ISOLASI DAN SELEKSI BAKTERI DESULFURISASI DARI TANAH PERTAMBANGAN BATUBARA ASAL SUMATERA SELATAN DENGAN PENGAYAAN DIBENZOTHIOPHENE DAN BATUBARA

Transkripsi

1 ISOLASI DAN SELEKSI BAKTERI DESULFURISASI DARI TANAH PERTAMBANGAN BATUBARA ASAL SUMATERA SELATAN DENGAN PENGAYAAN DIBENZOTHIOPHENE DAN BATUBARA NASTI SUSANTI PROGRAM STUDI BIOLOGI FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI UNIVERSITAS ISLAM NEGERI SYARIF HIDAYATULLAH JAKARTA 2011 M/1432 H

2 ISOLASI DAN SELEKSI BAKTERI DESULFURISASI DARI TANAH PERTAMBANGAN BATUBARA ASAL SUMATERA SELATAN DENGAN PENGAYAAN DIBENZOTHIOPHENE DAN BATUBARA SKRIPSI Sebagai Salah Satu Syarat Untuk Memperoleh Gelar Sarjana Sains Pada Program Studi Biologi Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta NASTI SUSANTI PROGRAM STUDI BIOLOGI FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI UNIVERSITAS ISLAM NEGERI SYARIF HIDAYATULLAH JAKARTA 2011 M/1432 H

3 ISOLASI DAN SELEKSI BAKTERI DESULFURISASI DARI TANAH PERTAMBANGAN BATUBARA ASAL SUMATERA SELATAN DENGAN PENGAYAAN DIBENZOTHIOPHENE DAN BATUBARA SKRIPSI Sebagai Salah Satu Syarat Untuk Memperoleh Gelar Sarjana Sains Pada Program Studi Biologi Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta NASTI SUSANTI Menyetujui, Pembimbing I Pembimbing II Megga Ratnasari Pikoli, M. Si Irawan Sugoro, M. Si NIP NIP Mengetahui, Ketua Program Studi Biologi DR. Lily Surayya Eka Putri, M. Env. Stud. NIP

4 PENGESAHAN UJIAN Skripsi berjudul Isolasi dan Seleksi Bakteri Desulfurisasi dari Tanah Pertambangan Batubara Asal Sumatera Selatan dengan Pengayaan Dibenzothiophene dan Batubara yang ditulis oleh Nasti Susanti, NIM telah diuji dan dinyatakan LULUS dalam sidang Munaqasyah Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta pada tanggal 6 September Skripsi ini telah diterima sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar Sarjana Strata Satu (S1) Program Studi Biologi. Menyetujui, Penguji 1, Penguji 2, DR. Lily Surayya Eka Putri, M. Env. Stud. Dini Fardila, M. Si. NIP NIP Pembimbing 1, Pembimbing 2, Megga Ratnasari Pikoli, M. Si Irawan Sugoro, M. Si NIP NIP Mengetahui, Dekan Fakultas Sains dan Teknologi Ketua Program Studi Biologi Dr. Syopiansyah Jaya Putra, M. Sis Dr. Lily Surayya Eka Putri, M. Env. Stud. NIP NIP

5 PERNYATAAN DENGAN INI SAYA MENYATAKAN KEASLIAN SKRIPSI INI BENAR-BENAR HASIL KARYA SENDIRI YANG BELUM PERNAH DIAJUKAN SEBAGAI SKRIPSI ATAU KARYA ILMIAH PADA PERGURUAN TINGGI ATAU LEMBAGA MANAPUN. Jakarta, September 2011 Nasti Susanti NIM

6 NASTI SUSANTI Isolasi dan Seleksi Bakteri Desulfurisasi dari Tanah Pertambangan Batubara Asal Sumatera Selatan dengan Pengayaan Dibenzothiophene dan Batubara JAKARTA 2011 M / 1432 H

7 ABSTRAK NASTI SUSANTI. Isolasi dan Seleksi Bakteri Desulfurisasi dari Tanah Pertambangan Batubara Asal Sumatera Selatan dengan Pengayaan Dibenzothiophene dan Batubara. Skripsi. Program Studi Biologi Fakultas Sains dan Teknologi. Universitas Islam Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta Pembakaran batubara menghasilkan emisi sulfur yang menyebabkan pencemaran lingkungan seperti hujan asam. Batubara mengandung senyawa sulfur organik heterosiklik salah satunya adalah dibenzothiophene (DBT) yang sulit untuk dihilangkan. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendapatkan isolat bakteri yang mampu melakukan desulfurisasi batubara dengan pengayaan DBT dan batubara. Tahapan penelitian terdiri dari isolasi dan seleksi berdasarkan pola pertumbuhan dan kemampuan desulfurisasi DBT. Hasil isolasi bakteri desulfurisasi (IBD) diperoleh sebanyak 22 isolat bakteri. Isolat-isolat bakteri tersebut memiliki kemampuan desulfurisasi DBT yang berbeda-beda. Isolat bakteri yang terseleksi adalah isolat 15N, 26N dan 34N berdasarkan pertumbuhan pada medium MSM-DBT agar. Seleksi lebih lanjut pada medium MSM-DBT cair diketahui bahwa isolat 15N memiliki kemampuan desulfurisasi DBT tertinggi dengan nilai absorbansi sulfat rata-rata 0,559. Hasil pengukuran desulfurisasi DBT pada isolat 15N selama fase eksponensial sebesar 0, mm atau sebesar 3% dari jumlah DBT awal. Kata kunci : Bakteri, batubara, desulfurisasi, dibenzothiophene dan isolasi

8 ABSTRACT NASTI SUSANTI. Isolation and Selection Bacterial Desulphurization of Soil Coal Mining in South Sumatra with the Enrichment Dibenzothiophene and Coal. Undergraduated Thesis. Biology Departement. Faculty of Science and Technology. Syarif Hidayatullah State Islamic University Jakarta Coal burning produces sulfur emission that causes environmental pollution such as acid rain. Coal contains heterocyclic organic sulfur compounds such as dibenzothiophene (DBT), which are difficult to remove. Purpose of this research was to get bacterial isolates which are capable of doing desulfurization DBT with the enrichment DBT and coal. Stages of research were isolation and selection based on growth patterns and DBT desulfurization ability. The results showed that 22 of the isolates could desulfurize DBT and coal containing media. All of the isolates had different ability of DBT desulfurization. The selected bacteria were 15N, 26N and 34N based on the growth in MSM-DBT solid medium. Further selection in MSM-DBT liquid medium showed isolate of 15N had the highest ability to DBT desulfurization with sulfate absorbance value of 0,559 on average. The DBT desulfurization by isolate 15 N during the exponential phase was 0, mm which was equivalent to 3%. Key word : Bacteria, coal, desulphurization, dibenzothiophene and isolation

9 KATA PENGANTAR Puji dan syukur kehadirat Allah SWT Yang Maha Kuasa, atas segala rahmat, hidayah, inayah dan karunianya yang tak terhingga sehingga skripsi ini dapat Penulis selesaikan. Shalawat serta salam semoga senantiasa tercurah kepada Nabi Muhammad SAW yang memperjuangkan kesempurnaan agama ini hingga akhir hayat. Skripsi dengan judul Isolasi dan Seleksi Bakteri Desulfurisasi dari Tanah Pertambangan Batubara Asal Sumatera Selatan dengan Pengayaan Dibenzothiophene dan Batubara disusun sebagai salah satu syarat dalam menyelesaikan program studi S1 pada Program Studi Biologi Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri Syarif Hidaytullah Jakarta. Pada kesempatan ini Penulis ingin menyampaikan terima kasih yang tidak terhingga kepada pihak-pihak yang telah membantu baik secara langsung maupun tidak langsung dalam penyusunan skripsi, yaitu : 1. Dr. Syopiansyah Jaya Putra, M. Sis., selaku Dekan Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta. 2. Dr. Lily Surayya Eka Putri, M. Env. Stud., selaku Ketua Program Studi Biologi Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta. 3. Dini Fardila, M.Si., selaku Sekretaris Program Studi Biologi Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta. i

10 4. Megga Ratnasari Pikoli, M. Si., selaku pembimbing I dan Irawan Sugoro, M. Si., selaku pembimbing II yang senantiasa memberikan ilmu bermanfaat, nasehat serta pengalaman yang berarti, semoga semuanya menjadi bekal Penulis di masa depan kelak. 5. Ibunda dan Ayahanda tercinta serta adikku tersayang, terima kasih atas kasih sayang yang luar biasa, motivasi dan doa yang tidak pernah putus untuk Penulis. 6. Nani Radiastuti, M. Si., Reno Fitri, M. Si dan Rina Hidayati Pratiwi. M. Si., selaku penguji pada seminar proposal dan seminar hasil, serta Dr. Lily Surayya Eka Putri, M. Env. Stud dan Dini Fardila, M. Si., selaku penguji dalam sidang munaqasyah, terima kasih atas semua saran yang telah diberikan demi kesempurnaan penyusunan skripsi ini. 7. Seluruh Dosen Biologi Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Islam Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta, terima kasih atas ilmu dan nasehat yang selama ini telah diberikan kepada Penulis. 8. Sayyid Haedar Amuli, seseorang yang telah memberikan motivasi, kasih sayang, doa, bantuan serta mengajarkan penulis untuk memahami banyak hal dalam kehidupan ini, terima kasih karena telah memberikan banyak warna baru dalam kehidupan Penulis. 9. Nur Amaliah Solihat, saudari seperjuangan selama penelitian, terima kasih atas semangat yang senantiasa diberikan. 10. Mba Puji, Mba Ida dan Kak Bahri, terima kasih atas semua bantuannya selama penelitian di laboratorium. ii

11 11. Teman-teman Biologi angkatan 2007 yang tidak bisa disebutkan satu persatu, terima kasih telah memberikan dukungan kepada penulis dan tetap semangat untuk terus melanjutkan perjuangan ini. 12. Saudara-saudaraku di IRMA Jami Nurul Mutaqien Esti, Eli, Ika, Teh Siti, Deni, A Adi, Bayu dan lain-lain, terima kasih atas semangat dan bantuan yang senantiasa diberikan kepada penulis. Penulis hanya bisa berdoa semoga semua amal baik dan bantuannya mendapat balasan yang sesuai dari Allah SWT. Tidak ada manusia yang luput dari kesalahan dan kekhilafan, demikian pula dengan penulisan skripsi ini. Oleh karena itu, saran dan kritik yang bersifat membangun sangat diharapkan demi penyempurnaan skripsi ini. Jakarta, September 2011 Nasti Susanti iii

12 DAFTAR ISI KATA PENGANTAR. DAFTAR ISI... DAFTAR TABEL DAFTAR GAMBAR... DAFTAR LAMPIRAN... i iv vii viii ix BAB I PENDAHULUAN 1.1. Latar Belakang Perumusan Masalah Hipotesis Tujuan Manfaat... 5 BAB II TINJAUAN PUSTAKA 2.1. Sulfur dalam Batubara Biodesulfurisasi Sulfur Organik Dibenzhothiophene (DBT) Jalur Metabolisme Biodesulfurisasi Sulfur Organik Bakteri dalam Biodesulfurisasi Sulfur Organik Isolasi dan Seleksi Bakteri Kerangka Berpikir iv

13 BAB III METODOLOGI 3.1. Waktu dan Tempat Penelitian Alat dan Bahan Alat Bahan Cara Kerja Persiapan Sampel Pembuatan Medium Medium Minimal Salts Medium (MSM)-DBT Medium Trypticase Soy Agar (TSA) Pengayaan Sampel Tanah Isolasi Bakteri Total (IBT) Isolasi Bakteri Desulfurisasi (IBD) Isolasi Bakteri Desulfurisasi Langsung (IBDL) Isolasi Bakteri Desulfurisasi Tidak Langsung/ Diperkaya (IBDTL) Pemurnian Isolat Seleksi Isolat Bakteri Seleksi Bakteri Desulfurisasi pada Medium MSM-DBT Agar Seleksi Bakteri Desulfurisasi pada Medium MSM-DBT Cair v

14 Analisa Hasil Desulfurisasi DBT dari Bakteri Terseleksi dengan Menggunakan UV-Vis Spectrophotometer Analisis Data BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN 4.1. Hasil Isolasi Bakteri Hasil Isolasi Bakteri Total (IBT) Hasil Isolasi Bakteri Desulfurisasi (IBD) Hasil Seleksi Bakteri Desulfurisasi pada Medium MSM-DBT Agar Hasil Seleksi Bakteri Desulfurisasi pada Medium MSM-DBT Cair Pertumbuhan Bakteri ph medium Desulfurisasi DBT Hasil Pengukuran DBT BAB V KESIMPULAN DAN SARAN 5.1. Kesimpulan Saran DAFTAR PUSTAKA LAMPIRAN vi

15 DAFTAR TABEL Hal Tabel 1. Jenis Serta Persentase Senyawa Sulfur di dalam Batubara... 8 Tabel 2. Karakteristik Isolat Bakteri Tabel 3. Hasil Uji Seleksi Isolat Bakteri Desulfurisasi pada Medium MSM-DBT Agar 35 vii

16 DAFTAR GAMBAR Hal Gambar 1. Model Struktural Batubara Keras. 6 Gambar 2. Jenis-Jenis Sulfur Organik yang Diidentifikasi dalam Batubara 7 Gambar 3. Struktur Kimia DBT Gambar 4. Biodesulfurisasi dengan Jalur 4S.. 12 Gambar 5. Kerangka Berpikir. 16 Gambar 6. Skema Penelitian.. 18 Gambar 7. Gambar 8. Gambar 9. Kemunculan Isolat Bakteri Total Selama Waktu Pencuplikan Kemunculan Isolat Bakteri Desulfurisasi Selama Waktu Pencuplikan dengan Metode IBDL Kemunculan Isolat Bakteri Desulfurisasi Selama Waktu Pencuplikan dengan Metode IBDTL Gambar 10. Pertumbuhan Isolat Bakteri Terseleksi Gambar 11. Nilai ph Medium Isolat Bakteri Terseleksi Gambar 12. Nilai Absorbansi Sulfat Isolat Bakteri Terseleksi Gambar 13. Analisa Hasil Desulfurisasi DBT Isolat 15N dengan Menggunakan Spektrofotometri UV-Visible viii

17 DAFTAR LAMPIRAN Hal Lampiran 1. Komposisi media. 49 Lampiran 2. Lampiran 3. Lampiran 4. Lampiran 5. Lampiran 6. Lampiran 7. Kehadiran isolat-isolat bakteri hasil isolasi tanah pertambangan batubara asal Sumatera Selatan dengan pengayaan DBT dan batubara Contoh morfologi koloni isolat-isolat bakteri hasil isolasi tanah pertambangan batubara asal Sumatera Selatan Hasil pewarnaan isolat-isolat bakteri hasil isolasi tanah pertambangan batubara asal Sumatera Selatan.. 53 Hasil uji seleksi isolat bakteri desulfurisasi pada medium MSM-DBT agar Hasil uji seleksi isolat bakteri desulfurisasi pada medium MSM-DBT cair Analisis hasil desulfurisasi DBT Isolat 15N dengan menggunakan UV-Vis Spectrophotometer. 59 Lampiran 8. Kurva standar DBT Lampiran 9. Output SPSS 16. MANOVA dan Duncan ix

18 BAB I PENDAHULUAN 1.1. Latar Belakang Kebutuhan manusia terhadap sumber daya energi akan terus mengalami peningkatan seiring dengan berkembangnya sektor industri, transportasi dan perumahan. Sebagian kebutuhan energi diperoleh dari penggunaan bahan bakar fosil seperti batubara dan minyak bumi (Tanaka, 1999). Batubara di Indonesia merupakan salah satu bahan bakar fosil yang melimpah. Tahun 2005 Indonesia menduduki peringkat ke-2 di dunia sebagai negara pengekspor batubara. Data pada tahun 2009 menunjukkan bahwa Indonesia memiliki cadangan batubara sebesar 4,968 juta ton atau 0,5% dari total cadangan batubara dunia. Sumber daya dan cadangan batubara Indonesia sebesar 104,8 miliar ton dan 18,8 miliar ton (ESDM, 2009). Berdasarkan lokasi, sumberdaya batubara Indonesia sebagian besar berada di pulau Sumatera dan Kalimantan. Pulau Sumatera merupakan lokasi sumberdaya batubara terbesar di Indonesia. Cadangan batubara di pulau Sumatera, sebagian besar lokasinya berada di Sumatera Selatan. Sumber batubara di Sumatera Selatan cukup besar sekitar 22,24 miliar ton (48% dari total sumber daya batubara di Indonesia). Namun, kualitas batubara Sumatera Selatan umumnya rendah dari jenis lignit hingga subbituminous, karena memiliki kandungan sulfur yang cukup tinggi yaitu, lebih dari 2% (ESDM, 2009). 1

19 2 Pembakaran batubara menghasilkan emisi sulfur yang menyebabkan pencemaran lingkungan. Kandungan sulfur pada batubara saat dibakar akan bergabung dengan oksigen untuk membentuk sulfur dioksida (SO 2 ) yang dapat menyebabkan polusi udara dan hujan asam (Prayuenyong, 2002). Sulfur dalam batubara hadir dalam dua bentuk yaitu, sulfur anorganik dan sulfur organik, namun sulfur organik lebih sulit untuk dihilangkan daripada sulfur anorganik. Sulfur organik dalam batubara terikat secara kovalen ke dalam struktur yang besar dan kompleks pada molekul batubara serta terdistribusi di dalam substansi batubara (Constanti et al., 1994). Metode terbaik untuk membatasi jumlah sulfur dioksida (SO 2 ) yang dipancarkan ke atmosfer adalah dengan mengurangi jumlah sulfur dalam batubara sebelum pembakaran yang disebut dengan desulfurisasi. Penyingkiran sulfur pada batubara dapat dilakukan dengan menggunakan tiga metode, yaitu fisika, kimiawi, dan biologis (Koizumi, 1984). Hidrodesulfurisasi merupakan sebuah teknik fisikokimia yang telah diterapkan sebagai metode konvensional untuk menghilangkan sulfur di seluruh dunia. Namun, proses hidrodesulfurisasi ini memiliki beberapa kelemahan, yaitu membutuhkan biaya operasional yang tidak sedikit, memproduksi produk yang berbahaya dan mempengaruhi struktur batubara. Selain itu, prosesnya tidak bekerja baik pada sulfur organik, khususnya sulfur poliaromatik heterosiklik salah satunya adalah dibenzhothiophene (DBT) (Monticello, 1998). Dewasa ini banyak diupayakan penanganan desulfurisasi secara biologis menggunakan mikrooorganisme sebagai alternatif, yang disebut dengan

20 3 biodesulfurisasi. Proses ini memiliki banyak keuntungan dibandingkan dengan proses fisika dan kimia konvensional, yaitu proses dilakukan dalam kondisi ringan dengan tidak ada reaksi produk berbahaya, dapat mereduksi sulfur organik serta struktur batubara tidak terpengaruh (Monticello, 1998). Pemanfaatan bakteri untuk biodesulfurisasi sedang dikembangkan dan banyak dikaji sebagai penanganan alternatif untuk mengatasi kandungan sulfur pada batubara terutama kandungan sulfur organik yang sulit untuk dihilangkan (Kayser et al., 1993). Penggunaan bakteri dinilai efektif digunakan dalam proses desulfurisasi sulfur anorganik dan organik pada batubara. Penelitian yang dilakukan Bozdemir et al. (1996) menunjukkan bahwa Rhodococcus erythropolis IGTS8 dapat menghilangkan 55,2 % sulfat, 20 % pirit, 23,5 % sulfur organik dan 30,2 % sulfur total dari batubara lignit dalam waktu 96 jam. Beberapa spesies bakteri lainnya juga telah diisolasi dan diketahui memiliki kemampuan dalam proses desulfurisasi sulfur organik pada bahan bakar fosil seperti Corynebacterium. sp, Gordona. sp, Bacillus. sp, Pseudomonas. sp dan Rhodococcus. sp (Zhongxuan et al., 2002). Proses biodesulfurisasi dapat berjalan maksimal jika menggunakan bakteri yang memiliki kemampuan tinggi dalam proses desulfurisasi. Salah satu upaya yang dilakukan untuk memperoleh bakteri desulfurisasi tersebut adalah dengan melakukan isolasi dan seleksi bakteri desulfurisasi dari lokasi yang tercemar sulfur. Bakteri sulfur dapat ditemukan pada tempat di mana komponen sulfur tereduksi berada, seperti endapan, tanah, permukaan perairan baik kondisi aerob maupun anaerob, serta di daerah sekitar gunung berapi seperti daerah sekitar

21 4 kawah (Holt et al., 1994). Menurut Zhongxuan et al. (2002) bakteri yang mampu mendesulfurisasi DBT dapat diisolasi dari berbagai macam tanah yang tercemar sulfur. Mikroorganisme yang terdapat dalam jumlah kecil pada suatu lingkungan alami relatif sulit untuk diisolasi, sehingga perlu digunakan medium pengayaan. Medium memberikan nutrisi dan kondisi lingkungan yang menunjang pertumbuhan organisme tertentu, namun tidak cocok bagi pertumbuhan organisme lain. Menurut Dick (1992) pada isolasi mikroorganisme pengoksidasi sulfur perlu dilakukan penambahan komponen sulfur tereduksi. Hal ini dilakukan untuk memperpendek fase adaptasi (fase lag), sehingga pertumbuhannya relatif menjadi lebih cepat. Pada penelitian isolasi bakteri desulfurisasi dari tanah pertambangan batubara asal Sumatera Selatan ini dilakukan pengayaan komponen sulfur tereduksi yaitu DBT dan batubara. DBT dapat mewakili senyawa sulfur organik yang terdapat dalam bahan bakar fosil (Oda dan Otha, 2002). Penambahan DBT dan batubara ini dilakukan untuk memaksimalkan bakteri desulfurisasi yang terisolasi. Batubara yang mengandung sulfur ditambahkan untuk menjaga agar bakteri tetap teradaptasi karena nantinya akan diaplikasikan pada proses biodesulfurisasi batubara (Prayuenyong, 2002). DBT telah digunakan sebagai model sulfur heterosiklik poliaromatik untuk isolasi dan karakterisasi bakteri yang mampu mengubah senyawa sulfur organik yang ditemukan dalam berbagai bahan bakar fosil (Izumi et al., 1994).

22 Perumusan Masalah 1. Apakah dengan pengayaan DBT dan batubara bakteri desulfurisasi dapat diisolasi dari tanah pertambangan batubara asal Sumatera Selatan? 2. Bagaimanakah kemampuan desulfurisasi dari isolat-isolat bakteri desulfurisasi yang diperoleh melalui pengayaan DBT dan batubara? 1.3. Hipotesis 1. Bakteri desulfurisasi dapat diisolasi dengan pengayaan DBT dan batubara dari tanah pertambangan batubara asal Sumatera Selatan. 2. Isolat-isolat bakteri desulfurisasi yang diperoleh melalui pengayaan DBT dan batubara memiliki kemampuan desulfurisasi yang tinggi Tujuan 1. Memperoleh isolat bakteri desulfurisasi dari tanah pertambangan batubara asal Sumatera Selatan dengan pengayaan DBT dan batubara. 2. Mengetahui kemampuan desulfurisasi dari isolat-isolat bakteri desulfurisasi yang diperoleh Manfaat Hasil penelitian ini diharapkan memperoleh isolat bakteri yang dapat dikembangkan dalam bioteknologi desulfurisasi bahan bakar fosil sehingga mendukung penggunaan bahan bakar ramah lingkungan.

23 BAB II TINJAUAN PUSTAKA 2.1. Sulfur dalam Batubara Sulfur dalam batubara hadir dalam dua bentuk yaitu sulfur anorganik dan sulfur organik. Sulfur anorganik dalam batubara terutama terdiri dari sulfit dan sulfat. Beberapa bentuk sulfit yang biasanya ditemukan dalam batubara, antara lain pirit (FeS 2 ), sphalerit (ZnS), galena (PbS), arsenopirit (FeAsS) dan lain-lain. Bentuk sulfat yang biasa ditemukan dalam batubara, antara lain barit (BaSO 4 ), gipsum (CaSO 4.2H 2 O), kalsium sulfat anhidrit (CaSO 4 ), serta sejumlah besi sulfat dan lain-lain (Calkins, 1994). Pirit pada umumnya merupakan sulfur anorganik yang memiliki ukuran lebih besar dan tidak terikat pada molekul batubara. Partikel dari pirit tersebar secara acak sebagai matriks dan berada dalam bentuk kristal-kristal kubus pada seluruh bagian batubara (Gambar 1). Gambar 1. Model struktural batubara keras (Wise, 1981) 6

24 7 Berbeda dengan sulfur anorganik, sulfur organik dalam batubara terikat secara kovalen ke dalam struktur yang besar dan kompleks pada molekul batubara serta terdistribusi di dalam substansi batubara sehingga sulit untuk dihilangkan secara fisik ataupun kimia (Constanti et al., 1994). Menurut Klein et al. (1994) sulfur organik pada batubara terdapat dalam bentuk senyawa alifatik, aromatik atau heterosiklik, yang dapat diklasifikasikan ke dalam empat kelompok, yaitu : 1. Thiol alifatik atau aromatik (merkaptan, thiofenol) 2. Sulfida alifatik, aromatik atau campuran (thioeter) 3. Disulfida alifatik, aromatik atau campuran (dithioether) 4. Senyawa heterosiklik atau tiofena yang sejenis (dibenzothiophene) Gambar 2. Jenis-jenis sulfur organik yang diidentifikasi dalam batubara (Shennan, 1996) Kandungan sulfur di dalam batubara bervariasi bergantung pada wilayah batubara tersebut berasal (Prayuenyong, 2002). Kandungan sulfur dalam batubara secara umum sesuai dengan Tabel 1.

25 8 Tabel 1. Jenis serta persentase senyawa sulfur di dalam batubara Unsur Persentase Sufur organik 0,31 3,09 % Sulfur pirit 0,06 3,78 % Sulfur sulfat 0,01 1,06 % Total sulfur 0,42 6,47 % (Sumber : Speight, 1994) 2.2. Biodesulfurisasi Sulfur Organik Sulfur merupakan senyawa yang secara alami terkandung dalam bahan bakar fosil, namun keberadaannya tidak diinginkan karena dapat menyebabkan berbagai masalah, termasuk di antaranya korosi pada peralatan proses, meracuni katalis dalam proses pengolahan, bau yang kurang sedap atau produk samping pembakaran berupa gas buang yang beracun seperti sulfur dioksida (SO 2 ) dan menimbulkan polusi udara serta hujan asam (Hidayat et al., 2006). Penyingkiran sulfur pada batubara dapat dilakukan dengan tiga metode, yaitu fisika, kimiawi dan biologi. Metode komersial yang mutakhir saat ini untuk menghilangkan senyawa sulfur adalah hidrodesulfurisasi. Hidrodesulfurisasi merupakan sebuah teknik fisikokimia yang telah diterapkan sebagai metode konvensional untuk menghilangkan sulfur di seluruh dunia. Metode ini menggunakan tekanan tinggi (10-17 atm) dan temperatur tinggi ( o C) dalam melakukan prosesnya, dimana sulfur akan diubah menjadi hidrogen sulfida (Monticello, 1998). Namun, proses kimia atau hidrodesulfurisasi ini memiliki beberapa kelemahan yaitu membutuhkan biaya operasional yang tidak sedikit, memproduksi produk yang berbahaya dan mempengaruhi struktur batubara.

26 9 Selain itu, prosesnya tidak bekerja baik pada sulfur organik, khususnya sulfur poliaromatik heterosiklik. Salah satunya adalah DBT yang biasa digunakan sebagai model dari senyawa heterosiklik yang mengandung sulfur organik untuk penelitian biodesulfurisasi (Zhongxuan et al., 2002). Sulfur dalam batubara hadir dalam dua bentuk yaitu sulfur anorganik dan sulfur organik, berbeda dengan sulfur anorganik yang mudah dihilangkan dengan cara fisika dan kimia, sulfur organik dalam batubara terikat secara kovalen ke dalam struktur yang besar dan kompleks pada molekul batubara serta terdistribusi di dalam substansi batubara sehingga sulit untuk dihilangkan secara fisik ataupun kimia (Constanti et al., 1994). Oleh karena itu, saat ini penelitian tentang biodesulfurisasi lebih banyak difokuskan pada desulfurisasi sulfur organik. Sebagian besar kerja biodesulfurisasi telah menunjukkan hasil desulfurisasi yang baik dimulai dengan DBT atau senyawa pengganti golongan alkilnya (Takashi dan Izumi, 1999). Dewasa ini banyak diupayakan penanganan desulfurisasi secara biologis menggunakan mikrooorganisme sebagai alternatif yang disebut dengan biodesulfurisasi. Proses ini memiliki banyak keuntungan dibandingkan dengan proses fisika dan kimia konvensional, yaitu proses dilakukan dalam kondisi ringan dengan tidak ada reaksi produk berbahaya, dapat mereduksi sulfur organik serta struktur batubara tidak terpengaruh (Monticello, 1998). Pemanfaatan bakteri untuk biodesulfurisasi sedang dikembangkan dan banyak dikaji sebagai penanganan alternatif untuk mengatasi kandungan sulfur pada batubara terutama kandungan sulfur organik yang sulit untuk dihilangkan (Kayser et al., 1993).

27 10 Beberapa spesies bakteri telah diisolasi dan diketahui memiliki kemampuan dalam proses biodesulfurisasi sulfur organik pada bahan bakar fosil seperti Corynebacterium. sp, Gordona. sp, Bacillus. sp, Pseudomonas. sp dan Rhodococcus. sp (Zhongxuan et al., 2002) Dibenzhothiophene (DBT) Dibenzothiophene (DBT) adalah sulfur heterosiklik yang ditemukan pada minyak mentah dan batubara (Kirimura et al., 2001) (Gambar 3). Gambar 3. Struktur kimia DBT (Kirimura et al., 2001) Permasalahan proses biodesulfurisasi pada batubara yang saat ini dilakukan adalah sulitnya menghilangkan kandungan sulfur organik. Oleh karena itu, penelitian biodesulfurisasi saat ini lebih banyak difokuskan pada penghilangan kandungan sulfur organik. Biodesulfurisasi sulfur organik banyak menggunakan DBT sebagai senyawa model. DBT dipandang secara luas sebagai senyawa model yang dapat mewakili pecahan senyawa sulfur organik aromatik pada batubara dan minyak mentah (Gilbert et al., 1998). DBT telah digunakan sebagai model sulfur heterosiklik poliaromatik untuk isolasi dan karakterisasi bakteri yang mampu mengubah senyawa sulfur organik yang ditemukan dalam berbagai bahan bakar fosil (Izumi et al., 1994).

28 Jalur Metabolisme Biodesulfurisasi Sulfur Organik Sebagian besar proses biodesulfurisasi sulfur organik menunjukkan hasil yang baik. Hal ini ditandai dengan berkurangnya kadar DBT pada bahan bakar fosil (Takashi dan Izumi, 1999). Menurut Zhongxuan et al. (2002), pengurangan kadar DBT pada bahan bakar fosil selama proses biodesulfurisasi memiliki dua jalur yang berbeda yaitu jalur Kodama dan jalur 4S. Jalur Kodama dianggap tidak sesuai karena pada jalur ini dihasilkan senyawa sulfur yang larut air, yang mana kemudian tidak tersedia untuk pembakaran dan oleh karena itu akan menghilangkan nilai kalori dari bahan bakar. Salah satu cincin homosikllik dari DBT rusak dalam jalur Kodama, namun sulfur tetap dalam bentuk organik sebagai 3-hidroksi-2-formylbenzothiophene (HFBT) (Bressler dan Fedorak, 2001). Jalur lain untuk menghilangkan sulfur adalah dengan jalur 4S. Jalur 4S merupakan penemuan baru yang ditemukan oleh Institute of Gas Technology (IGT) pada tahun Mereka mengisolasi dua bakteri yang dapat menghilangkan sulfur dari DBT secara selektif. Penelitian lebih lanjut menunjukkan bahwa isolat tersebut dapat mengoksidasi DBT menjadi DBT sulfoxide, kemudian menjadi DBT sulfone, 2-hydroxydiphenyl atau 2,2-biphenol dan sulfat, sementara struktur karbon tetap utuh (Kevin et al., 1996) (Gambar 4). Melalui jalur 4S, DBT berubah menjadi 2-HBP dan sulfit. Dalam jalur ini struktur karbon yang dilepaskan utuh sebagai 2-HBP sehingga nilai bahan bakar tidak berkurang (Mohebali et al., 2006).

29 12 Gambar 4. Biodesulfurisasi dengan Jalur 4S (Zhongxuan et al., 2002) Aplikasi biodesulfurisasi batubara di lapangan dengan menggunakan bakteri pada jalur 4S perlu dilakukan setelah proses desulfurisasi sulfur anorganik dengan menggunakan metode fisika dan kimia. Menurut Klein (1998), 90% sulfur anorganik pada batubara dapat dihilangkan dengan cara desulfurisasi fisika seperti dihancurkan, ditumbuk dan dicuci. Selanjutnya proses desulfurisasi dilanjutkan dengan menggunakan bakteri. Hal ini dilakukan untuk desulfurisasi sulfur organik yang sulit untuk dihilangkan dengan metode fisika dan kimia, salah satunya adalah DBT (Prayuenyong, 2002) Bakteri dalam Biodesulfurisasi Sulfur Organik Biodesulfursasi sulfur organik pada awalnya dianggap gagal karena bakteri yang diisolasi tidak bisa secara khusus menghapus sulfur dan menyebabkan penurunan nilai karbon pada batubara. Perhatian awal telah

30 13 difokuskan pada penghapusan sulfur dari DBT karena senyawa ini merupakan sulfur organik yang ditemukan pada sebagian besar bahan bakar fosil. Isolasi dan karakterisasi Rhodococcus erythropolis IGTS8 (sebelumnya disebut Rhodococcus IGTS8) menyebabkan kemajuan dalam penelitian biodesulfurisasi DBT (Prayuenyong, 2002). Beberapa mikroorganisme desulfurisasi DBT telah diisolasi, contohnya Rhodococcus. sp IGTS8 (Gallagher et al., 1993), R. erythropolis D-1 (Izumi et al., 1994), R. erythropolis H-2 (Ohshiro et al., 1996), R. erythopolis KA2-5-1 (Izumi et al., 1994), Rhodococcus. sp SY1, yang sebelumnya diidentifikasi sebagai Corynebacterium. sp (Omori et al., 1995), Mycobacterium. sp G3 dan Gordona sp CYKS1 (Nekodzuka et al., 1997). Bakteri yang saat ini paling banyak dipelajari dalam proses biodesulfurisasi sulfur organik adalah dari genus Rhodococcus. Genus Rhodococcus memiliki kemampuan untuk menghapus sulfur anorganik dan sulfur organik dan akibatnya proses biodesulfurisasi saat ini telah banyak dilakukan dengan menggunakan spesies ini (Prayuenyong, 2002). Spesies Rhodococcus yang telah ditemukan diantaranya yaitu Rhodococcus erythropolis IGTS8 (Kayser et al., 1993), R. erythropolis D-1 (Izumi et al., 1994), R. erythropolis H-2 (Ohshiro et al., 1996), Rhodococcus. sp SY1 (Omori et al., 1995) dan Rhodococcus. sp ECRD-1 (Grossman et al., 1999). Diantara semuanya R. erythropolis IGTS8 adalah yang paling banyak dipelajari. Berdasarkan penelitian yang dilakukan oleh Bozdemir et al (1996) diketahui bahwa R. erythropolis

31 14 IGTS8 dapat menghilangkan 55,2 % sulfat, 20 % pirit, 23,5 % sulfur organik dan 30,2 % sulfur total dari batubara lignit selama 96 jam Isolasi dan Seleksi Bakteri Populasi mikroorganisme di alam sangat banyak dan kompleks, baik yang terdapat di udara, tanah, air dan substrat lainnya yang semuanya dapat diisolasi (Pelczar dan Chan, 2005). Isolasi adalah proses untuk memperoleh mikroorganisme dalam bentuk biakan murni untuk pertama kalinya. Proses ini mencakup dua kegiatan yaitu memisahkan mikroorganisme yang diinginkan dari substrat alaminya atau dari mikroorganisme kontaminan dan disertai usaha untuk memperoleh mikroorganisme yang diinginkan dalam bentuk biakan. Tujuan isolasi adalah untuk memperoleh mikroorganisme murni (tunggal) dan mudah dikultivasi dengan harapan dapat menghasilkan produk dan sifat-sifat unggul lainnya. Metode isolasi dibagi menjadi dua metode yaitu metode langsung dan metode tidak langsung (diperkaya). Metode isolasi langsung adalah metode pengisolasian mikroorganisme secara langsung dari sampel tanpa proses pengayaan terlebih dahulu. Isolasi tersebut dapat didahului dengan pengenceran atau tidak. Penanaman dilakukan pada medium padat dengan menggunakan metode sebar. Metode tidak langsung (diperkaya) adalah metode yang dilakukan untuk meningkatkan jumlah mikroorganisme yang diinginkan sehingga menjadi lebih banyak daripada mikroorganisme lainnya dalam inokulum asli (Casida, 2001).

32 15 Proses yang terjadi pada media tidak langsung (diperkaya) akan menghasilkan populasi campuran dan memberikan kondisi yang cocok untuk mikroorganisme yang diharapkan, misalnya memberikan substrat khusus atau memasukkan penghambat tertentu. Modifikasi medium tersebut berpengaruh terhadap selektivitas mikroorganisme, namun dalam proses lebih lanjut akan terjadi suksesi yang diikuti oleh pertumbuhan mikroorganisme lain (Hidayat et al., 2006). Suksesi terjadi akibat proses inkubasi yang terlalu lama, akan tetapi apabila terlalu cepat maka mikroorganisme yang terseleksi akan lebih sedikit, karena belum beradaptasi dengan nutrien yang ada (Casida, 2001). Seleksi dilakukan untuk mengetahui ciri-ciri yang lebih khusus atas isolat yang ditemukan dan memilih sifat-sifat yang diinginkan atas isolat yang telah ditemukan dengan berbagai pengujian (Hidayat et al., 2006).

33 Kerangka Berpikir Sumber Energi Utama di Indonesia Batubara (Bahan Bakar Fosil) Pencemaran Lingkungan Meningkat Emisi sulfur dioksida (SO 2 ) Desulfurisasi Penyakit Pernafasan Akut dan Kronis Hujan Asam Fisika Kimia Biologi Mikroorganisme Tanah Mengandung Sulfur Isolasi Batubara DBT Penambahan Komponen Sulfur Tereduksi Isolat Bakteri Bahan Bakar Fosil Ramah Lingkungan Aplikasi Seleksi Bakteri Desulfurisasi Potensial Gambar 5. Kerangka Berpikir

34 BAB III METODOLOGI 3.1. Waktu dan Tempat Penelitian Penelitian ini telah dilakukan pada bulan Maret sampai dengan Juni Penelitian dilakukan di Laboratorium Mikrobiologi, Pusat Laboratorium Terpadu (PLT) UIN Syarif Hidayatullah Jakarta Alat dan Bahan Alat Alat-alat utama yang digunakan dalam penelitian ini adalah cawan petri, labu erlenmeyer, tabung reaksi, inkubator, timbangan analitik, vorteks, ph meter, hot plate, magnetic stirer, mortar, saringan berukuran 100 dan 200 mesh, mikroskop, kamera, autoklaf, rotary shaker, Laminar Air Flow Cabinet (LAFC), Visible Spectrophotometer dan UV-Vis Spectrophotometer Bahan Bahan yang digunakan dalam penelitian ini adalah sampel tanah pertambangan batubara yang berasal dari Sumatera Selatan, medium Minimal Salt Medium (MSM), medium Trypticase Soy Agar (TSA), agar bubuk, batubara bubuk berukuran 200 mesh, dibenzothiophene (DBT), Na 4 P 2 O 7, NaCl 0,85%, aquades, crystal violet, lugol, safranin, alkohol 96%, alkohol 70%, gliserol 20%, BaCl 10% dan HCl 5%. 17

35 Cara Kerja Persiapan sampel, alat dan bahan Pembuatan medium Sampel tanah pertambangan batubara (100 mesh) Isolasi bakteri total (IBT) Pemurnian, pewarnaan dan pengamatan morfologi Isolat-isolat bakteri total Isolasi bakteri desulfurisasi (IBD) Pengayaan sampel tanah (DBT + Batubara) Pencuplikan tanah Hari ke-0, 7, 14, 21 dan 28 Isolasi langsung (IBDL) Isolasi tidak langsung/ diperkaya (IBDTL) Pemurnian, pewarnaan dan pengamatan morfologi Isolat-isolat bakteri desulfurisasi Seleksi isolat-isolat bakteri desulfurisasi pada medium MSM- DBT agar Seleksi isolat terseleksi pada medium MSM-DBT cair Uji lanjut isolat terpilih dengan pengukuran pengurangan kadar DBT Gambar 6. Skema Penelitian Analisis Data

36 Persiapan Sampel Sampel yang digunakan adalah tanah pertambangan batubara yang berasal dari Sumatera Selatan. Sampel dihancurkan secara aseptis dengan menggunakan mortar, lalu disaring dengan menggunakan saringan berukuran 100 mesh. Sampel hasil saringan tanah pertambangan batubara inilah yang kemudian akan digunakan Pembuatan Medium Medium Minimal Salts Medium (MSM)-DBT Medium Minimal Salts Medium (MSM) dibuat dengan cara menimbang sebanyak 2 ml gliserol; 4 g NaH 2 PO 4.H 2 O; 4 g K 2 HPO 4.3H 2 O; 2 g NH 4 Cl; 0,2 g MgCl 2.6H 2 O; 0,001 g CaCl 2.2H 2 O dan 0,001 g FeCl 3.6H 2 O, ditambahkan aquades hingga volumenya mencapai 1 liter, kemudian diaduk sampai homogen (Gallagher et al., 1993). Medium MSM-DBT dibuat dengan cara menambahkan batubara serbuk sebanyak 10% (b/v) berukuran 200 mesh pada medium MSM. Batubara yang ditambahkan sebelumnya sudah dicuci dengan menggunakan aquades. Medium tersebut kemudian disterilisasi dengan autoklaf pada suhu 121 C dengan tekanan 1,5 atm selama 15 menit. DBT disiapkan secara terpisah dari medium basal, DBT dilarutkan dalam alkohol 70% hingga 10 mm, kemudian medium MSM steril ditambahkan 0,1 mm DBT. Medium MSM-DBT ini adalah medium MSM-DBT cair sedangkan untuk keperluan plating, medium tersebut ditambahkan 1,5% agar (Maghsoudi et al., 2000).

37 Medium Trypticase Soy Agar (TSA) Medium Trypticase Soy Agar (TSA) dibuat dengan cara menimbang 40 g media (Lampiran 1), kemudian ditambahkan aquades hingga volumenya mencapai 1 liter dan dipanaskan hingga homogen. Medium tersebut kemudian disterilisasi dengan autoklaf pada suhu 121 C dengan tekanan 1,5 atm selama 15 menit Pengayaan Sampel Tanah Pengayaan sampel tanah pertambangan batubara dilakukan untuk mengaktifkan bakteri desulfurisasi. Sampel tanah pertambangan batubara yang telah dihaluskan (100 mesh) sebanyak 100 g dicampur dengan 10 g batubara bubuk steril (200 mesh) dan 0,1 mm DBT di dalam beaker glass berukuran 500 ml, kemudian ditutup dengan menggunakan penutup yang terbuat dari kaca. Pengayaan sampel tanah dilakukan selama + 30 hari pada suhu ruang. Selama proses pengayaan tanah berlangsung kondisi tanah tetap dijaga kelembabannya, dengan cara memberikan beberapa tetes aquades steril setiap hari. Pencuplikan tanah dilakukan pada hari ke-0 (jam ke-3), 7, 14, 21 dan 28. Sampel tanah pada waktu-waktu tersebut diambil untuk diisolasi dan dihitung komunitas bakteri total dan bakteri desulfurisasi (Gallagher et al., 1993) Isolasi Bakteri Total (IBT) IBT dilakukan pada sampel tanah pertambangan batubara asal Sumatera Selatan sebelum dan sesudah pengayaan DBT dan batubara. Sebanyak 1 g sampel tanah pertambangan batubara (100 mesh) dimasukkan ke dalam 9 ml larutan fisologis (NaCl 0,85%), kemudian dilakukan seri pengenceran, dengan cara

38 21 mengencerkan 1 ml sampel ke dalam 9 ml larutan fisiologis (NaCl 0,85%). Hasil setiap seri pengenceran diambil sebanyak 0,1 ml dan ditumbuhkan pada medium TSA cawan dengan teknik sebar. Setelah itu, diinkubasi pada suhu ruang selama 48 jam Isolasi Bakteri Desulfurisasi (IBD) IBD (pengguna DBT) dilakukan dengan dua cara yaitu metode langsung dan tidak langsung/ diperkaya Isolasi Bakteri Desulfurisasi Langsung (IBDL) Isolasi bakteri desulfurisasi langsung (IBDL) dilakukan dengan cara 10 g tanah yang diperkaya dengan DBT dan batubara, dicampur dengan 90 ml sodium pyrophosphat (Na 4 P 2 O 7 ) 0,1% sebagai buffer, kemudian dikocok selama 20 menit pada rotary shaker dengan kecepatan 200 rpm (Young et al., 2006). Setelah itu, suspensi diencerkan dengan melakukan seri pengenceran, dengan cara mengencerkan 1 ml sampel ke dalam 9 ml larutan fisiologis (NaCl 0,85%). Hasil setiap seri pengenceran diambil sebanyak 0,1 ml dan ditumbuhkan pada medium TSA cawan dengan teknik sebar. Setelah itu, diinkubasi pada suhu ruang selama 48 jam Isolasi Bakteri Desulfurisasi Tidak Langsung/ Diperkaya (IBDTL) Isolasi bakteri desulfurisasi tidak langsung/ diperkaya (IBDTL) dilakukan dengan cara 5 g tanah yang diperkaya dengan DBT dan batubara dimasukkan ke dalam erlenmeyer yang berisi 95 ml MSM-DBT. Kultur diinkubasi pada rotary

39 22 shaker berkecepatan 150 rpm pada temperatur ruang selama 3 hari. Kemudian 10% (v/v) kultur ini diinokulasi ke dalam medium baru dan diinkubasi kembali. Hal ini dilakukan sampai tiga kali transfer, untuk memperkaya jumlah bakteri (Kirimura et al., 2001). Pada kultur terakhir pengayaan, 1 ml sampel diambil kemudian dilakukan seri pengenceran, dengan cara mengencerkan 1 ml sampel ke dalam 9 ml larutan fisiologis (NaCl 0,85%). Hasil setiap seri pengenceran diambil sebanyak 0,1 ml dan ditumbuhkan pada medium TSA cawan dengan teknik sebar. Setelah itu, diinkubasi selama 48 jam pada suhu ruang Pemurnian Isolat Seluruh isolat bakteri yang diperoleh dimurnikan sampai menghasilkan isolat bakteri tunggal. Apabila dari proses isolasi menghasilkan isolat yang bermacam-macam maka dipisahkan tiap isolat bakteri dengan cara mengambil sebagian kecil koloni dengan menggunakan ose kemudian diinokulasikan pada medium TSA cawan dan diinkubasi pada suhu ruang selama 24 jam. Proses pemurnian dilakukan sampai menghasilkan isolat bakteri yang murni atau tunggal, yang diketahui dari pengamatan morfologi pada pewarnaan Gram. Koloni bakteri yang telah dimurnikan disimpan sebagai kultur stok di dalam medium TSA miring pada suhu 4 0 C Seleksi Isolat Bakteri Desulfurisasi Seleksi Bakteri Desulfurisasi pada Medium MSM-DBT Agar Setiap isolat bakteri desulfurisasi yang diperoleh, pada medium TSA yang berumur 1 hari diambil sebagian kecil koloni dengan menggunakan ose kemudian

40 23 diinokulasikan pada medium MSM-DBT agar cawan dan selanjutnya diinkubasi pada suhu ruang selama 48 jam. Pertumbuhan setiap isolat bakteri diamati pada medium MSM-DBT agar. Tiga isolat bakteri yang memiliki pertumbuhan tertinggi pada media MSM-DBT agar disimpan sebagai kultur stok di dalam medium MSM-DBT agar miring pada suhu 4 0 C. Kultur tersebut digunakan sebagai kultur untuk tahapan seleksi berikutnya Seleksi Bakteri Desulfurisasi pada Medium MSM-DBT Cair Tiga isolat bakteri desulfurisasi yang memiliki pertumbuhan tertinggi pada medium MSM-DBT agar yang berumur 1 hari diinokulasikan sebanyak satu ose ke dalam 30 ml medium MSM-DBT. Kemudian diinkubasi pada rotary shaker berkecepatan 120 rpm pada temperatur ruang selama 24 jam. Kultur inokulum sebanyak 10% (v/v) diinokulasikan ke dalam 200 ml medium MSM-DBT dan diinkubasi pada suhu ruang dengan agitasi 120 rpm. Pencuplikan dilakukan pada jam ke-0, 4, 8, 12, 16, 20 dan 24 untuk pengukuran enumerasi sel, ph dan desulfurisasi DBT. Enumerasi sel dilakukan dengan cara mengukur total plate count, ph diukur dengan ph meter. Desulfurisasi DBT dilakukan dengan cara mengukur sulfat yang terbentuk. Sulfat ditentukan dengan metode kekeruhan barium sulfat. Lima ml gliserol 20% (v/v) dalam air ditambahkan ke dalam sampel cair dan dikocok dengan kuat hingga homogen. Satu ml barium klorida 10% (v/v) dalam HCl 5% (v/v) ditambahkan dan dikocok dengan kuat untuk memastikan presipitat barium sulfat yang terbentuk tercampur merata dalam larutan gliserol. Kemudian aquades ditambahkan sampai volume total 10 ml, dikocok merata dan diukur

41 24 kekeruhannya dengan Visible Spectrophotometer pada panjang gelombang 460 nm, terhadap larutan blanko (Gleen dan Quastel, 1953 dalam Burlage et al., 1998). Isolat bakteri yang memiliki kandungan sulfat tertinggi akan di uji lanjut untuk analisis hasil desulfurisasi DBT dengan menggunakan UV-Vis Spectrophotometer Analisis Hasil Desulfurisasi DBT dari Bakteri Terseleksi dengan menggunakan UV-Vis Spectrophotometer Sampel sebanyak 3 ml selama pencuplikan pada fase eksponensial isolat yang terseleksi diasamkan sampai ph 2 dengan menggunakan HCl 1 N. Setelah itu sampel diukur kadar DBT dengan menggunakan UV-Vis Spectrophotometer pada panjang gelombang 328 nm (Rhee et al., 1998). Konsentrasi kadar DBT pada sampel diketahui dengan cara membandingkan nilai absorbansi dengan kurva standar Analisis Data Data enumerasi, ph medium dan nilai absorbansi sulfat dianalisis secara deskriptif ditampilkan dalam bentuk kurva dengan program excel 2007 serta di analisis varian multivariate (MANOVA) dengan bantuan SPSS 16 dilanjutkan dengan uji Duncan taraf 5 %.

42 BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN 4.1. Hasil Isolasi Bakteri Proses isolasi bakteri dari tanah pertambangan batubara asal Sumatera Selatan dilakukan dengan pengayaan dibenzothiophene (DBT) dan batubara. Isolasi yang dilakukan terdiri atas dua macam yaitu isolasi bakteri total (IBT) dan isolasi bakteri desulfurisasi (IBD). Dua puluh empat jenis isolat bakteri terisolasi dari IBT dan 22 jenis isolat bakteri terisolasi dari IBD. Dua belas jenis isolat bakteri yang terisolasi, baik pada IBT maupun IBD diketahui memiliki kesamaan morfologi, yaitu isolat 1N, 2N, 6N, 7N, 8N, 9N, 10N, 12N, 14N, 15N, 21N dan 26N. Jadi, keseluruhan isolat yang diperoleh berjumlah 34 jenis isolat bakteri. Deskripsi karakteristik seluruh isolat bakteri dapat dilihat pada Tabel 2 dan Gambar isolat bakteri dapat dilihat pada Lampiran 3 dan 4. Berdasarkan pengamatan morfologi, isolat bakteri yang diperoleh sebagian besar berbentuk kokus yang saling lepas, sedangkan sebagian kecil berbentuk basil. Sebagian besar isolat bakteri yang diperoleh memiliki karakteristik Gram negatif. Pada Tabel 2 dapat dilihat bahwa setiap jenis isolat bakteri tidak selalu muncul pada setiap waktu pencuplikan. Beberapa isolat bakteri muncul lebih dari sekali dalam waktu pencuplikan, misalnya isolat 8N. Isolat 8N muncul paling banyak dibandingkan dengan isolat lainnya, yaitu 12 kali selama waktu pencuplikan, dimana terisolasi 4 kali pada IBT dan 8 kali pada IBD (Lampiran 2). Hal ini menunjukkan bahwa isolat 8N dominan selama waktu pencuplikan dilakukan. 25

43 26 Tabel 2. Karakteristik isolat bakteri Metode Isolasi IBT IBD Kode Isolat Jumlah Kemunculan isolat 3N 1 4N 1 5N 1 11N 1 13N 1 16N 1 25N 1 27N 1 28N 1 36N 1 37N 1 39N 1 32N 1 Karakteristik Koloni Bentuk koloni: bulat; Tepi: entire; Elevasi: convex; Permukaan: dull; Warna: kuning; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat; Tepi: entire; Elevasi: convex; Permukaan: dull; Warna: putih; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: irregular; Tepi: lobate; Elevasi: gunung; Permukaan:rough; Warna: putih; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat; Tepi: entire; Elevasi: convex; Permukaan: dull; Warna: putih; Opasitas : opaque. Bentuk koloni: bulat; Tepi: entire; Elevasi: convex; Permukaan: dull; Warna: orange muda; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat ; Tepi: entire; Elevasi: timbul; Permukaan: dull; Warna: kuning; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat ; Tepi: entire; Elevasi: gunung; Permukaan: dull; Warna: putih; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat dengan penebalan tepi; Tepi: entire; Elevasi: timbul; Permukaan: dull; Warna: kuning; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat ; Tepi: entire; Elevasi: gunung; Permukaan: dull; Warna: kuning; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: irregular; Tepi: lobate; Elevasi: timbul; Permukaan: rough; Warna: putih; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat dengan penonjolan tengah; Tepi: entire; Elevasi: gunung; Permukaan: dull; Warna: putih susu; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat dengan tepi agak bening; Tepi: entire; Elevasi: convex; Permukaan: dull; Warna: kuning; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: menyebar tidak teratur; Tepi: rough; Elevas : flat; Permukaan: rough; Warna: kuning agak bening; Opasitas: translucent Karakteristik Sel Bentuk sel kokus, susunannya rantai. Termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel kokus, susunannya anggur. Termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel kokus, susunannya anggur. Termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel basil, susunannya rantai, termasuk ke dalam Gram positif Bentuk sel kokus, susunannya rantai, termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel basil, susunannya rantai, termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel kokus, susunannya anggur, termasuk ke dalam Gram positif Bentuk sel kokus, susunannya rantai, termasuk ke dalam Gram positif Bentuk sel kokus, susunannya rantai, termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel kokus, susunannya rantai, termasuk ke dalam Gram positif Bentuk sel kokus, susunannya rantai, termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel kokus, susunannya rantai, termasuk ke dalam Gram positif Bentuk sel basil, susunannya tunggal, termasuk ke dalam Gram negatif

44 27 Terisolasi pada IBT dan IBD 33N 3 34N 3 40N 1 41N 1 42N 2 43N 2 46N 1 49N 1 50N 1 1N 3 2N 2 6N 3 7N 3 8N 12 9N 2 Bentuk koloni: bulat dengan penonjolan ditepi; Tepi: entire; Elevasi: gunung; Permukaan: rough; Warna: kuning; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: irregular; Tepi: lobate; Elevasi: timbul; Permukaan: rough; Warna: putih; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: irregular; Tepi: lobate; Elevasi: timbul; Permukaan: rough; Warna: kuning; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: menyebar tidak teratur; Tepi: irregular; Elevasi: convex; Permukaan: dull; Warna: putih; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat; Tepi: entire; Elevasi: convex; Permukaan: dull; Warna: orange muda; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: irregular; Tepi:lobate; Elevasi: gunung; Permukaan: dull; Warna: putih; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat; Tepi: entire; Elevasi: timbul; Permukaan: rough; Warna: kuning; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: irregular; Tepi:lobate; Elevasi: timbul; Permukaan: rough; Warna: kuning; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: irregular; Tepi: lobate; Elevasi: timbul; Permukaan: rough; Warna: putih; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat; Tepi: entire; Elevasi: convex ; Permukaan: dull; Warna: putih; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat; Tepi: entire; Elevasi: convex; Permukaan: dull; Warna: kuning; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat; Tepi: entire; Elevasi: convex; Permukaan: dull; Warna: kuning muda; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: irregular; Tepi: lobate; Elevasi: gunung; Permukaan: rough; Warna: kuning muda; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat; Tepi: entire; Elevasi: timbul; Permukaan: dull; Warna: putih; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat; Tepi: entire; Elevasi: convex ; Permukaan: dull; Warna: putih susu; Opasitas: opaque. Bentuk sel kokus, susunannya rantai, termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel basil, susunannya tunggal, termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk basil, susunannya rantai, termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel kokus, susunannya anggur, termasuk ke dalam Gram positif Bentuk sel basil, susunannya rantai, termasuk ke dalam Gram positif Bentuk sel kokus, susunannya rantai, termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel basil, susunannya rantai, termasuk ke dalam Gram positif Bentuk sel kokus, susunannya tunggal, termasuk ke dalam Gram positif Bentuk kokus, susunannya tunggal, termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel kokus, susunannya tunggal, termasuk ke dalam Gram positif Bentuk sel basil, susunannya rantai. Termasuk ke dalam Gram positif Bentuk sel kokus, susunannya tunggal, termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel basil, susunannya tunggal, termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel kokus, susunannya tunggal, termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel basil, susunannya rantai, termasuk ke dalam Gram negatif

45 28 10N 10 12N 3 14N 3 15N 5 21N 5 26N 6 Bentuk koloni: bulat; Tepi: entire; Elevasi: convex; Permukaan: dull; Warna: putih agak bening; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat; Tepi: entire; Elevasi: convex; Permukaan: dull; Warna: putih; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: irregular; Tepi: entire; Elevasi: timbul; Permukaan: rough; Warna: kuning;opasitas:opaque. Bentuk koloni: irregular; Tepi: lobate; Elevasi: timbul; Permukaan: rough; Warna: putih; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: bulat; Tepi: entire; Elevasi: convex; Permukaan: dull; Warna: putih; Opasitas: opaque. Bentuk koloni: irregular; Tepi: lobate; Elevasi: timbul; Permukaan: rough; Bentuk sel basil, susunannya tunggal, termasuk ke dalam Gram positif Bentuk kokus, susunannya rantai, termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk kokus, susunannya tunggal, termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel kokus, susunannya tunggal, termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel basil, susunannya anggur, termasuk ke dalam Gram negatif Bentuk sel kokus, susunannya anggur, termasuk ke dalam Gram negatif Warna: putih; Opasitas: opaque. Keterangan : entire : utuh; flat : datar; opaque : tidak tembus cahaya; convex : cembung; dull: tumpul; translucent: tembus cahaya; irregular: tidak beraturan; lobate: berlekuk; rough: kasar Dua belas isolat bakteri yang terisolasi pada IBT tidak terisolasi pada IBD. Begitu pula sebaliknya, sepuluh jenis isolat bakteri hanya muncul pada IBD yaitu, isolat 32N, 33N, 34N, 40N, 41N, 42N, 43N, 46N, 49N dan 50N. Hal tersebut menunjukkan adanya pengaruh dari pengayaan DBT dan batubara yang dilakukan pada sumber isolat. Pengayaan DBT dan batubara yang dilakukan pada sumber isolat mampu memunculkan jenis isolat baru yang sudah berada pada sumber isolat namun jumlahnya tidak dominan. Pengayaan DBT dan batubara yang dilakukan merupakan penambahan komponen sulfur tereduksi pada sumber isolat yang dapat memberikan kesempatan isolat bakteri yang tidak dominan pada sumber isolat untuk tumbuh sehingga isolat bakteri dapat terisolasi. Hal ini diperkuat dengan pernyataan Davis et al. (2005) yang menyatakan bahwa penggunaan pengayaan pada sumber isolat adalah kebutuhan untuk menumbuhkan populasi sel yang dapat terdeteksi dari tingkat awal yang sangat