Materi kuliah Bioteknologi Pertanian Jurusan Agribisnis Pertemuan ke 2 Dosen: Ir. Sri Sumarsih, MP. Struktur Sel Kompetensi: 1. Memahami komponen dasar sel, struktur dan fungsinya, 2. Membedakan sel prokariot dan eukariot Kelengkapan materi kuliah: Animasi Struktur dan Komponen Sel beserta Fungsi nya Evaluasi: E-mail: 1. Pertanyaan lisan Sumarsih_03@yahoo.com 2. Tugas tertulis secara individu Weblog: flagella kapsul Membran Ribosom Sumarsih07.wordpress.com plasma dlm Website: agriculture.upnyk.ac.id pili Dinding 1 2 sel KEANEKARAGAMAN BENTUK KEHIDUPAN DI ALAM Jasad hidup di alam: non seluler dan seluler Non seluler: satuan jasad hidup berupa virion bersifat parasit obligat ciri hidup hanya nampak saat berada di dalam sel berupa partikel yang terdiri bahan genetik (/RNA) pada virus dan viroid atau hanya protein pada prion Seluler: satuan jasad hidup berupa sel ciri hidup tetap nampak tanpa ada interaksi dengan sistem biologis lain 3 JASAD HIDUP SELULER DAN KLASIFIKASINYA Semua jasad hidup seluler dapat diidentifikasi sebagai genus dan spesies, misal nama: Canis lupus (serigala) Pengelompokan : kingdom > Phylum > Class > Order > Family > Genus > Species 6 Kingdom jasad hidup seluler: Sel prokariot Archaebacteria bakteri anaerobik Eubacteria autotroph dan heterotroph Sel eukariot Protista organisme satu sel (awal Eukariot) Fungi khamir, mold, mushroom Plantae - umumnya tumbuhan multiselular Animalia hewan multiselular dari sponge sampai manusia 4
Penemuan Robert Hooke dan Antonie van Leeuwenhoek Sel tumbuhan yang tersusun membentuk jaringan Sel sperma Berbagai macam hewan satu sel yang hidup dalam air Animalcule dan Sel yang berisi Juice Awal penemuan sel: Galileo melihat mata faset dari insekta Robert hooke melihat bagian terkecil mahluk hidup yang dia beri nama sel Van Leeuwenhoek menemukan beberapa tipe sel hidup termasuk sperma Schleiden and Schwann mengajukan ide bahwa semua kehidupan terdiri sel Virchow berkesimpulan bahwa sel berasal dari sel 6 Jaringan: Kelompok sel yang terorganisasi untuk aktivitas khusus Sel : Unit terkecil yang mempunyai kemampuan hidup dan berkembang biak secara mandiri atau bagian dari organisme multiseluler Organel :Isi sel kecuali pada bakteri,yg dikelilingi membran atau bagian terpisah yang punya tugas khusus Molekul: Unit yg terdiri 2 atau lebih atom yang terikat Atom : Unit terkecil unsur yang menyimpan sifat unsur Partikel Subatomik: Elektron, proton, atau netron, yang merupakan penyusun atom 7 Struktur Dasar Sel Pengorganisasian struktur sel Membran plasma memisahkan sel dari lingkungannya, mengatur aliran molekul yang melalui membran, dan mengandung reseptor yang mempengaruhi aktivitas sel. Bagian yang mengandung membawa sifat yang diturunkan, dapat digandakan dan diterjemahkan. Sitoplasma terdapat sistem membran, partikel termasuk ribosom, filamen/ sitoskeleton dan bahan semi-cair Terdapat 2 macam sel di alam: Sel Eukariotik yg nampak jelas dapat dibedakan organelnya termasuk membran inti sel Sel prokariotik / bakteri yang tidak mempunyai inti sel 8
Sel Prokariot- Sel Bakteri Prokariotik berarti sebelum inti, yang menunjukkan keberadaan bakteri sebelum sel berevolusi adalah seperti inti sel; bakteri tersebar dalam plasma (seperti nukleoid) Bakteri adalah sel terkecil dan paling sederhana Flagela bakteri terletak pada membran dan merupakan alat gerak. Dinding sel yang rapuh melindungi dan mengelilingi membran sel, untuk mengatur transport bahan dari dan ke dalam sel. Ribosome, tempat pembentukan protein, tersebar di dalam. 9 Sel Eukariot Komponen sel utama Inti yang mengontrol. Ribosome yang bebas atau terikat membran, tempat pembentukan polipeptida. Endoplasmic reticule (ER) memodifikasi menjadi protein dan tempat pembentukan /lemak. Badan golgi juga memodifikasi protein, menyortir dan mengirim protein, dan berperan dalam sekresi atau penggunaan /lemak. Vesikula untuk transport, penyimpanan dan pencernaan berbagai bahan dalam sel. Mitochondria membentuk enzim untuk pembentukan ATP. Sitoskeleton yaitu bentuk sel dan organisasi internal dalam sel; yang menentukan motilitas/ kemampuan bergerak sel 10 Ujung hidrofil Ujung hidrofob 1 lapis 1 lapis Lipid bilayer/ dua lapis Struktur sel prokariot MEMBRAN SEL LIPID BILAYER Cairan ekstraseluler flagella pili kapsul Dinding sel Membran plasma Ribosom dlm 12
Golgi body microfilaments (components of cytoskeleton) STRUKTUR SEL TUMBUHAN central vacuole rough endoplasm reticulum (rough ER) ribosomes (attached to rough ER) STRUKTUR SEL HEWAN components of cytoskeleton microfilaments microtubules nuclear enevelope nucleolus NUCLEUS + nucleoplasm lysosome rough ER mitochondrion chloroplast microtubules (components of ribosomes (free in smooth endoplasmic reticulum (smooth ER) + nucleoplasm nucleolus nuclear envelope plasma membrane cell wall NUCLEUS plasma membrane mitochondrion ribosomes (attached to rough ER and free in smooth ER Golgi body pair of centrioles KOMPONEN SEL Komponen makromolekul penyusun sel terdiri atas: 1. Karbohidrat 2. Lemak 3. Protein 4. Asam nukleat Protein adalah polimer asam-asam amino (polipeptida) yang mempunyai berbagai macam fungsi dalam sel: Sebagai pengatur ekspresi genetik Protein enzim: biokatalisator reaksi biokimia dalam sel Sebagai pengangkut molekul kecil dan ion Berperan dalam sistem pergerakan terkoordinasi Komponen sistem kekebalan tubuh Pheromone Sebagai penerus impuls syaraf Sebagai komponen pendukung kekuatan regang 15 20 MACAM ASAM AMINO PENYUSUN PROTEIN Macam Asam Amino Simbul 1 Huruf Simbul 3R HurufN Alanine Arginine Asparagine Asam aspartat Cysteine Glutamine Asam Glutamat Glycine Histidine Isoleucine Leucine Lysine Methionine Phenylalanine Proline Serine Threonine Tryptophan Tyrosine Valine A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V Ala Arg Asn Asp Cys Gln Glu Gly His Ile Leu Lys Met Phe Pro Ser Thr Trp Tyr Val 16
Teori sel: Kesimpulan Semua kehidupan terdiri sel Sel adalah unit terkecil kehidupan Sel baru terbentuk hanya dari sel yang sudah ada sebelumnya Sel mempunyai membran plasma,, dan Membran plasma mempertahankan sel sebagai satu kesatuan yang terpisah Sitoplasma terdiri cairan, ribosome and organel dalam sel eukariotik terdapat diantara nucleus dan membran Kesimpulan Membrane tersusun lipid bilayer dan protein tenggelam dalam bilayer atau berada mengambang di permukaannya. Protein yang menentukan fungsi membran Protein merupakan komponen sel dengan banyak fungsi Membran dibedakan secara fungsional dengan organel Membran organel memisahkan reaksi metabolik plasma 17 18