III. METODE PENELITIAN

Transkripsi

1 III. METODE PENELITIAN A. Waktu dan Tempat Penelitian Penelitian ini dilakukan pada bulan April - September Penelitian ini dilakukan di Laboratorium Biokimia Jurusan Kimia Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Universitas Lampung. B. Alat dan Bahan Alat-alat yang digunakan pada penelitian ini adalah mortar, kertas saring, neraca analitik OHAUS GA 200, autoklaf TOMY High Pressure Steam Sterilzer ES-315, inkubator shaker, waterbath, ph meter, vortex, magnetic stirrer, spektrofotometer UV-Vis, Beckman High Speed sentrifuge, ultrasentrifus, mikropipet, waterbath, oven, spektrofotometer UV-vis, jarum ose dan alat-alat gelas lain seperti tabung reaksi, cawan petri, erlenmeyer, gelas beaker, gelas ukur, labu ukur, pipet tetes, batang pegaduk, serta pemanas bunsen. Bahan-bahan yang digunakan dalam penelitian ini adalah Bahan yang digunakan ialah isolat lokal A. niger. Media pertumbuhan terdiri dari 1,2 % K 2 HPO 4, 0,1 % MgSO 4, 0,05 % KCl, 0,003 % FeSO 4, 0,08 % (NH 4 ) 2 SO 4, 0,01 % CaCl 2, 0,5 % pepton, 0,5 % pati dan sitrakonat anhidrida.

2 32 C. Prosedur Penelitian 1. Pembuatan Media Inokulum, Media Fermentasi dan Pereaksi. a. Pembuatan media agar kentang dekstrosa (Potato Dextrose Agar) Sebanyak 39 gram PDA dilarutkan dalam akuades hingga 1000 ml, kemudian dipanaskan sambil diaduk hingga homogen. Larutan dipanaskan di atas hotplate sambil terus diaduk hingga PDA melarut dan berwarna jernih. Medium disterilkan dalam autoklaf pada suhu 121 C, tekanan 2 atm selama 15 menit. Medium dimasukkan ke dalam tabung reaksi bersih medium miring, sumbat mulut tabung dengan kapas lemak dan dilapisi kertas lalu ikat tabung dengan karet, sebagian medium dimasukkan ke dalam Erlenmeyer, media dalam Erlenmeyer disimpan sebagai stok media pada suhu ruang atau dalam lemari pendingin. b. Pembuatan media inokulum dan fermentasi Media Inokulum dan fermentasi yang digunakan terdiri dari 1,2 % K 2 HPO 4, 0,1 % MgSO 4, 0,05 % KCl, 0,003 % FeSO 4, 0,08 % (NH 4 ) 2 SO 4, 0,01 % CaCl 2, 0,5 % pepton, 0,5 % pati dan dilarutkan dalam buffer fosfat ph 7. c. Pembuatan pereaksi untuk penentuan kadar protein enzim α- amilase metode Lowry Pereaksi A : 2 gram Na 2 CO 3 dilarutkan dalam 100 ml NaOH 0,1 N. Pereaksi B : 5 ml larutan CuSO 4.5H 2 O 1% ditambahkan ke dalam 5 ml larutan Na(K) tartarat 1%. Pereaksi C : 2 ml pereksi B ditambahkan 100 ml pereaksi A

3 33 Pereaksi D : reagen folin ciocelteau diencerkan dengan akuades 1:1. Larutan standar : Larutan BSA (Bovine Serum Albumin) dengan kadar 0, 20, 40, 60, 80, 100, 120, dan 140 ppm. d. Pembuatan pereaksi untuk uji aktivitas amilase metode Fuwa 1) Pereaksi Iodin : 2 gram serbuk KI dilarutkan dalam 10 ml aquades, ditambahkan 0,2 gram I 2, dan di tambahkan akuades sampai tanda batas pada labu takar 100 ml. 2) Larutan amilum : 0,1 gram amilum ditambahkan 100 ml aquades ke dalam labu ukur kemudian dipanaskan hingga larut. (Fuwa, 1954). e. Pembuatan pereaksi untuk uji aktivitas amilase metode Mandels Ke dalam labu ukur 100 ml, dimasukkan 1% DNS (dinitrosalisilic acid), 1% NaOH, 0,2 fenol, 0,05% Na 2 SO 3, dan 1 ml Na(K) tartrat kemudian dilarutkan dengan akuades hingga tanda batas (Mandels, et al., 1976). 2. Pembiakan fungi Aspergillus niger L-51 Biakan A. niger L-51 ditanam pada media agar miring PDA (potato dextrose Agar) dalam tabung reaksi, diinkubasi pada suhu 37 C selama 5 hari. Spora yang terbentuk dikerok dengan jarum ose, sehingga diperoleh biakan A. niger.

4 34 3. Inokulasi A. niger Pada Media Inokulum dan Media Fermentasi Disiapkan media inokulum dan fermentasi yang terdiri dari 1,2 % K 2 HPO 4, 0,1 % MgSO 4, 0,05 % KCl, 0,08 % (NH 4 ) 2 SO 4, 0,003 % FeSO 4, 0,01 % CaCl 2, 0,5 % pepton, 0,5 % pati dan dilarutkan dalam bufer fosfat ph 7. Ujung kawat ose dicelupkan ke dalam alkohol 96% lalu dipanaskan pada api bunsen sampai berwana merah. Biakan A. niger dari media PDA diambill dengan menggunakan kawat ose lalu dicelupkan beberapa saat pada media cair hingga tampak keruh. Media cair ditutup dengan sumbat dan diinkubasi pada suhu ruang ± 25 C selama 24 jam. Pekerjaan ini dilakukan di ruang aseptik. Produksi enzim α-amilase dilakukan dengan memindahkan secara aseptis 20 ml (2% dari total volume media fermentasi) ke dalam media pertumbuhan yang komposisinya sama dengan media inokulum. Selanjutnya media fermentasi yang telah berisi 2% medium inokulum diinkubasi pada suhu ruang menggunakan shaker dengan kecepatan 150 rpm selama 72 Jam. 4. Isolasi dan Pemurnian Enzim α-amilase a. Isolasi enzim α-amilase Tahapan pemurnian enzim dimulai dari sentrifugasi. Tujuan sentrifugasi ini adalah untuk memisahkan enzim ekstraseluler dari sel. Sentrifugasi ini dilakukan pada suhu rendah (dibawah suhu kamar) untuk menjaga kestabilan aktivitas enzim (Suhartono, 1989).

5 35 Media fermentasi yang berisi Aspergillus niger L-51 dikocok dengan menggunakan shaker pada suhu ruang selama 72 jam. Kemudian dilakukan pemisahan enzim dari komponen sel lainnya dengan setrifugasi pada 5000 rpm pada suhu 4 C selama 20 menit. Filtrat yang diperoleh merupakan ekstrak kasar enzim yang selanjutnya akan diukur aktivitas enzim α-amilase dengan metode Fuwa dan diukur kadar proteinnya dengan menggunakan metode Lowry. b. Proses pemurnian enzim α-amilase 1) Pengendapan dengan amonium sulfat Supernatan difraksinasi dengan menggunakan amonium sulfat pada konsentrasi (20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 95%) kemudian dilakukan sentrifugasi dengan kecepatan 6000 rpm selama 30 menit (lihat Gambar 6), endapan yang diperoleh dilarutkan dalam 5 ml buffer fosfat 0,1 M ph 6. Selanjutnya diukur aktivitas enzim dam kadar protein.

6 36 Ekstrak Kasar Enzim + (NH 4 ) 2 SO 4 (0-20%) Endapan(F1) Filtrat + (NH 4 ) 2 SO 4 (20-40%) Endapan(F2) Filtrat + (NH 4 ) 2 SO 4 (40-60%) Endapan(F3) Filtrat + (NH 4 ) 2 SO 4 (60-80%) Endapan(F4) Filtrat + (NH 4 ) 2 SO 4 (80-95%) Endapan(F5) Filtrat Gambar 6. Skema pengendapan protein enzim dengan amonium sulfat. Endapan protein enzim yang didapatkan pada tiap fraksi kejenuhan amonium sulfat (Gambar 6), dipisahkan dari filtratnya dengan sentrifugasi pada kecepatan 5000 rpm selama 20 menit. Kemudian endapan yang diperoleh dilarutkan dengan buffer fosfat 0,1 M ph 6,0 dan diuji aktivitasnya dengan metode Fuwa dan diukur kadar proteinnya dengan metode Lowry untuk mengetahui pada fraksifraksi mana terdapat enzim α-amilase dengan aktivitas spesifik yang tinggi. 2) Dialisis Endapan enzim yang telah dilarutkan dari tiap fraksi amonium sulfat dengan aktivitas spesifik tertinggi dimasukkan ke dalam kantong selofan dan didialisis dengan buffer fosfat 0,01 M ph 6

7 37 selama 24 jam pada suhu dingin (4-5 C) (Pohl, 1990). Selama dialisis, dilakukan pergantian buffer setiap 2-6 jam sekali agar konsentrasi ion-ion di dalam kantong dialisis dapat dikurangi. Proses ini dilakukan terus menerus hingga tidak ada amonium sulfat yang tersisa. Pengujian adanya amonium sulfat dalam buffer dilakukan dengan menambahkan larutan BaCl 2. Proses ini dihentikan sampai tidak terbentuk endapan putih pada saat penambahan BaCl 2. Selanjutnya dilakukan uji aktivitas dengan metode Mandels, serta diukur kadar proteinnya dengan metode Lowry. 5. Uji Aktivitas Enzim α-amilase a. Metode Fuwa Aktivitas enzim α-amilase ditentukan dengan menggunakan metode iodin (Fuwa, 1954). Sebanyak 0,1 ml larutan enzim ditambahkan 0,4 ml aquades dan 0,5 ml pati, kemudian diinkubasi pada suhu 60 C selama 10 menit. Reaksi dihentikan dengan penambahan 0,1 ml HCl 0,25 M dan kemudian ditambahkan 0,25 ml larutan iodin dan 4 ml akuades ke dalam campuran reaksi. Campuran tersebut dihomogenkan dan diukur serapannya menggunakan spektrofotometer UV-vis pada λ 600 nm. Kontrol dibuat dengan proses yang sama, namun menggunakan 0,25 ml larutan enzim yang sudah diinaktifkan. Penentuan aktivitas dengan menggunakan metode iodin dilakukan pada tahapan isolasi, pemurnian dan karakterisasi enzim.

8 38 b. Metode Mandels Metode ini didasarkan atas glukosa yang terbentuk. Sebanyak 0,5 ml enzim, 0,5 ml larutan pati 0,1% dicampur lalu diiinkubasi selama 30 menit pada suhu 60 C, kemudian ditambahkan 2 ml pereaksi DNS (dinitrosalisilic acid) dan didihkan selama 10 menit pada penangas air dan selanjutnya didinginkan. Diukur serapan dengan menggunakan spektrofotometer UV-vis pada λ 510 nm. Kadar glukosa yang terbentuk ditentukan dengan menggunakan kurva standar glukosa. Uji ini akan dilakukan pada tahap penentuan K M dan V Maks. 6. Penentuan Kadar Protein Metode Lowry Sebanyak 0,1 ml enzim ditambahkan 0,9 ml akuades lalu direaksikan dengan 5 ml pereaksi C kemudian dihomogenkan dan dibiarkan selama 10 menit pada suhu ruang. Setelah itu ditambahkan dengan cepat 0,5 ml pereaksi D dan diaduk sempurna kemudian didiamkan selama 30 menit pada suhu ruang. Sebagai kontrolnya, 0,1 ml enzim diganti dengn 0,1 ml akuades dan diperlakukan sama seperti sampel. Kemudian diukur serapannya menggunakan spektrofotometer UV-vis pada λ 750 nm (Lowry et al., 1951). Untuk menentukan konsentrasi protein enzim digunakan kurva larutan standar BSA (Bovine Serum Albumin) yakni dengan mencari panjang gelombang maksimum dan pembuatan kurva larutan standar BSA. Penentuan Panjang gelombang maksimum larutan standar BSA dilakukan

9 39 dengan membuat larutan BSA 0,2 mg/ml dan direaksikan dengan reagen Lowry, kemudian diukur serapannya dengan spektrofotometer UV-vis pada rentang panjang gelombang nm. Sedangkan, untuk membuat kurva standar BSA dapat dilakukan dengan membuat variasi konsentrasi larutan BSA antara 0,2-1,4 mg/ml dengan rentang 0,2 mg/ml dan diukur serapannya pada panjang gelombang maksimum (Atmaja, 2013). Setelah didapatkan kadar protein, dilakukan perhitungan Aktivitas spesifik untuk mengatahui unit aktivitas per mg protein. Perhitungan aktivitas spesifik enzim menurut Machfoed et al., (1989) adalah sebagai berikut: Aktivitas Spesifik Enzim = Unit aktivitas (Unit ml ) Kadar Protein ( mg ml ) D. Modifikasi Kimia Enzim α-amilase dengan Sitrakonat Anhidrida Residu amilase pada suatu enzim secara spesifik dapat dimodifikasi dengan sitrakonat anhidrida yang prosedurnya telah dilaporkan oleh Khajeh et al., (2001). Sebanyak 10 ml enzim hasil pemurnian dalam 10 ml larutan buffer fosfat ph 8 ditambahkan reagen sitrakonat anhidrida sebanyak 30 μl secara bertahap. Setiap penambahan reagen, ph larutan dijaga konstan pada ph 8 dengan menambahkan larutan Na 2 HPO 4. 7H 2 O lalu diaduk mengunakan magnetic stirrer selama 60 menit. Penambahan reagen sitrakonat dilakukan

10 40 dengan variasi volume sebagai berikut : 3μL, 4μL dan 5μL dan dilakukan dengan prosedur yang sama. E. Karakterisasi Enzim α-amilase Hasil Pemurnian dan Hasil Modifikasi Karakterisasi enzim α-amilase hasil pemurnian dan hasil modifikasi yang dilakukan meliputi : 1. Penentuan derajat modifikasi Derajat modifikasi enzim merupakan perbandingan antara residu lisin dalam enzim yang termodifikasi terhadap residu lisin sebelum dimodifikasi. Prosedur pengerjaannya adalah sebagai berikut: Untuk sampel, sebanyak 0,1 ml enzim yang telah dimodifikasi dilarutkan dalam 0,9 ml buffer borat (ph 9,0). Kemudian ditambahkan 25 μl 0,03 M asam 2,4,6-trinitrobenzena-sulfonat (TNBS). Campuran ini kemudian dikocok dan dibiarkan pada suhu kamar selama 30 menit. Larutan standar dibuat dengan komposisi sama, namun menggunakan enzim hasil pemurnian (sebelum dimodifikasi). Sedangkan, blanko terdiri dari 1 ml buffer borat ph 9; 0,1 M dan 25 μl TNBS 0,03 M. absorbansi diukur pada panjang gelombang 420 nm. Derajat modifikasi dapat dihitung dengan menggunakan rumus sebagai berikut: Derajat Modifikasi: = Jumlah residu lisin yang termodifikasi Jumlah residu lisin awal X 100% = (A St A B1 ) (A Sp A B1) (A st A B1 ) X 100%

11 41 Keterangan : Ast A B1 A Sp : Absorbansi larutan stándar : Absorbansi larutan blanko : Absorbansi larutan sampel 2. Penentuan ph dan suhu optimum a. Penentuan ph optimum Untuk mengetahui ph optimum enzim sebelum dan sesudah modifikasi digunakan buffer fosfat 0,1 M dengan variasi ph sebagai berikut : 4,5; 5; 5,5; 6; 6,5; 7; 7,5 dan 8. Suhunya dijaga tetap pada 60 C, kemudian dilanjutkan dengan pengukuran aktivitas enzim dengan metode Fuwa. b. Penentuan suhu optimum Untuk mengetahui suhu optimum kerja enzim dilakukan dengan variasi suhu yaitu 45; 50; 55; 60; 65; 70, 75 dan 80 C, ph tetap dijaga pada ph optimum. Selanjutnya diukur aktivitas enzim dengan metode Fuwa. 3. Penentuan data kinetika enzim (nilai K M dan V maks ) Konstanta Michaelis-Menten (K M ) dan laju reaksi maksimum (V maks ) enzim sebelum dan sesudah modifikasi ditentukan dari kurva Lineweaver- Burk. Kurva Lineweaver-Burk dibuat dengan menguji aktivitas enzim α- amilase dengan variasi konsentrasi substrat 0,25 %; 0,5 %; 0,75 %; 1,0 % dan 1,25 % dalam buffer fosfat ph 5,5 dan suhu 50 o C selama 60 menit. Selanjutnya diukur aktivitas enzim dengan metode Mandels.

12 42 4. Uji stabilitas termal enzim (Yang et al., 1996) Penentuan stabilitas termal enzim dilakukan dengan mengukur aktivitas sisa enzim setelah diinkubasi selama periode waktu 180 menit pada ph dan suhu optimum hasil penentuan sebelumnya. Caranya adalah dengan mengukur aktivitas enzim menggunakan metode Fuwa dengan proses pemanasan setiap interval waktu 30 menit. Aktivitas awal enzim (tanpa proses pemanasan) diberi nilai 100%. Aktivitas sisa = Aktivitasenzim setelah perlakuan Aktivitas enzim awal (tanpa perlakuan) x 100% 5. Penentuan waktu paruh (t 1/2 ), konstanta laju inaktivasi (k i ) dan perubahan energi akibat denaturasi ( G i ) Penentuan nilai k i (konstanta laju inaktivasi termal) enzim α-amilase hasil pemurnian dan hasil modifikasi kimia dilakukan dengan menggunakan persamaan kinetika inaktivasi orde 1 yaitu : ln (E i /E 0 ) = - k i t Sedangkan untuk perubahan energi akibat denaturasi ( G i ) enzim hasil pemurnian dan hasil modifikasi kimia dilakukan dengan menggunakan persamaan (Yandri et al., 2007) : G i = - RT ln (k i h/k B T) Keterangan : R = konstanta gas (8,315 J K -1 mol -1 ) T = suhu absolut (K) = konstanta laju inaktivasi termal k i

13 43 h = konstanta Planck (6,63 x J det) k B = konstanta Boltzmann (1,381 x JK -1 ) Tahapan secara keseluruhan modifikasi kimia enzim α-amilase dengan menggunakan sitrakonat anhidrida dapat dilihat pada Gambar 7.

14 44 F. Kerangka Penelitian Produksi Enzim Ekstrak Kasar Enzim Uji aktivitas enzim α- amilase (metode Fuwa ) Pemurnian Enzim : 1. Fraksinasi dengan amonium sulfat 2. Dialisis Modifikasi Kimia Enzim hasil modifikasi Enzim hasil pemurnian Penentuan ph dan suhu optimum Penentuan K M dan V maks Penentuan Stabilitas termal Uji aktivitas enzim α- amilase (metode Mandels ) Gambar 7. Kerangka penelitian produksi, pemurnian, dan modifikasi enzim α-amilase dari A.niger L-51