 METODE DALAM DATA MINING UNTUK PREDIKSI PENERIMA BEASISWA BERDASARKAN PRESTASI DI SMA NEGERI 6 SURAKARTA SKRIPSI

PEMBUATAN FILM IKLAN LAYANAN MASYARAKAT YANG BERJUDUL AWAS CALO SIM BERBASIS ANIMASI 3 DIMENSI

TUGAS AKHIR STUDI PERENCANAAN UNTUK PERFORMANCE SPOILER MCX-1 SP DAN MCX-2 SP PADA KENDARAAN TRUK DENGAN METODE COMPUTATIONAL FLUID DYNAMIC (CFD)

SKRIPSI ANALISIS PERBANDINGAN DETEKSI TEPI PREWITT DAN ROBERTS PADA UANG KERTAS DAN MENGGUNAKAN KLASIFIKASI SUPPORT VECTOR MACHINE (SVM)

MASA KERJA, PENDIDIKAN, KOMPETENSI, GENDER DAN KOMPENSASI KARYAWAN PT. MOWILEX INDONESIA

PERANCANGAN SISTEM PENDUKUNG KEPUTUSAN PENENTUAN PERFORMANCE SEKOLAH DENGAN MENGGUNAKAN METODE FUZZY MULTI CRITERIA DECISION MAKING (MCDM) SKRIPSI

SKRIPSI Disusun sebagai Syarat Memperoleh Gelar Sarjana Teknik Pada Program Studi Teknik Sipil Fakultas Teknik Universitas Sebelas Maret Surakarta

SISTEM PENDUKUNG KEPUTUSAN DALAM PEMILIHAN KARTU KREDIT BERBASIS WEB SKRIPSI

ANALISIS FAKTOR YANG MEMPENGARUHI BESARNYA KONSUMSI RUMAH TANGGA KARYAWAN BKKBN KABUPATEN BLITAR

PENERAPAN METODE JARINGAN SYARAF TIRUAN BACKPROPAGATION DALAM MENGUKUR TINGKAT KEPARAHAN PENYAKIT OSTEOARTHRITIS

Aplikasi Pembelajaran IPA Berbasis Multimedia Interaktif Menggunakan HTML5 (Studi Kasus: SD Negeri 06 Salatiga)

ANALISIS FILTER PASIF SINGLE TUNED UNTUK MENGURANGI ARUS HARMONISA PADA MIXER

MEMBANGUN GAME MAIN KATA DENGAN MACROMEDIA FLASH

DEPARTEMEN TEKNIK MESIN FAKULTAS TEKNIK UNIVERSITAS SUMATERA UTARA 2013

APLIKASI BRICK BREAKER MOTION DETECTION. Laporan Tugas Akhir. Diajukan Untuk Melengkapi Salah Satu Syarat Memperoleh Gelar Sarjana Komputer

IMPLEMENTASI TEKNOLOGI AUGMENTED REALITY SEBAGAI MEDIA PROMOSI PAKAIAN BATIK

PENGENALAN NOTASI BALOK MENGGUNAKAN SEGMENTASI DAN JARINGAN SYARAF TIRUAN UNTUK MENGHASILKAN NADA BERIRAMA BERBASIS IOS

Analisis Pengawasan Kualitas Baju Seragam Dinas Lapangan (PDL) TNI AD Pada PT. Asa Persada Indah Kencana Surabaya SKRIPSI

PENENTUAN PROFIL FARMAKOKINETIKA DEKSAMETASON PADA KELINCI (Oryctolagus cuniculus)

GRAFIK KOMPUTER DAN PENGOLAHAN CITRA. WAHYU PRATAMA, S.Kom., MMSI.

( Tesis ) SUMIYATI NPM :

MOTTO DAN PERSEMBAHAN. Semua memiliki kehebatan dan keunikan masing-masing. Saling menghargai dan jangan lupa berbahagialah!

Transkripsi:

Rekonstruksi 4D Citra MRI Aliran Darah dan Trombus pada Pasien Aneurisma Aorta Abdominalis DISERTASI CUT MAISYARAH KARYATI P R O G R A M D O K T O R T E K N O L O G I I N F O R M A S I P R O G R A M P A S C A S A R J A N A UNIVERSITAS GUNADARMA 2013

Rekonstruksi 4D Citra MRI Aliran Darah dan Trombus pada Pasien Aneurisma Aorta Abdominalis DISERTASI CUT MAISYARAH KARYATI P R O G R A M D O K T O R T E K N O L O G I I N F O R M A S I P R O G R A M P A S C A S A R J A N A UNIVERSITAS GUNADARMA 2013

ABSTRACT Abdominal aortic aneurysm (AAA) is the most common location of an aneurysm in the blood vessel diseases. Therapeutic indications for AAA non-rupture is mainly based on the criteria of maximum diameter of the aneurysm. Commonly accepted therapeutic indication is when the largest diameter reaches 5.5 cm. In fact, some small aneurysms (less than 5.5 cm) can rupture, while the bigger may not. In addition, there are other variability that have big influence in the evolution of diameter on small AAA was observed, such as the presence of thrombus in the AAA, the velocity profile of blood flow, and the blood volume inside the AAA. Image processing is a job out of range for a doctor. Thus, improve the living material modeling techniques and simplifies the material biomechanical that still a matter of discussion, will create new opportunities for the application of Information Technology in medical area. Deformable models approach for image segmentation of dynamic blood flow has been used and developed in conjunction with the method of scalar volume data (isosurface) to produce image reconstruction which can represent the anatomy of the aortic aneurysm with blood flow animation in each category of thrombus. This method has been proven to successfully presenting the animation of blood flow based on distinction the color of vector that adapted to the direction of blood flow in each coordinate axis (x, y, z). White color which has the highest intensity value has been successfully visualized as a color that represents the presence of thrombus in the aneurysm. The results of this research can be used by relevant experts in the field of Cardiovascular whose using MRI for observations, as well as helping the aortic surgeon in the decision to perform surgery before the rupture of the aortic wall that causes death. The result of this research is a software that can categorize thrombus in the small AAA. This software also can extract and reconstruct the image of the blood flow along with the animation of blood flow in each thrombus category automatically. In addition, this software can process the calculation of the size of thrombus area, the maximum diameter, blood flow velocity and volume of blood flow. In this study, it can be seen that the presence of thrombus parameters can affect the volume and blood flow velocity, ie, the larger thrombus would further reduce the volume and blood flow velocity. However, the presence of thrombus, blood flow velocity and volume of blood flow has not been shown to affect the evolution of diameter of the small AAA. Keywords : Abdominal Aortic Aneurysm, Blood Flow, Image Processing, MRI, Thrombus

ABSTRAK Aneurisma Aorta Abdominal (AAA) merupakan lokasi yang paling umum pada penyakit aneurisma di pembuluh darah. Indikasi terapi untuk AAA non-ruptura terutama didasarkan pada kriteria diameter maksimum kantung aneurisma. Indikasi terapi yang umum diterima adalah ketika diameter terbesar melebihi 5,5 cm. Pada kenyataannya, beberapa aneurisma kecil (kurang daripada 5,5 cm) dapat ruptura sementara yang lebih besar mungkin tidak. Selain itu, terdapat variabilitas lain yang besar pengaruhnya dalam evolusi diameter AAA kecil yang diamati, misalnya adanya trombus di dalam AAA, profil kecepatan aliran darah, dan volume darah yang berada di dalam AAA tersebut. Penanganan dengan pengolahan citra adalah pekerjaan yang berada di luar jangkauan dokter. Sehingga, meningkatkan teknik pemodelan bahan hidup dan menyederhanakan materi biomekanik yang masih terus menjadi bahan perdebatan, akan menciptakan peluang baru untuk aplikasi Teknologi Informasi di bidang kesehatan. Pendekatan deformable model untuk segmentasi citra aliran darah yang dinamis telah digunakan dan dikembangkan bersama dengan metode isosurface data guna menghasilkan rekonstruksi citra yang dapat merepresentasikan anatomi aneurisma aorta beserta aliran darah di dalamnya pada setiap kategori trombus. Metode ini terbukti telah berhasil memberikan animasi aliran darah dengan pembedaan warna vektor yang disesuaikan dengan arah aliran darah pada tiap-tiap sumbu koordinat (x, y, z). Warna putih yang memiliki nilai intensitas tertinggi telah berhasil divisualisasikan sebagai warna yang mewakili keberadaan trombus pada aneurisma. Bentuk keluaran dan sekaligus merupakan tujuan dari penelitian ini adalah membuat perangkat lunak yang dapat mengkategorikan trombus di dalam AAA kecil, serta dapat mengekstraksi dan merekonstruksi citra aliran darah beserta animasi aliran darah didalamnya pada setiap kategori trombus secara otomatis. Selain itu perangkat lunak ini juga dapat memproses perhitungan ukuran wilayah trombus, ukuran maksimum diameter, nilai kecepatan aliran darah dan nilai volume aliran darah. Pada penelitian ini dapat dilihat bahwa parameter keberadaan trombus dapat mempengaruhi volume dan kecepatan aliran darah, yakni semakin besar wilayah trombus akan semakin mengurangi nilai volume dan nilai kecepatan aliran darah, demikian juga sebaliknya. Namun, keberadaan trombus, nilai kecepatan aliran darah, maupun volume aliran darah belum terbukti dapat mempengaruhi evolusi diameter dinding AAA kecil. Kata Kunci : Aliran Darah, Aneurisma Aorta Abdominal, MRI, Pengolahan citra, Trombus

PERNYATAAN ORIGINALITAS DAN PUBLIKASI Saya yang bertanda tangan di bawah ini: Nama NIM : 99208903 : Cut Maisyarah Karyati Judul Disertasi : Rekonstruksi 4D Citra MRI Aliran Darah dan Trombus pada Pasien Aneurisma Aorta Abdominalis Tanggal Sidang : 3 Desember 2013 Tanggal Lulus : 3 Desember 2013 Menyatakan bahwa tulisan ini adalah merupakan hasil karya saya sendiri dan dapat dipublikasikan sepenuhnya oleh Universitas Gunadarma. Segala kutipan dalam bentuk apa pun telah mengikuti kaidah dan etika yang berlaku. Mengenai isi dan tulisan adalah merupakan tanggung jawab Penulis, bukan Universitas Gunadarma. Demikian pernyataan ini dibuat dengan sebenarnya dan dengan penuh kesadaran. Depok, 3 Desember 2013 (Cut Maisyarah Karyati )

Rekonstruksi 4D Citra MRI Aliran Darah dan Trombus pada Pasien Aneurisma Aorta Abdominalis DISERTASI Untuk Memenuhi Salah Satu Syarat Meraih Gelar Doktor Teknologi Informasi di bawah Pimpinan Rektor Universitas Gunadarma Profesor Doktor E.S. Margianti, SE., MM Dipertahankan dalam Sidang Terbuka Senat Universitas Gunadarma Pada Hari Selasa Tanggal 3 Desember 2013 Jam 09.00 WIB - Selesai CUT MAISYARAH KARYATI P R O G R A M D O K T O R T E K N O L O G I I N F O R M A S I P R O G R A M P A S C A S A R J A N A UNIVERSITAS GUNADARMA 2013

Rekonstruksi 4D Citra MRI Aliran Darah dan Trombus pada Pasien Aneurisma Aorta Abdominalis DISERTASI CUT MAISYARAH KARYATI Telah disetujui oleh: Profesor Doktor Sarifuddin Madenda Promotor Profesor Doktor Dokter Johan Harlan Ko-Promotor Profesor Doktor rer nat Achmad Benny Mutiara Ko-Promotor Depok, 2013

Daftar Riwayat Hidup Cut Maisyarah Karyati, dilahirkan di kota Banda Aceh pada tanggal 21 Mei 1971 dari Bapak H. Teuku Zaini dan Ibu Hj. Cut Ismarjati. Anak terakhir dari 7 bersaudara (5 perempuan dan 2 laki-laki). Lulus Sekolah Dasar tahun 1984 di SDN 14 Jakarta, selanjutnya lulus di SMPN 99 Jakarta tahun 1987 dan lulus di SMAN 31 Jakarta tahun 1990. Melanjutkan kuliah di STMIK Gunadarma jurusan Manajemen Informatika dan lulus S1 pada tahun 1996. Kemudian menerskan S2 pada Universitas Gunadarma program studi Magister Manajemen dan lulus pada tahun 1998. Lulus pendidikan S3 tahun 2013 pada program studi Teknologi Informasi di Universitas Gunadarma. Menikah dengan Aries Muslim sejak 2 November 1997. Saat ini bertempat tinggal di Perumahan Rancabana Jln. Bhineka II B/7 Rumbut Kelapa Dua, Depok 16951.

KATA PENGANTAR Bismillaahirrahmaanirrahiim. Assalamu alaikum Warrahmatullaahi Wabarokaatuh Alhamdulillahi robbil aalamiin, segala puji bagi Allah, Tuhan semesta alam. Puji syukur ke hadirat Allah SWT, atas berkat rahmat, bimbingan, pertolongan, karunia, ilmu, dan pengetahuan-nya, Penulis dapat menyelesaikan penyusunan disertasi ini dengan sebaikbaiknya. Disertasi ini dihasilkan dengan bantuan berbagai pihak, baik bantuan materi, maupun bantuan moril. Pada kesempatan ini, Penulis dengan segala kerendahan dan ketulusan hati ingin menghaturkan ucapan terima kasih yang sebesar-besarnya bagi semua pihak yang memberikan bantuan tersebut, kepada : 1. Yayasan Pendidikan Gunadarma, yang telah memberikan beasiswa kepada Penulis untuk melanjukan pendidikan di Program Doktor Teknologi Informasi di Universitas Gunadarma. 2. Ibu Prof. Dr. E. S. Margianti, SE., MM, Rektor Universitas Gunadarma dan Bapak Prof. Suryadi H. S, SSi., MMSI., Pembantu Rektor II Universitas Gunadarma, yang telah memberikan kesempatan dan kepercayaan kepada Penulis untuk melanjutkan studi di Program Doktor Teknologi Informasi Universitas Gunadarma. 3. Bapak Prof. Dr. Yuhara Sukra, MSc., Koordinator Program Pasca Sarjana Universitas Gunadarma, yang telah memberikan petunjuk penulisan disertasi ini. 4. Bapak Prof. Dr Busono Soerowirdjo, MSc., Direktur Program Doktor Teknologi Informasi. 5. Bapak Prof. Dr. I Wayan Simri Wicaksana, Ketua Program Doktor Teknologi Informasi 6. Bapak Dr. Eri Prasetyo, Sekretaris Program Doktor Teknologi Informasi beserta staff. 7. Ibu Prof. Dr. Ir. Tati Latifah R. Mengko, selaku Penguji luar. 8. Bapak Prof. Dr. Sarifuddin Madenda, sebagai Promotor yang dengan segala keikhlasan dan kesabarannya selalu menyediakan waktu dan membagi ilmunya, meluruskan di kala Penulis salah arah, mengingatkan agar fokus pada penelitian, memotivasi di kala Penulis mulai kurang semangat, dan banyak memberikan masukan serta koreksi terhadap penelitian yang Penulis lakukan.

9. Bapak Prof. Dr. dr. Johan Harlan, selaku Ko-Promotor yang dengan keikhlasan dan kesabarannya membagi waktunya dan memberikan ilmu serta masukan dalam bidang medis terhadap penelitian yang Penulis lakukan. 10. Bapak Prof. Dr. rer nat. Achmad Benny Mutiara, selaku Ko-Promotor, yang senantiasa meluangkan waktu dan kesempatan pada Penulis untuk berdiskusi tentang materi penelitian sejak awal perkuliahan hingga diselesaikannya penelitian ini. 11. Prof. François Brunotte, Prof. Eric Steinmentz, dr. Alexandre Cochet, PhD, dan dr. Olivier Buchot, PhD dari CHU de Bocages, Dijon, Perancis, yang telah memberikan waktu dan kesempatan Penulis untuk belajar dan mengambil data penelitian. 12. Alain Lalande, PhD, Paul M. Walker, PhD, Marie Xavier, PhD, dan Sebastian Parfait, PhD, selaku guru dan rekan sejawat pada groupe Imagerie Médicale, Le2i, Faculté de Médecine, Université de Bourgogne, France. 13. Bapak Dr.ing Adang Suhendra dan Akbar Marwan, ST, MT beserta keluarga, atas dukungannya kepada penulis. 14. Teman-teman S3-TI Universitas Gunadarma, Angkatan 9, Dr. Andini Sintawati, Dr. Onny Marleen, Dr. Rodiah, Dr. Novrina, Achmad Tantawi, ST, MT, Riza, Doddy dan Narendro, atas berbagi suka duka selama perkuliahan berlangsung. 15. Sahabat sesama peneliti di Université de Bourgogne, Dr. Sunny Arief, Dr. Elfitrin, Dr. M. Iqbal, Dr. Ira Puspita, Dr. Dian Kemalaputri, Dr. Debyo Saptono, Aning, Dr. Purnawarman Musa, dan Yudi Nugraha, terimakasih karena sudah menjadi saudara bagi Penulis selama berada di Perancis. 16. Rekan-rekan VIBOT dan MCV Université de Bourgogne tahun 2009-2011, Philip, Bakr, Vanya, Rocio, Adiguna Mahendra dan Ruddy J. Suhatril, atas persahabatan yang luar biasa selama belajar di Perancis. 17. Adik-adikku di jurusan SarMag TI dan Elektro Universitas Gunadarma Angkatan 1-4 yang belajar Université de Bourgogne, le-creusot, Perancis, atas kebersamaan dan bantuannya kepada Penulis untuk berbagi ilmu, terutama pada saudara Sigit Widiyanto, Prasetyo, dan Arrumaisha. 18. Suami tercinta, Aries Muslim, SKom, MM, atas segenap cinta dan pengertiannya, atas dukungan dan motivasinya, dan atas do a yang luar biasa hingga Penulis bisa menyelesaikan disertasi ini. Bagi Penulis, beliau juga adalah guru, sahabat dan partner kerja di semua bidang, dengan penuh suka dan duka. 19. Ayahanda T. Zaini, SH (alm) dan Ibunda Cut Ismarjati (alm) tersayang, yang selalu memberi restu dan doa, serta kasih sayang yang tak putus kepada penulis. Rasanya

Penulis tak akan sanggup membayar segala perjuangan, pengorbanan, perhatian dan kasih sayang yang diberikannya dengan tulus dan ikhlas. 20. Papa Mudjadid Djafar (alm) dan Mama Yayah Saroyah, serta adik-adikku Arief, Reza dan Ana beserta keluarga, yang selalu memberi restu dan do a kepada Penulis. 21. Kakak-kakakku tercinta, T. Dharyan Surya Chandra (alm), Cut Lis Marita, Cut Noviani, Cut Lisa Marlina, Cut Efriati dan T. Putra, beserta keluarga, atas dukungan lahir dan batin demi kelancaran dan kesuksesan Penulis dalam menyelesaikan penelitian ini. 22. Rekan-rekan di Bagian Sidang PI dan Sidang Sarjana, di PSMA Online serta BAAK, yang selalu menyemangati Penulis dalam menyelesaikan disertasi ini. 23. Keluarga Courtot, Keluarga Barshot, Keluarga Zainan, Keluarga Julia dan Keluarga Saepudin, atas kesediaannya menjadi kerabat Penulis selama melakukan penelitian di Dijon, Perancis. Terimakasih atas kebersamaan yang indah. 24. Semua Pihak yang tidak dapat disebutkan satu per satu yang telah turut memberikan bantuan dan peran serta dalam penyelesaian penelitian ini. Penulis juga mengucapkan terima kasih kepada semua pihak yang tidak dapat disebutkan satu per satu atas bantuan, saran, masukan serta do a yang telah diberikan. Hanya Allah SWT yang dapat membalas semua itu. Penulis menyadari sepenuhnya bahwa disertasi ini masih jauh dari sempurna. Untuk itu Penulis sangat mengharapkan kritik dan saran yang membangun. Akhir kata semoga disertasi ini dapat berguna bagi diri Penulis pada khususnya dan bagi para pembaca pada umumnya. Wabillahi taufiq wal hidayah Wassalamu alaikum warrahmatullohi wa barokaatuh Depok, 3 Desember 2013 Penulis (Cut Maisyarah Karyati)

DAFTAR ISI JUDUL PERNYATAAN ORIGINALITAS DAN PUBLIKASI LEMBAR PENGESAHAN ABSTRAK ABSTRACT KATA PENGANTAR DAFTAR ISI DAFTAR TABEL DAFTAR GAMBAR DAFTAR ISTILAH i iii iv vi vii viii xi xiv xv xix BAB 1 PENDAHULUAN 1 1.1 Latar Belakang Penelitian 3 1.2 Batasan Penelitian 8 1.3 Rumusan Penelitian 11 1.4 Tujuan Penelitian 12 1.5 Kontribusi Hasil Penelitian 13 BAB 2 TELAAH PUSTAKA 14 2.1 Pengolahan Citra 14 2.2. Citra Medis 16 2.3. Segmentasi Citra Medis 29 2.3.1. Thresholding (pengambangan) 33 2.3.2. Polygon 34 2.3.3. Operasi Morfologi 35

2.3.4. Deformable Model (Model Terdeformasi) 35 2.3.5. Pendekatan Terhadap Metode Segmentasi Citra Medis 40 2.4. Rekonstruksi Citra Medis 44 2.4.1. Metode Interpolasi 46 2.4.2. Pendekatan Terhadap Metode Rekonstruksi Citra Medis 47 2.5. Visualisasi Citra Medis 54 2.6. Aorta 56 2.6.1. Anatomi Aorta 56 2.6.2. Aneurisma Aorta 57 2.6.3. Pendekatan Terhadap Parameter Diameter Aneurisma Aorta Abdominalis 60 2.6.4. Aliran Darah 62 2.6.5 Aplikasi Mekanika Fluida pada Aliran Darah 63 2.6.6. Pendekatan Terhadap Parameter Kecepatan Aliran Darah Pada Aneurisma Aorta Abdominalis 64 2.6.7. Penggumpalan Darah (Trombus) 68 2.6.8 Pendekatan Terhadap Parameter Trombus Pada Aneurisma Aorta Abdominalis 69 2.7. Rangkuman Hasil Penelitian Aneurisma Aorta Abdominal 72 BAB 3 METODE PENELITIAN 77 3.1 Sampel Pasien Aneurisma Aorta Abdominal (AAA) Kecil 78 3.2 Akuisisi Citra Aorta Menggunakan MRI 79 3.2.1. Protokol Akuisisi Citra Menggunakan MRI dalam penelitian ini 79 3.2.2. Citra Relaksasi T1 dan T2 84 3.2.3 Citra Amplitudo dan Fase Kontras 85 3.3 Manajemen Citra dengan DICOM 87 3.4 Pengolahan Citra dengan Perangkat Lunak MatLab 88 3.4.1 Analisis Trombus 88 3.4.2. Analisis Aliran Darah 95 3.4.3 Rekonstruksi Citra Aliran Darah 104 3.4.4 Pembuatan GUI pada Matlab 107

BAB 4 HASIL DAN PEMBAHASAN 112 4.1 Hasil Analisis Trombus 112 4.2 Hasil Analisis Aliran Darah 117 4.3 Hasil Rekonstruksi Citra Aliran Darah 123 BAB 5 KESIMPULAN DAN SARAN 122 5.1 Kesimpulan 125 5.2 Saran 126 5.3 Penelitian Lanjutan 126 DAFTAR PUSTAKA 127 LAMPIRAN DAFTAR RIWAYAT HIDUP

DAFTAR TABEL Tabel 2.1 Contoh Informasi Tags pada DICOM 25 Tabel 2.2. Interval waktu yang Disarankan untuk Pengamatan Citra Digital 61 pada Aneurisma Aorta Abdomen vs Diameter Aorta Tabel 3.1 Karakteristik Pasien 79 Tabel 3.2 Jenis Protokol Akuisisi Citra dengan MRI 80 Tabel 3.3 Informasi umum 87 Tabel 3.4 Informasi rinci 87 Tabel 4.1 Hasil Analisis Trombus 114 Tabel 4.2 Hasil Analisis Trombus dan Hasil Analisis Aliran Darah 117

DAFTAR GAMBAR Gambar 1.1 Anatomi Jantung 4 Gambar 1.2 Pembuluh Darah 5 Gambar 1.3. Anatomi Aorta 6 Gambar 2.1 Skema sistem MRI 18 Gambar 2.2 Orientasi bidang citra (a) axial, (b) sagittal, (c) Coronal 20 Gambar 2.3 Skema Dasar Ruang MRI 21 Gambar 2.4 Area aplikasi DICOM 24 Gambar 2.5 Penentuan Nilai Ambang T 33 Gambar 2.6 Contoh polygon 8 sisi dengan warna merah tertutup oleh tepi hitam 34 Gambar 2.7 Bentuk dasar aktif kontur 39 Gambar 2.8 Topologi aktif kontur (Snake) 39 Gambar 2.9 Segmentasi citra multislices dengan Deformable Model pada pasien AAA 40 Gambar 2.10 Proses Deteksi Tepi 42 Gambar 2.11 Contoh hasil segmentasi aorta dari beberapa pendekatan segmentasi 42 Gambar 2.12 Piksel tetangga dalam 8 arah 44 Gambar 2.13 Citra Paralel (a) dan citra divergent (b) darijenis irisan citra 2D 45 Gambar 2.14 Luas segitiga sebangun menunjukkan area yang digunakan untuk 47 menurunkan formula interpolasi linear Gambar 2.15 Citra Rekonstruksi Janin dari USG 48 Gambar 2.16 Epipolar Geometri 50 Gambar 2.17 Blok diagram sistem rekonstruksi permukaan cortical 51

Gambar 2.18 Rendering permukaan medial pada citra cortical yang direkonstruksi 51 Gambar 2.19 Arsitektur dari rekonstruksi citra terurut dari kamera 52 Gambar 2.20 Hasil rekonstruksi Citra 4D dari materi tiruan (phantom) dari organ 53 jantung Gambar 2.21 Model penyimpanan piksel pada buffer memori 54 Gambar 2.22 Operasi pengubahan citra 24 bit (piksel warna) ke citra abu-abu YUV 55 Gambar 2.23 Aorta dalam tubuh manusia 56 Gambar 2.24 Jenis Aneurisma aorta 58 Gambar 2.25 Contrast-enhanced CT scan dengan rekonstruksi 3D menampilkan nilai 60 diameter AAA 5.6 cm Gambar 2.26 Tingkat pertumbuhan aneurisma aorta abdomen kecil vs ukuran diameter 61 aneurisma Gambar 2.27 Aliran Darah Normal 62 Gambar 2.28 Perilaku rheologi darah dan plasma sesuai dengan Kurva Viscosimetric 63 dari cairan Newtonian dan fluida non-newtonian Gambar 2.29 Jalur/baris arus dalam tabung 64 Gambar 2.30 Contoh aneurisma aorta abdominalis (AAA) dengan menggunakan 65 protokol cine MR Gambar 2.31 Prinsip metode 3D paraboloid 66 Gambar 2.32 Citra 3D Paraboloid 66 Gambar 2.33 Plot kontur dari profil kecepatan (m/s) dari peak systole pada semua 67 subjek Gambar 2.34 Citra 2D yang merepresentasikan vektor kecepatan aliran darah 67 Gambar 2.35 Trombus pada aorta 68 Gambar 2.36 Kategori trombus pada pria 71 tahun 70

Gambar 2.37 Permukaan lumen (magenta), trombus (kuning) dan dinding AAA (ungu) 71 divisualisasikan oleh CT-scan (kiri). Hasil visualisasi dari metode finite element mesh (kanan) Gambar 3.1 Diagram Metodologi Penelitian Secara Umum 77 Gambar 3.2 (a) MRI Siemens 3T (b) Citra Sagittal (c) Citra yang digunakan dalam penelitian ini 83 Gambar 3.3 (a) citra relaksasi T1 dan (b) T2, pada aneurisma aorta abdominal 84 Gambar 3.4 (a) citra amplitudo, (b) citra fase kontras 86 Gambar 3.5 Tiga arah pemantauan (a) LR, (b) AP, (c) TP 86 Gambar 3.6 Polygon yang diwakilkan dengan beberapa simpul 90 Gambar 3.7 Kontur manual pada citra T1 90 Gambar 3.8 Diameter aorta yang diperoleh secara otomatis 92 Gambar 3.9 (a) citra relaksasi T1, (b) citra relaksasi T2, (c) area normalisasi 94 Gambar 3.10 (a) penelusuran kontur otomatis pada citra amplitudo, (b) aorta terpilih 101 Gambar 3.11 Encoding Kecepatan pada Citra Fase Kontras dari MRI 101 Gambar 3.12 Kaitan Vektor 3D dengan piksel citra pada skala keabuan 102 Gambar 3.13 Pemilahan warna untuk mewakili arah vektor 103 Gambar 3.14 Hasil segmentasi irisan citra aorta 106 Gambar 3.15 GUI Utama 108 Gambar 3.16 Bagan Alir GUI Analisis Trombus 109 Gambar 3.17 Bagan Alir GUI Analisis Aliran Darah 110 Gambar 3.18 Tampilan GUI untuk Analisis Trombus 111 Gambar 3.19 Tampilan GUI untuk Analisis Aliran Darah 111 Gambar 4.1 (a) Kategori AAA tanpa trombus (luas permukaan trombus = 11,6% < 30%), (b) Kategori AAA dengan trombus (luas permukaan trombus = 112

86,1% > 30%) Gambar 4.2 Citra pasien penderita AAA dengan kategori trombus heterogen 115 Gambar 4.3 Citra pasien penderita AAA dengan trombus Homogen 115 Gambar 4.4 Citra pasien penderita AAA Kecil dengan trombus tidak terdefinisi 116 Gambar 4.5 Citra pasien penderita AAA Kecil tanpa trombus 116 Gambar 4.6 Grafik Kecepatan Aliran Darah Sesaat dengan beberapa irisan citra aliran darah 3D pada kategori trombus heterogen Gambar 4.7 Grafik Kecepatan Aliran Darah Sesaat bersama dengan beberapa irisan citra aliran darah 3D pada kategori trombus homogen Gambar 4.8 Grafik Kecepatan Aliran Darah Sesaat bersama dengan beberapa irisan citra aliran darah 3D pada kategori trombus tidak terdefinisi 118 119 120 Gambar 4.9 Grafik Kecepatan Aliran Darah Sesaat bersama dengan beberapa irisan 121 citra aliran darah 3D pada AAA kecil tanpa trombus Gambar 4.10 Rekonstruksi 4D citra aliran darah pada kategori trombus heterogen 122 Gambar 4.11 Rekonstruksi 4D citra aliran darah pada kategori trombus homogen 122 Gambar 4.12 Rekonstruksi 4D citra aliran darah pada kategori trombus tidak 123 terdefinisi Gambar 4.13 Rekonstruksi 4D citra aliran darah pada AAA kecil tanpa trombus 123

DAFTAR ISTILAH Abdominal/Abdomen Perut Aneurisma/Aneurysm Pelebaran setempat pembuluh darah arteri Angiografi Visualisasi pembuluh darah secara radiologi dengan menyuntikkan zat kontras yang radio-opak ke dalam sirkulasi darah Aorta Pembuluh darah arteri terbesar yang membawa darah yang tinggi oksigen keluar dari jantung kiri Aorta asendens Aorta menaik Aorta descending Aorta menurun Asimptomatik Tanpa gejala Clipping Penjepitan pembuluh darah pada area aneurisma dengan menggunakan klip Degeneratif Proses kemunduran karena usia Diseksi Pemisahan dinding aorta lapis demi lapis Disfagia Kesulitan menelan Dislipidemi Kadar lemak dalam darah tak seimbang Embolisasi Pelepasan coil (spiral) pada kateterisasi yang akan menghasilkan pembekuan darah yang menutup aneurisma Endoluminal Di dalam lumen Enzimatik Proses kerja enzim, yaitu protein yang menjadi katalisator biologis Fibrin Protein berwarna putih yang dibentuk dari fibrinogen sebagai hasil aktivitas trombus Fusiform Salah satu bentuk aneurisma yang pelebarannya simetris Hemodinamik Tidak statik dan selalu bergerak pada porosnya Hemoptisis Batuk darah Intraluminal Di dalam lumen

Koagulasi Lumen Phantom Pseudoneurysm/false aortic aneurysm Refluks/Regurgitasi Ruptura Toraks Trombus Penggumpalan darah Rongga di dalam pembuluh darah, tempat darah mengalir Tiruan anatomi tubuh Akumulasi darah ekstravaskuler disertai disrupsi ketiga lapisan pembuluh darah Pembalikan aliran darah Sobek/koyak Dada Bekuan darah dalam lumen pembuluh darah