STUDI KERAGAMAN FENOTIPE DAN PENDUGAAN JARAK GENETIK KERBAU SUNGAI, RAWA DAN SILANGANNYA DI SUMATERA UTARA SKRIPSI ANDRI JUWITA SITORUS

Transkripsi

1 STUDI KERAGAMAN FENOTIPE DAN PENDUGAAN JARAK GENETIK KERBAU SUNGAI, RAWA DAN SILANGANNYA DI SUMATERA UTARA SKRIPSI ANDRI JUWITA SITORUS PROGRAM STUDI TEKNOLOGI PRODUKSI TERNAK FAKULTAS PETERNAKAN INSTITUT PERTANIAN BOGOR 2008

2 RINGKASAN ANDRI JUWITA SITORUS. D Studi Keragaman Fenotipe dan Pendugaan Jarak Genetik Kerbau Sungai, Rawa dan Silangannya Di Sumatera Utara. Skripsi. Program Studi Teknologi Produksi Ternak. Fakultas Peternakan, Institut Pertanian Bogor. Pembimbing Utama : Dr. Ir. Cece Sumantri, M. Agr.Sc Pembimbing Anggota : Ir.Anneke Anggraeni M.Si. PhD. Penelitian bertujuan untuk memperoleh informasi mengenai keragaman fenotipe dan menduga jarak genetik kerbau sungai, rawa dan silangan (Murrah x rawa) di Sumatera Utara. Penelitian dilaksanakan dari bulan Juli sampai Agustus 2007 di Kotamadya Medan, Kabupaten Deli Serdang, Serdang Bedagai, Langkat dan Tapanuli Utara di Provinsi Sumatera Utara. Data merupakan data primer ukuran tubuh dan pengamatan sifat kualitatif pada 49 ekor kerbau sungai yaitu kerbau Murrah (15 jantan dan 34 betina), 20 ekor kerbau silangan (2 jantan dan 18 betina) serta 51 ekor kerbau rawa (12 jantan dan 39 betina). Karakteristik morfologi yang diamati adalah sifat kualitatif yaitu warna kulit, garis kalung (chevron) dan warna kaki serta sifat kuantitatif berupa ukuran-ukuran tubuh yaitu tinggi pundak, tinggi pinggul, lebar pinggul, panjang badan, lingkar dada, dalam dada dan lebar dada. Data sifat kuantitatif distandarisasi terhadap umur (3,1-4,0) tahun, lokasi (kabupaten) dan jenis kelamin (betina). Data kemudian dianalisis untuk mendapatkan rataan, simpangan baku, koefisien keragaman dan persentase heterosis. Jarak genetik diperoleh dengan melakukan analisis diskriminan pada data morfometrik. Matriks jarak genetik yang diperoleh digunakan untuk membuat dendogram (pohon filogenetik). Data sifat kualitatif diolah untuk mendapatkan persentase dengan menggunakan rumus frekuensi relatif. Hasil analisis menunjukkan bahwa secara umum ukuran tubuh kerbau rawa diketahui lebih kecil daripada kerbau sungai (Murrah) dan silangan baik jantan maupun betina (P<0,01). Kerbau Murrah jantan memiliki ukuran tubuh yang lebih besar (P<0,01) daripada kerbau rawa kecuali pada ukuran lingkar dada. Kerbau sungai Murrah betina memiliki ukuran tubuh yang hampir sama dengan silangan kecuali pada ukuran dalam dada dan lingkar dada. Ukuran lingkar dada dan dalam dada kerbau silangan lebih besar (P<0,05) daripada kerbau Murrah. Keragaman ukuran tubuh yang relatif tinggi adalah pada kerbau rawa (3,86-21,69%). Efek heterosis diketahui terjadi pada seluruh kerbau silangan. Ukuran tubuh kerbau jantan silangan memiliki persentase heterosis yang relatif lebih tinggi daripada kerbau betina. Sebagian besar kerbau rawa yang diamati berwarna abu-abu (92,16%) dan dalam jmlah kecil terdapat warna abu-abu gelap. Keseluruhan kerbau rawa memiliki chevron serta stocking. Variasi warna pada kerbau Murrah adalah hitam 75,51% dan coklat 24,49%. Seluruh kerbau Murrah tidak memiliki chevron. Stocking putih ditemukan pada kerbau Murrah dengan frekuensi yang cukup besar (36,74%). Variasi sifat kualitatif kerbau silangan merupakan variasi sifat kerbau rawa dan kerbau sungai dengan kecenderungan kemiripan sifat yang mengarah pada sifat kerbau sungai. Hasil analisis diskriminan dari sifat morfologi tubuh menunjukkan bahwa kerbau rawa dan sungai merupakan kelompok bangsa yang berbeda, sementara

3 kerbau silangan dan Murrah memiliki banyak kemiripan ukuran tubuh. Ukuranukuran tubuh yang membedakan ketiga bangsa kerbau adalah ukuran lebar pinggul, lingkar dada dan tinggi pinggul dan tinggi pundak. Kerbau rawa dan sungai (Murrah) memiliki jarak genetik paling jauh, sebaliknya kerbau sungai dan kerbau silangan memiliki jarak genetik paling dekat. Dendogram jarak genetik menunjukkan bahwa kerbau sungai dan silangan memiliki hubungan kekerabatan yang dekat. Kerbau rawa dan sungai memiliki hubungan kekerabatan yang jauh. Hasil penelitian ini mendukung pendapat sebelumnya bahwa kerbau rawa dan sungai didomestikasi dari nenek moyang yang berbeda. Kata-kata kunci: kerbau sungai, rawa, silangan, fenotipe, morfometrik, jarak genetik.

4 ABSTRACT Study on Phenotypic Variation and Estimation of Genetic Distance among River, Swamp and Crossbred Buffaloes in North Sumatera Sitorus, A., C. Sumantri, dan A. Anggraeni The objectives of this research were to study the variation of qualitative traits and morphological characteristics and to estimate genetic distances among river (Murrah), swamp and crossbred buffaloes in North Sumatera. A total of 120 buffaloes from different areas including 49 river buffaloes, 51 swamp buffaloes and 20 crossbreds were identified for their qualitative traits and measured for their quantitative traits. Genetic distance was estimated using a discriminant analysis. Morphometrical measurements of the river buffaloes were observed much higher than swamp buffaloes (P<0,01) but it was almost similar to crossbreds for some body measurements. Chest depth and chest width of river buffaloes were higher than crossbreds (P<0,05). The similarities of body measurements were found at a lower level in swamp buffaloes than the two others. Heterosis effect was found in all body measurements of crossbreds. Almost all of the swamp buffaloes had a gray coat color while 75,51% of river buffaloes had black coat color. Variation of coat colors in crossbreds was the variation of both swamp and river buffaloes. Canonical analysis showed that there were many similarities between the river buffaloes and crossbreds. The dendogram based on the genetic distance showed a large difference between river buffaloes and swamp buffaloes. This result demonstrated that both of river and swamp buffaloes were domesticated from different ancestor. Lower difference of the genetic distance was found between riverian and crossbreds. Thus, it might be considered that they have a high similarity compared to swamp buffaloes. Keywords: river buffalo, swamp buffalo, crossbred buffalo, phenotype, morphometrics, genetic distance

5 STUDI KERAGAMAN FENOTIPE DAN PENDUGAAN JARAK GENETIK KERBAU SUNGAI, RAWA DAN SILANGANNYA DI SUMATERA UTARA ANDRI JUWITA SITORUS D Skripsi ini merupakan salah satu syarat untuk memperoleh gelar sarjana Peternakan pada Fakultas Peternakan Institut Pertanian Bogor PROGRAM STUDI TEKNOLOGI PRODUKSI TERNAK FAKULTAS PETERNAKAN INSTITUT PERTANIAN BOGOR 2008

6 STUDI KERAGAMAN FENOTIPE DAN PENDUGAAN JARAK GENETIK KERBAU SUNGAI, RAWA DAN SILANGANNYA DI SUMATERA UTARA Oleh ANDRI JUWITA SITORUS D Skripsi ini telah disetujui dan disidangkan di hadapan Komisi Ujian Lisan pada tanggal 31 Maret 2008 Pembimbing Utama Pembimbing Anggota Dr. Ir. Cece Sumantri M.Agr.Sc Ir. Anneke Anggraeni M.Si. PhD. NIP NIP Dekan Fakultas Peternakan Institut Pertanian Bogor Dr. Ir. Luki Abdullah. M.Sc.Agr NIP

7 RIWAYAT HIDUP Penulis dilahirkan di Palembang pada tanggal 5 November Penulis merupakan anak pertama dari empat bersaudara dari pasangan Bapak H. Sitorus dan Ibu N. Silitonga. Pendidikan dasar diselesaikan selama 6 tahun ( ) di SDN Medan. Pendidikan Menengah Pertama diselesaikan pada tahun 2001 di SLTP Trisakti 2 Medan. Pendidikan Menengah Atas diselesaikan selama tiga tahun ( ) di SMA Negeri 5 Medan. Penulis diterima sebagai mahasiswa Tingkat Persiapan Bersama melalui jalur USMI pada tahun Penulis melanjutkan pendidikan sebagai mahasiswa di Fakultas Peternakan Institut Pertanian Bogor. Selama mengikuti pendidikan di Institut Pertanian Bogor, penulis aktif dalam Komisi Pelayanan Siswa Unit Kegiatan Mahasiswa Persekutuan Mahasiswa Kristen IPB dan menjadi tenaga pengajar Pendidikan Agama Kristen Protestan di SMA Negeri 5 Bogor.

8 KATA PENGANTAR Puji dan syukur penulis panjatkan kepada Tuhan Yang Maha Esa karena telah melimpahkan berkat dan perlindungan yang tak terhingga sehingga skripsi ini dapat diselesaikan dengan baik. Skripsi ini merupakan salah satu syarat untuk memperoleh gelar Sarjana pada Fakultas Peternakan di Institut Pertanian Bogor. Saat ini kerbau masih belum termanfaatkan secara maksimal walaupun sudah ada upaya di beberapa daerah di Indonesia untuk memaksimalkan pemanfaatannya. Provinsi Sumatera Utara merupakan provinsi dengan ternak kerbau yang cukup tinggi. Populasi kerbau di Sumatera Utara lebih tinggi daripada populasi sapi namun belum ada usaha yang nyata untuk meingkatkan kualitas dan kuantitasnya. Informasi dasar mengenai keadaan kerbau di Sumatera Utara masih belum lengkap. Skripsi ini bertujuan untuk melengkapi informasi dasar mengenai karaktristik fenotipe kerbau yang terdapat di Sumatera Utara. Hasil penelitian ini diharap dapat digunakan sebagai sumber informasi untuk menyusun program pemuliaan dan pengembangan kerbau di Sumatera Utara. Penulis menyadari skripsi ini masih jauh dari kesempurnaan. Saran dan kritik dari pembaca akan membantu penyempuraannya. Penulis berharap semoga skripsi ini bermanfaat untuk kemajuan ilmu pengetahuan terutama pengembangan peternakan di Indonesia. Bogor, Maret 2008 Penulis

9 DAFTAR ISI RINGKASAN... ABSTRACT... RIWAYAT HIDUP... KATA PENGANTAR... DAFTAR ISI... viii DAFTAR TABEL... DAFTAR GAMBAR... DAFTAR LAMPIRAN... PENDAHULUAN... 1 Latar Belakang... 1 Tujuan... 2 TINJAUAN PUSTAKA... 3 Kerbau... 3 Kerbau Sungai... 4 Kerbau Murrah... 5 Kerbau Rawa... 6 Kerbau Silangan (Murrah x Rawa)... 6 Kerbau di Indonesia... 8 Kerbau di Sumatera Utara... 9 Keragaman Kerbau di Indonesia Keragaman Fenotipe Keragaman Produksi Jarak Genetik Analisis Diskriminan Pohon Filogenetik METODE Lokasi dan Waktu Materi Ternak Peralatan Analisis Data Sifat Kualitatif Sifat Kuantitatif Analisis Data Keragaman Morfometrik Metode Pengamatan Sifat-sifat Kuallitatif Pengukuran Bagian Tubuh Halaman i iii vi vii x xi xii

10 HASIL DAN PEMBAHASAN Keadaan Umum Lokasi Penelitian Pengamatan Sifat Kualitatif Kerbau Warna Kulit Garis Kalung (Chevron) Warna Kaki Pengamatan Ukuran Tubuh Kerbau Perbandingan Morfometrik Kerbau Jantan Perbandingan Morfometrik Kerbau Betina Perbandingan Morfometrik Kerbau Pendugaan Jarak Genetik Peubah Pembeda Jenis Kerbau Nilai Campuran Fenotipik antar Jenis Kerbau Peta Penyebaran Jenis Kerbau Penentuan Jarak Genetik dan Dendogram antar Jenis Kerbau KESIMPULAN DAN SARAN Kesimpulan Saran UCAPAN TERIMA KASIH DAFTAR PUSTAKA... 43