UNIVERSITAS INDONESIA POLA RESISTENSI BAKTERI DALAM DARAH TERHADAP KLORAMFENIKOL, TRIMETHOPRIM/SULFAMETOKSAZOL, DAN TETRASIKLIN DI LABORATORIUM MIKROBIOLOGI KLINIK FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS INDONESIA (LMK FKUI) PADA TAHUN 2001-2006 SKRIPSI TOMMIE PRASETYO U. W. 0105001677 FAKULTAS KEDOKTERAN JAKARTA JUNI 2009
UNIVERSITAS INDONESIA POLA RESISTENSI BAKTERI DALAM DARAH TERHADAP KLORAMFENIKOL, TRIMETHOPRIM/ SULFAMETOKSAZOL, DAN TETRASIKLIN DI LABORATORIUM MIKROBIOLOGI KLINIK FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS INDONESIA (LMK FKUI) PADA TAHUN 2001-2006 SKRIPSI Diajukan sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar sarjana kedokteran. TOMMIE PRASETYO U. W. 0105001677 FAKULTAS KEDOKTERAN JAKARTA JUNI 2009
PERNYATAAN ORISINALITAS Penelitian ini adalah hasil karya saya sendiri, dan semua sumber baik yang dikutip maupun dirujuk telah saya nyatakan dengan benar. Nama : Tommie Prasetyo U. W. NPM : 0105001677 Tanda tangan : Tanggal : 3 Juli 2009 ii
LEMBAR PENGESAHAN Skripsi ini diajukan oleh : Nama : Tommie Prasetyo U. W. NPM : 0105001677 Program Studi Judul Skripsi : Pendidikan Dokter Umum : Pola Resistensi Bakteri dalam Darah terhadap Kloramfenikol, Trimethoprim/Sulfametoksazol, dan Tetrasiklin di Laboratorium Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia (LMK FKUI) pada tahun 2001-2006 Telah berhasil dipertahankan di hadapan Dewan Penguji dan diterima sebagai bagian persyaratan yang diperlukan untuk memperoleh gelar sarjana pada Program Pendidikan Dokter Umum Fakultas Kedokteran. DEWAN PENGUJI Pembimbing : Dr. Anis Karuniawati, SpMK, PhD ( ) Penguji : Dr. Anis Karuniawati, SpMK, PhD ( ) Penguji : Dr. T. Mirawati Sudiro, SpMK, Ph.D ( ) Jakarta, 3 Juli 2009 iii
KATA PENGANTAR Alhamdulillah, segala puji bagi Allah SWT, hanya dengan rahmatnya saya dapat menyelesaikan pembuatan skripsi yang berjudul Pola Resistensi Bakteri dari Darah terhadap Kloramfenikol, Trimethoprim/Sulfametoksazol, dan Tetrasiklin di Laboratorium Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran (LMK FKUI) pada tahun 2001-2006 ini dengan cukup mudah dan lancar. Ucapan terima kasih kami sampaikan kepada dr. Anis Karuniawati, SpMK, PhD selaku pembimbing penulis dalam pembuatan skripsi ini. Kemudian kepada DR. dr. Ernie H. Purwaningsih atas bimbingan yang telah diberikan. Juga kepada seluruh staf Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI yang terlibat dalam penyediaan data sekunder dalam penelitian ini. Kemudian kepada orangtua saya, teman-teman dan pihak-pihak yang tidak dapat saya sebutkan satu per satu, yang telah memberikan dukungannya baik dukungan moral maupun material sehingga saya dapat menyelesaikan skripsi ini dengan lancar. Harapan saya skripsi ini dapat menambah pengetahuan di bidang kedokteran khususnya bidang mikrobiologi mengenai resistensi bakteri terhadap antibiotik. Terlebih lagi bila tulisan ini bermanfaat bagi penggunaan antibiotik secara klinis dan dapat menolong orang banyak. Saya menyadari bahwa skripsi ini jauh dari sempurna. Oleh karena itu saya mohon maaf kepada pembaca bila terdapat kesalahan atau kekurangan dalam tulisan ini yang mengganggu atau tidak berkenan di hati pembaca. Saran dan kritik yang membangun selalu saya harapkan demi kesempurnaan ilmu pengetahuan dan perbaikan tulisan saya berikutnya. Selamat membaca. Jakarta, 3 Juli 2009 Tommie Prasetyo U. W. iv
HALAMAN PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI TUGAS AKHIR UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS Sebagai sivitas akademik, saya yang bertanda tangan di bawah ini: Nama : Tommie Prasetyo U. W. NPM : 0105001677 Program Studi : Pendidikan Dokter Umum Fakultas : Kedokteran Jenis karya : Skripsi demi pengembangan ilmu pengetahuan, menyetujui untuk memberikan kepada Hak Bebas Royalti Non-Eksklusif (Non-Exclusive Royalty- Free Right) atas karya ilmiah saya yang berjudul: Pola Resistensi Bakteri dalam Darah terhadap Kloramfenikol, Trimethoprim/Sulfametoksazol, dan Tetrasiklin di Laboratorium Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran (LMK FKUI) pada tahun 2001-2006 beserta perangkat yang ada (bila diperlukan). Dengan Hak Bebas Royalti Non-Eksklusif ini berhak menyimpan, mengalihmedia/format-kan, mengelola dalam bentuk pangkalan data (database), merawat, dan mempublikasikan tugas akhir saya selama tetap mencantumkan nama saya sebagai penulis/pencipta dan sebagai pemilik Hak Cipta. Demikian pernyataan ini saya buat dengan sebenarnya. Jakarta, 3 Juli 2009 Yang menyatakan Tommie Prasetyo U. W. v
DAFTAR ISI HALAMAN JUDUL...i PERNYATAAN ORISINALITAS... ii LEMBAR PENGESAHAN... iii KATA PENGANTAR...iv LEMBAR PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI KARYA ILMIAH...v ABSTRAK...vi ABSTRACT... vii DAFTAR ISI... viii DAFTAR TABEL...x DAFTAR GAMBAR...xi DAFTAR SINGKATAN... xii 1. PENDAHULUAN...1 1.1. Latar Belakang...1 1.2. Rumusan Masalah...2 1.3. Pertanyaan Penelitian...2 1.4. Tujuan Penelitian...2 1.4.1. Tujuan Umum...2 1.4.2. Tujuan Khusus...2 1.5. Manfaat Penelitian...2 2. TINJAUAN PUSTAKA...4 2.1. Bakteri...4 2.1.1. Definisi...4 2.1.2. Klasifikasi...4 2.1.3. Struktur.....6 2.1.4. Pertumbuhan dan Reproduksi.....7 2.2. Antibiotik...8 2.2.1. Klasifikasi...9 2.2.2. Resistensi Bakteri terhadap Antibiotik...11 2.2.3. Pemeriksaan Aktivitas Antimikroba in vitro...13 2.2.4. Kloramfenikol...15 2.2.5. Tetrasiklin...16 2.2.6. Trimethoprim/Sulfametoksazol...17 2.3. Kultur darah...19 2.3.1. Kepentingan Klinis.....19 2.3.2. Pengumpulan dan Transpor spesimen...19 2.3.2.1. Waktu Pengumpulan Kultur Darah....19 2.3.2.2. Jumlah Spesimen Darah untuk Pembuatan Kultur...20 2.3.2.3. Volume Darah....20 2.3.2.4. Distribusi Darah...21 2.3.2.5. Pengcegahan Kontaminasi Kultur Darah....21 2.3.2.6. Pengumpulan Kultur Darah...21 2.3.2.7. Kriteria Penolakan...23 viii
2.3.3. Pedoman Khusus Berhubungan dengan Pemeriksaan Kultur Darah 23 2.3.4. Kerangka Konseptual...24 3. METODE PENELITIAN...25 3.1. Desain Penelitian...25 3.2. Tempat dan Waktu Penelitian...25 3.3. Populasi Penelitian...25 3.3.1. Populasi Target...25 3.3.2. Populasi Terjangkau...25 3.4. Sampel dan Cara Pemilihan Sampel...25 3.5. Besar Sampel...26 3.6. Kriteria Inklusi dan Eksklusi...26 3.6.1. Kriteria Inklusi...26 3.6.2. Kriteria Eksklusi...26 3.7. Cara Kerja...27 3.8. Definisi Operasional...30 3.9. Persetujuan Setelah Penjelasan (Informed Consent)...31 4. HASIL...32 5. PEMBAHASAN...40 6. KESIMPULAN DAN SARAN...44 6.1. Kesimpulan...44 6.2. Saran...44 DAFTAR REFERENSI...46 ix
DAFTAR TABEL Tabel 1. Tabel 2. Sebaran isolat bakteri gram positif dan negatif dari darah di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI, Tahun 2001-2006 32 Persen resistensi beberapa bakteri yang didapatkan dari spesimen darah di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006 terhadap antibiotik kloramfenikol, kotrimoksasol, dan tetrasiklin...38 x
DAFTAR GAMBAR Gambar1. Pola resistensi Acinetobacter anitratus terhadap antibiotika kloramfenikol dan kotrimoksasol di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006...33 Gambar2. Pola resistensi Klebsiella pneumoniae terhadap antibiotika kloramfenikol dan kotrimoksasol di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006...34 Gambar3. Pola resistensi Pseudomonas aeruginosa terhadap antibiotika kloramfenikol dan kotrimoksasol di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006...35 Gambar4. Pola resistensi Salmonella Typhi terhadap antibiotika kloramfenikol dan trimethoprim/ sulfamethoxazole di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006...35 Gambar5. Pola resistensi Staphylococcus epidermidis terhadap antibiotika kloramfenikol dan kotrimoksasol di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006...36 Gambar6. Pola resistensi Staphylococcus aureus terhadap antibiotika kloramfenikol dan kotrimoksasol di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI Tahun 2001-2006...37 Gambar7. Pola kepekaan berbagai bakteri yang didapatkan dari spesimen darah terhadap tetrasiklin di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI tahun 2001-2003......39 xi
DAFTAR SINGKATAN CLSI DNA DAP MDR MIC MLC mrna NAG LMK FKUI LPS PABA PBP PUFA RSCM trna : Clinical and Laboratory Standards Institute : Deoxyribonucleic Acid : Diaminpimelat : Multi Drug Resistant : Minimum Inhibitory Concentration : Minimum Lethal Concentration : messenger-ribonucleic acid : N-acetylglucosamine : Laboratorium Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran : Lipopolisakarida : p-aminobenzoat : protein binding penicillin : Polyunsaturated Fatty Acids : Rumah Sakit Cipto Mangunkusumo : transfer- Ribonucleic acid xii